SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp30299_c0_seq3
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_tubulin-specific_chaperone_C_isoform_X1_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0000902 P cell morphogenesis
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0006457 P protein folding
GO:0007021 P tubulin complex assembly
GO:0007023 P post-chaperonin tubulin folding pathway
GO:0008152 P metabolic process
GO:0015631 F tubulin binding
GO:0032391 C photoreceptor connecting cilium
Transcript
Level		FPKM:8.83 TPM:8.86
ORF EntryO_SariMG15475_complete:A_SariMG_comp30299_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
CAAATTGCCATTATATAAGAAGAAGAAATGGTACCAAAAAAAAAGTATGTGGTCTGTATC
AGGCGAGGCGCTTACGTTACGTCATCGTACGACTTTGACAAATGCTTATAAATTATTCTT
ATTCTGGACGAATATTGGGAATATCTGATTTTATTCTATTATGCTCACAAAAACCCCCAA
GTCTGGATTCCGAAAATTTGTTGGCTTTTCACTAAAAACTGTGTTCATAGTTGAAGCGGC
GGCCTTTGCAGTATCTTACGGTTGTTGGTACAGACTTAACACCGATCGTGATTTCCGCTT
TTATATGTACAAAAATCATAATTGGATCCTAGAAAGTTACTATGCTCTAGGAGAAAAAAT
TGCTGATCAAAAAACATGTCAGCTTGATCAAGCAGTCTGGACTGGTGAAGGAAAAATATA
GTTTATTTGGAAATACGCAATTGACCTGGTGAGATGAGTGTTGCTATAAGAGCCACTTTT
TGGGTGGTCACATTTGGAAGTATTGGTTATGCATTGTTCAAGTTGGTCAAACCTGATGAT
GAACTGCTCAAAAAGTTTAATGAAGAGTCAAAACACACTGATGCACGTAAATTAACAAGT
CAAACAATAGATATTCTAAAAGAGGCTGCTAATAATAATTCTGAATTAAATAAAAAGATT
GATGATTTATTAAGAAAAGGAAAATGAATGATAAAAATTCAGTTTTAGAAAGACTTAGCA
GGAGAGATGCACAGCGTTTACAAAAATTACAGAAGGCTCATAAGGCTAGGGAAGAAGCAG
ATGCCTGTGATGAAAATGAAGAATATTTCTCTAGTGTGTTTGAAATTAAATCAGAATATA
TAGAAGATCTTTTAATACAAGTACCAACATTAGAAACAAACACACTTCCATTGCATTTTG
ATAATTTGAAAAGAGAAGTTAATGAATTACAAAAATATGTGGTCACATCATCATTTTTCT
TAAAAGAGTTTAATATGCGCAAATATTTGGGTATAGTTCAGAATTTACAAACAAAATGTT
ATGAGTTAGAAGAAAGATATGTCCCAAGAAAAAAGTTTGGTTTCTCAAAGAAGAAATTGC
CAAGATCCCACGATCAGAAACAGAATTCTATAGATGAGAATGATGGGGTTGCAATGAAAG
AGAACAACAAATGGGATGAAAAGTTATTTGGATTTGATTCATTGGAAGGGAAAGTGCTAT
TGCTTGAAAATGATGATTTGTTTCAGAGAGATGTAGCTTTGCGTAATTTAAAAAACTGTA
CAATAGGTCTCAAAGGTGTAATGGGAACACTGCATTTGACTAATTTAGATAACTGTGTAG
TATTGTCTGGGCCTGTTACCTCATCGGTTTTTGTTGAAAAATGTACAAATTGTAAAATTG
TAACAGTTTGCCAGCAACTCCGTATGCATACTTCTAACAAATGTGATATTTATTTGCATG
TAACTAGTAAAGGTATCATTGAAGATTGTACGGAAATTCATGTGGCACCTTACAATTTGT
GTTATGAAGATTTGGAAAAGCATTTTAATATGTCCACATTAGATAAATGTTCAAATAATT
GGGATAATCTAGATGATTTCAATTGGCTCGCTCCTGATGTACCGTCGCCAAATTGGTCCG
TTTTGGACTGCGCTAAACGAGTGAATAATTGGACCTCATTGTGGTCTAAACCACCTTCTT
AGTAATAAATACTCAATATTCAAAAAAGAATAAGTATTTTCTAGTAATAATTAATGTCTA
TAATACATTAATAAATCAGCAGTGTTAATGTAATGGATTTAATTGTCTTAGAGATGATGT
GCAACATTTTTTTCTCTAATATAACCTAAACATCACGATAATCATTTCAAGTATTTACTT
TATAATTTTTAAAGCAATTCACAGATATTTTACTCTTAAATGCTGATGTATATTTAATTA
TACAAAAGTGGTAAATGAGAAAACTTCTCGATGTTAATACTTTTTTTGACATCTAATACT
TTTCAGTGACAAGTATGAAAAAAAAGTTGAATGCATGAAGCTCTAAATGGCATTGGTATT
AAAATCGCCTGTAATTAATTTACAAACAAGCCGTAACTAATTATGTAATGTAATTATAAG
GTATCCATAAATTATTTTATGCATGTATTTGCGACCCAATATTTACGAAACATATATTGG
GGGTTAAATGACATACCGGAAAAACTACAAATGACGCATCAACTATTACGTGTATACATT
GGTGTACATTACTACTATTCTACAATCAACTTTGATGTGTTTGACAACTGCCGTGAATCC
CGTGACGTCCAACTTTATCTTAAATCCTTAACTCCCCTGACATTTATCAGGTACTTTTTG
TAGGTTATAACTGGATAGGGTATTAGAAAGATAATGTAAAGAATCGAGTGGCAACACTCG
TTCTCGTTTTGCTTCCTATATTCAAGTATTCCCACTAATTCATTCAAATTCCTCCGATAA
GACTGGCAACAACGTTCGTCTAAAGAACCTGATCTTTATCTTACACCATGCAATTGCATT
TATGAGTGATACACTTTTTTTCATAATTTGTGGATCCTTCCTATAATTATAAATGTAAAC
GCTTTGTAATAATTATGTATGTAGTAGCAGCATTTATTAATCGAAG
(2626 bp)

- SilkBase 1999-2023 -