SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp30279_c1_seq8
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_multiple_C2_and_transmembrane_domain-containing_protein_1-like_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005509 F calcium ion binding
GO:0005544 F calcium-dependent phospholipid binding
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0019722 P calcium-mediated signaling
Transcript
Level		FPKM:8.89 TPM:8.91
ORF EntryO_SariMG15387_complete:A_SariMG_comp30279_c1_seq8
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTAATGCTCTCATTTTTTTTATTGATATAATCTTAACAACTTAATTTACAATCCT
GCATCACAGAAATTAATAAAACAGCTAATAAACGACGTAATAATATGTATTCAACGTTTA
TCTCATCCAATCGGATAGTTACAATTTTTGAAAAATAAATACAGCCAGATCTTCATTCTT
CAAATTTAACTTGAGTGTGTAATTAAAAATTTAAAAACGATCGAACGAAAGTAATAATAA
TAATTTTAATGAGAAGATTTGAATATTTTTTTTCCACAGAAAACAAATGTTTGATATGTT
CTATGTCCACTATTTAATTCAAAGTCAATCTATATACTTATTCCGCTCAAATATAAGGAC
CAGCTTATTTTAAATAGAGTTAAGTATTTTTAACTTTCTCGTGTAATACTCTTCTGGGTT
GAACAGGTTCAGGTACACTGAGTTCCTTCCAGTCTTTCAATATTTCGTTATCAGGTATCC
TTGAGAGAAAATCTAATATGTCATTATTTAACATCCTTCCTGGATTCATGTACTTCCTTG
TAAATTTATAAATACCTAAAGTCATCATTAAATAATTATAGGGTATGAAACAAAACACTA
CTGACGTAATAATCAGTATAAGCATCGTCAGATAACTAAGAAATGGCACCTTGAAACTGG
CTAAGTTGTAAAATCTTTCGGCTAGAGAAGCCAAATATTCAACGCCATTTGTTATAGTAA
TTGTCATATCGGACAAGTTTTGAATTTTACCCGTGAAACTTTTCTCGTTGGACTTGACAT
TATCATTTTGATCCGTGGCAACATCTACGATACTGTATCCTCTCATGAAGGATTTTTCTT
GTTGATTTTTATTGAACGCCCAAAAATAAACAAACGGTATCAAAAGCATCAACGGCGCCG
TCCACATTTTGAAATAATACCAAAACAGCAACCAAATTAATAAGGCCACAGCTGAAAACT
CTTGATTGTCCCATTCGAATAGACGCTTCAAATTTTCGTTTATTTCATACAGAAAGTCAA
AAGTATCTTTGACGAACTCTAAGTTTTTGTAGACGAGAGCTATATCAAATTTCGGTGATT
CCTTTATGTGTTTCACTTCTTTTGGTTGAAATAACCTCAATGATCCTTTTATAGGATTCC
AAATCAAAGACATTTCCAAAAGGATTCTTGGACAGTTCCCTTTAGCGCTATTCCTCTTGT
GTTTGTCTTTGAGAGCGTACCATCGCGTCTCACCGTTACGTATCCTCAACAAAGGTATTG
AAATCTTCCCCGAGGGTTCATTACGAATAGTATTCACTAGAGAACTGTCGTACACTTTCA
GGTCTAAAGTTGACGTGACGTCATACACGTTGAATGTGTATTTTTTATTCCAAACGGGTT
CAACTTGACCTTGTGAACAGTGAGTTTGTACTCTCTCATTGTCCAGTTCTAGTACACAAT
ACGCGTTGGGTTTCGCCATAAGCCCTTTTGCCATAATGACTTTCACTTGCAATTTTCCCA
CTAAATTCCAATTAGTGGTTAAATCATAAACATCATGTTTATTGTGGAAATCAGGGGCAT
TCGGATATCCATCCGGTGTTCTGTTAGAGTTAGCTGTTGTACACATTGTAACTGATAAGT
GAACTGAACCGAAGCCGTCGTCGAGCTCCTGCCAAATTTCATGAGTACGATCCCTTTCTA
GACGGGATAAATCTAGAACACAACTTTAAAATAACGGTTACAAACAGAAATAACCATATC
CAACATAGGAAGGGAATGGTTATTAGAACTATGTGTTCGAAATTATCTTGATACGATTGA
GTGAATGATTCTAGTATGTCGTTGTTTCATATGTAATACCTCGTATGCGTAAGCTAGCCT
CTAGATTCCTTCTTTTTAAAGTTTTTTTTTTCAAAGTGAAATCATCTTTAGCGGCGTTGA
GCTATAATCGGCAGTGGAAAAACTTCCGTCAACATGCTAAACAGTACCTCATGTATAAAT
AAGATCGCGTTTTATAAGATTTTTAATTCAATGCACAAATTTTAATATTTAAAACTATGA
AATTAAAACATTTAAAAAAAAAATATTTTTCAAAGTTTCGAGTTTTCCTACTGTCGGCAG
TGTAATTTTTTTTTTGTCAAATTGAAAGGAGTCAGGTAGTCCACTTTTCAGAAGCGTCAA
AATACTGTTTTATTATTCAGCTACACCAATATTATAAACTCCCTGGATTTCAAACTATCT
TCATACCAAATTTCACCCAAATCGGTCTAGTAGTTTTTAAGTTTATTCTTTACATACAAA
TCTTTCCGCTTTATAATATTAGCAAAGATATGAATTAAGATCTTTTGTCTCGAAATCGTT
TATATATTTTGCATTCCAACGTATTAAAATTAACATTTCGCATTGAATTTCGTACGCGTT
TGGTTTTTTTATACTGTTTACATAACGGTTTAGTTCGGCCTATCACAATCTCGCCTTGTA
TTATGTAGGTATTACGAAAAAACACTTGTAAAATTACTTAAATAGAAATACGTAACTTAC
AAAATAATGGAAGATTCAAATAAAAAAATATATACTTTTGTCTATTGTACTTTTTTTTTC
TTATCCGCG
(2589 bp)

- SilkBase 1999-2023 -