SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR10717c1_g1_i4
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_tight_junction_protein_ZO-1_isoform_X8_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0001825 P blastocyst formation
GO:0005515 F protein binding
GO:0005516 F calmodulin binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005911 C cell-cell junction
GO:0005912 C adherens junction
GO:0005913 C adherens junction
GO:0005921 C gap junction
GO:0005923 C bicellular tight junction
GO:0007043 P cell-cell junction assembly
GO:0007605 P sensory perception of sound
GO:0014704 C intercalated disc
GO:0016020 C membrane
GO:0016323 C basolateral plasma membrane
GO:0016324 C apical plasma membrane
GO:0016327 C apicolateral plasma membrane
GO:0019904 F protein domain specific binding
GO:0030054 C cell junction
GO:0035329 P hippo signaling
GO:0043296 C apical junction complex
GO:0045177 C apical part of cell
GO:0046581 C intercellular canaliculus
GO:0090557 P establishment of endothelial intestinal barrier
GO:1901350 P obsolete cell-cell signaling involved in cell-cell junction organization
Transcript
Level
FPKM:1.29 TPM:1.26
ORF EntryO_TrvaFAMAMG11912_complete:A_TrvaFAMAMG_TR10717c1_g1_i4
Sequence
(Nucleotide)
GGTTTATTTTTTAACCCATAACTCGAAAATTAAATTTAATTAAGTCATAATATTAAGAAA
AATGTCTACGTATTGGCTTGTGAACTTATTTCTAAAATGCTAATGAAAATTTTTATATTT
CAATTTCTTTTGAAGTATCAATTTTAATATTAAACGAGGTGGGAGATACGAATTTTAATA
ATCAAAACGAGACAATTTTATTTCGAACAATTTTCACAACAAGGATTTTAATTATACAAT
AACTTGTGGCTTAAAAGTGGTCCACTTTGACAGCTTAAAAATGCTCAATTTTGACATTTA
CTGGTGCTGTACTCTAACAGTCATTAAAAAGTGCTCCACTTTGAACGCTTAATATTCGAA
AGTGGTGCACTTTGACAGCTATAGCTCAAAAGTGGTCCACTTTGACAGCGACAGTATTCA
AAGTGGTCGTCGCAGGCAGATGTATTTGATCCCAGTCCGTGCTCAAATGTGCTTCAGTGT
CAGTCGCTTTGATAGTCAGTCCTAGTGATGGGACAGCGTTCGCGCAATGCGGTAGGCGAA
GTGTTACCGGCCTTAGGAACACAAGTCCTTGGGGGCCACACATCACTAGTGGGGAAAGCA
TCGCTTCACCTGTTTGTTGAAATGTTGTTGTATTATTTTGAAGATTTAGTGTAGATTCAT
ATTGTAATGCCGATCATAGTTCGTTCTAAAAAGTAAGTTCAAGGAAATCTTGTTTTTAAA
ACATTAACCTAACTCCTTCAATTTAGTATGTATTTGTGTTTCTTAAATCGATTCCTGATT
CACAATTATTATAAAAATAAAGAATTAGCAGTACGAGAAGTATACCATGATAACTGAACA
GAAATTAGATTGGCATTACAACATGAATCTACCAATAAAAGTGCTATAAATTTGGATAAA
CATGGTGTAGATTTAGAATTTAGATGTGAAAGACAAAACTGAACACACAAACACACATCG
