SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR11284c9_g2_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_lanC-like_protein_2_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0007186 P G protein-coupled receptor signaling pathway
GO:0008152 P metabolic process
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0016020 C membrane
GO:0017124 F SH3 domain binding
GO:0043295 F glutathione binding
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0050750 F low-density lipoprotein particle receptor binding
GO:0070062 C extracellular exosome
Transcript
Level		FPKM:5.12 TPM:5.01
ORF EntryO_TrvaFAMAMG12871_complete:A_TrvaFAMAMG_TR11284c9_g2_i1
Sequence
(Nucleotide)
CTGGGCCTGGGGTCACTTTTCAAACAAACGTGAATTTCTCTTTAATAAACGCAAAATTCC
ATAAAATAAATATGCAATTAGATACTGGATTAACCAACGATTCTACACATATGTCATATA
ATCATCATGTAATTCATACTCGTAATTAATATAGAAAAACGAAGTTGAAAATGGAAAGCG
CTATACGACGAGCATCCAGGTCGGCCACCCTAGTTTGATTAATTAAGGGAAACTTATTTC
CACCACAAGTTAAGCATCTGGGTTGTTCACCTAATTGAGAAATGTGTTTTTTTTTTCATA
ATCTGTGTTTGTTTTTGTTTTTCATAGTCTGTGTGTGTGGTCTGTGTTTTTGAACTTTTG
TGTTTTGTTTATTTTGTTACAGTGAGAGTGTGTTTAATGCTGTGGTTTAATATTTATTAG
TAAACATTAATTAACGCATAACGCTGGTACCTATTGGTTTTGATTCTAGGTTTAACCTTA
ATTGAAATAAAAAGCATAATGGCACCAGGATGTGCTTTCGATAACCAATACGATGATTAC
ACCTCAGATAAAGCTCTCAATGTTCTGGATGAATCAGGACAGCATGTTTCGCCAAAATTC
AAGCAAAAGTTAGAAATGTTTAAAGCTTCTAAATTAGAAAGTATCCAGTCACAGGAAACT
GATATATTTTACGACAATACTTTGTATATTGGGTCTGCTGGTATGGCCTTGTATTATTAT
ACAGTATCCTTAAGAAGTAATGACCCTAGTCCAATGTTGAAGGTGGCATTAAAATATATA
AACTTGGAAGGATTAAAAGGAAAAAAAATAAGTTTTATTTGTGGAGACGCTGGACCTTTA
GCTCTTGCTGCTCTCATTTCATATCGACTAGGTAGCAAGAGACCTGATCGGTTACCGGAT
TACAAGTCGATAGTAAAAAGATTGATATCTTTGGGTTCATTAGTAAATGAAGCACCCGAT
GAACTATTGTATGGAAAATCAGGATATCTTTACGCACTGTTATTTGTTAATAAGAATATT
CCAGGACAGGAAATTATTCCCGCCAAACACATTGAAATGGTCATCAATAGTATTCTAAAA
TCAGGAAAGCAATTTTCACTGCAAACAAAATCTGAGAGTCCACTACTATGGCAGTGGCAT
GACAAAATATACTTTGGAGCTGCTCACGGCATTGCTGGCATTCTGTACATACTATTGCAG
GCACGCCTGTACGTGAACATCATTGAGATCCGCAGATTTATAAAACCCACCCTCGATTGG
TTATTGAGTCAACAATTTCCTAGTGGGAATTTTCCGTCCTCGTTAAATAGCATTAATGGA
