SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR11339c1_g1_i15
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC106104179_isoform_X6_[Papilio_polytes]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005545 F 1-phosphatidylinositol binding
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0008150 P biological_process
GO:0010314 F phosphatidylinositol-5-phosphate binding
GO:0016020 C membrane
GO:0032266 F phosphatidylinositol-3-phosphate binding
GO:0061458 P reproductive system development
GO:0070273 F phosphatidylinositol-4-phosphate binding
GO:0080025 F phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding
Transcript
Level		FPKM:0.39 TPM:0.38
ORF EntryO_TrvaFAMAMG13615_complete:A_TrvaFAMAMG_TR11339c1_g1_i15
Sequence
(Nucleotide)
AACGTTTAGACGAAAGAAATATTTTATATTCTTTCGATAATCGTATCTTAGAGGCGAAAA
AATGTCACCGTCTAAATGGCGTTTTGTTGTTTAATTGTTGTTTTAAACTTGTGTTTACCT
TCACAGAGCTAGAGTCTTAAAAAAAGTTGCAGATAACAATGCGACTAGCTGCAACTGTAA
TGTGCATGTATCCTTAATAAACTAAATACGTTATAACACATAAAATACCTAAACCAATAT
TGTACAAAATACTAAAACGCATTCACCAAATATTAAGTAAACAAACATCATTTACCTTTT
GTTTTAATTTATGGCATTACTTCATGTTACTTTAGTTCCGTATTTATAACGAATATTGAA
GAATTCTATCGAAAATATAACTTTTGTATATTCGTAATCATTCAATAATCGCAATCGTAA
GTAATCTCAAAACAATCGCTTCTGAATTGTTCTTAAAGTAATATTCATATTTTGTAGTTC
TCAACAAACTATATAATGAAAGTGCTGATTTTTCAATACATAAATAATCGTAAATACAGA
ATATGTACTACATTGTATGTATTCGTGATCAAATATAATAAATTGTAACGCAACAAAACT
GCATTGATGTCGTTATTTATGTATTCACTTGCTGTTTAATCGTAATTTAAAAAAGTTAAA
TATTTTTGGCAGCCGATGCAAAAAATATTATGCATGTCAAAGTTAGTAAAAAACAGTACC
TAGGTCTTTAAATCCCTTTTTTTTAAAGAATTAAGAAACAATGTCAAACCGACTCGAACT
ATTTTTAACACTTTCCATTAATATTTTACACAGGAATAATAATTTTATGATCTGCTTGTT
GATCAAAAGTAACTATTAAGTAGATAATTCACTATCTATCATAGGAATGTCGTCATAATT
GAGCAAATATTTAGAAAATCAATTCCTTTTAAGTAAGCGCTTGACTGAAACGAGTTTTGA
AATAGTTACTGTCCAGTTGATTTAAAGTTTTTCCAATGCACCCAGATTAGCAATCACACA
CTACAACTTTTTCCTTAAAAAATTGGGTAGACTAAAAAAACTCACTAAAATTCATTAAAA
ACACTTTTCGTCATCGCTTTTTCCTAAAGAACTAGTTAAGTACTCGTTAAACAGCTCATA
GTGAAGATATAGTTACTTACTACTAATTGATCATCTACAAAGATCGATATAATTTTAAAG
CCCAGCTCGATTATATAGGTGCTAATTATAAGTTAGACTTTTAAGTCACTAATTGATATT
