SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp30111_c1_seq4
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		Alpha-(1,3)-fucosyltransferase_C_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0008417 F fucosyltransferase activity
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016757 F glycosyltransferase activity
GO:0032580 C Golgi cisterna membrane
GO:0036065 P fucosylation
GO:0046920 F alpha-(1->3)-fucosyltransferase activity
Transcript
Level		FPKM:8.26 TPM:8.29
ORF EntryO_SariMG14351_complete:A_SariMG_comp30111_c1_seq4
Sequence
(Nucleotide)
AACAAATTATGAAATTTAAACATTACAAAAACAGTTCGTGCAAAGTTTTGAGTCTTCACT
TTTGTCGGTAGCCCCCCTAGCTGCCTAGTTTTTTTACCTGTTTCGTTTTACTAAGACTTA
TGTTACTTGAAATACATCTATATAATCAAAGCCATATATCAGAAGCAAATTTTTAGCACG
TTTGAGTAATATTATGTACCAATTAATAATACTACACGTAATTATTATTAAATAGAATAA
ATATAATAAAAATATTTAACAAACATTTACAAAAAATACAACAATAATAATTACAGGTAT
CAAACATTTAGACATTATTCTTAAACGAATAGATTGTTGTATTTTGATAGACGAGAGGTC
TAAGAAGTATAACTGAGATGAGAATGATAGATAAAGTAAGGAATAGTGTTATAAGGGAAC
GTTCTGGTATGGTAGAGGATGTAGTGACCAAATAGAGAAAGGGATGCTTAATTGGTATGA
ACATCTAGAGAGGATGCATGAAAGAAGATTGACGCTTTTTAAATTTGTTAAAAAGCGAGT
ATGACAGGGTAAGCTGGTAAGGGTCGTCCTAGGCGAACGTATCTCGACCAGAACGAGGAC
GTTCTGGAGAAAGGCTAGGTTAAAAGTACCCCTAAACGAAGAGCATATATGAAGGTGCTA
ATGAAAGTAGAAGAAGCGAAAGACGTTTACCAGGATTATAGCAAGTGGAAGGATGTTGTC
TCTATCTACCCTTATGGGAGAGAGGCGTGACGTTATGTATGTATGTATGTACATTTTAAA
TTATACTTAGATCAAATAATTGACATTATCTGCTTAATTACATTTACTCGTAACTTAATA
AAATTATACTTTGACATTTAATTAAAATTTAAAAATTTAATATTCACCGACGACCTTAGA
TACATTAAACAAGTCTTCAATTATTAAATGTATCAGCAATTTGTTGTTACATTCTATTGA
ACCTTCATAGTCAAATTCTATAAAGATTTAGTGCCGTTAGTAAAATGTCTACTAATCCGT
TTCCGACGCCATAGCTTTTTAGCTCTATCAAGTATAGATTCAATAAATTTTTTCTCTCCC
AAAACCACTGCATTAATTAATTCTTTCGTAACTTTTTGCAATTGCAAACACGAATGTTTG
TGCATTGTTATTGTTCTCGTTTGTATATTGTTCGATAATTAACTAATCAACTATCAGCTA
AACCGTATTAGACACTACTCGGATTGCGTTTATGTTCTAATCACTTTTGTTAATTACTAA
TCAATGACCACTCGCATTCGCACTAATCAGAATCCAAACGAATCTTAATGGTAAATTTTT
TCACTCTCATAATAAGCTTTTATTTTATAAGCGTAATGTCTCTAGTTCATTTCTAAAATC
TAAAAGTTACAATCTAATAGTTTACACCTTTTTATTAGTAATACAATTTGGAATCGAGTT
TTTGGTGTCAAACGAACACATTTTAAGAAATAGTGTTGTGTGACAAAAAGTAATATTTCT
ATTTAAAAAAGCAAAAAAGTTAAAACGAAACAAATTTCCAATCAAAGACACTTTGTGATA
