SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR11347c1_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		Vacuolar_protein_sorting,_partial_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0000938 C GARP complex
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005829 C cytosol
GO:0006810 P transport
GO:0006896 P Golgi to vacuole transport
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0007283 P spermatogenesis
GO:0007286 P spermatid development
GO:0007291 P sperm individualization
GO:0015031 P protein transport
GO:0019905 F syntaxin binding
GO:0030154 P cell differentiation
GO:0042147 P retrograde transport, endosome to Golgi
Transcript
Level		FPKM:4.03 TPM:3.95
ORF EntryO_TrvaFAMAMG13741_5prime_partial:A_TrvaFAMAMG_TR11347c1_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TTTCGGAGGAGTTCAAGTTCGAACACCGTGACACGAGAATTTTATATATTAGAAGAAGAT
TACCCAACTGTTGGCCCCATCATTGGCTCAGTCGGCTCATTTTGCGAAGTGGAAGTTTCA
CGATTTCCTACTACTCAAAAAAAGTTTAGATATAATTCAACTCACACACGTCTCTAAATT
TTTTTTATATTTCGTTATTCTCTTAATCAGCAGGTCGATCAGAAAGACAGGAGATCAAGA
TAAGTATATTGCTCTCATAGAATTATTACCTCCTATTATTAGGTAATAATTCCATGATTG
CTCTGAAATTTCAGTAGATGTATTCAAGGTTAGGTACTGCGCAGTTTACAAAATAACTAA
TAATTCGCGTTGTATGGGTTCCTTAATGTTGAAAGATCGTGATCGTATCTATTAGTCACT
ATTTAAGCACATTTTTTTAGTACATAAATCAAGCTGATCCGGCCAGTATTTGTTACTTGC
TAACTTTAACGTCAAGTTGGCAGCACTATTTTTTTGGTATCGGTCACTATTTAGTCACAA
TTTTTCAACATATTCAAAAACATTAAAATTCCATTGTGTACCTTCCTGTCGTGCCGGGGA
GAAAAACATGAAATTATTACACCTATGGAGAAAAACTAATTAATATTTTTGTATATTGAA
AACTCATTGCCTACGCCGGCAGTGGGTGCACTTTAGCGTATTTATCGAACAATTTGACAG
GTTTCCATGAATTTTTCATATTTTATTTACCCATTTCCGTAATAGGTAGACAAACTGACC
GAAATAAAAATTCGTTAAATTAAATAATAACTGTAATAAAACTTACGAACATTTCAAAGA
GACGATTAATAATAATTTATATTCTATATTATAACTATACATATACATTTCAATTACATA
GTTATGTACAAAATTTATGTCACTTATAATTAGTATGAAAATTGTATTTTAATTCTTACA
ATAAAATCCTATGTAAGCAGCTATTCCTTCAATTTTATCACCCATCGAAGGCATACAGTG
AAAATTTATTAAATGCATCAAAGGGCAGACAAAAATTTGAAATTTTAATCTTGACCATTA
GCTCACAGTACCTAGATATAGACTTCTTCCAATACTACCACCACTACAATTACTAGTGCG
ACCCGTACTGTTATGTATTTATTCAGAGGCTTTTCACAGCACTGAAGATCATCAGTGCAG
CTGAGAACAAGATCTCATAAGTTTTATTTAACTGTTACCTACCCTTACATGTCTTATTTC
ATTTGGATGCTATTGATACATATACGATTACATGATTATATTAAGACGCAACTTTAATTT
AACCAAACATCATATAATATATTATCCTCTGTATCATTATCATTTACAACCCTTAATGTT
TTTAGAGTTTGCAAATAAAACGTCAATTCCGAAGTCACTACACCATGTTGAGGACTGCCA
TTAGCAACTATATTCATTTTCATTAATTGTTCTCGTAATTTGTCTTTAAAATTATCATGA
ACACGCTTATATATTGACTTTATTTGTTCAGGTGGCAAAATATCAATTAATGCCTCATGT
AGTTTTACCAAATGTTTTGATATATTGCGGAATGTTTGAGAAGGTACAGGAGGCTTTGCA
