SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR10705c2_g2_i7
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_phosphatidylinositol-binding_clathrin_assembly_protein_LAP_isoform_X4_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005543 F phospholipid binding
GO:0005545 F 1-phosphatidylinositol binding
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005829 C cytosol
GO:0005905 C clathrin-coated pit
GO:0006897 P endocytosis
GO:0006898 P receptor-mediated endocytosis
GO:0007268 P chemical synaptic transmission
GO:0007269 P neurotransmitter secretion
GO:0007270 P neuron-neuron synaptic transmission
GO:0008021 C synaptic vesicle
GO:0016020 C membrane
GO:0016183 P synaptic vesicle coating
GO:0030131 C clathrin adaptor complex
GO:0030136 C clathrin-coated vesicle
GO:0030276 F clathrin binding
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0042331 P phototaxis
GO:0048268 P clathrin coat assembly
GO:0048488 P synaptic vesicle endocytosis
GO:0048489 P synaptic vesicle transport
GO:2000370 P positive regulation of clathrin-dependent endocytosis
Transcript
Level		FPKM:0.15 TPM:0.15
ORF EntryO_TrvaFAMAMG11790_complete:A_TrvaFAMAMG_TR10705c2_g2_i7
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTTTTGATTTCGATAAATTTATTTGGTTAAAGATAGACATTCGCTCACTA
TTAGCTATTCAAGAAGGGTACACGATGTATAAGCTTGGGATGTGCTTTAGTGGAGTCTGG
GACAAAATCTTACGTGCTAACACAGTCCTAACAAAAATAGATTCTTCAAATATCCATCAC
TACTAAACGTGTGTCAATTGTTAATCCATGACGAATATTCGGAAACTACTACAATAATAT
CGATCTAATTTGAAACTGTATTTAAGATAATTTAAGGTGCTATTATAATACTGTATTTAA
ATTTATAATAATTTAAGAAATGCACTGTTTTGAGAGTGGTGTTTAAATTTCCAATTTTAG
TGCTGAAAATACTTTGTACTCTGCATAATTTCAAAACAGTCATCCTTTTCTATTTTTCTT
ACACACAGAGGCCATTAAATATATTTTTGTTAACTAGTATTGTCATCAGAAAGTGAAGTA
ATAATTCATTATCTATTATTTGTACTGTTTATAACATTATAGTAAGAGCCAAGCGAAAAA
AGGCAAAAAAAAACACAAAAAATAATATTGCTTGATTTATTAATTTTATAAATAAGCTAA
ATCCAATATCTAACGCTCAAACGAGAATAACATAGCAAAGTATATTTACATAAAACGTAA
CTCGATATAGTATTCAAAAATAATGTACAACTTATAATTTTTTATATGTTACGAACTTCT
AAATAAAATTAACTCATAATACGCACTAATTTCACTTAATAAAACGAAAATACCTCTACA
TACTAATAGAGAATTCAGCTATTTAAATATTAATCAGTCGATTACCGCCGTGCGTTACAG