CGACACGTTACGCGGATTAACACATAGAAAGCAAGCAAACACAGACGGTAAACATACATG
CAAATAAAAATATTAATTTATTAGTCATTGAATAAAATGCAGGCAATAAGCTTATGAAAA
ACACAAAATAATTTATAGAGTGGATTTTTAACCTTGTCCAAATAAAAGTTTAACGTATGT
CAAAAAGTAGTTCTAAGTTGTATTTAGATAGATCATTTATCCCAATTCTGCTTGCACAAG
ATTAAAAATCAACACAGTATGATTATGAAAGGCAAAAACATGTGAGTCTATTCTGTCCCG
CAAATAGTACCTTTTTAAAAAAGAAGTAACCAAACCAAATCTGAAAAAAGAACAAAATAA
TTATGGCCCAGACAACTCTTCTCTTAGGTTATGCTAAAGATAATATTTAAAACAGCAGAG
CTTTATCTCTTGTCTGTGGTTGTCAAATTTACCAATAGATGGCACCACTAGACGAACGTC
AATTGGTTGAAGTATTAGGGTTGTCGAATCAAGTTAAAATGAAAAATATTTTCCAACTAA
GCAAGCCTTTTATTACATCTCAATATTCGTTATTTCATAGAATACTAGCTGATGCGTGTA
ACTTCAAATTTCATTGCATAGTTTTGAAAATTTAATAGGGACAGAGAAAGCGACTTAGTT
GTATACTATGTAGTAATTTAAGACTTCTAGATAAAAGAGTATATATATCATATTTGCGGG
ACACAATACGATGAAAATATTATAAAGTAATATATGGTGCACAGATAAATAATATTATAA
TTAGTAAACATACGATTATTTGGTTAGTTGTAGGTAATATAATCGTTGACGGCTTCTCTC
GTCGATCTCTAAGTACGAATGTAAGTGGTAGTAACTGCAATAAATATAATGTTAGTTATA
AAAATAAACATAGTATAATGTTATACAAAAATATATGACATAAATGTGTGATTTAAATGT
ACAAGTGCCATGTGAGCATATAAAAATAATTAGATTTAAAAGTATAATTGTAATGTTGTG
TAAAATAGTAGTATTAGTAATAGATGTATAAAAGTTGTCATGCCACGATCCATGCAATAA
ATACATTTTAAACCAACGTTCCAGAACGATCTATACAAGAATTGCGTCATAAATCTCAGT
GTATAAATATTTCTCGCAATGCCCAATGCTTTCAAAAATCCATTCTCACACAATAAGGCC
AATTAGTAGGTGCAGTCTACTGCTACAGTTTTATTTTGCGTGCTTATATAAAGCTTTACC
GTTATCCATGTCGATGGGTGGTCCCCCTACGCGCTGACTCAGTCGTGGATCTGACACCGT
AAAGTAGATCTTTTGCTTGATGCCGGGAGCTATGGCCTTGGGAGGAATTATGAGGGACAC
ACCCCATTGTCTATCTTCCAATACGCCTCCTTCGCTGTCAAATATTCCCCAAGTTGTATG
CGGGCCTTCTGGTTCAATATCTTGGGATTTGTTGCCAGATTCAGTGCTTTCTGAGAGAGT
TGTTTGTATCACTGTGTTTTGGTTGTTTATGATTGTCGTCTCGTTCTGACTATTAGACAT
GTTTTGTGAATTCTCCTGGCTCGTTTCAGGACTTTTTTCAGCAATCTTTTCACAGAATGT
AACAGTTTTGTTTTGTTTGGAAGATTGGTCTGGTAAGTCTTGTGATGTATACGGTGTGCT
TTGTGGTTTATTTTCAAAGTTCATACTGCATTCGGAGGCATAATGCGTCTCCATAGAGGT
AGTTGATTCATAAGGGGTTGGTGATGTGGTAACTTTTAATGCATTAGAAATATGATCGGC
TTTCCCATGTAACCGAGGAGCATACATAGCTTCCCCTTTTAATACATTCGCTTCTAAATT
CAATGATTTTTCTTTCTCAGCATCGGTTTTAGACTCCGTGAGTCTTAATTTTGAGAAGTC
AATCTCTTGGAATGTATCTTTCTTTAATCCGGTTTCCGCTTCATCCTTTGTTTGATAGAT
TGGTTCTCGTCGTGATAAGTGATTTGCATCGCTTAGTTCATAAGGACTGCTTCTATTACT
CGAGTCCTGAACTTCAATTTGAGTTTCTTTAGTTTCGTGGTGAGATTCATAAATAACACT
ATCTTTTAGTTCTCTCTTTGAGACATACAATGGTTCTCTTATTTTAGCTGAATCACTTTC
