SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR10717c1_g1_i8
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_tight_junction_protein_ZO-1_isoform_X8_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0001825 P blastocyst formation
GO:0005515 F protein binding
GO:0005516 F calmodulin binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005911 C cell-cell junction
GO:0005912 C adherens junction
GO:0005913 C adherens junction
GO:0005921 C gap junction
GO:0005923 C bicellular tight junction
GO:0007043 P cell-cell junction assembly
GO:0007605 P sensory perception of sound
GO:0014704 C intercalated disc
GO:0016020 C membrane
GO:0016323 C basolateral plasma membrane
GO:0016324 C apical plasma membrane
GO:0016327 C apicolateral plasma membrane
GO:0019904 F protein domain specific binding
GO:0030054 C cell junction
GO:0035329 P hippo signaling
GO:0043296 C apical junction complex
GO:0045177 C apical part of cell
GO:0046581 C intercellular canaliculus
GO:0090557 P establishment of endothelial intestinal barrier
GO:1901350 P obsolete cell-cell signaling involved in cell-cell junction organization
Transcript
Level		FPKM:0.12 TPM:0.12
ORF EntryO_TrvaFAMAMG11925_complete:A_TrvaFAMAMG_TR10717c1_g1_i8
Sequence
(Nucleotide)
GGTTTATTTTTTAACCCATAACTCGAAAATTAAATTTAATTAAGTCATAATATTAAGAAA
AATGTCTACGTATTGGCTTGTGAACTTATTTCTAAAATGCTAATGAAAATTTTTATATTT
CAATTTCTTTTGAAGTATCAATTTTAATATTAAACGAGGTGGGAGATACGAATTTTAATA
ATCAAAACGAGACAATTTTATTTCGAACAATTTTCACAACAAGGATTTTAATTATACAAT
AACTTGTGGCTTAAAAGTGGTCCACTTTGACAGCTTAAAAATGCTCAATTTTGACATTTA
CTGGTGCTGTACTCTAACAGTCATTAAAAAGTGCTCCACTTTGAACGCTTAATATTCGAA
AGTGGTGCACTTTGACAGCTATAGCTCAAAAGTGGTCCACTTTGACAGCGACAGTATTCA
AAGTGGTCGTCGCAGGCAGATGTATTTGATCCCAGTCCGTGCTCAAATGTGCTTCAGTGT
CAGTCGCTTTGATAGTCAGTCCTAGTGATGGGACAGCGTTCGCGCAATGCGGTAGGCGAA
GTGTTACCGGCCTTAGGAACACAAGTCCTTGGGGGCCACACATCACTAGTGGGGAAAGCA
TCGCTTCACCTGTTTGTTGAAATGTTGTTGTATTATTTTGAAGATTTAGTGTAGATTCAT
ATTGTAATGCCGATCATAGTTCGTTCTAAAAAGTAAGTTCAAGGAAATCTTGTTTTTAAA
ACATTAACCTAACTCCTTCAATTTAGTATGTATTTGTGTTTCTTAAATCGATTCCTGATT
CACAATTATTATAAAAATAAAGAATTAGCAGTACGAGAAGTATACCATGATAACTGAACA
GAAATTAGATTGGCATTACAACATGAATCTACCAATAAAAGTGCTATAAATTTGGATAAA