AATAAATGACGCGTGTTAAAATTGCACTCTCTACAATCTATGTGATTCTATCAAAAGTTT
ATACCATGTTAAACTACAAAGTATCAAGATACATAATAGACGATATTAAATTCATGTAAC
AGTTAAACATGTTAGACAAAGATTAACGAGGAATAATCTAATAATAGATTGACCTTTTCG
AAGTAATTTCGTTTTGAGGAAATGCCCCGCTTTTACGTAAAACACAATTTTGAGAAGTGG
TTTTGAGTTGTTTCATGAAGTAAGAAGATTTTTAAGAATGCCTCATACTGCATCGAAGAC
ATATCAGATCGAAGCAATCGATCAAATTCAATTTTAAATTGGTCACTTTCGAATCATTCT
TGATTAATCTTTGACTAACATCTCTTTAAATATAATCTACATTGATATAAAAATTTAGAC
TAAATCAACATTATATTCCGAATATTTTATGTGAAAAAGTTATCGCGTTGTTGATATATC
GGCAGTTCGACATCGGGTGAACGATCTTCCGCATCCTCGTCATTCTGGTTTTGTGGTAGC
TCTTCCAACGCTTTCACTGTCATAAAACACACGCTAATTTACATAAAAACACTTAAGGAT
GTACCAAATTTAACGAAAATGCAAATAAATCCAAGCAACTACAAATTTTAATAGAGACCT
ACTCACACAATGCGCAAAACGATATCATGCTGCAACGCCGCATACCAGAATTCTCCGAAG
GACCGTCCAATGTCAGCCAATTGAATTAAAAAGTATTTAGTGTAGAACAGGAGTCTCCAA
ACTACGAACAGAGAGCTGAAGCTGGTCTGATAGCCAATGCAGTATTTTTACATAGATTTG
TTTATAATGGCACAAAATTTAAATATTTGCCCTGAACTTTCTGAATTGAAGTCAATTATT
ATGGCCCTTAAAGGCTTTAAAGTTTGGAGAGCCCTAATGAAGAGTATAGTGAACTAGTGG
TTGTGAGATGTGCAATGATGTAGATAGTTATAATAGATCATGTATGTTGTGTGAGGTTAT
CAATTGTTTGAGGCGGACGGTCCTTGTTCCGAGTTGTTTCCTGCAGAAAACGGTACAAAA
CGACATCAAGCAAAACTTCGTTACATGCGTGGACACACGTGATGTTAGTCACGTCAAACT
ATTACAAGAATTACCAGTAGTGACAAATAAAAAATGTATCAGAAAGTTTGCTAACAGAAC
CAAGTGTAGCCCTTATACGATTTTAAAATTCTTTTTCTTGGTCCCCAGTTCAAAACATTG
ATGTTACTTTATACGAAAGTTAAAACATTGTTATTTGTGTAAAAGGTGAAATTCAGGAGA
ACATAAAACCGGTGTTGATATTATGAGTTAGAGGTTATTAAACCGAACCAGGGTTACAAA
GTGATTATATCGTTATGTTACGTTTTCAATTGTTTTTATTCTATTCTGACTGCAATGATT
GTTGGAATCAGTTTGTCGTGTACTTTTTTGCCCTATAGCTCAAAGCTTCAAAGCTGATTA
CAAATCTCATATGGTAATTCTTGTAAACCACACAAAATGAAAATAACAAAACAAAGTGCA
AAAATTCCAAAGAGAACAGTAAAAGGAAAAAGTAAGTAAATACGATTGTACTCTGTGGCG
TTACAGGCCGTTTAGCTCAATCACAATAACAATATTATAAGGTACATTAAATCGACATAT
GACGTGAAAAAGTTAAAGTGACGATAGAATAAGGGAGTAATCTAATTAATAAGAATACTA
ATGCTCGTTTTCATTACTGATTATTAAGCTTCATATGGGATACCTACAGGTTTTTTCCAA
AAGAGGCACGAAATTAATAAAATAAGTAAAAGAACTAAAGAGGGGAACTTGTTTTGAAGT
ATACAACTTTTTTGGTATTAATATATAAGTAACAAAGCATTATTTACTACAATTATTTGT
ATGGACCTCTATTCATATAAAAACTATCTAAAACTAGTATGACAAAGTTAAAATGAGACT
ATATTTCACATATGAAAACGAGCACAGTCTAAAAATTCAAAATAGGATTCAATTTAATAT
