SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp30070_c0_seq4
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_ATP-binding_cassette_sub-family_A_member_1-like_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0005215 F transporter activity
GO:0005319 F lipid transporter activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005615 C extracellular space
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006810 P transport
GO:0006869 P lipid transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016887 F ATP hydrolysis activity
GO:0042493 P response to xenobiotic stimulus
GO:0042626 F ATPase-coupled transmembrane transporter activity
GO:0044267 P cellular protein metabolic process
GO:0051384 P response to glucocorticoid
GO:0055085 P transmembrane transport
GO:0097208 C alveolar lamellar body
GO:0097232 C lamellar body membrane
GO:0097233 C alveolar lamellar body membrane
Transcript
Level		FPKM:7.68 TPM:7.71
ORF EntryO_SariMG14101_complete:A_SariMG_comp30070_c0_seq4
Sequence
(Nucleotide)
GTGAATGTGAAACACTGTTTTCTGTTTTCCTCGAAAATATGTTAACGAGATTTTCATTAC
GAATTTGTTAATAAGTAATTAAAAGGAACTAGATAGAGAATACACAATGAGCATGAGACG
TCAGCCAAAGGAAGCAGGGGCTTTCATAAAATTCAGGTTGTTGATGTGGAAGAATTTTTT
GCAACAATGGAGGCATCGATTCCAGACAATTACAGAATTATTGTTACCAGTTTTAACAAT
GACATTGGTTCTTATATTGCGATGGCAGATAGAACCTATCCCTCGTGATACCATGGTGTA
TCCATCTATACCAGCTCGCAGTCTTAACTTCTCTACAACAATATTAGCAGGAATGAACCT
AACGGAAATGTCTATTGCGTATTCACCAACAAGTCCAGAATTAGAAGATGTGGTAAGGTC
TGCAATTGCTCATTTATTAGTAGGAAATATAAAAGATATGCTTCCTGTCATAATTGAAAC
AATACCAGAGTTGGAAGGAATACAATGGCCACCTGAATTTGAAGGAATAGAATGGCCACC
TGACATTAATATTAATACAACTCTTATTTTGGAAATCATCAAAAGATTTATTAAAGTGGA
TTCATATAATAGTAGCAGGGAACTTAGAGGAATTTACGTCTTGGAAGAAACGACCCGTAA
AGTTATTGCAGCTGTAGAATTCAACGATTTACTTTATGGAGCTACACAACTGACTCATAA
TTTGTCGTACGCTCTACGATTTCCTGAAAGACCACGGCTTAATTCATTTTTTACACGTGG
AGGCCGAACTTGGCGAACGGATCATGTCTTTCCAGTTTTCGAATTCCCTGGACCAAGATT
CCCATTTTCTTGGGAGGGTGGCAATGATCCTGGTTATGTTAACGAGATGTTCATCGCTCT
GCAGCAATGCATATCGACGGAACTGATTGCGAGGTTTACGGGTGTTGAAGATATAAGAAA
TTTCAATGTGCATATACAGAGATATCCGCATCCACCTTATGTTCAAGATTTGGCTATTGA
GGCATTGCAGTTACTTTTTCCGATGTTTATTACGCTTAGTTTTAGTTATATAGCGGTAAA
CATCGTTAGAGCAGTAACAGTTGAAAAGGAACAGCAATTGAAGGAAACAATGAAAATTAT
GGGTCTTCCGACATGGTTGCATTGGACCGCTTGGTTTTGTAAACAATTTATTTATTTGCT
ATTAACAGCTGTATTTATAACAATACTTCTAAAGGTAAATTGGTTTACTACAGAAGATGG
ATTCACTGATTACGCTGTTTTTACGAATACACCATGGACGGTTTTATTATTTTATTTAAC
TTTATACTTGACATGTACGATATTCTTCTGTTTTATGCTAAGTGGATTCTTTTCAACAGG
TAGCACAGCGGCATTATTCGCAGGAGTCATATGGATACTATCATATATTCCTGCATTATT
ATTAACTATGGATTTTAACATGTCCGCTGCTTTGCAAGCTTTCACATGTCTCAGTGTTAA
