SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR10757c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_exonuclease_mut-7_homolog_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004659 F prenyltransferase activity
GO:0004663 F Rab geranylgeranyltransferase activity
GO:0005968 C Rab-protein geranylgeranyltransferase complex
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0008318 F protein prenyltransferase activity
GO:0016740 F transferase activity
GO:0017137 F small GTPase binding
GO:0018342 P protein prenylation
GO:0018344 P protein geranylgeranylation
Transcript
Level		FPKM:6.06 TPM:5.93
ORF EntryO_TrvaFAMAMG12401_complete:A_TrvaFAMAMG_TR10757c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CTATAATCTGTGATTCCCAGTAAAATCTCGATAATATTTAATTTTGTGAGAAGTAGAAGG
ACATATATATATAAATACGAGAATTTGTTTTCGAATAAGCATACTGATAAGAAAGACAAT
GTCCTAAGCAATGTCAATAAAGTTTATTTCCAAATTATTTAAATAAACGTAAGCCTTCTG
CTTCTAAAATGTATAAAAACAGTCCGGTTAAGTTATCTTCAATGAACCAATCCGTAAAAA
TAGTTCCCTCAGTCGAGGAGTCTTTACAATCCATGGGGCTCAACATTACGTTGGATGAGC
GCAGTATAATCTGGTGGCAACAGTTACAGTTGAAATGGAAAACCTGGAAGAAAAGTGAAA
CTATAGAACTACTCATCGAAAATTATTTGCAGTCAATACCGGATCCTTTCCGAGTTACCC
TGGTATTTATAACAAAGTGTATAACTCAAGATTGTAAACCAAAAACACTGCCATACTGTT
TTGTGGAAACATTACAGAAATGGTCACAAAATAATAATACAATACCTGAAGAGCCTATCA
AGCAGCCAGCTTTCTATGTTGCAATCCAGCAGAGAAATTACAACTTTTTAAATCTTATTG
CTCAGACTTACCAGCTATCAACTATAAAACAACTAATACTGCCAAACATAAAAGAAATGA
TTAAAAATGATAATTGCAAGTTAGCCTCTCAAATTGTAATGGCTTTGGACATGAGTGAAG
ATATACCAGTTGAGGATTTATTATTTCCTTTAATATTGCAGGATAAGAATAATATAATTG
ATGAGTTTCTGACCACATGTCCAAGTCAAGTTAAACCCTTGTTATTTTTTCTAGACAATT
TATTAAACAAATCATTTAATTTACGTGACTACATACAAACTTACTTAGAAAACAATCACA
TAAGTCAAATTAGGTATGAGAAACTACATTATAAGCCTCTTGGAAAATTGGTGGCAAGAC
TTTGCAGCAAATTTAATATACCAATAGAGACTTGTAAGAATCTAAGTAAGAACAGAACAG
CTGGTGGGCTACGGTACTTGATTCACCAGAAATACACTGAGAACAACATAAGCTCTACAG
TGTGGGATGATTTAGTAAAAGATTCACTGAGACAAAATGTTGAGGCTGCCAATGATTTTA
TTGAAATGCTCTCAAAATATGATAAAAATGAAGCCTTGAAGTGGGTTGGATATTTAAAGA
TTGAAAATGATCAACTACCTAATTCATTAAAAGCAATGTCTCTTGAAAATAACCAGGAAG