ACATGCTTCTTTCCTTGTTTGATAAATCATGTCTTTTTTAGCTTGATTTCTTTGCTTTAT
AATTTCCAATTTCTCTTCTAATTTTATGCTATAGGTAGAGTCTTTATTTGCTAGCAATGC
TGCTTTCTGTGACATAATTTCTTGCTTTGTTACATAAGTGCACTCTGCAGAGGCTGGTCT
AATGTCATTTTTGTAATCAAACACCTCATTCCTACAGTTGTACTGACTATCAGAACAGCT
AGATTTTACATCAGAGTGTGTACTATATGGAGAGTCTGTCTGTCCAATTCTAGACATCAT
TTCTGATCTGGTTGCATACGGAGGCTCACTCATACATTTACTCATAGGTGTTATCCTCCC
AGACCAAGTTACTGGAGCCTGGTATCTTCTATCGGGTCTGACAGCGTAAGGACTTTCAGA
CCACGATGTGCTAGGTGGTGGTTCATAAGTTCTTTTGCCATATATGGGTTCTTTAGCACA
AGTGTTGTCCAATCTTTGTTTAAGAAGTTCCTCTTTAGTGTTGTAAGGAGATTCGGAGAA
TCTTTGCCGTAGCATTTCTTCTTTCGTTGCGTATGCACTCTCAGGTTTTAGGATTTGATC
TCTGCTTGCATATGGAGGTTCATGAGTGAGATACTCTGATTGTTTAAGTATTTCCTGCTT
ATTAGCATAAGGACTTTCAGTCATTATTTCACTTCGTGTTGCGTAAGGATTTTCTCGAAG
ACATTCAGATTTAGTGGCGTATGGAGGATCCATGAGTGGCATCGGTAATGTTGGTCGACT
TCCGTAAGGACTTTCAAAGCTTTGATTCGACATTTCTGATCGACTCGCATAAGGATTTTC
GGATGACGTATCATATTGGGAAGTGTAAGTTCTCCTCGGTTTCGGGATAGGATCATAAAC
GAGATCTTTACTTTGGTAAACTGGTTCTGGAGGTAGTGGTTGAGTTGGGTAAAATGGTTC
ATGTTTTATTTGTTGCTGTCTTTGGTAAATGGGATCTATTTTGGTGATCATATTGAAATT
ACTGGTTTGTCCGTATATTCCTCTCCTGTTGTATTCTATTAGAGAGTTTTGTCTACGCAG
TAAAGGCGTGACTTTCGGTTCAGTTTCGATATCGCACATTGAATTCTGTCGTCTGAGGCT
TTTGACGACGGGTTTAGCGTCATAATCGCGTATGGTACAGATCGAGCCGTTTCGATCGTC
GCAAAAAGAGCTTTGTCTTTTGAGGATCGGTTTCAGGACAGGTTTTTCACAAGAGGACGA
GTTGCTTCGCTGCAACATTTGGTTTCTGATCTGTGTGTTCCTCATGTGCGTACTAAGATC
GCTTAGATCAGATTTCTCGCGTCTAAGCATAGTCACTTGTGGGCTCTGATGTCTCTGTTG
GAGATCGCTTTCACATAGCGATTTTTGACGAGAGACTTTCTGTGAGGTTTTCGTTTTCGA
ACGGAATAAATCGAGGACGGCGTTTTTAATGAACGATGGCTTTTTGGATAATTTCTTTTT
AGTTTTTGGTGAGAATGTTTCGTCGCGCTCCACGCTCGAGTTCAAGACATCGGATGAACT
CAGATTATGCATGTGTTGAGGCTTCCTGTATAATTCGAAAGCCGAACCGCGTTGTTCTCT
GCTTCCTGCTAAATCAATGAGGTGTGGGTTGTGGGGCAGGTTGATCCCGCGGTGGTGGGA
GGGGGGTCCGGAGTAGGGCGGTGATTGAGGCGGTATTTGACCACCGTACATGTTTTGTCC
ATTCCTATTATGTGGGTTGTTGTCCGGCGGTCGGTAGTGTTTAGGTTTGGGAGGGGGCAC
GGGCTTGTAGGGGGGCACGGGGCCCGCGGTCCGCTGACTGTAGTCCGCCTGGGAAGCCGA
GTTTGTTCGGCTGCTATATTTAGCATGATCATTGGTGGGTACGTTTGGTAGCGACGGTCC
TCTGGCGTGCATGGGCGCGTGCGGACTGTGACCGTTCATGGGCGGGGGACGGTTCTGCTG
AGGACTTCTGTATTCTGGAGGCCTGCTGTAATTGTTGTCAGGGCCTCTGTAGTCGAGTGA
GGTGTGTTCGTGTGAGTTGGAGTTCCGCTGCGGAGTGTGCGGGGACATCGCCGCGGGGTT
CGGGGGAGGGGGCGGCTCTAGTTTAACGGAAGGCGGTGGTGCCACCTTGAGGTCATCCGG