TTCGGCAATGTCTTATGGTTTTCAATTTTTGTTAGGCAAAGAAAGTACCGGAGGTATGCA
ATGGGGCGAATTTATGTCATCGCCTATACAAGATTCATCGCGCTTCGTATTTGGGCATGT
TGTTATCATGTTAGCCTTAGACTGTGTGATTTATATGCTCATTGCTCTCTACCTAGAGCA
AGTTATGCCTGGTACCTATGGAATGCCAAAACCTTGGTATTTTCCGTTTCAGAAAAGTTT
TTGGTTTCCTAAACAGAATATGTCATACGAAGAAGCAGTATTCGGAACATCTGATGTACA
TGAAGAAATAATTAAAGAAGAAGATCCAAATGGACACGCTATCGGGGTTCAAATGATTGG
TTTAACAAAAACATTTAACAATAACGTTGCTGTAAATAATTTGACATTGAATATTTATGA
TGATCAAATAACTGTGCTCCTTGGACATAATGGTGCAGGAAAATCTACAACAATATCTAT
GTTAACAGGAAATTTGGAAGCCACGAGTGGTACAGTAACCGTGTCTGGATATGACGTAAG
GAGCCAAGGTCGGTATGCCCGAGGTAACCTAGGGTTCTGTCCACAGCATAATGTATTATT
TAATGAGCTCACCGTTAAAGAACATTTGGAGTTTTTTGCTCGACTTAAGGGCTTTAGAGG
AGAGGAGCTCAAGGAGGAAATAGACGCACTTATTGAAAAATTAGAATTGCAAGAAAAACG
TAATTACCAATCTCAAGGGCTGTCAGGCGGTCAAAAGCGAAGACTCTGTGTGGGTATAGC
GCTGAGTGGTGCAGCTCGTGTTGTGCTATTAGACGAACCAACTTCTGGAATGGACCCTGC
TTCCAGGCGTGCCTTGTGGGATCTTCTACAAAAAGAGAAAAAGGGACGATCCATGATTTT
AACGACCCACTTTATGGATGAAGCTGATATACTCGGTGACAGAATTGCGATCATGGCCAA
CGGACGACTGCAATGCATTGGCTCACCATATTTTCTGAAACGTCATTATGGCATAGGATA
CACTCTTGTTGTAGTTAAAAATCACGGTTTTGCATATGAAACGTGCACTGAACTTATTCA
CAAGTACATACCGGACGCTACTATAAAGGAAGATCGAGGTTCTGAAATAACTTACTCTCT
GACAAATGATCAATCGCATATATTTGAAGTTATGTTAAACGATTTGGAAAGAAACGTTGA
TCTCATAAGATTTAAGAATTATGGTCTAGAAGCAACAACTTTAGAGGACGTTTTTATGTC
TGTGGGTTCAGATGTTGCTCTTGTAAATTCTGTATGCGAAGATGGCCCTGGATCATCAGA
AGCTTCTACTGACGATTTATTAAAGCACGAATTTGATTCTACGGATCAACTCAATAAGGG
GACAGAGAAAACGAAAGGATTCCGTCTAGTCTATCAGCATGTTACAGCTATATGGATGAA
GTTATGGTTGGTGTGGACACGTTCCTGGTGGCTGATAATCCTACAGCTGATTGTACCTTT
GCTGCTAATCAACGCTTCTCTGTTGTTACTTGAATTTATTATTTCATTTACTGCAAATAT
ACAGATACGGCCGCTGTCTCTCGAAGAGGGATTTACGAGAACTGAGACTCTACTGACATA
CAATGGAAGCCTTATGACTTCAATCGGTGCTTTAGCAAAAGATGGTTTTGAGCGTCTCTT
TAGAGTGTCAAATGTTGAAACAATGGAGCTTACCGTGGTCGGCAATCAGTCTCTCGATCA
ATATTATTTAGAAAGGGGAGCGGATCCTACAGCTATGGGAAGTTTGCGTCACAGTATTCT
TATTGGCGCGACTTTTGATGAAAGCGCCGCGACTGCTTGGTTCAGTAATTTTGGTTACCA
CGATGTGGCCACTTCACTCGCCACTGTTTATTCGGCTTTACTTAAAGCATACAATTCCAC
TGCTGAAATAAATGTCTCCAACTTTCCTTTGGAAGCGACATACAGAGATCAGAACGACAT
GCAAATCATGGTGACAATGCTATCAATGCAACTCGCTTCAGGAATCGGCAGTAGTATATC
GATTGTCAGTGCTGTTTTTATCATGTTTTATATCAAGGAACGAGCATCGGGCGCTAAACT
ACTGCAAAAAGCGGCCGGCGTGCAACCAGCCGTACTGTGGGCGAGCGCCTCTGTGTTCGA
TTGGTTCTGGTTCATGACAATATGCATTACCATCATAATATCGTGTGCTGCATTTCAAGT
GCTGGGTCTGTCCTCTACTACCGAATTAGGGTATTTGTACCTGTGCTTCATGGTATATGG
TGCGGCCATGTTACCCATGAACTATTTACTGTCCTTGCTGTTCAGCGGGCCGGCGATGGG
TTTTGTCGTCGTTTTCTTTGTGAATGTACTATTTGGTATGATGGGAGCACAAATCGTGGA
AGCTTTATTGGCGCCACAGCTTGATACAGAAGAAGCTGCGTTAATTCTTGACTCAATCCT
GCAATTTTTTCCTTCGTACAGCCTCATCACTGCGGCCAGGAAGCTGAATCAGATTGGTTT
