SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR10697c0_g2_i11
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_phosphatidylinositol_N-acetylglucosaminyltransferase_subunit_Q_isoform_X1_[Papilio_polytes]
Ontology
GO:0000506 C glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0005975 P carbohydrate metabolic process
GO:0006506 P GPI anchor biosynthetic process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016254 P preassembly of GPI anchor in ER membrane
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016757 F glycosyltransferase activity
GO:0017176 F phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase activity
Transcript
Level		FPKM:0.04 TPM:0.04
ORF EntryO_TrvaFAMAMG11680_complete:A_TrvaFAMAMG_TR10697c0_g2_i11
Sequence
(Nucleotide)
CCGACTGTTTATACTGTTTGGTTAGAATTTTGAAAAAAATATAATTTAAATAATTTAATG
CTTAAGTGCATAACTTGTTCCGGAAACTATTTATTTGATGATATTTGCGATACATAATAG
ATGTATGTAGGCGGCATATTTTCTAATAATGACAAACTCAGTCAACATTTTTTTCCCTGC
TAATCGTGGCAAAATCAAAAGTTTTTATTTCAGCGGTTACATCGAAAAACAAGAAAATGT
AACAAATATTTATATTACTCAATTATATGAGAAGTATCCAAAACCCCTTAATGCCAAAGA
TAGTATTTACAAGTGTAAAATTTATGGGCATTATGATGAAGAAACAGTCGTGAAAAAAAA
TCACTTTAATTATTTAATATTAAGTAACGCTGGACAAAAAGTAAAGTTATTAGTAATAGA
AAATGTGGTAATATCCCCAGTAAACTGTATTATCTTATTATTTGATCGTAATAAAATAAA
GGAATCACAAACACCAATACATTACAAACCATTTACTAAGTTAAAAAGTTTGATACATGA
CGATTATAATGAGAAACAACTTGAAGAATGCAATTTGAACGATACTAAACTACCATGGCT
ATCAAATTCAATGTTTTTGCAACATTTTTTTGTTTACTACCAATTGATGCAGTGGTTTAT
AGCTTCAACAAAAAAAAATAGAAAGGTTACAATAAAACAGGGTAATTTAATTTTAGCAAT
AATAGCTGATGTGATATTGGGTTATGTAATGTTGCAACTATTATTAGAAGATATTAACAA
TATTAGTTCACTGCTCATGGGAATGCTTGAGAGATTAATAAATTCCCTATATTCATTATT
AAAATGGTTGATGGGTGCACCAGTTGGCCTAAAATTGAACAATGCTTTTAATAAAATGTT
AGGAAAATATTTTTCTTATCATGTTCAACTATGGTGGTTATTTTTGGATGTATCAAGAGA
AAAGCTTGACATTATTCTACACATCTATCGCTATGTTGGTTATTTGGGACTCACATTTCA
AATAGCTGTTATTTCAGATATGGTGTGCATAGCAACATTTCATTCCTATTGTATCTATGT
ATATGCTGCAAGATTATTTAACATGCAAATATCAGGGCTAATTGCATTGTTGCGACTCTT
TGTTGGTCGTAAATACAATCCACTTAGGGGCAGTATTGATTCCTGTGAATATACAAACCA
AGAACTGTTTGTTGGGACTGTGGCATTCACAATACTGTTACTTTTACTGCCTACTACAAC
ATTGTATTACATTGTGTTTACATTGGTAAGAAGTTTAAATAAAACTGAAGTTACCTCAGT
TCTATAGGAAGTCTTATAAAATAGTAAGAAATTATAGGTTGTAGGATGATTTGTCCAAAC
ATAGAAAAGTTCTTTATAATCAAATAATTTAACTCAATCAATTTTTGATTTAATAGGTAA
AAAACCTCAGAACGAAAAATAATATTGATTGTCAATTTGTAACACCCTGTATAGAATTCT
TTTTCTGTTTACAGTTTAGAATATTGTCTCTGGTATTACAATATATACTAGCACAGTTGA
TTTATGTGATACAAACTTGTCCTTTGTATGTTATATCACTTTGGGTTTCACAATCACCAA
AAGTAGCAGGTGAGACTTACAGTGCTTATAATTTAATACTTTTTATTGTTACTTTCATTA
GTGGAAGGGATGCACTAATAAAAATGTTATTACATTTCCCCAGGCAATGTTTTAGTGGAG
AGAATTAGTACTAATACACCTTTAGTATTAGAAGTGAAGTTACTCAGTAAATCTTTAACA
GATTTAGTGAACAGATTCAAACCTCCAGTTGAAAAACCTAAAAGTATTGAATGGACTAAT
TTATTATCAAATGTGCTGGTTGGAAAACAAATTGTGTAAGACTGATGAAAAATAAAACAA
CTTAATTTTATCATGAAGTTT
(1941 bp)

- SilkBase 1999-2023 -