CATGGTGTAGATTTAGAATTTAGATGTGAAAGACAAAACTGAACACACAAACACACATCG
CGACACGTTACGCGGATTAACACATAGAAAGCAAGCAAACACAGACGGTAAACATACATG
CAAATAAAAATATTAATTTATTAGTCATTGAATAAAATGCAGGCAATAAGCTTATGAAAA
ACACAAAATAATTTATAGAGTGGATTTTTAACCTTGTCCAAATAAAAGTTTAACGTATGT
CAAAAAGTAGTTCTAAGTTGTATTTAGATAGATCATTTATCCCAATTCTGCTTGCACAAG
ATTAAAAATCAACACAGTATGATTATGAAAGGCAAAAACATGTGAGTCTATTCTGTCCCG
CAAATAGTACCTTTTTAAAAAAGAAGTAACCAAACCAAATCTGAAAAAAGAACAAAATAA
TTATGGCCCAGACAACTCTTCTCTTAGGTTATGCTAAAGATAATATTTAAAACAGCAGAG
CTTTATCTCTTGTCTGTGGTTGTCAAATTTACCAATAGATGGCACCACTAGACGAACGTC
AATTGGTTGAAGTATTAGGGTTGTCGAATCAAGTTAAAATGAAAAATATTTTCCAACTAA
GCAAGCCTTTTATTACATCTCAATATTCGTTATTTCATAGAATACTAGCTGATGCGTGTA
ACTTCAAATTTCATTGCATAGTTTTGAAAATTTAATAGGGACAGAGAAAGCGACTTAGTT
GTATACTATGTAGTAATTTAAGACTTCTAGATAAAAGAGTATATATATCATATTTGCGGG
ACACAATACGATGAAAATATTATAAAGTAATATATGGTGCACAGATAAATAATATTATAA
TTAGTAAACATACGATTATTTGGTTAGTTGTAGGTAATATAATCGTTGACGGCTTCTCTC
GTCGATCTCTAAGTACGAATGTAAGTGGTAGTAACGTTATCCATGTCGATGGGTGGTCCC
CCTACGCGCTGACTCAGTCGTGGATCTGACACCGTAAAGTAGATCTTTTGCTTGATGCCG
GGAGCTATGGCCTTGGGAGGAATTATGAGGGACACACCCCATTGTCTATCTTCCAATACG
CCTCCTTCGCTGTCAAATATTCCCCAAGTTGTATGCGGGCCTTCTGGTTCAATATCTTGG
GATTTGTTGCCAGATTCAGTGCTTTCTGAGAGAGTTGTTTGTATCACTGTGTTTTGGTTG
TTTATGATTGTCGTCTCGTTCTGACTATTAGACATGTTTTGTGAATTCTCCTGGCTCGTT
TCAGGACTTTTTTCAGCAATCTTTTCACAGAATGTAACAGTTTTGTTTTGTTTGGAAGAT
TGGTCTGGTAAGTCTTGTGATGTATACGGTGTGCTTTGTGGTTTATTTTCAAAGTTCATA
CTGCATTCGGAGGCATAATGCGTCTCCATAGAGGTAGTTGATTCATAAGGGGTTGGTGAT
GTGGTAACTTTTAATGCATTAGAAATATGATCGGCTTTCCCATGTAACCGAGGAGCATAC
ATAGCTTCCCCTTTTAATACATTCGCTTCTAAATTCAATGATTTTTCTTTCTCAGCATCG
GTTTTAGACTCCGTGAGTCTTAATTTTGAGAAGTCAATCTCTTGGAATGTATCTTTCTTT
AATCCGGTTTCCGCTTCATCCTTTGTTTGATAGATTGGTTCTCGTCGTGATAAGTGATTT
GCATCGCTTAGTTCATAAGGACTGCTTCTATTACTCGAGTCCTGAACTTCAATTTGAGTT
TCTTTAGTTTCGTGGTGAGATTCATAAATAACACTATCTTTTAGTTCTCTCTTTGAGACA
TACAATGGTTCTCTTATTTTAGCTGAATCACTTTCACATGCTTCTTTCCTTGTTTGATAA
ATCATGTCTTTTTTAGCTTGATTTCTTTGCTTTATAATTTCCAATTTCTCTTCTAATTTT
ATGCTATAGGTAGAGTCTTTATTTGCTAGCAATGCTGCTTTCTGTGACATAATTTCTTGC
TTTGTTACATAAGTGCACTCTGCAGAGGCTGGTCTAATGTCATTTTTGTAATCAAACACC
TCATTCCTACAGTTGTACTGACTATCAGAACAGCTAGATTTTACATCAGAGTGTGTACTA
