SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_SariMG_comp30457_c0_seq2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_CBP80/20-dependent_translation_initiation_factor_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000184 P nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0003674 F molecular_function
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006417 P regulation of translation
GO:0006446 P regulation of translational initiation
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
Transcript
Level
FPKM:3.08 TPM:3.09
ORF EntryO_SariMG16545_complete:A_SariMG_comp30457_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
ATCTTTTTTTTTAATAGTGCGTAAACTTAAATCAGCATACAAAAATACAATACACATTTC
TTAACACAGAGAAAACAATAAACGGAAAAATATCGCTAAATGCTGTAGTGCATTAACCAA
AGACAAATATTTTGATAATCGAACGCCATTGGGAAACCGCGTACGACGGCTGTCACATAA
CAAAACGCGGGAAATTTCGTGTGCGTTCAATTACCTAGTATATTGAAAAGTTTAATTGTG
GCAAATCGGAAAAAAATCGACAAGATGCAGACACAAATTGGAGTCGGTAATGAGCTGCAG
CGGAGCTACAGAATTCAAGATTTCGCGACGCCTGGCGTCATCATGAGAGAACGAAGTTTC
GTACGACCACAGTCTCATCACAACATGCATCATAACCAGTTTTCAAACAATGCCAAACGT
CGAAGCATGATCCTTACGAATTCTAAAGGGAAACCCACTCTCGAAATTTATAGACCGCCT
GACGGGGTTGCTACGGTGACGGCGGGCGGCACAATGGTCACCACGAGCAACTCATCGACA
TCTACGAACAAGCTCAACGTGCATGCTAAGGAATTCACCATGGCCAAGCCTGTCGACCAT
AACAACAGGCCGGCGATGGGTATGGGATATGCGAGCGTCGGGCTGCAGCACTCGCGGTCC
GCAGTGCTGCACGCGCAAGTGCCGCCGCACTACCGGCCCGTATTGCCGCCCCACGCTCTA
CTGAACAGCACATCCAGCGGGAACGTGCCTCACGCACAGGTCGGGCCGCGCGTTCACTTC
AAACTGCAGCCGCAGAATTCTGTCATACACGAGAAGAAGAGGTCCCCTCCTTCGTCCCTG
ACTAATGGTAATGGGAAGGGAGTCCGCCCTCAGTCGTTTACTCCGGGGTTAAAGAGGTCT
AAATCGCTGACCTCTGCGGATGCGTTGGCCAGCGGTATGGCTGCGCTGGGTCTCGCCGCC
GACGCGGGCGACCTCGGCACGTTCCCGCCTGATATTCAAGAGTGCATCGATAAAGCACTT
GAAGATCCGAACGCTGTGTGCGCTCGTACGCTGATGGACGCGGTGGGGCACCTCGTGTCG
CGCGCCGTCGAGTCGCCGCGGTACGCGCTGCCGGCCGCGCGGCGCTGCATCGCCGTCGTC
GAGCGCGAGCAGACCGAGACCTTCCTCGAGTCCTTGCTCAACACGTGCCAGCAGTGGTAC
CACGACAGGGAGAAGTTGTTGGGGACAATGGTGGGCGGCGGTCGGCCGCGGCTGATGGCG
TTCCTCTCGTTCCTGTTGGAGATGTACTGTCAGTTGCGCAGACGCACGATACAGCGCCGC
GGCGCGAGCGCGCAGCCCGGGCAGGTCCTGCTCACGCTCATCTGCAAGTGCTGCGAGGAC