TGCATTAGGGGGCAGTCGGGTCCCGTTGCCGTTGTTACACGAGTACTCGTATGAAGGCGT
GCCATCGTACGAATTGGCCGGATTATTGAGATGTCTATGCCTATCCAGAGAGCCTTGAGT
GGGTTGTATGATCATGCTGGTCGGTCGAGCTGTGTATGTAGAGTTCTCATCGCTGGACTC
TTTTGGAGGACCGAATAGACGTTCCTGAGCGCTTGGACGGGAGTTCGGTGGATTATGTCT
AAGTGTATGCGGCGGTCGTCCCGGCGGAGGGGCCGGTAGTAGCACGCCTCCCGGGGGCCG
GGGCACGGGGCCTCCTCGAGGGGGCAACTCTGGAACTGTTCCATAGAGAGGTGAATGCGG
CGGCGAATGCGTCATAGGACTGCACTGGTAGGGCGGAGCTTCGTTACCCATGTTGTGGTT
CACTTGGTGATTTTGACTGTTCTGACCGTTACCATTCGCTGCGAAACCGTACTTGCTGTC
ACCGTAACCAGTTTGCGTGTATGGAGGCGGGACTGCTTCGTTGATATGATTGATGTCTTC
ATCGCGATCCATATTGTCCTGCGTCGTGGCTATAGAAGGATCCGATGAAGACTTGACTAA
TCTCGGCGCTGGTGGTGGACTCACTTCCAAGTCACTCTCAGGACTTGAAGCGTAAGAGAG
TCTGTTCTCTGTGCTCGACGACATTGAAAACAAAAAGTCGTCGGAGAGAGGCTCCGGTCG
CTGTTTGCCGCCATTTTGTGTCAGCGTCCGATAGGGTGGGTTATGGAATGGGGTGAAAAC
AATGAATGATCGCGTTTAAACACATCACAAAAACAAAACAAGAATTTAGCGTATTGTGGA
TGATTAATGGATTTCAATTTATACACACTTTGATCAACGGTGAAGTCAATTAAAGAACCA
AAAAAGTTTTAGTTAGGTAGGTAGGAAAATCTTTATCAAAGACAATTTTCACTTCAACGA
TGATCAAAAAAAAGGAGTGGATTTGTACACTGGTAACTAAATGATTAAATTCACAAAATA
ATCACACATAAAAACAAAAACACATCTTATGTCCCAAAAAAATGTCAATAGAAGCAAAAG
CGCAAGCTAAATAAAATACATAAAATAATAATAGTCAACAATATTACTTTGTAAGTGTTA
AGTTATTTAATTGTGTACAGATATTGAAGTTAGTTGTGCAAAAAGACACGAAGAAATCTA
AACGTAGCCTAAGTGTTGTTCTGAAATAGGTTTACCAATAGTCACTACGTCTTTTTCTGC
CTCAGATCTGTCGTCTTTGTCATCTTTTTCCAACTCTTCAATCTTAAGAGTAGGCAAAGA
CAGATTTCTAACTTTGTTCAAAGATCTTTCAGAGACAGTGGGAAGAGTCCTAACTTCGCT
AAGCCTCCCATAATTGAGAATTGGTTTGGCCCCACACTTGCAATTTGGGATCCTACATAT
CTGCCTAACAGGTTTATCTATGCTTTTGTATGGTTGAGGCATTTCTTTTTGAAGCCTTGC
TTTCCACTCAGGAATGTCGTTCGACTTCTCATTATCAGTTATGAAGAATGACGCTGGTCT
GTACTGATCTGACATACTTGGAACAACTGATGACGGCCTTTGCAGATTGAAGATTGTGGG
TTTATTCCCAGTTTCTAAAACACTGTAAGGCCTAAATGCTTGTGGTTGGATTATATTGGT
CTTGGCGTAAATTGGAGAATCAGGACTCGCATTTAAAGACGACTTTAGTCTAGGAGTAGA
TCTCTGTCTATCATTATAAGGGTAAGTGGCCATAGTGTGCCTGTTTTTATTCGGCATGCT
GTAAACGTTGTTAGGCATGCAAGGGGTTAAAGTTTCAGCGTAATAATAAGGCACTAAGTG
ATTTCTGTTAGCGTCATACAAATGGTCGTGTTTTGTGTTAGTGAAGGGTAAACTATGTGG
TGAACTTATGGGGCGGTTAGGGGATTGTTGGTACGTGTTAATGGGATGGGATATGGGGTA
GAATGCGGGGTAGGGGGACGGAGGGATCGGGAAGTATATGTCCGACACCATTTCAATGTG
CTTGGTCTCAGAAACCCAGAGCTGTTGTTGTTGAGTCCTCTGTATGAGTTCAACGAGTTT
GTTAAACCACGTGTTGTGGTTCGCCTCGCTCAGTGTGATAGCGTGAGTGAACACGTGACC