CAATTACCGATAAAAGTACAGTGTTGCCAACTGAAAAATAAGCTAAAAATAATACACTGG
TTTTTTCTCTTGGCAAAATGGCTTTACGAAATAACGAAATATGCCACAAAATAATAAAAA
TATTGCACATATTTACTAGATTTTTTTTTTCTTAATTTTCATGATAAAATCATGTCAACA
GATCTCAATCGATACATATCACATTTTATATAGATACTAATAAATAAGAATCATCTAGGA
AAAGCTACTGTTACACTAAAATGTGTAATTTTCATTTTTAAGCAAAAGATACTGCAGCAT
GCCATTTAGTACGATTTAAACTATCGCAATAGCAACACTGATGTGTTGCCACATATTCTT
CTATATAGCCTACAATTCATTTCTATGGTTGTCTATTATCATAAAGCAAATTTTAATACT
TCAAAATTAATTTGGCAGTCTTCGACGAAAAATATTGTAAAGCTTAAATTAACAATAGGT
TTAATGTTATTAAATAAAATAATAAATCACGCAGTACTAGTACAGTACGCTAGTAGACAT
AAACATCTATGTTTCCATACATTTTTACTAGAACATTAAAAGTTAAATACATGAATATTT
TTATCTTTGAATCCGATCAATAGATGACAATCCTTCAAAAGATTCGATATTAATCGTAAT
TCATCTTGCATTGATAGTAAAATATTATGAATGCATTAATTTTGAAAACTGCATTATAAC
CGGGGCCTCTACACAAAACAAGCACCTATGCATTTTTAAATAACAGCCATACAATATTAT
ACACCCGTAACATCTAATTATAACAATCTAATGTATTTTTTTAAACATTCTATACACGAA
AATATTGGGTCCTACAATTTGGATATTTTTTTTTTATCATCGACGTAACATTGGTTTTGT
AATTCCAAAATGTCCTGTTGTCTGATAAATCAGGCTTCAACGAGTGTTGCCATACTCAAA
GAAATAATTTCTACCAAAAATACGGCAATGCTAGAATTTGATTAGGAAATATCCAAACAG
TAGAACCGCTACTATTTCTTTATAATAATCTTTACAATAATGAATATTATACGGTTACAA
TTTTAACGGCAGAAACTTCTAAACAACACTGGCTTAATATTAAGGACTAACATGTTTTAC
ATAGACATCTAATATATTTATTTTATTGAATATAATTTATTTACTGTTCCAACAAAAACG
TTAATTAATTTTACACTGGCAAGCGTTTTATTTTGGGCATCAGCTAGGTAGTAACTTAAG
CCTTTTTCAATACACCACATAGACGTAAAATCCATTTTATTTGGAACAGTTAAGTGTTTT
TTTGTCTAAATGCTGAATTGAAACACCTCTTTACACGATTTCAAGTGTCTGTACAATAAT
GGAATGTGATTATAACGTGAATAATAGAAGCAAAACTAAAAACGCACCTTTGTCTCATAA
GAAATTTCATAAAAACATAAGATAACAAAACAGGAGTATAATATAATCGGAAAATTAAAA
TTTTATTATGATTTCGCATACAATAAATATACAAGAAAAATAATTCATAAATAATAATTC
TAAACCGTCGAATTAATTCCAATATAGAAAATATAAGACAAATTAAAAATGACCACTTAA
AACTTTAAAGTGGTAACTTTAATAAAAATAATTATTTATACAAATAAACGTATTTTTTGT
TTAACTTTAACACTAATCAAGATACTTTCTATTAATATCATTAGCAGTATTATCTATGGT
TTGCGTATGACAGCTGTCAAATGAATGACATGAAGTTCGCACGCATCAGAAAACGTCAAA
GTACCGCGAGTGATGTTAAAATTAAACAACAGCTTTCTAGTTTCCTAGGTAATTACCAGC
TGGGTCTTAAAGACCTAATCATTATCTCCTATTCAGTTTTAAGCGCAACACAAGGTACTC
TATAAGAAAAAACGTACCTAAACTAAATCTCATAGACGAAATGGCTTCCGAATACTACCA
ACTGTTGTTAATGCAACAAAAGATGGGATTAACTTAAATAATGTATTAAGTTCAACAAAT