ACCACTACATAACAACAATAGCAACTCTCTACTGTTCTTACCGGCGATGATTTTGCTCAT
CTCTGTGACCTGTTTGGCCAATATCTGGTTCATTTGCAGCAAATGTTCGCGCTGCCTCTT
GTTATCGGGGTCCGGACTCTTTGTTTGATCAGCAGATGTGCTGGTTAGCATTTTCTTTAT
TGATTCCACCTTTTCTTGTCTTCTCTGCTGTTCTTCCGGTGACAATTCTGGGGGCTTCTC
CGGTATATATCTCTCCGGGATGACAATCTTCTGTGGCGCTGCTAGAAGCTGATCTATTGT
ATTGTCAGCTAGTTTCAACACTTGTGGAGGTAGCGCTGAACGAACGACGTCAGGAGCCGG
ACCGCCGCGGAGAGCGCGCTCCATGTCAGCATCGTCTAGAGATCTTCCTAGTTTATCTTG
ATTGTAAGGGTCTTTTGGCATTTCATTCAAAGTCTTGGCGCTCAAATGATGTGGAGCGGT
ATTATGCCTTCTTTTCTCTTTGGGCACCTGTCGTCTGTGCAATGACCCATTTTTGGGAAC
ATCCGAAGACATTTCAGTAATAATTTGCTTGGCAGCTTCACTCTTGAACATTGGAGATAA
TTCCATATTCGATCTAGTCAAACTTACGATGCTACTTGTCTTAGACATTGGATCGTTGGT
CAAAGTTCTAGAACTATCTGTGGGACTGTTTAGATATTGTGTTGAAATAGACATTGTTCT
GTCATAACCGGATCTGTCATAGCTTTTATTGTAACTGCTGCTTAGGGAAGAAATGTCACG
AGAATAATCGTAGTTTGATAAAGAAGGACTCGATACATATTTGGGACTAAGTTCTAAGTT
TTTGTCATTGGTTCGACCGTATGTTGGCGCTTGGGGTTTGTTGTAATAGTTGTCGTAAAT
GTTGGTTCTTGGCAAGGAAGCGGCTCTAGAGTAATTTGTGGGTTGGACGAGCTCTTCTTC
GAGGAATTGTTCGATGTTGGTGGTGATGTTGTTGGGCCAATCTGACATTGGCTGTAAGGA
ACGTTCTCTGTCGCGTTGTCTCCTTTCGCTTTCACGTTTGACTATGCGAACTGTTTTGAT
CTCTTGTTTTTCAACGTTTGATAAGTTTGCGAAACCGCCTTGCATATCTTCACTCTGTGG
TGACGTCACATCTAATGTAGGTACTCCAGTATCGACATATAGAGGTCTGACCATATTGTT
GGGGTCGTAATATCCTGGAGGTAGAAGTGGGCTCTCGTATTCATAATCAGAATGGCCATG
GTCGATTGTATGTCCTGTATCTAAGTTGGTTTCTTGCCATGATGATAGAGGTCGATTTTT
ACCAGGCATAGACTCTTGCGTGCTCTGCAGTGCATGAGACTGTTGTGTAAGATGTCTAAC
AGCTCTGCTTAATTCTTGTCTCTGCCTTTGCAGAGCTGACACTAGTTGTTGAACTCTTGT
CACTTCATCTTCGAGCATCGCCGTAGGATGTGCGGGAGCAGACGCCCGTCGCGCTTGGAG
AGCTCGACGTAGTTGATGCAGCTCTCGTTCCAGACGAGCGTTATCTGCTACTGTCTGTTC
GAGTTTCTTAGAATTGTGTGCCAACATCGCATGAACTCTCGCCAACTCTGCTTCCAAATC
CTCTCCAGTAGCGGCTCTTGGTCTTCCACGACCATTCATTTCATAGATGTTATTAGCTTT
CTGGCATTGCAGATTATCACGGGCACGGTTTATATTCAGACCTGATAGTATATTCTCGAT
GGTATCTTTATTGGACTTGAATCCTTGTAATATATCAGCTTCGTGCGCTAACTCTTGTTC
TAGTGACCACAGTTCTGCAACTCTTGCTCTTGCTGCCTCCGTTTCCAATGGTTTTCCTGC
AGCTACACTTTCTAGCCATCTTTGTTGTTCTAAAGCATGTTCAGCTAAAACCTTTTGCCT
CAGCCTTTGATTCCTTTCCAACCTTTCAATAGTCGAGCCTGGTCTGTTGTATAGTGATCC
TAACTTTACCATATTATCAACTAATTGCACCAGCGGTTTACTTTTCTCATACTGGTGTTC
