SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR10705c2_g2_i17
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_phosphatidylinositol-binding_clathrin_assembly_protein_LAP_isoform_X3_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005543 F phospholipid binding
GO:0005545 F 1-phosphatidylinositol binding
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005829 C cytosol
GO:0005905 C clathrin-coated pit
GO:0006897 P endocytosis
GO:0006898 P receptor-mediated endocytosis
GO:0007268 P chemical synaptic transmission
GO:0007269 P neurotransmitter secretion
GO:0007270 P neuron-neuron synaptic transmission
GO:0008021 C synaptic vesicle
GO:0016020 C membrane
GO:0016183 P synaptic vesicle coating
GO:0030131 C clathrin adaptor complex
GO:0030136 C clathrin-coated vesicle
GO:0030276 F clathrin binding
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0042331 P phototaxis
GO:0048268 P clathrin coat assembly
GO:0048488 P synaptic vesicle endocytosis
GO:0048489 P synaptic vesicle transport
GO:2000370 P positive regulation of clathrin-dependent endocytosis
Transcript
Level
FPKM:4.43 TPM:4.34
ORF EntryO_TrvaFAMAMG11805_5prime_partial:A_TrvaFAMAMG_TR10705c2_g2_i17
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTTTTGATTTCGATAAATTTATTTGGTTAAAGATAGACATTCGCTCACTA
TTAGCTATTCAAGAAGGGTACACGATGTATAAGCTTGGGATGTGCTTTAGTGGAGTCTGG
GACAAAATCTTACGTGCTAACACAGTCCTAACAAAAATAGATTCTTCAAATATCCATCAC
TACTAAACGTGTGTCAATTGTTAATCCATGACGAATATTCGGAAACTACTACAATAATAT
CGATCTAATTTGAAACTGTATTTAAGATAATTTAAGGTGCTATTATAATACTGTATTTAA
ATTTATAATAATTTAAGAAATGCACTGTTTTGAGAGTGGTGTTTAAATTTCCAATTTTAG
TGCTGAAAATACTTTGTACTCTGCATAATTTCAAAACAGTCATCCTTTTCTATTTTTCTT
ACACACAGAGGCCATTAAATATATTTTTGTTAACTAGTATTGTCATCAGAAAGTGAAGTA
ATAATTCATTATCTATTATTTGTACTGTTTATAACATTATAGTAAGAGCCAAGCGAAAAA
AGGCAAAAAAAAACACAAAAAATAATATTGCTTGATTTATTAATTTTATAAATAAGCTAA
ATCCAATATCTAACGCTCAAACGAGAATAACATAGCAAAGTATATTTACATAAAACGTAA
CTCGATATAGTATTCAAAAATAATGTACAACTTATAATTTTTTATATGTTACGAACTTCT
AAATAAAATTAACTCATAATACGCACTAATTTCACTTAATAAAACGAAAATACCTCTACA
TACTAATAGAGAATTCAGCTATTTAAATATTAATCAGTCGATTACCGCCGTGCGTTACAG
CAATTACCGATAAAAGTACAGTGTTGCCAACTGAAAAATAAGCTAAAAATAATACACTGG
TTTTTTCTCTTGGCAAAATGGCTTTACGAAATAACGAAATATGCCACAAAATAATAAAAA
TATTGCACATATTTACTAGATTTTTTTTTTCTTAATTTTCATGATAAAATCATGTCAACA
GATCTCAATCGATACATATCACATTTTATATAGATACTAATAAATAAGAATCATCTAGGA
AAAGCTACTGTTACACTAAAATGTGTAATTTTCATTTTTAAGCAAAAGATACTGCAGCAT
GCCATTTAGTACGATTTAAACTATCGCAATAGCAACACTGATGTGTTGCCACATATTCTT
CTATATAGCCTACAATTCATTTCTATGGTTGTCTATTATCATAAAGCAAATTTTAATACT
TCAAAATTAATTTGGCAGTCTTCGACGAAAAATATTGTAAAGCTTAAATTAACAATAGGT
TTAATGTTATTAAATAAAATAATAAATCACGCAGTACTAGTACAGTACGCTAGTAGACAT
AAACATCTATGTTTCCATACATTTTTACTAGAACATTAAAAGTTAAATACATGAATATTT
TTATCTTTGAATCCGATCAATAGATGACAATCCTTCAAAAGATTCGATATTAATCGTAAT
TCATCTTGCATTGATAGTAAAATATTATGAATGCATTAATTTTGAAAACTGCATTATAAC
CGGGGCCTCTACACAAAACAAGCACCTATGCATTTTTAAATAACAGCCATACAATATTAT