GTAATAGTTTGTTGACAAGGAACAGTTGGCCGTGATGATATATAACCTGTGGTTCAGGTT
TGTGGTTTAACTAAACTGGTTGGTTGCGGGCTGTGGCGGTACTGGTGGTCGCATGGGCGC
GCCCATCGACATGGGCATCATGGGGGCTCCTTGCATGCCCATCATGCCTGGTTGTTGCAT
CATGTAATGCGGGGGGTGATATGTGTGGGTCAAAGTGTGGGGCATTGTCGGTAATGTCAT
GCCTGGGCCCATCGGTCGGTAGCCCGCGCCCGTGGTGGCCTGCATGGGCTGAGGACTCCA
TTGCTGTCCCGGTTTGGAAGCATTCTTTGGGGAGTTGTTCCACTGCATTGGTTTCTGTGC
CGTAGCTGTTTTGTTGATGGACAAGTTATTAGCGAGCGATGCTAGAGACGAGTCCAGGTC
TCCCGTTAGCACTTTGCCCGGCTGCTGGGTTTGTTGACCTGTGGTGTCAGTGTTATTGAA
TACGTTAGAGAAGTTAGCCTCTGAAACGAACGTGTTGTTTTGCTGAGCCGGCCCTGTCTG
ACCGAAGGCCGAGAACCCGTTGGTGGGCGGAGCGGATGTGGGGGGCGCGGCCCACATCTG
ACCTGAGCCTTGAGCCGGCCCTGGCGTAGCACCAAACATATCGGCAAACGGATTGCCCAA
CGACAACAAATCATCGGACGCCTTACTCGCCGAACTAACAGTGCTTGTGTTATCAGCCGA
TGTTGGCCCAAACAGATCGACAATCGACTGTTGGTTGTTGGCCGGGGCCGGTGTGGCCAA
GAACGGATTGTTGGCCGCGTTTGTTGGCGATTGCACTTTGTTCTTATACTGGTTCATAGC
AGCCTCCTCCTCAGCCAAGGCCTGTTGTTTGAGCGTGTCATCAATGAACAGAGCACCATT
GTTCTGGTAGTCGAGTCGCGACGAGGCGGCCGCGTTGCCGAACGACGATGACGTAGACGA
TAGAGCGCCCATCACGCTCGCTACGTTCTTTTGGGCACTGGCAGTCTGCGTGGGAGTGTT
GGCCGCGGATCCCTTCTTGCCCTCCAGTGTGGCGAGGTGACCCTCTAGGGCGTCCAGCAA
ACTGCTAGGAGCCTTAGTAAGGTCCGGTATATCGCCCTTGTCTATGCCCACGTTTTCAGC
CACCTTCAAGAACTCCCCAACTCTATCCATTCGAATGAGGAATTTTTTATAGAGATCGAG
AGCCTCGCGACAATTCTTCTTGTTCATATCGAAGTACTTCTCTAGAAGATTTATTATCCC
ATCGTTGTAGCACGCGAATAACCTAATGAGATCCCTAAATAGTAACATGAAGCACATATT
GATGACTCCGTTCGTGAGATCATTGGCCGTACAATCGAACTCGAGTAAGGCGTCCAACTG
AGCTTGGAGCACCGGTAGCGTCTTGAGGAGTTTCTCAGCGTTCATCATACGGAGCGAGCC
TTCTTCCTTGCCCCTTTTAACCTTGCAGAAGTCGAAGGCGACAGTCCTGTATGAAAGCGC
CTTCTCGTTGAGATATTTAGCATAACGCCGGATGAACGGGGACATGTCATATCCTTGTAC
TCCGCTTTTATCTAGGAAATTATTTAGTTGAAACGTTGAATTACTCGACGCTAGATACTG
TGTGAATCTCTCATTCCCATACGCGAGTAGATGATGTACTGTAATAAGAGCCTTATAAAC
AACCACCCAGTTTGTGTTCTGAGTGCGCTCGACGAGGAGATTGGCTAGCTGCGGTATTGA
GACGTTGGGCTCGTTTGTGCAGTGTACTAGATAGTCTAAATGCTTCTTTTTGGGTGCTAT
CATTTCTTCAGTGGTCGCCTTGCAGACGGACTTGGCTAGTCCTTGCCCGGCGATACTGTG
TCGGGCTGCTAACAGCCTATCGTTTATTGTCTGACCTGCCATTTTCACGTTGCTTATTCA
AAATAATTTGTTACACGTTTAAACAGCACTATTTTAGATGTTTTTCGAATAAATTCACAA
AATTCTGACGATGACGGGTAAAATATGTCACCGCCCCCCCGACTGGCACAATACTAAATT
CAA
(4923 bp)

- SilkBase 1999-2023 -