TGCATCCGCCAACCCGTGCCCTCCGCTAGCGATACGGAGAATCTGTTCTTCGTGCTTACG
TACATCGGTCGAGATCTCGAGGCTCAGTTGCCGGGAGACCTCGAGCGGCTCCTGACGGCT
GTCCGCGACGCATTCCTTAACACCGCCGCCGCGCCCTCCATCCGCAGGACTCTGCTCCAG
CTCATAGAGCTACACGCGTCCCGCTGGCAGCTACCCGGCTGTGCGGTACTCTATTACTAT
CCCTCATCGAAATAATGTAAGGTTTGATCGATATCGATTTGATCGACACTGGAACAATAT
CGATACTGTGATTAATTGTTAAATACTTTTGAAATATCAGAAGATGTCAAAACTTACGCT
GTATGGCGCCAAAAGACTTTGGGAAGTCGACGTTGCTGTTCCCGTGTTATTGATATATCG
ATTCTTTTCGAATATCGTTCATCCCTACTATACGATGCAGCTATAATATCATCTACATAT
GCTAAGTCTTAATGTTAAGTCGTATCTTATGACTGACTTTGATTCATTATGGGGTCTTTA
TAATTATTTAACTTAATAATAGGTAAATGTAAAGTACATTATACTTATTTTTTTAGATTA
ACAAACAAAAGGGTAGCTTTTAGTAACCAATCGGGATATGATGGTGTACTCACGTATTAA
ATCTAATTAGGATTTAAACTTATGTTCCTATTATATCAAAATCACTGATTCTTAGTTTTC
ACCGAAAAGAGGGTGTTTAATATCAACATTAGAGTTTTATAACACAGAGGTTACAAAAAG
CATTTGGTTTGGTTTTCTTTCTAAGTTTCAGTACTATTGCGTTAGTCCTATTTATGTTTT
GTTGGCTCGAGGCTGCCATAAGCTCCATAATAGTGTGCCTTTATAAAATATTTTAATAGA
CTATTCATGGTTTTTAACATATATTAAAAAATACAGCAAATATGAAAGCCTGAAATGGTT
AGTATATATTTATTTGTAAGGTTTTAATCATTTATAGCTTAAGGTATAGATTATATACAG
TAGACATAGAGGATTGATATACGCCTTGAAAGTATTAAAAAAAGTACGTGTAAAAAAATA
ATTAGTTTTGGACAAATGTATGGTGTACATTACTGTACGACTCTCGCATAGTACATCGTG
CATTGTATCCTTTGTCTATAATTTATTATAAAAAATCTAACTTTAGATGTTTTGCCGACT
CTGTCTCTAGCTTTGTAGCACCTACTGCTTCGTGTATTGTTTGCCTGCAAATAATTGTTG
TATTTAGTTAAGTTCCATTGCACTAAATAATGTAAACGTTGATGATGCACTATGGTATTT
AGTTGTATTTTTTTGTCTCTTTATCAAATCATTGCAAAAAAATTACAGAAATGAATTTGA
CTGAATATTTTTTTTTATAAATGAGCTGTTTTTCAATGTTTTACGCTTGTGATATTATAA
ATTTTAAGTTAAATAATCTCGATGTCTTTTCTCTGTCCCTAACCAAAGACTGTACTGATG
GGAGATTCATTTTAATTTTATTAAAAAAAAAAAGAATTAATATTGTTGAAGCTGGACCAA
ATTTTCTTCGTTTCGAGGTTTTTCTTTATGGGTGTGTTTCATTAGCATGATGTAATAAGT
TCGTTATTTACTTAGGCTATTCGACTCAATGCTTTGTCAAATGGATAGCTTAAGTTTTGT
TAGTTGGATATTAAAGGAGAAAAAGTTAAAAAGACCATGAACTTTTTGTTACTGTGCATT
CGTAGTAATTTAAGGTAATGATAATGTTATGTTTGTAGAAAAAAAATGAAAAAAAAAAAT
GGTGCTAACTAAAAAAAAGTATTGGTGTATTGTATAATATTCTCATAGATTACGGGCAAT
AACAATATTCTCGTTACCGCTATAAATTTTTTTTACGATTAAAACCATTTTAAAGGAATT
ATTATAACCAATAAAACTCTATAAAAACACGAA
(3333 bp)

- SilkBase 1999-2023 -