TATGGAGAGTCTGTCTGTCCAATTCTAGACATCATTTCTGATCTGGTTGCATACGGAGGC
TCACTCATACATTTACTCATAGGTGTTATCCTCCCAGACCAAGTTACTGGAGCCTGGTAT
CTTCTATCGGGTCTGACAGCGTAAGGACTTTCAGACCACGATGTGCTAGGTGGTGGTTCA
TAAGTTCTTTTGCCATATATGGGTTCTTTAGCACAAGTGTTGTCCAATCTTTGTTTAAGA
AGTTCCTCTTTAGTGTTGTAAGGAGATTCGGAGAATCTTTGCCGTAGCATTTCTTCTTTC
GTTGCGTATGCACTCTCAGGTTTTAGGATTTGATCTCTGCTTGCATATGGAGGTTCATGA
GTGAGATACTCTGATTGTTTAAGTATTTCCTGCTTATTAGCATAAGGACTTTCAGTCATT
ATTTCACTTCGTGTTGCGTAAGGATTTTCTCGAAGACATTCAGATTTAGTGGCGTATGGA
GGATCCATGAGTGGCATCGGTAATGTTGGTCGACTTCCGTAAGGACTTTCAAAGCTTTGA
TTCGACATTTCTGATCGACTCGCATAAGGATTTTCGGATGACGTATCATATTGGGAAGTG
TAAGTTCTCCTCGGTTTCGGGATAGGATCATAAACGAGATCTTTACTTTGGTAAACTGGT
TCTGGAGGTAGTGGTTGAGTTGGGTAAAATGGTTCATGTTTTATTTGTTGCTGTCTTTGG
TAAATGGGATCTATTTTGGTGATCATATTGAAATTACTGGTTTGTCCGTATATTCCTCTC
CTGTTGTATTCTATTAGAGAGTTTTGTCTACGCAGTAAAGGCGTGACTTTCGGTTCAGTT
TCGATATCGCACATTGAATTCTGTCGTCTGAGGCTTTTGACGACGGGTTTAGCGTCATAA
TCGCGTATGGTACAGATCGAGCCGTTTCGATCGTCGCAAAAAGAGCTTTGTCTTTTGAGG
ATCGGTTTCAGGACAGGTTTTTCACAAGAGGACGAGTTGCTTCGCTGCAACATTTGGTTT
CTGATCTGTGTGTTCCTCATGTGCGTACTAAGATCGCTTAGATCAGATTTCTCGCGTCTA
AGCATAGTCACTTGTGGGCTCTGATGTCTCTGTTGGAGATCGCTTTCACATAGCGATTTT
TGACGAGAGACTTTCTGTGAGGTTTTCGTTTTCGAACGGAATAAATCGAGGACGGCGTTT
TTAATGAACGATGGCTTTTTGGATAATTTCTTTTTAGTTTTTGGTGAGAATGTTTCGTCG
CGCTCCACGCTCGAGTTCAAGACATCGGATGAACTCAGATTATGCATGTGTTGAGGCTTC
CTGTATAATTCGAAAGCCGAACCGCGTTGTTCTCTGCTTCCTGCTAAATCAATGAGGTGT
GGGTTGTGGGGCAGGTTGATCCCGCGGTGGTGGGAGGGGGGTCCGGAGTAGGGCGGTGAT
TGAGGCGGTATTTGACCACCGTACATGTTTTGCTGTGTGTAGTTGTGCGGTCGATGGGAT
GGTTGTGACAGCGAGTGTTGGTGAGAGTAAGGCGCTCGTCCCGGAGACCCCGCGCGACCA
CCGCCTTCCATGTTAGTTCCATTCCTATTATGTGGGTTGTTGTCCGGCGGTCGGTAGTGT
TTAGGTTTGGGAGGGGGCACGGGCTTGTAGGGGGGCACGGGGCCCGCGGTCCGCTGACTG
TAGTCCGCCTGGGAAGCCGAGTTTGTTCGGCTGCTATATTTAGCATGATCATTGGTGGGT
ACGTTTGGTAGCGACGGTCCTCTGGCGTGCATGGGCGCGTGCGGACTGTGACCGTTCATG
GGCGGGGGACGGTTCTGCTGAGGACTTCTGTATTCTGGAGGCCTGCTGTAATTGTTGTCA
GGGCCTCTGTAGTCGAGTGAGGTGTGTTCGTGTGAGTTGGAGTTCCGCTGCGGAGTGTGC
GGGGACATCGCCGCGGGGTTCGGGGGAGGGGGCGGCTCTAGTTTAACGGAAGGCGGTGGT
GCCACCTTGAGGTCATCCGGTGCATTAGGGGGCAGTCGGGTCCCGTTGCCGTTGTTACAC
GAGTACTCGTATGAAGGCGTGCCATCGTACGAATTGGCCGGATTATTGAGATGTCTATGC
