SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMSG_c24028_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		sarco/endoplasmic_reticulum_calcium_ATPase_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0005388 F P-type calcium transporter activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0006810 P transport
GO:0006811 P ion transport
GO:0006816 P calcium ion transport
GO:0006874 P cellular calcium ion homeostasis
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016529 C sarcoplasmic reticulum
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0033017 C sarcoplasmic reticulum membrane
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0070588 P calcium ion transmembrane transport
Transcript
Level		FPKM:3.73 TPM:2.38
ORF EntryO_SariMSG10533_complete:A_SariMSG_c24028_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
TTTGTGAAAAATGACGGCTAGATTGGATACGTGTTCTTGTCTTTTATGATATTTACGAGA
AAAAGTATTATTCTAGTACAATATTCAATTTATTTTTCAGTAATAAAGAAGTCGAATAGT
ATACATTCAGTGAAAATCAACTGACGGCAACGTAGTAATTCCACCATGGAGGACGCTCAC
ACGAAATCCGTGGATGAAGTCTTAAAATATTTTGGCACAGACCCAGACAAAGGCCTCAGT
GCAGACCAAGTGAAAAGAAACCAAGACAAATATGGACCCAATGAATTACCTGCTGAGGAA
GGTAAAAGTATATGGCAGTTAGTTCTTGAACAATTTGATGACCTCTTAGTGAAGATTTTG
CTGTTAGCCGCTATTATTTCATTCGTTTTAGCTTTATTTGAAGAACACGAAGATGCATTT
TCAGCCTTCGTAGAACCTTTTGTAATTTTACTTATTCTCATTGCCAACGCTGTGGTAGGA
GTATGGCAGGAAAGAAATGCGGAATCTGCCATCGAAGCTTTAAAAGAATATGAACCCGAA
ATGGGTAAAGTTGTAAGAGGGGACAAAGCCGGTATTCAAAAAATAAGAGCAAAGGAAATT
GTACCCGGTGACGTCGTTGAGGTGTCCGTGGGTGATAAGATTCCCGCTGACATCCGCCTT
ATCAAAATTTACTCCACTACAATCCGTATTGATCAGTCCATCCTGACCGGTGAATCAGTA
TCCGTTATCAAACACACTGACGCTATCCCTGATCCACGCGCTGTGAACCAGGACAAGAAA
AACATCCTTTTCTCGGGTACCAATGTCGCTGCCGGTAAAGCCCGTGGCATTGTTATCGGC
ACTGGCCTTAACACTGCCATCGGTAAAATCCGTACCGAAATGTCCGAGACTGAAGAAATC
AAGACCCCTCTTCAACAGAAACTCGACGAATTCGGTGAACAACTCTCTAAAGTCATTTCC
GTCATTTGCGTTGCTGTGTGGGCTATCAACATTGGTCATTTCAATGACCCCGCTCACGGT
GGCAGCTGGATTAAAGGCGCAGTGTATTACTTCAAAATTGCCGTAGCTCTGGCCGTCGCT
GCTATACCTGAAGGTCTTCCAGCTGTCATCACGACTTGTTTAGCTCTGGGTACTAGGCGC
ATGGCTAAAAAGAACGCTATTGTAAGGTCCCTGCCTTCCGTAGAAACTCTTGGTTGCACT
TCAGTCATTTGTTCCGACAAAACTGGAACTCTGACCACCAACCAAATGTCAGTATCTCGC
ATGTTCATTTTTGAAAAAGTTGAAGGTACCGACAGCAGCTTCTTGGAATTCGAAATTACT