CTCATGAAGAGATGTGGGATTCAGAAGTGAACAAAGAAACTCCAGCTCAAGAATGTTACA
AATTGTCTGTGGCCAGAGAACACATTGTTCTTGTTGACAATGGTGAAAAGTTTTATGATA
TGCTCAATAACATTAAAATGTATAATGTTGTCAGTATAGATTGTGAATGGAAACCTTCTT
TTGGGGCCGTCCAGTCACAAGTAGCATTGATTCAAATTGCTACCTATCACAATGTCTACC
TAATAGATACAATTGTTTTAAACAAACAAGAGTACACCAGTTTTTGGTACACCTTCAACA
AATCATTCATGGAAAATGGTGAAGTTATCAAATTAGGCTTTGGTCTTGAACAGGATCTAA
AGGAAATGAAAGCATCTATAAATGGTTTGGGTAAAATAAATGTGAAAGGAGAAGGACTGC
TGGATTTATCATTATTGTGGAGGAATGTTCTCAATAATGGTCTTGTTATATCGGGGTGTT
GTGACACCACAGGAAATGGATTAAGTTCTATTGTACAGTCTTGTTTTGGACTGCCTTTGG
AAAAGTCAGAACAGTGCTCAAACTGGGAATTAAGACCTTTAAGAGAGACTCAAATAATGT
ATGCAGCATTAGATGCATATGTTTTGTTACAAATTTTTGACTTCATACAGAAAATGTGTG
TTCAACAGAATATCAACTTTGAAGATATTATTAATGAAACAATGCATGAGACCAAAAAGA
AATTGCCTAAGAAAGCTAAAGTCATAGATAGATTGCAATTTAATCTTGGTGAAAACAAAT
TTGTTGATGATGTTAAGTTTATTGTTGTACCTAGTTTATCACATCTAATGGGATACCTTA
GGTATTGTGGAATGGATACCATAGTTATATCTGACAGTGTACAATGGCACGACGCCATAA
ACATGGCAATATCAGACAATCGCTACATATTAGTAGACAAACTAAAGTGTTCCCCAACAC
CGGACTTTCCTCAAAACTCAATATTACATGTTGGAAAGGATATTATAGTAAAACAATTGC
AAAATATATTCGAAAACTTTAATATTAAAATAAGACAAACTGATCTTTTGAGATTATGTG
TGAAATGCAATAGCAAGAACATTAAGAAATTAGATTTAGATGAAATTAAAAAAATATGTG
ATGATTACAATAATACAAGTCATAAGTATTCATCTGTTAACACATATTCTGCTGATTATG
ACGAAGATGACAGTTATGAAAATTTTCTTAGTGATTCTGAAGGAGATGGTGATATTTTAC
TGCCAGTTAAAAACCATTATTGTCCTAAAACCTGTGTTACTAGCAAAGGAGCAACTATTG
AAATAAGTAACCCACAAAAACTAGTTGAAACACACAAACTAGCAATATTATGTGAAGATT
GTGGTCAAGTGTATTGGGATGAAGATGACTTGTATAAAACTGTTAGTAATGTAATATTTC
AAATCACCAATTTTACATTTTGGTAACGATGGTACATTAACACTGTTTACAAGAATATTT
CCATGACTTGAAAAGAAATGAATCAAATATAACTAAAATCAATTTAAAATGATTGCGATT
TGAGATCCTAGTGGTAAAAGTAGAATTAAAATATTGAATTCCATGAAAATAAAAAGAGAC
TGTTGTAAGCTAAGTACTGAATATTAAGAATTACCAGCAATAACTAATAAGTGGTAGAAT
AAGTGACACAAAAAGGCTTAATATATTTTTGTACTTAAATATATTTCAACTTTGTTAATG
TTAATTAGTTTCATAATTATTATAGTTACTTAAACACACTATTGTATAATTTATTAAAGT
TTTCTTAAAAAATCTCATTCAAATAGAATCTCAAGAGTTGTAATGTAATGACTCGATGTC
AATAGACCCAAATAAAAAAATAATCATTATTGTAATTAAATAACAAATTTATTTGCCTAC
AACTGAGTTTATAATGTTTAATTTTTTTTGCTCATATATTGAAAGATATTTGCAACAATG