TCCCAGCCTGTTAATTGAGAACATAACATGTTACTCACTATTAGGCAAATCTTATTCTCT
ATTTCCTGCTTATGACTAAGAATATCACTTTCAATAGCAACAAAACCATTTAAAGAAATT
TCAGAAGAATGAACTCTTTCAAGCAGCTGCTTTACCATTGGTAAGAACCAAAGAATTACC
TGCAGAGATCGAGATACTAGAGCTAAGTTGGATGTGGAAATAGTCTTAAGTCCAGCACTC
TGTATTGCACCTGCTCCCAAAACAAGTTGACAGCAACGAGAGTTGAACAATCTTAATAAT
TCTAACATACAATGAATTAAATACTGAACAATAATGGGTGATTGTCTAGTTGCATCACAG
TATTCTAATAAAATTTTTACCAGCAGTTGCACTGTCCCAACTACAGCATACCCTTCTTTG
TTTATAAACAGATATTTTCCATCAGATTTACCACTTTCGTATTGTATTTCTGGAGGTATT
TGTTGGACTTCACATATTTTTGAAATTGCACTTTGTAATTCATATGGAACATCAGCAGCT
TTCCATCTCTCAGAATTTAAAGCATTTGTTAATTGTGTTCTGCGTTCAGAATGAAGGGTC
TGTATATATTTCATGGCAAAGCTTCTCAAAGCCAAATTCATGGCATTACTATTATAGCCT
GTTACATCTTCACATTTTGAACAAAATTCTTTGATCAAATTTGATAAAAGTGATAACTGA
GACATATCAGAACATATATAATCTTTTTCTGTCTTAGTTACAATAAGGTTAGCACATCTT
TCATTGCAGTAATCAGATAGTGAAGCAATCATTTTTTTTAACTTTTCTTCAATGGTTATT
AACTCATTGGTTGTCCATACTTCTTCATTATCACTTCCAGTCACATCTTCCATTTGACTA
ACTTCTACAACTAAATTTGTTAATGATAATATTCTTTTAAATAAAACAACTAAATTTGGT
GTTACTTTTTGTAAAAATAAAATACCTTCATTACACAACAACCACATGTTATCTGCATTA
GACCCTCTCAAAACAATTTCAGAGCAACCATCACGTTGACAAATAATTTCTATAACTGAT
TGTTTAATTGTAGCTTGAATTGAGGTCATTGCTTCCATCTTAAAAGTATCTATAAAGTCA
AATTCTTTGAGACGAAGGATTCCAGAAACTATTGATATTATTTTATCTTTATCAGGTATA
TCATTTTCATCAGTCTGTGGTCTATTCAAGTCACATACAATAAATCTTAAAAATTCATTA
TTTAGCATTTTATGAATTAATCTTCTCATTTCAGTTAGTTGTGGAGATAGGTGTCTAAAT
GCTTGTATACCTGTAAGCCGAGTTGACAAGACTCTCTGAGTAGAGCCTATCAAATCCAAT
GCGGCTACATAGTCTGAAGTGCTAAGTAATAGCTGTATCATAGGTTGGGTTTGCTGTACT
GTTGACATTAACTTAAGGAGTTCATGGACATTACCAAGGTTGTGGTTGATTCTGGTTAAG
CTTTTCAATTTCAGAGGACACTCAGTAAGGTTACATTTGACTTGTTTTATATTTTTTCTT
GTTTGCTGAACAGTGTGTACAGCTTTTGCCATTTGTTCCATTATAGTGTCATGTGACAGC
ATAGCATGAAAAAATGCATCTGATCTTTGTGCCACCTGTTTTGAAATGTTCATTTCTATA
ATGTCCAAATAAGTGCTTAAAGTTTCCTGTAGTGATCGTATAGCCACATTATTATCTACA
GACCCACTAAGATTTGGAAAAACTTTACTGAATACTACTGGATCATTTAGGGGCAAACCT
GGTTCATAGAATATTTCTGGAATTTCACAAACATTTTCTATGACAGTGTTTTTATTTTTC
ACAGGTAAATTTTCCTTTAATCTTAAATGTCTTCTATATCTTTTTGAAATCTTTTTACAA
TATGATTCAAAATGAGCTAAAGTTATATCTGGCAAATACGGACTAGGAAGTATATCAATT
TTTTCCACAAAGCTGTCGCCCCAAGTTTTTGTGAAGAAACTACTCTGCTTTCCTCTATTA
GGATCGTTCAATACAGCAGGAAGATTTTGAGAGGATGAATAGAATGTCCAATCTTCATTG
GGTGCCTTAGCATATGTATGATATTCTCGGATATGGTACTTAAATCCAGCTTTTCGTAGG
TCTCCAAATTGCAACGCCGAACACATTCCATTTTGTCCGTACTGACAAAGAATTATACTT
CCTTCTTTTATTGAATGTTTGTCTAGGATATGTCTTTCAAATTCTGCGGCGGTGTTGAAA
ACAAGGCTGGGACACTGATCGCAGTTTTGCCATGCTGGTTTTGTTCTTGATGATGAATTG
TCCTCCATAACATTTTTAAGTAAATTTATATTTGAAACCAAACTTTGTATGAATTTTATT
TTTATCAGACTAATTTTCAAGTTTTGTCGTTG
(4052 bp)

- SilkBase 1999-2023 -