CAGTTCCATTAACTGCATTTTGAGTTGTTCCAGTCTTTTAAGACTTTCTTCTCGTTCTGC
TGCTTTCAATGAATTCAAACATTCTATGTCATTGTTTTCAGTATTCCGTCGAATTCTTGG
ACTCACAGCCCTAATTGGCTGTTGAGAAGCTCTAGAAGGTGATCTTGTCATTGCCCATGA
ATCCTCAGTCGATAATGCATGTAAGTTTTGTTGCGATGTTGACATCTGCTGTGAGCAATA
AGGATCAGCAGACGGTTTATCTTCCACCCACCTAACCCTTGGACTCACGGCGCGTACAGG
TATGTTATTATCTCTATTATTTCTTCCGATAGAAGTATTGCTTCCGAGAAAAGCTTTCTT
TGACAATGTTTGTTGAGTGTTCGGGTTGCTGTTAGTTCCTTGGTCTACGTTATTGGCCAT
TGTCATAGAAGCTTCATCGTCAGAAGAATAGCTATTATAAGAGGCGTTCGCAAATGTCTT
GGGTTTATACTGGTCAGATCGCAACGATTGTCGACTTTGATTTAATGATCGAGCTAGCGA
TATTGTTGCTGGCGTACTCTTTCGAGTTAATGGAGATTGTAACATCCTTTGCTTCCATTC
TAACAGACGTTTCATGGATTCCTCACGCTGTTGAACTTTTTTATCACCCTCTTTTTCTGT
TGCAGAAGGCAGTCTTGCACTAGCAGATCTTATAAACCCTTCTGCATTTGGATCGTATCT
GGCGTCTTTCGTTAATGCACTAACATTAGAACCATCACTCATAACACTTCCACTTCTATT
TAAATAATCTTTTGAATTCTCTGCATTCTTCTCTTTTAGAGTCCAATTTGAGTTAATAGT
TTCAACATCCGATTTTGAATTATGACTGATATTGTCTCGATTTGTCTTATTTTGATTCAA
TTCTGGATTGTAATTGTGATTTGTAATTTGAGAATAGGCTGTGCTTAGTTGCTTTTGGGC
TAGGCCACTGGCGTATTTTGCTAAAGGGATATCAATATTACGTGGTCTCATTCCCTGTTG
CAAATACTGCACCGATTGTCTCATTTTTTCTGCATAGCTTTCTTCAGAATAATAAGTTTC
CGAACTAGGGTCATAATAAGAGTTGATATCTAGACTAGACTTAGGCCTTTGTGGTTGTCG
TGGTTGATCGCGAACTGTCCTTGTCGGCATAGATTTATTTAGCATTTCGTTCTTAGTTTC
GTATTCCAGGAAATCTGCGCTATGAGGCCTTGGCATCGGTGGTTGAATACCACTGGATTG
CATTTTTTTCTTTCTCAAAACTGATGGGCCACTAAACGATTTTTCTTGTGGTTGATGTCC
AGAACTTTGTTGTTGTTGATGACTAGATATGCTCACAGCATCTCTAGTCTGGGATGAATT
TAAAGACTTCGATGTCGCTTTACCATATTCATTTTCAACTCCATAAATACCGTAAACATC
CTCATAATCGCCAGTTTTTTCTTTGTTATAAGATGACATAGCAGTTGACCTACTGTAAAC
ATCAGGAGTCCGTCTCTCCGCCATAAGTCGCTCATTAGTAGCAGTGTTGGTTCTACCTCC
TCGAACATCTAAAGCCCCATAAATATCCCTACTATAAGAGTTTTCACCATACGTAGGTGC
TTCGTTTGTCCCAGGCTGAGCGGCTCTATTTACAGATTGTGACCGTTCTTTTTCGTTAAT
CTGGGGATTTTGATTGTGCATATCAATATTATGTGAACTACCCATTTTCGGGGTCGTATC
GTGTAAAAATGGATTTTTTTGCGGCTGTCGGTCATAAATTTGTTCGTTTTTATTGTGCTG
CTCTGGAACATTCTGCTGCTGTCCACGACTCCTATCAAAATATTGAGAATTAGTATCATT
CGTCGATGTGCTTGGTTCATTCTCTAATCTATCGGTGATCGTGTTTGTTAGAGGTAACGA
AAGATTGTGCGAGTCATATGGTCTTTTCTGGTATTTTGTGGTTCGTTGTTGCGGTGGAGA
TTGTGGACTATGTGTGTAAATGGGTTCTTGAGTTGGACTAGAATAGCTGTTGTGTTCTTG
