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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp30319_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_nuclear_receptor_corepressor_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000118 C histone deacetylase complex
GO:0000122 P negative regulation of transcription by RNA polymerase II
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GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008134 F transcription factor binding
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GO:0016363 C nuclear matrix
GO:0016604 C nuclear body
GO:0016922 F nuclear receptor binding
GO:0017053 C transcription repressor complex
GO:0042826 F histone deacetylase binding
GO:0044255 P cellular lipid metabolic process
GO:0047485 F protein N-terminus binding
GO:0072365 P obsolete regulation of cellular ketone metabolic process by negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:1903799 P negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
Transcript
Level		FPKM:3.78 TPM:3.79
ORF EntryO_SariMG15533_5prime_partial:A_SariMG_comp30319_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
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CTGCTATACTCATCAGCGAGGGCATCTTCGCGCTTCTCTGCTATCTCTTTAACGATACGT
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CGATGCCTCGAGGGCACTTCTTCAGGCTCCTCAGCCCTGGCAGGCTTCGACGCGGTCTGT
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TCGACGGTGGGTTCCGACGGCGGGTTCGGCGACAGAACTTCCACCGTGTTATACACATTC
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GGCTCCGGCATGAGGCAGACTTTCTTGAAGGGTGGCGGGTCGGCCGGGGGCGGGTGGTGT
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(6100 bp)

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