GACAAATTAATACAGTGGTGTCATGGGGCTCCCGGTTTCGTCCCACTGTGCATATTAGCC
CATCAGGTATTTGAAGATGATAAATATTTAAAAATAGCCTTGCACTGTGGTGAAGCTATT
TGGCAACGCGGGCTGTGTACGAAAGGTTACAGCCTTTGTCATGGAGTTGGAGGAAATACT
TATGCTTTCATCCAACTGTTTCAAGCTACTAAGAAACCAGTTCATCTATATAGGGCATGC
TGTTTCATGGAGTGGTGTGCGCTAGAACGACCTGGAACTGAATTACATCGACCGGACAGA
CCGTTTTCCCTTTTTGAAGGAGTTATAGGTCGCTTGTATTTGGCAGAAGAATTCACTAAC
ATTATGGACGCTAAATTTCCAGCATTTTCAATTTAAAGGGCATTTAAATCTTAATAAGAA
TGTATGTGAAAATTATAATACGACGTTCTTATTAATTAAATAGATAAAAATTAAACTGTG
TGCAAATAAAACTCGCACCTACATCATAAATCAGTTTGTAAATGGACTTCGGGAGACAAT
ACCTTTATTTTCTTGAAAGCCAGCTTTAGATTTTAAATATAACATGAATAAATATCACGG
GATTGTATATAAATTATATGTTACCTCACCATATTAGATTTCGTTATCGACCTATAATAT
TCAAGCTAATCAGGGTTCAAGTTTATCAGGGATAAACGATAAACCTTAAATTAGAATAAC
AAAAGAAAGTTTTATGTTTGTAATATTTCGTTTTGCACTTCTTATTAATTCCAACTAAAG
GAGCGCACACAGTTAGGTGGGCCACACCAACTTGAGTGATACGTTAGATCTTGACCAGTT
TCTTATTAATTTTGTATGAACTAACATACACTTTGAAGGGTAGCAATGTAACGCAATCAT
AATACATATTCAATATCAGATTCTCATATAAAATTGTTGTGACAGGATGTGTTGGCCCGC
ATAAGTGTCCGCGCTCCAGAAACTTACACCATGTAATAAATGGAGAAAATAAAACATGTC
TGTGAAACATATTAAATTTTATTGTAATATCACCCAATTAGTTTTTTTTACAATATCTTA
TATATCAAATACTATTCAAGTAAAGGTGTAATATAAAATTGCAAAATTCATTTGTCTAAA
AAATACAAAAACTTACAACTCTCACTTATATTTTTATTATTTATTTATAGTTATTTTACT
ATAGTCGACAATGTATTTAGTATACTCTATCATACAGGGTGAAAGGTAAACGATTATACA
TTCTAATGCAAAATACACAAAACGAGGTATGTACTCAATTCCCAGGAAATCCCAGAAAAA
AAAACGGTTAGGACACTACTGGCGAACTTAATAAATTCTTTACGAGTAATTAATTAATTT
AAATTTACTCGCTGACAAAATTATATTTGTAAATTGTTGCTAATAATAACCCTCAATATG
CAAAATCATTTTCCGGTCACCCTGGTTTTAATAGCTTTATTTAAAATAAGAGACATTATT
TTACGGAAGCCAAAATTCAATTACGTAATTTATAAAACACGAAGTGTGCCCGCGACTTCG
TCTGCATGACATTATTTTTATATACATGGTTACATACACAACTGAGTAAGAAATTGTACT
ACTACAAAAAAACTCTCCTAGGTCAAACTTATTATAGGTATTTATTAAGAAGAAGCTGGC
AGATGTACGAAACACGTAGCATCACATAATTTCCCCAGGTACAGTGGCAAATGCTAAAGT
AACCTCCATGTTTTTTAGCCATAGGACCCATATTTGTGACAGATGTGTTGTGATAACAAC
GTTATACTTTGCACTTGTTCATCTTTTTATTGGATGAACCAGTTTCTATAATTCTTTTTT
TCGTTGAAAGCACGCATGGAATATATCTGTCAACGGAAAATACGCACAAATATCGCTTGT
TAAGTTCCGTTAAGTTTCTACGGAACTTAACAAGTTTCGTAAGA
(3284 bp)

- SilkBase 1999-2023 -