SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR10717c1_g1_i3
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_tight_junction_protein_ZO-1_isoform_X8_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005516 F calmodulin binding
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005911 C cell-cell junction
GO:0005921 C gap junction
GO:0005923 C bicellular tight junction
GO:0009986 C cell surface
GO:0016020 C membrane
GO:0030054 C cell junction
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0070830 P bicellular tight junction assembly
GO:0071277 P cellular response to calcium ion
Transcript
Level
FPKM:0.97 TPM:0.96
ORF EntryO_TrvaFAMAMG11910_complete:A_TrvaFAMAMG_TR10717c1_g1_i3
Sequence
(Nucleotide)
GGTTTATTTTTTAACCCATAACTCGAAAATTAAATTTAATTAAGTCATAATATTAAGAAA
AATGTCTACGTATTGGCTTGTGAACTTATTTCTAAAATGCTAATGAAAATTTTTATATTT
CAATTTCTTTTGAAGTATCAATTTTAATATTAAACGAGGTGGGAGATACGAATTTTAATA
ATCAAAACGAGACAATTTTATTTCGAACAATTTTCACAACAAGGATTTTAATTATACAAT
AACTTGTGGCTTAAAAGTGGTCCACTTTGACAGCTTAAAAATGCTCAATTTTGACATTTA
CTGGTGCTGTACTCTAACAGTCATTAAAAAGTGCTCCACTTTGAACGCTTAATATTCGAA
AGTGGTGCACTTTGACAGCTATAGCTCAAAAGTGGTCCACTTTGACAGCGACAGTATTCA
AAGTGGTCGTCGCAGGCAGATGTATTTGATCCCAGTCCGTGCTCAAATGTGCTTCAGTGT
CAGTCGCTTTGATAGTCAGTCCTAGTGATGGGACAGCGTTCGCGCAATGCGGTAGGCGAA
GTGTTACCGGCCTTAGGAACACAAGTCCTTGGGGGCCACACATCACTAGTGGGGAAAGCA
TCGCTTCACCGTTATCCATGTCGATGGGTGGTCCCCCTACGCGCTGACTCAGTCGTGGAT
CTGACACCGTAAAGTAGATCTTTTGCTTGATGCCGGGAGCTATGGCCTTGGGAGGAATTA
TGAGGGACACACCCCATTGTCTATCTTCCAATACGCCTCCTTCGCTGTCAAATATTCCCC
AAGTTGTATGCGGGCCTTCTGGTTCAATATCTTGGGATTTGTTGCCAGATTCAGTGCTTT
CTGAGAGAGTTGTTTGTATCACTGTGTTTTGGTTGTTTATGATTGTCGTCTCGTTCTGAC
TATTAGACATGTTTTGTGAATTCTCCTGGCTCGTTTCAGGACTTTTTTCAGCAATCTTTT
CACAGAATGTAACAGTTTTGTTTTGTTTGGAAGATTGGTCTGGTAAGTCTTGTGATGTAT
ACGGTGTGCTTTGTGGTTTATTTTCAAAGTTCATACTGCATTCGGAGGCATAATGCGTCT
CCATAGAGGTAGTTGATTCATAAGGGGTTGGTGATGTGGTAACTTTTAATGCATTAGAAA
TATGATCGGCTTTCCCATGTAACCGAGGAGCATACATAGCTTCCCCTTTTAATACATTCG
CTTCTAAATTCAATGATTTTTCTTTCTCAGCATCGGTTTTAGACTCCGTGAGTCTTAATT
TTGAGAAGTCAATCTCTTGGAATGTATCTTTCTTTAATCCGGTTTCCGCTTCATCCTTTG