CTATCCAGAGAGCCTTGAGTGGGTTGTATGATCATGCTGGTCGGTCGAGCTGTGTATGTA
GAGTTCTCATCGCTGGACTCTTTTGGAGGACCGAATAGACGTTCCTGAGCGCTTGGACGG
GAGTTCGGTGGATTATGTCTAAGTGTATGCGGCGGTCGTCCCGGCGGAGGGGCCGGTAGT
AGCACGCCTCCCGGGGGCCGGGGCACGGGGCCTCCTCGAGGGGGCAACTCTGGAACTGTT
CCATAGAGAGGTGAATGCGGCGGCGAATGCGTCATAGGACTGCACTGGTAGGGCGGAGCT
TCGTTACCCATGTTGTGGTTCACTTGGTGATTTTGACTGTTCTGACCGTTACCATTCGCT
GCGAAACCGTACTTGCTGTCACCGTAACCAGTTTGCGTGTATGGAGGCGGGACTGCTTCG
TTGATATGATTGATGTCTTCATCGCGATCCATATTGTCCTGCGTCGTGGCTATAGAAGGA
TCCGATGAAGACTTGACTAATCTCGGCGCTGGTGGTGGACTCACTTCCAAGTCACTCTCA
GGACTTGAAGCGTAAGAGAGTCTGTTCTCTGTGCTCGACGACATTGAAAACAAAAAGTCG
TCGGAGAGAGGCTCCGGTCGCTGTTTGCCGCCATTTTGTGTCAGCGTCCGATAGGGTGGG
TTATGGAATGGGGTGAAAACAATGAATGATCGCGTTTAAACACATCACAAAAACAAAACA
AGAATTTAGCGTATTGTGGATGATTAATGGATTTCAATTTATACACACTTTGATCAACGG
TGAAGTCAATTAAAGAACCAAAAAAGTTTTAGTTAGGTAGGTAGGAAAATCTTTATCAAA
GACAATTTTCACTTCAACGATGATCAAAAAAAAGGAGTGGATTTGTACACTGGTAACTAA
ATGATTAAATTCACAAAATAATCACACATAAAAACAAAAACACATCTTATGTCCCAAAAA
AATGTCAATAGAAGCAAAAGCGCAAGCTAAATAAAATACATAAAATAATAATAGTCAACA
ATATTACTTTGTAAGTGTTAAGTTATTTAATTGTGTACAGATATTGAAGTTAGTTGTGCA
AAAAGACACGAAGAAATCTAAACGTAGCCTAAGTGTTGTTCTGAAATAGGTTTACCAATA
GTCACTACGTCTTTTTCTGCCTCAGATCTGTCGTCTTTGTCATCTTTTTCCAACTCTTCA
ATCTTAAGAGTAGGCAAAGACAGATTTCTAACTTTGTTCAAAGATCTTTCAGAGACAGTG
GGAAGAGTCCTAACTTCGCTAAGCCTCCCATAATTGAGAATTGGTTTGGCCCCACACTTG
CAATTTGGGATCCTACATATCTGCCTAACAGGTTTATCTATGCTTTTGTATGGTTGAGGC
ATTTCTTTTTGAAGCCTTGCTTTCCACTCAGGAATGTCGTTCGACTTCTCATTATCAGTT
ATGAAGAATGACGCTGGTCTGTACTGATCTGACATACTTGGAACAACTGATGACGGCCTT
TGCAGATTGAAGATTGTGGGTTTATTCCCAGTTTCTAAAACACTGTAAGGCCTAAATGCT
TGTGGTTGGATTATATTGGTCTTGGCGTAAATTGGAGAATCAGGACTCGCATTTAAAGAC
GACTTTAGTCTAGGAGTAGATCTCTGTCTATCATTATAAGGGTAAGTGGCCATAGTGTGC
CTGTTTTTATTCGGCATGCTGTAAACGTTGTTAGGCATGCAAGGGGTTAAAGTTTCAGCG
TAATAATAAGGCACTAAGTGATTTCTGTTAGCGTCATACAAATGGTCGTGTTTTGTGTTA
GTGAAGGGTAAACTATGTGGTGAACTTATGGGGCGGTTAGGGGATTGTTGGTACGTGTTA
ATGGGATGGGATATGGGGTAGAATGCGGGGTAGGGGGACGGAGGGATCGGGAAGTATATG
TCCGACACCATTTCAATGTGCTTGGTCTCAGAAACCCAGAGCTGTTGTTGTTGAGTCCTC
TGTATGAGTTCAACGAGTTTGTTAAACCACGTGTTGTGGTTCGCCTCGCTCAGTGTGATA
GCGTGAGTGAACACGTGACCCCACACACGCTCCATGTGCTGACATTGTTCTAGCAACTTC