ATTTCGAATGTGACTGGTTGTTTGACTGTAATGCGACGCCGGTTTTTTGAGTAGGTCATA
GTTGGGATCATACATGTCAGGACTTGGGGAATTAAATCCGTCGTTAGATCGCCTAGGTTT
TGGCGGTGCATTTGCGTACATTGGTATTTCTTCACCGTCCTCGACTTTCGTATTGGATAT
CTCGTTTTGATTGCGTGGATATTCATTGGATGATTGCATAAGTGCAGCCATTGTCAAAGC
CTTCACCCACTTCATCATAGCATCCTGATCTGGCGCTGCTAGTACATACGTTCTCATATT
TGCATGTTCCAATTTGAAAGCAAATTTACGAAGCACTTTATCTTCAGCTGTACAAGCAGA
TACTTTGTACGAAGGTAATAAAACAGACCCTAATAACTTTTCTTCTTCTTGACTTTTATA
GTAAAATAAACAGTATTCGGAGAGTACGAACCAACGCTTTCGCCAAACTTTCAGACCATC
GGATCCTTGTTTATATAAAATACCGGCTAGGGTTACTGGTGCAGATGGTATTCGTTGAGC
AGTAGGTGACCTCAACGCTTGAGTACCACTACTACTTCTCCGGCTATCAGAAGAGGGTGA
TTTTACACTTGGAGAACTGGAGTCACTGGTTGACTTCATTGGGGAAATGACGTTATTTTT
CTGATTTTGAGTTAGATTTGAAGGTGGTGATTTGCTTTTTCCTTTATCTCCTTCCGGTCT
TCTAGGAGGTTCCTGTTGTTCCCTGTAGTCAACTTGGTGATTGTGTTGCCATTGAGGTTC
TTGATACTGACGACTTCGATGCTCCATTTCGCGATAGTCAATGTTCTTGTCGTAATTTTC
TACCTCCTTTGGTGTATCGGGACTACTATAATCTTTAAAATCGCTTTTACTGCAATATCT
GTCAAGGTCGCGGTAAGAACTGTCGGAATATATGCTGTTCTGTAAATTAGGAGGAGGTTG
AACTCCGTGAATCTGCTGTAAAAGGAGCTGTCGTTCAGCGAATTTCTGCTGTTGATGCAT
CTGCGCCTGATTTTGATAATGTATTTGTTGTTGTAATTTCATTTGTTGAATCTCATTGTA
CTGTTTCCGTAACAGTTCTGTGTTGCTTTGTGGTCCTATTCTATTTGAATACGGTAAATA
TGGTTTTGAACCGTATTGGTTTGCATTTGGTCTATAAGCAGGTTGGTGGTTTTGATAAAT
TTGGTTTGAATCTTTCGGTGGGTTGCGTTTCAAATAATCTTGGTAAACCTCTACATTGTA
ACCTGGGGTTATATTTTGAGCAAGTGCGCTATTTACATTTTGATCTAGATAAACTTCAGG
TCGTTCTTGTCTGGGTGGCGACTGTGGGTAGTTATTATAATTATCATTTACTCCATACTG
TCTTCCATAGTCTTGGTTTTGACTATACGAACTTCCATATTGTTCGTGTCTGTTTTCTAG
TAATGGTGACCGCGCGTCTAAATTTGAATGATACTGGCTTTGTAATAACTGATGCATGAC
GCCATTCGGTTGAATCTGATCTGTTTGTGTGGGCGTGAGATGAGCTGATAGTTGTGGATG
ATGTTGCGAGTACATTCCGTTGGGGTGCACATGGTGAGCCATCAGATGTTGATGTGTGAA
AGGTTGTTGTGTAGCCGGCGCTGCCTTTTTGTTCTCCATAGCGAATTGTGATTGTGATGG
TGGAGGATCAAGCCTTCTCTGTTAACAAATCCTCTGTATCATTGGAAATTGGTGTTTCAT
TTGTCTTGACAGTTAACTCCACTATTAAAAGTTATCGAACCACTATTAAACACTTCACCA
ACACAAAAAACTTTTTGGAAATTCTATTAGTTTGGATTTTTTACTTCAAAGTCGATTTTG
TTCGCAAATTTAATATTAAATTAAAATATTACAAGTTTAATTTAAGAATTGCTTTTTAAC
TCATGTTTTTTTATCTCGAAATGTAAATAATTTACGTAAATGTTTAACACTATTATCGAG
AATCCAAA
(9368 bp)

- SilkBase 1999-2023 -