TTTGATAGATTGGTTCTCGTCGTGATAAGTGATTTGCATCGCTTAGTTCATAAGGACTGC
TTCTATTACTCGAGTCCTGAACTTCAATTTGAGTTTCTTTAGTTTCGTGGTGAGATTCAT
AAATAACACTATCTTTTAGTTCTCTCTTTGAGACATACAATGGTTCTCTTATTTTAGCTG
AATCACTTTCACATGCTTCTTTCCTTGTTTGATAAATCATGTCTTTTTTAGCTTGATTTC
TTTGCTTTATAATTTCCAATTTCTCTTCTAATTTTATGCTATAGGTAGAGTCTTTATTTG
CTAGCAATGCTGCTTTCTGTGACATAATTTCTTGCTTTGTTACATAAGTGCACTCTGCAG
AGGCTGGTCTAATGTCATTTTTGTAATCAAACACCTCATTCCTACAGTTGTACTGACTAT
CAGAACAGCTAGATTTTACATCAGAGTGTGTACTATATGGAGAGTCTGTCTGTCCAATTC
TAGACATCATTTCTGATCTGGTTGCATACGGAGGCTCACTCATACATTTACTCATAGGTG
TTATCCTCCCAGACCAAGTTACTGGAGCCTGGTATCTTCTATCGGGTCTGACAGCGTAAG
GACTTTCAGACCACGATGTGCTAGGTGGTGGTTCATAAGTTCTTTTGCCATATATGGGTT
CTTTAGCACAAGTGTTGTCCAATCTTTGTTTAAGAAGTTCCTCTTTAGTGTTGTAAGGAG
ATTCGGAGAATCTTTGCCGTAGCATTTCTTCTTTCGTTGCGTATGCACTCTCAGGTTTTA
GGATTTGATCTCTGCTTGCATATGGAGGTTCATGAGTGAGATACTCTGATTGTTTAAGTA
TTTCCTGCTTATTAGCATAAGGACTTTCAGTCATTATTTCACTTCGTGTTGCGTAAGGAT
TTTCTCGAAGACATTCAGATTTAGTGGCGTATGGAGGATCCATGAGTGGCATCGGTAATG
TTGGTCGACTTCCGTAAGGACTTTCAAAGCTTTGATTCGACATTTCTGATCGACTCGCAT
AAGGATTTTCGGATGACGTATCATATTGGGAAGTGTAAGTTCTCCTCGGTTTCGGGATAG
GATCATAAACGAGATCTTTACTTTGGTAAACTGGTTCTGGAGGTAGTGGTTGAGTTGGGT
AAAATGGTTCATGTTTTATTTGTTGCTGTCTTTGGTAAATGGGATCTATTTTGGTGATCA
TATTGAAATTACTGGTTTGTCCGTATATTCCTCTCCTGTTGTATTCTATTAGAGAGTTTT
GTCTACGCAGTAAAGGCGTGACTTTCGGTTCAGTTTCGATATCGCACATTGAATTCTGTC
GTCTGAGGCTTTTGACGACGGGTTTAGCGTCATAATCGCGTATGGTACAGATCGAGCCGT
TTCGATCGTCGCAAAAAGAGCTTTGTCTTTTGAGGATCGGTTTCAGGACAGGTTTTTCAC
AAGAGGACGAGTTGCTTCGCTGCAACATTTGGTTTCTGATCTGTGTGTTCCTCATGTGCG
TACTAAGATCGCTTAGATCAGATTTCTCGCGTCTAAGCATAGTCACTTGTGGGCTCTGAT
GTCTCTGTTGGAGATCGCTTTCACATAGCGATTTTTGACGAGAGACTTTCTGTGAGGTTT
TCGTTTTCGAACGGAATAAATCGAGGACGGCGTTTTTAATGAACGATGGCTTTTTGGATA
ATTTCTTTTTAGTTTTTGGTGAGAATGTTTCGTCGCGCTCCACGCTCGAGTTCAAGACAT
CGGATGAACTGTGGAAACCCACAACCAAAAACCTACTTAGTGACTTTCATATCATTTTCA
TTGATTAATTTCGTATAATATTATTATAGACAACCAAAAACTAATTCGATGCAAAGTTCT
TTAATTTTGCGATAGACGCTATAAAGCATATTGAAATAATTGTCACTAAAGGATAGCTCA
GAACGATACTGAAAATTCAAAAAAACTTAATAATAAATAATCTACAGGGTTGTGTGATGT
GTATTACAGGAAAAGAAGCGAAAAGAAAA
(3329 bp)

- SilkBase 1999-2023 -