TTGGACGATTTGTGGGCCGATTTAGGCAATCCAGATCTGAGCTGCTTTATAATATGCTTG
TTATCAGCCTTCAAGAATATAACAATAGGATAGAACTGGGCATAGTTGAGTCTATCCACA
GCGTTCGGTGTGATATCTAATAAGGCGTGCTTGCCTCTCTCCATAATGTTCCTTATACTA
GATAATCTTATAATACCGGCTGATTTTGTTTTACTATCTTCTAGGGAACTGTCCATTTTA
GGCGATGCGAATCTATCTGGGTGCTCAGTGAGGAGACGTGGGTGCGCTATGTCGGACACA
GCGCCAAGTACAATAACCGGGCGCACGAAGCCAGGCTGTTTGAGCACGACACGTTCATAC
GCGGGGAACTTGCTTATGCTGTCTGATAGTACTACCTCGTCCCAGTGCTCCTTTCCTAAA
CTCTTGCTCCGTCGATGCGTGGATCTTCTCCTTCTGAAGAAGTTGCTCTTCCCATCGTTT
CCTGACATCTCTTTCTTGGTCGCGTTGAATTGAGCTGTTGCTAATTCTTCGGCGCGAGCT
TTGTTGGGTATCGTGCCTTTTTGTACCTCTTGGTTATTACGACCTATCCGATAAACCTGC
CAAGCTCCAACAGTACCATTATGTAACGTATCAACCACATGAAATACATCGCCACAACGG
AACGACATCTCTCCGTCCGTGGGCTCCGTGTAGTGGAAATGAGTTTTTATGTGGAATGAA
TCGCCCGGCATTTGTCCACTTGCAACTGCATTATATTCTTCGGGCGAATGTTGTACGATC
AAATCTATTCTGTCCTGTAAGCTGAGTAGAAACAATACTGCTTCTTCACGAGTCACTCCT
TTCATTTCCATATCGTTTACCTTTAATATTTTATCAGCCGGTTGTAACCCCTGCAATGCG
GCAGGGCTGGTCGGTTGTACTCCCGATACGAAAACTCCTGAACGATTCCCGCCACACAAC
CTTAATCCCACGGAACCTTCCTTTTGAAAACTTATTAATCTTGGTTCACTTGGCGGTTTA
TTCCTTTGATTCATCGCATCTTCTTCGTACAACTGTCTTCTACTGCTGTAGTAATCGTCG
TTCCTAGGGGGCGGTGGTCTCGGCGGCTCGGCCTCGTGCGACATGGGTCCTCGCCTCGCG
TCTATAGAGCCGCCCCTCACTGGCGCTGCCACGTACAGGTTCTGTCCGCTGCTGGAGTAC
GCCGAGGATAGAGGCTCTGAACCGGGGTATACGTTGTGGGATGGAGCATCTAAACTGCTA
TAATTGTTCTGGTAATTTCCATTAGTAACAGTCTCTTCCCTAATCAGTTCTCTTGTCACG
ACAAGGTTCAGTCGATCTTTGCAAGATTCCACAAGTTTCTTAGCTTCCTTAAGTGTCATA
ACGTCAGTTACTGGAGTATTGTTAATTCTGGTTATCACATCGCCCTCGCAAAGACCTTGC
CCTGTTTGGTTTAGCTGTTCTCTCGCCCTCATAGTTAATTCTTTTATGTACAATTTACAT
CCTAGGACGATTCCGAAATCTTCTTTCTTCCCATTCCTAGAGAGTGCTAGTTTAATAGTA
GTAGGAGCTGTAGGAGGTGGAGCTGGGGCTCTTCGTCTCACTACCAATGACACTGTGGCT
CCTGAATCCCGTAACACTTGCACGGCTCTGGCGTATTCAACGTTCTCAAGGGAAACGCCA
TTTACTGATACTATCCTGTCGTTTACTTGCAGTTTATCTTCAGCGGGTCCTCCTCGGAGT
ACATCAGACACTGCTATAGAAGGATCTCCACTCGCAAAGTGTGGATTGTCCCTGCCCCCA
GACACGGCGATGCCAAAACCGTACCCCTGCACCCTGTTTAAACGCACTCGATGTGTTTCC
CATCCTGTGCTGCGTTCTGCGGTCTGCAATTTTTCAAATCCATAATTGTCTAATTTCATC
GTGTCCAAATATTTTAAATCACTTCACAAAACACGAACACGTTTTAAAAATTTAAATTCC
CGCGTTAAATCAACATTCTAAATTCTTTTTTTTTCACTAAGGAGGCACAAGTTTCGTACA
AGGAGTTTTATTATATTCACAACGAAGTTACGTATGCGTGTCACCTATGAAGCCGCG
(9297 bp)

- SilkBase 1999-2023 -