GCCTGTTAGATACCATAACATAGTTATGTCATTATATCCATCGATATACCAAATAAAATA
ATACGTCGAATAGTAAAATAATAATCAAAACCAGTTAAAATGTCCATATTATTTAAAAAA
TGTTCTGAATGTTTCATTTTTTGAAAAAGGTGATCACGTGGATTGACACTTCATTGCTCA
TTGGTGTCCAACTACAAGATATGTCAACGGCTCTGTTCATATTTTAACTTTTTATATAGT
TTATTTATTTCAATAATTTTATTATAACTTAATAGTAATAATAATTTATGGTATTGGAAG
TTGTTATTATTGGCTCAAGTTAACCTACCTAATCCATATACAATTTAATATAACAAGAAA
TCTAGCAAAATCTAGTCAGAAGATGAATTTAGTATAATCATAAGCAAAGTAACGTATAAA
GAGAGAAACTTTGTAATACTATTTTGTAATAATACAATTTTTTCAATATTTTCCTATAGG
AATAGGAATAGGATTTTTTTTTAAATACATAAAATCGTCATTGTGAAACATACTCGTATT
TGTGTCACTGTTTGTTTTTAAAGTATTTGGCATACTGCAAATAAGTTAGCAAACATTCTT
AAAAATCGATATTTATAGTGACATTTACAATTTGTTATATATAAGCTTTATCTAACATAT
ACCTGGTGGATTCCACCATTTTCTAAAATCTCCATAGATACTTATATTATTAATTGATTT
GTCATTTATTTTAGCGCACAGTCTGCAATAACTGTCGGTGTCTGGAGATTCTTCGACCAT
ATGATAAGAGTAATGGTTGTGCCATTTAAAGAAATTATAATACTTTGCCTTATCGGTCAT
GATCTCAATCATTCGATTGACTAATTCTTTCGCGCCTAATTTCTTTCCATCCAAATAAAT
TCCATCCGGCATGAATCTTGAATAATCGGCTCCACCAAACACAACGGGTACGGCGTAATT
ATCAAGCGAATGGAGTAATTTCTCCGTAACATAATCTTCGCTGAATGAATTTTCAAATGA
AAAATAAAAGTAATAATCAGTTTCGATCATTTTCAAACAATCAATCATTTCATCGCGTGG
GCATTTCTTTGTACCACATTTACCATAGACGTCGACAGATAACCCATAATATTCCAACTC
TTTTTGAATTTCGTCTACATATTTCTCTCTTTCACTTGGAGTATTACAGTTTGACACAAA
CCAGGCTGCAATTTTGCGTTTATTCATTAGTTTTTCCTTGATGGTTTCATTTATTGGATC
CATATCTTCTACATGCATCCATTGTATATCTTTTTTTGGGCCGATTATGTTACCTCGATT
ATCTTTTATACTTATATAACCATAATGCACGTCTGAATCTAATTTATATGTCCAAGTCCA
ATTAAAGTAACCATTAAATCTAACGTCACGAATTGGATAATAATGAGACGATTCCATATT
TGCATAAACATATTTTTGGTGTGTTGATCGAGTATGTGGCATAGTTGGTAATCTCCTTGC
AATTTCTTTACCATGAAAAACAATAACATCGAATTCAGTTATATTGTCAAAAAATAATCT
ATTAGATGTTACATAACAGTTACTAACTGGACAATTCCTTTTTATAAATGTCAATCTTGC
TTCTCTCAAGTAGACAATCGGTTCTACATTGGGATCTGTCCATACTAAAATGTATTTCAT
ACGATTTTGTGTTGGTCTAAGCATTGTTTTTATATCCATTGTATCCAAAAGAGGCTTATC
AATCTTATAGTCCATTGCGGACCAAATAAAAAATAATGGAAGACAGACTATTGCACACCA
AAAACAACGTTTTAACTTCTTTATCATTTTTTTTTGTCCACATATCTTTCTTTAATGTTA
ACTTGACCTACTCCAGCACATGACTTCTTCTTCGAATTATATTATCCTCTATTACTTTGT
AGGTACTTCTTATCTTGATAAATTCACATTTTACACATTACTAATTATTTATACGATTAC
GTTAAATATAAATTGTATTACGTTACAAAATTCTACTAAATCTAAAATGCAGAAATA
(3597 bp)

- SilkBase 1999-2023 -