GGATCCACATACGAACCTATCGGTGATGTTTACTTGAAGGGGCAAAAAGTCAAGGCCTCC
GAATTCGATGCACTCCACGAATTGAGCACCATCTGCGTTATGTGCAATGACTCGGCTATC
GACTTCAACGAATTCAAACAGGCCTTTGAAAAAGTCGGTGAGGCTACGGAGACTGCTCTT
ATTGTACTGTCTGAGAAGATGAATCCTTTCAACGTTCCCAAAACTGGACTCGACCGCCGC
TCGTCTGCTATTGTTGTGCGTCAAGAAATCGAAACTAAATGGAAGAAAGAATTCACTTTG
GAATTCTCTCGTGACAGGAAATCTATGTCTACGTACTGCACACCCCTGAAGCCTTCTCGC
CTCGGCAACGGGCCTAAACTGTTCGTTAAGGGTGCCCCCGAAGGTGTATTAGAACGTTGT
AGCCATGCTCGTGTCGGCACCACTAAAGTCCCACTAACGACAACCCTGAAGAACCGTATC
TTGGACCTGACCCGGCAGTACGGTACCGGTCGCGACACGCTCCGTTGCTTGGCGCTCGCC
ACCGCTGACAACCCTATGAAGCCCGATGAAATGGATCTCGGTGACTCCACTAAATTCTAT
ACTTACGAAGTGAACCTCACGTTCGTCGGTGTCGTCGGTATGTTGGACCCTCCCCGTAAG
GAAGTGTTCGACTCCATCGTACGTTGTCGCGCTGCTGGTATCCGTGTCATCGTCATCACC
GGTGACAACAAGGCCACCGCTGAAGCTATCTGCAGGCGCATCGGTGTATTCGGTGAAGAC
GAAGACACTACCGCCAAGTCGTACTCTGGTCGCGAGTTCGATGACCTTCCCGTGTCGGAG
CAGCGGGCTGCTTGTGCGAAGGCGCGCTTGTTCTCCCGCGTCGAACCCGCACACAAGTCC
AAGATCGTTGAATACCTCCAGAGCATGAACGAAATCTCCGCCATGACTGGTGACGGTGTA
AACGACGCCCCCGCCTTAAAGAAAGCCGAGATCGGTATCGCCATGGGATCGGGTACCGCG
GTCGCCAAGTCCGCCGCCGAGATGGTGCTGGCCGATGACAACTTTTCATCCATCGTCGCT
GCCGTTGAAGAAGGTCGTGCCATCTATAACAACATGAAGCAGTTCATCCGTTATCTGATT
TCTTCAAACATCGGTGAAGTCGTATCTATTTTCTTGACCGCCGCTCTCGGTCTGCCCGAG
GCGCTGATCCCCGTACAACTGCTGTGGGTCAACTTGGTGACTGACGGTCTCCCCGCCACC
GCTCTCGGTTTCAACCCCCCTGACCTCGACATCATGGACAAACCCCCGCGTAAAGCTGAC
GAGGGTCTCATCTCTGGATGGCTATTCTTCAGGTACATGGCAATCGGTGGATACGTCGGC
GCTGCGACCGTCGGTGCGGCCTCTTGGTGGTTCATGTACTCTCCCGATGGGCCCCAGATG
ACCTACTGGCAACTGACACACCACTTGCAATGCCTCAACAGTCCCGATGACTTCAAGGGT
ATAGACTGCAAGCTCTTCCAAGATCCTCACCCCATGACTATGGCTCTCTCGGTGCTCGTC
ACGATCGAGATGTTGAACGCCATGAACAGCTTATCGGAAAACCAGTCACTAGTCACAATG
CCTCCGTGGTACAACATGTGGCTCGTCGGGTCCATGGCACTTTCATTCACTCTTCACTTC
GTCATTCTATACGTTGAGGTCTTGTCGGCCGTATTCCAAGTGACACCGCTATGTATTGAG
GAGTGGGTGACGGTGATGAAGTTCTCAGTGCCGGTCGTGCTGCTCGACGAGGTGCTCAAG
TTCGTCGCGCGCAAGATCTCCGATGGTGAGAAGCACTCTCTGCTAGAGTGGCTCAACGGC
ATGGAATGGATTGTGCTCATGTGGGCAGTCTTCTTTGGCATCATCATCTACGGACCACTA
TAAGCCGGCCCGCCCCGTGTGCCGTGCGACCCTAGCCCGCCACCCAACAACCTCCCCCCT
CGTTTGATTCACACTTCTAATACTACCCCCCAACATTGACAAATTCTACGCGCCACTCAC
CGTACTATCTCTATACGCGTTTATATAGTTTTTAATTATTATTTATTATTAAACAAAATG
ATTATCGTCTGGATATGAGTGGGTGAGTGGCGCATGGAATTCAACACTGTGGAAAATTAT