CCACACACGCTCCATGTGCTGACATTGTTCTAGCAACTTCTTGGACGATTTGTGGGCCGA
TTTAGGCAATCCAGATCTGAGCTGCTTTATAATATGCTTGTTATCAGCCTTCAAGAATAT
AACAATAGGATAGAACTGGGCATAGTTGAGTCTATCCACAGCGTTCGGTGTGATATCTAA
TAAGGCGTGCTTGCCTCTCTCCATAATGTTCCTTATACTAGATAATCTTATAATACCGGC
TGATTTTGTTTTACTATCTTCTAGGGAACTGTCCATTTTAGGCGATGCGAATCTATCTGG
GTGCTCAGTGAGGAGACGTGGGTGCGCTATGTCGGACACAGCGCCAAGTACAATAACCGG
GCGCACGAAGCCAGGCTGTTTGAGCACGACACGTTCATACGCGGGGAACTTGCTTATGCT
GTCTGATAGTACTACCTCGTCCCAGTGCTCCTTTCCTAAACTCTTGCTCCGTCGATGCGT
GGATCTTCTCCTTCTGAAGAAGTTGCTCTTCCCATCGTTTCCTGACATCTCTTTCTTGGT
CGCGTTGAATTGAGCTGTTGCTAATTCTTCGGCGCGAGCTTTGTTGGGTATCGTGCCTTT
TTGTACCTCTTGGTTATTACGACCTATCCGATAAACCTGCCAAGCTCCAACAGTACCATT
ATGTAACGTATCAACCACATGAAATACATCGCCACAACGGAACGACATCTCTCCGTCCGT
GGGCTCCGTGTAGTGGAAATGAGTTTTTATGTGGAATGAATCGCCCGGCATTTGTCCACT
TGCAACTGCATTATATTCTTCGGGCGAATGTTGTACGATCAAATCTATTCTGTCCTGTAA
GCTGAGTAGAAACAATACTGCTTCTTCACGAGTCACTCCTTTCATTTCCATATCGTTTAC
CTTTAATATTTTATCAGCCGGTTGTAACCCCTGCAATGCGGCAGGGCTGGTCGGTTGTAC
TCCCGATACGAAAACTCCTGAACGATTCCCGCCACACAACCTTAATCCCACGGAACCTTC
CTTTTGAAAACTTATTAATCTTGGTTCACTTGGCGGTTTATTCCTTTGATTCATCGCATC
TTCTTCGTACAACTGTCTTCTACTGCTGTAGTAATCGTCGTTCCTAGGGGGCGGTGGTCT
CGGCGGCTCGGCCTCGTGCGACATGGGTCCTCGCCTCGCGTCTATAGAGCCGCCCCTCAC
TGGCGCTGCCACGTACAGGTTCTGTCCGCTGCTGGAGTACGCCGAGGATAGAGGCTCTGA
ACCGGGGTATACGTTGTGGGATGGAGCATCTAAACTGCTATAATTGTTCTGGTAATTTCC
ATTAGTAACAGTCTCTTCCCTAATCAGTTCTCTTGTCACGACAAGGTTCAGTCGATCTTT
GCAAGATTCCACAAGTTTCTTAGCTTCCTTAAGTGTCATAACGTCAGTTACTGGAGTATT
GTTAATTCTGGTTATCACATCGCCCTCGCAAAGACCTTGCCCTGTTTGGTTTAGCTGTTC
TCTCGCCCTCATAGTTAATTCTTTTATGTACAATTTACATCCTAGGACGATTCCGAAATC
TTCTTTCTTCCCATTCCTAGAGAGTGCTAGTTTAATAGTAGTAGGAGCTGTAGGAGGTGG
AGCTGGGGCTCTTCGTCTCACTACCAATGACACTGTGGCTCCTGAATCCCGTAACACTTG
CACGGCTCTGGCGTATTCAACGTTCTCAAGGGAAACGCCATTTACTGATACTATCCTGTC
GTTTACTTGCAGTTTATCTTCAGCGGGTCCTCCTCGGAGTACATCAGACACTGCTATAGA
AGGATCTCCACTCGCAAAGTGTGGATTGTCCCTGCCCCCAGACACGGCGATGCCAAAACC
GTACCCCTGCACCCTGTTTAAACGCACTCGATGTGTTTCCCATCCTGTGCTGCGTTCTGC
GGTCTGCAATTTTTCAAATCCATAATTGTCTAATTTCATCGTGTCCAAATATTTTAAATC
ACTTCACAAAACACGAACACGTTTTAAAAATTTAAATTCCCGCGTTAAATCAACATTCTA
AATTCTTTTTTTTTCACTAAGGAGGCACAAGTTTCGTACAAGGAGTTTTATTATATTCAC
AACGAAGTTACGTATGCGTGTCACCTATGAAGCCGCG
(9577 bp)

- SilkBase 1999-2023 -