ATATTAGGAATACAAATTTTCATTTAACTAATCAAAAACCTGAGGGTAATCAAAGTACAA
AGCCAAAAAGTGTTTATTAGTGATATATTTCATTGTAAACTGATACATTCATTGTTCATT
ACTTATTAGCAAATAATATTGAAATTATACATTTTTTGGAATAACTCTTTTTCTTTTTTA
TCTAAATCCTCATTACCCAGTAGATTTAGTTCTTCCAAGTTCAAAACTGGGAAATTTCTC
AGTGTTGTCAGATTATTATTCTGTAATGATAATTTCTTGCAATGTTGAAGAACAATTAAA
GAAGGCAAATTCTTAGAAGTCAGCCTTTGATTGGACAAATCGACAGTATCACAGAAACTG
TAGTATTGTAAATATGGCAGACTTGTAATAGGAGTTTGGAATGTAAACTTTAAAGCTCGA
TTTTCTGCAATTCTATAATCTGCACAAAGTTGTTGTTCTATACTCCATTTTGCTATAAGA
TCGTCATAATAACCGGCCCGTAGTTTATCTATGGTTTTTAATTCGTGTAAATTTTGTATC
GACTCATTATGGTAAGCCTCTTCATCTATACAATGTAGGAAAATTGTGGTTGTCAGCATT
GTCCATTTGCTGTCAGGTTCCAATTTTAAAAGTTGCCTGCATGACTCAAGTTGATTTCGC
AACTCTTCTTTCACAGCTTCTGAATACTTTCGCTTGAAACTCACTTGATATTTACCAATG
TAAACACTATTCTTATAGGAAACACCATTTATTACTTGTATTTCCCCTTTATCAGTTTCA
TACTCTACCTTGATATTTAAATTATCCGTTATGACTGTGGAATGTTGAAATATCCATAGC
ACATCTGCAGTGTTGCCAGAACAAGAGATCCAGTCGCCATTTACGGCATTACCTTCGATA
ATCAATTTCGTTTTTGAACTAACATAATTCTTGTCAACATGTTTGCTATAGGCAAATGTT
GTTTTTGTCCGTGTTACTGTAAAATTGACTAAGTCGATTGTATTTTTCACTGCACCTAAC
AACCATCTTTGGTAAAACCAAGCGCTTGTGTCATCTGGGTCAGTGAATGCAGCATTCTGT
ACCATTTTCAACTCATGTTTGTGGTGACTGTCTTCAATTGGTCTTCCACCTTTTACATCA
GGGTACAGCTCAACAAGCATTTTACTTCTGTAGTGCCAAGCAGAATAATTGGAAAAGTTG
TCCATTAGCTTCTCAGTGGTATAGTTGAATTCATCAACTAATGATGGCTTGCATTGACTT
ACAACAAATCTTCTGTAATCCCAAGTGTGAAAATTCCTCTCATCTAACTTTAAGTATATA
TTGCACAATTCTAATTCCTTGAGCCAATCAGGGTCTTCACGAGTTAGAAGCACCCATTCT
CTTTGATGCCAGGCACAGTATGACTTTGGGTTGATTTTCAAACAATATTCAGTTAAATGC
AATTCAGCATTATACATTTCAGACATTTCTTCAAGGTGTTCACTGCTTGTCTTGAACAAA
TGTAGAATTTCCCTCCTTATGTTCCATAAAGTATAGATATCAGGATTAGAAGATAACACA
TTTCCTGTAATCTCCAGCAGTTCTTTGTCAAGAGCATTTTCTTTTCTCTTATCCTGAATC
TTTTGCATAGCATGCTTAAACAATTTAAGTTTCTCATTCCTTTCTTTTTCTTTCCTTGCC
TTTTCCTCTTCAGATGTTCTCACTTTGACTCTGCCATGCATTTTTGTATGTTAAAAGTGC
AGTTAGTGGAATACGAGATTTTAATAATATTTATGATGACTCTTTACTTTCAATGAAAAC
TTTTATGTTTAACAAAAACTAAAATAAAACAATTCCAAGTTGATAATGGTAGGTGAATCA
GCTGCAAAACAGTAATGTATTTAACAAACGATTTAATAATTTAGGTTGTCAATATAACGT
AATTTATAACTCATACAAT
(5179 bp)

- SilkBase 1999-2023 -