GAACTATGAGCAACGCTCACCGCAGTGACAGTTGTCTAACCGTTTGGAATGCTAATACTC
GCGCGCACCGTGTGTGAAGTGATTACCCAATCCCCCCCCCTAGTTAAGAGCACGTGTCCG
TCGTTGACGCGGTGACGGCGGTATGTGTGTGTGTGTAGTGTTAACGTGAATGGATCACTA
GTGCAAGTGGAGACACACACATCCCCCTACAGTGCGCCGGTGCTAATGGACCTTCTCGTT
TGCCGCATACCAGATAAGTCTTTTAGTGTTCGCTATATTTGTTTAGGATTTAATTCTGAC
GGAGACAGATGGATACACACTCCTCAGCCATCATCCAATCTCGGCTGTTGTCCTTTTTTG
TATGTGCGAGACAATAAATAATTTGGAGCTCATTTTACACGGAAAGATAATTAACACAAC
TGTTATATATATTTTATTCTTCATTTTATACTGTTTATTATTATATATATAATATTATAC
ACTTATTTGATGTGAAGTGGCTGTGAAGAAAACTTCATAATGTTGTTAACAATGAGAGAC
ACCAAAAATTGGTTATATTGAGGAGATATATTTTATAAGTTAGATATGTATTAATTACAG
TGCGTATGAAATGGTTTACGGAAGAAGCTCCTTAGGTATTGCAACAATATAATATTAACA
ACTCGCACATAGCTCAGTAGTACCTTGTCCGTTTTTGGACTGCAGACAATGTTTATTGAA
CTTACTTTAAAATTGCTAACTGTTAGCTTAGCTTAGTGTAATAATATATCTTAAGCGTAT
ATCGTTAGGGATTTGGTTATTATTATTTTGTCATCATGATGCTCTAGCTCTGAGAATATG
TCTTTCTCCCTTTCTCCTGTGATTGCTTGAAAACAAATTCCTAATAATGCATTTCTGTTT
CTTTTTAATCTACATTTAATTTTATTATTCAAGCATATCTCTCGTTACCATTATTAATAT
TTTCTTGACTTTTTTTTAAACTGATTTTAACTCGCTGTTTTTAATTAACCTATCTACATA
AGCCAAGTAGTTTTAGTAATCTAATTAGTAAAGATTACTCATGCTACATAAAAAATTACA
AATGCCTAATCAAAGTAAGCAAATCTACTTAATCATAGTGAAAGCTATAATAATGAAAGG
AATATATAACAATAATTAACATCACATTTCCTGTATAGAGAAATTCTGTTTTTATGTTTT
TTAATTTGATGTTAACTTAGTTTTGCAGTCTTTTATCTAGGACTTGAGGAAAAATAAATT
TACAAAGTATGTTTTATAAATGAGACATAATAATAATAATATTACTTGTTGTAAGTTTAG
TAAAGGGTTAAATATCGAAATTTTGTCCATTTATTAAAGTATTTATGGTACAAGGTCCGT
ACGTACATGATAAGTCTTTATACATAATTATAGTGAAAATAGTTTGTAATAATATATTGC
ATGTGTGCATTGTGCATGGTGTTCATATAATATTTAATATGATTATGAAATTTGTATTAA
CAATCTCCTGACATTAGGGGTCGTTCAAGTATAATATATCCAAAATGTTGGACTATCTTA
ATCCCCGCTCCTTCCCCTTCCCATGATTTTCATCCCAATCCCTTATTGATTAACTTTATT
TAAAAAGAAAAAGTTAATAAGTTCATGTTCCTTGCATAATTCTTGAACGGCTCCTTTACT
GTGAGTTTCATTGTTTGCCATTCCTTACCTATTATGATTGAATGTTTAAAGATACATGAA
GTATAGTAAAATGTAAATCTCAATGAAACTTCAGTAAGGTGAGTCATCATGATACTTTCT
TTTTTTTTTTGAAATGTTAAAACAAAAAATATAATAATATTTATGACAGAGAAAAAAATC
TGGTAATAGTTTAATATATTAAAGCTTACATACACTGCACAACTGTGAAGGCATGCTCAA
ACAGTACCTATATTGTTATTGTTTCCCCCCAGAAATCCTGAAAATTGTCATGATTGAATA
ACATTTGTTAAAATATACAGTTGTTTTATAAATACCACTTTTAATTAAAATAGTAAAGAT
TTTGAATGTTCAATTATTTCCTTTCAATTTACCATTACTAAAGACTACTTGGTGTGACAT
TATTAAACATTAATTACATGAAACATACA
(5609 bp)

- SilkBase 1999-2023 -