SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR11402c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_RB-associated_KRAB_zinc_finger_protein_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:5.17 TPM:5.06
ORF EntryO_TrvaFAMAMG14068_complete:A_TrvaFAMAMG_TR11402c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CGCCTATCAATTGTTTTTTTGAATTACATTGATTTGTTTGTTTTTAAATTATTAAGTACA
TATTTTTAAAAATATTCTTAATAGTGTAATAAATTAGTCATCTATGCCAATTTAATTTCT
TTCATCATTACTGTTTCTCTTTTCTTGAATAAATACATAAATAATTTTATAATTTTAATA
AGACTTTCTCTGCCAAAGCAGTAAGTGCTGATCAACACGTCTTTCAAAGAAAACTGCATG
TTTTGTATTAAGTGACTGGTTCTTCAATATTACCATTAAGCTTAACTTGTAAGTAAGTAG
GCATTCGTCCTGCTGCTCTTTTCTCCTGTTTATGAACATCCACCTCATGTTTTCTCATTG
CTTTTCTATAACCAAAATTTTTACCGCAAAAGTTGCAATTAAACTTCTTAACACCCAAAT
GCTCCACTTCGTAATGCTTCCGTAAGTAAAATTTGCAATGAAAAAACTTTTTGCAAGTAT
CACACTGGAATGTTGATTCTTTGTGTTTTAAGCTGTGTCTATTCAGATTGCTTTTAGTTA
GAAACCTAGCTGGACATTCAGCACACATGTAACGGTAATCTCCAGTGTGCCGTCTCATAT
GACCTTTAAGCAGACCAGAACTCCTTGCTTTGTACGGGCATAATTTACATTTGAATTTAA
AATCCGTACTATGAGTAAACCTGTGATTAATAAGTGCGCTTTGCTGACGAAAAGACTTCC
CACAGATATGACATATATATTTTGGTAAGCTAGGGTCGTGGAGAGCATAATGGTCTCTAC
CGTAGGCTTTAGTCACAATTTTATTGCATATCCGACATTGCACTCTTTTCCCAGCGCCAA
TGTTAGGGCAAATAGGTATCTTTGAGGATTCTGACTCACTTAACTCTATAAAGTACTGTT
GCACCAGTTCCCACTGGGTTGGCCTCTCACTAATCTCACTTTCGATATTATCAACATCAC
AGATTGGTGAGACAGGAGAATTTACTGAACAATTTAAGTCAGAGAATGAATCCGTTTTTA
ATACAGACTTTTTTAATAGTTCTTCGGATTGTTTGGCAGCTTTTCGGAACAAAATCGCAC
ATTGTAGAAGTTTGTAACATGCATCGCACAAATATTTCGGGAATTCATCGTCGTAACTCA
GATCAATATCTCCGAAGGTTCTAATATCATAGGACAAGTCAGTTGCACAGTCAGGCCCGT
ATATTGGTAAACTGCCTTCTTTTAAACATATTCTACACTTATTTTTCTCATTGCCACTGT
ATTTTGTTTCAGACATTTTGATGGTTTCCTTTTTCGTGTCCATATTACGTGATCATGTTA
TGTAGTTTTAATCGATTGGATTCAAGTTTTCTTCTAATACTATTTTGTTGTCACTGCAAC
AATAGCTTGTGATAATTTTAATGGAGAATTTTATCAAAAACAGAATTTTATAAACGAAAC
GAAAACCATTCGCAAACGTAAACAATGTTTTTTTTAAAATAGGGATTGATAGTGACGAGT
TAACGAAATAAATATCGATTTAATAGATCGTGTTTTTTGGATTCAGAAACGGAATTTATA
CTATTAACGATAACGAATCGAATAACGATACGATTTTATCCACTTCATTTTCACATTTAA
ATTACATTACAAATCATGTATAAATGATAACTCGAATCCCATCTTGACAATGTATTATCG
ATTTGTGGACTTAGATTGTCATCTCTATTTTCACTGGCTTTCCAGGCTTTCAACCGATTT
CAAAATAGAAGTATTATTTTGTTGAGATCATTTTCTGAGCAGTTGAATATCATTATTTTG
AACAACTCGAAAGCTAAGTAAACTCATTTGACGCCGTAATGAAGAGTTATCTAAATATGT
CACTGATATTGCAGAGGTTCACGACGGTAACCACAAAAGATCAGGTGGTCCGTGACAATG
AAAAAACATTACATAACTACAACACACAATTTAGTTCCAGATTATTTATTACTTACAACT
AGCAATTATAAATTGTAATAACATTAAAAATGCTGGTCAGTCTCAGTTTTTTCTTTTTCC
CTGGCTGCTTTCAAATAGTTTGGAACGCGTTTCATTAATCTCTCTCTATTATGGACCCTC
AGTTGATGACCCAGCAATTCATCTCTATGACCGAAACCCTTTCCACATTCATCACATATG
ACATCACGAAGTCCTACGTGGCTTGTAAAATAATGCTTCTCCATATTATTCTTACGGAAA
AAATATAAATTGCACTCGTAACATTTAATGTGTCCTTGACCATGTCTTTGAAGATGCTGA
TTAAGGTTACTTTTCGTTAGAAATTTCGCTGAACATTTTGGACATTTGTAATTATACTCA
CCTTTGTGAGTTTTTACATGGACTTGGAGCAGGCCTAAATATTGACATCTGTACGGACAA
AACTGACATTTATATTTAAAATCTTCAGAGTGTATTAACTGGTGCCTTTTGAAAGATGCA
CGATTTGTAAAGACTTTAGCACAGTGTTCACAGACATAAGACTCCGGAACGTTTCCATGG
CCAGCTAGATGATCTTTATATCTTGATTTATGCACCTGCTTTTGGCACACATAACAACTT
TGATAAACAACCTCATTATTACAACTGTCTGATTTTTCACCAATTAGATTCAATTTATGT
ATCTTTCTTAAATGACTGTTAAAATAACGTGTTGATACTGACTTCTTGCATATCTCACAA
GTCTTTTTCCTTTGATCTTGTTCTGTTTTAGTACCGTGCATTTTCATGTGATAATTAATA
TAGGTTTTTATGATGAGTTTTTTGCAAACTTTACATTCAACTTTTTCTTTTCTTTCCTGG
TTTTCATAATCTATTTTATGTTGTTCCATGTGTATATCTTGAGTTGCTATAGTGACATCC
TTGAAACAAACATCACATTTTATTTTATCTGTTATTTTTATATTATGTTGAAGCTCACAA
TGCTTTTCCAGTTCAACTATGTTTTCAATAATTTCATTACATACTCCACAGTTGTAACCT
GATTTT
(3006 bp)

- SilkBase 1999-2023 -