ACACCCGTAACATCTAATTATAACAATCTAATGTATTTTTTTAAACATTCTATACACGAA
AATATTGGGTCCTACAATTTGGATATTTTTTTTTATCATCGACGTAACATTGGTTTTGTA
ATTCCAAAATGTCCTGTTGTCTGATAAATCAGGCTTCAACGAGTGTTGCCATACTCAAAG
AAATAATTTCTACCAAAAATACGGCAATGCTAGAATTTGATTAGGAAATATCCAAACAGT
AGAACCGCTACTATTTCTTTATAATAATCTTTACAATAATGAATATTATACGGTTACAAT
TTTAACGGCAGAAACTTCTAAACAACACTGGCTTAATATTAAGGACTAACATGTTTTACA
TAGACATCTAATATATTTATTTTATTGAATATAATTTATTTACTGTTCCAACAAAAACGT
TAATTAATTTTACACTGGCAAGCGTTTTATTTTGGGCATCAGCTAGGTAGTAACTTAAGC
CTTTTTCAATACACCACATAGACGTAAAATCCATTTTATTTGGAACAGTTAAGTGTTTTT
TGTCTAAATGCTGAATTGAAACACCTCTTTACACGATTTCAAGTGTCTGTACAATAATGG
AATGTGATTATAACGTGAATAATAGAAGCAAAACTAAAAACGCACCTTTGTCTCATAAGA
AATTTCATAAAAACATAAGATAACAAAACAGGAGTATAATATAATCGGAAAATTAAAATT
TTATTATGATTTCGCATACAATAAATATACAAGAAAAATAATTCATAAATAATAATTCTA
AACCGTCGAATTAATTCCAATATAGAAAATATAAGACAAATTAAAAATGACCACTTAAAA
CTTTAAAGTGGTAACTTTAATAAAAATAATTATTTATACAAATAAACGTATTTTTTGTTT
AACTTTAACACTAATCAAGATACTTTCTATTAATATCATTAGCAGTATTATCTATGGTTT
GCGTATGACAGCTGTCAAATGAATGACATGAAGTTCGCACGCATCAGAAAACGTCAAAGT
ACCGCGAGTGATGTTAAAATTAAACAACAGCTTTCTAGTTTCCTAGGTAATTACCAGCTG
GGTCTTAAAGACCTAATCATTATCTCCTATTCAGTTTTAAGCGCAACACAAGGTACTCTA
TAAGAAAAAACGTACCTAAACTAAATCTCATAGACGAAATGGCTTCCGAATACTACCAAC
TGTTGTTAATGCAACAAAAGATGGGATTAACTTAAATAATGTATTAAGTTCAACAAATGT
AATAGTTTGTTGACAAGGAACAGTTGGCCGTGATGATATATAACCTGTGGTTCAGGTTTG
TGGTTTAACTAAACTGGTTGGTTGCGGGCTGTGGCGGTACTGGTGGTCGCATGGGCGCGC
CCATCGACATGGGCATCATGGGGGCTCCTTGCATGCCCATCATGCCTGGTTGTTGCATCA
TGTAATGCGGGGGGTGATATGTGTGGGTCAAAGTGTGGGGCATTGTCGGTAATGTCATGC
CTGGGCCCATCGGTCGGTAGCCCGCGCCCGTGGTGGCCTGCATGGGCTGAGGACTCCATT
GCTGTCCCGGTTTGGAAGCATTCTTTGGGGAGTTGTTCCACTGCATTGGTTTCTGTGCCG
TAGCTGTTTTGTTGATGGACAAGTTATTAGCGAGCGATGCTAGAGACGAGTCCAGGTCTC
CCGTTAGCACTTTGCCCGGCTGCTGGGTTTGTTGACCTGTGGTGTCAGTGTTATTGAATA
CGTTAGAGAAGTTAGCCTCTGAAACGAACGTGTTGTTTTGCTGAGCCGGCCCTGTCTGAC
CGAAGGCCGAGAACCCGTTGGTGGGCGGAGCGGATGTGGGGGGCGCGGCCCACATCTGAC
CTGAGCCTTGAGCCGGCCCTGGCGTAGCACCAAACATATCGGCAAACGGATTGCCCAACG
ACAACAAATCATCGGACGCCTTACTCGCCGAACTAACAGTGCTTGTGTTATCAGCCGATG
TTGGCCCAAACAGATCGACAATCGACTGTTGGTTGTTGGCCGGGGCCGGTGTGGCCAAGA
ACGGATTGTTGGCCGCGTTTGTTGGCGATTGCACTTTGTTCTTATACTGGTTCATAGCAG
CCTCCTCCTCAGCCAAGGCCTGTTGTTTGAGCGTGTCATCAATGAACAGAGCACCATTGT
TCTGGTAGTCGAGTCGCGACGAGGCGGCCGCGTTGCCGAACGACGATGACGTAGACGATA
GAGCGCCCATCACGCTCGCTACGTTCTTTTGGGCACTGGCAGTCTGCGTGGGAGTGTTGG
CCGCGGATCCCTTCTTGCCCTCCAGTGTGGCGAGGTGACCCTCTAGGGCGTCCAGCAAAC
TGCTAGGAGCCTTAGTAAGGTCCGGTATATCGCCCTTGTCTATGCCCACGTTTTCAGCCA
CCTTCAAGAACTCCCCAACTCTATCCATTCGAATGAGGAATTTTTTATAGAGATCGAGAG
CCTCGCGACAATTCTTCTTGTTCATATCGAAGTACTTCTCTAGAAGATTTATTATCCCAT
CGTTGTAGCACGCGAATAACCTAATGAGATCCCTAAATAGTAACATGAAGCACATATTGA
TGACTCCGTTCGTGAGATCATTGGCCGTACAATCGAACTCGAGTAAGGCGTCCAACTGAG
CTTGGAGCACCGGTAGCGTCTTGAGGAGTTTCTCAGCGTTCATCATACGGAGCGAGCCTT
CTTCCTTGCCCCTTTTAACCTTGCAGAAGTCGAAGGCGACAGTCCTGTATGAAAGCGCCT
TCTCGTTGAGATATTTAGCATAACGCCGGATGAACGGGGACATGTCATATCC
(4432 bp)

- SilkBase 1999-2023 -