GGTAGAATACACCTGTTTACAAGGCTGTGACTACATATCTATTATACTTCCGAATATTGA
AGAGTGTAATATGCAAGTAATGTGTGAAAATTTCTCGGAAAATTGTTGTGTTCGCGAAAA
TCCTTATTTGGAATGGGAAGATCCAGGAATACTACGTTATTTAATCATCATGCTGATCAC
AAGCGGTATATTTTGGATAATACTGATGATTGTGGAATATCGTTTACCACAAAAGGTTTT
TCATTTCAAAAAAACACCACCGCCCGTTGATGAGAGTACTATGGACGAAGACGTCATTGA
CGAAGCTAAGCACGTTCATTTATTGGACAAAGCTCATATTTCGAACTATGGTTTGATCTC
GAAAGATCTATCCAAGTACTATGGCAAAAACCTTGCTGTTGATCAAGTTACGTTTAGTGT
GAACGATACAGAATGTTTTGGATTGCTCGGCGTCAACGGCGCGGGTAAAACCAGTACGTT
CAAGATGCTAATGGGTGACGAGACTATTTCTAGTGGAGAAGCTTTCGTCAGCGGATACTC
AGTACAACGTGACATCACTAAAGTTCACGAAAATATCGGTTATTGTCCTCAGTTTGATGC
GCTTTTCGGTGAGCTGACGGGACGCGAGACGCTGCGTATGTTCTCGTTGCTACGTGGACT
GCGCACTGACGTCACTACGCCGAGAGCTGAAGTGCTCGCGCAATCCTTAGGATTCTTAAA
ACATTTAGATAAAAGAGTAGATCAGTACTCTGGTGGGACGAAGAGAAAGTTAAATACAGC
GTTGGCTTTCTTAGGGCGGACTCGGCTGGTGTTTGTCGACGAACCGACGACGGGTGTAGA
TCCAGCGGCCAAACGACATGTGTGGCGGTCCGTGCGAAGTGTTCAACGATCAGGTCGTGG
TGTCGTTCTCACTTCTCACAGTATGGAGGAATGTGAAGCTCTGTGTTCTAGACTTACTAT
AATGGTTAACGGTCGGTTTCAATGTCTCGGCACACCGCAGCATCTAAAGAATAAATTCTC
TGAAGGCTTCACACTAACTATTAAGTTAAGAATACAAGACGAAACAACACCCACATCAAG
TAGAAGCACAGCCGATGTAGTCAAAGCTTACGTCAATTCCAATTTCATGACACCAAAGAT
GATGGAAGAATATCAAGGTCTGCTGACGTATTATTTGCCGGATAAAACTATGCCCTGGTC
GAAAATGTTTGGTATAATGGAACAAGCGAAACGAGACCTCGGTGTTGAGGACTACAGTAT
ATCGCAAACGACTTTAGAACAGATCTTTTTGCAATTCACCAAATATCAAAGAGAAAATCT
TTAACTAGGTAACCTAGTCGTTTCATTTAGTAAAATTATTTATTCTACCGTGGAATGCAG
TTGGTGTATCAAAGCTTAAAACATGTGAAGGTTGTCATTCTACGTGATGAAAGTATGAAG
TGTCAAGTTAAAAGTAAATAAATGCATTTTGAACGTTAGCAAAACATAGAAGGTATTTGC
ACTTTAATTACTCAATCTTTTTTTATGGTCATAAAGGTTTATAGTTCTCTATAATATTAT
AAAGAGGAAAGATTTGTTTGTTAAAGATAAACTAAAATAATGAAGCTATTCTAATAATTT
TTCGCCATTAAAAATATACATTATGAATGTGTAACATAGGCTATATTTAATTAAAAATAG
ATATTTCTGTGTGAAGTCGGGATAGATCGCTGCTAATACATACAAGAATTAATTCTAAGG
AATTAGTATGTGTACTCATCTATCGGACATAATTATCCAAACAAGAATTAATCCACAATG
TCTGACACATTTTTGGGATAATTGATTTTTTGTAACAAACGAATGTAAAAATCACTAGAT
AATTAATTTATTTTAAGCTGTCAATTTTATCAACTTGCGTGAAGCATTGGGGGCAATCTA
ATTCATAGAACGTGGTAACAACACGATTAGGGGCGATCAAGTATTACGTCAGCAAAACTT
TTATAGCGTAAGCATAGGAATAATTTTGAAAAATAAGCAAAAATTGACATGTAAATATTG
CTTATGTAATCATTATGGAGATCCTCCCGCCCATGTAATCAATATAAGCAAGGAATACCC
CTCCTTTGATGCTTACGCAATACTGTAACGAGCCTTTTAGAACTGTCAAAGATATGTTCC
TCGAAATGTTCCCTGGTTCTAGTTTACATAACTCTGTCCAATATGTGTATAACAACTGCC
AATGTATGAAAGGGAAGTTAAGGGAAGGGAAAGACTTTGAGATAAATAGCAAACAATAAT
ATAGTTAAAAAATAACTACATTAAAAGTTTCAAAACTGTACGACTAGTATTCGGCGGGTG
TTGACCTCGCCTCGCGCTCGCGCACATCAGCTGATAATTTAACCTACATATACACGGTTA
CTGGGTTATCGACCGCTGCAAAACGACTACGCGATTTTGATTCTTTAATTGATTTTATAA
TGTATGTTTTATAGTTTTATTTAAAAAAAATCCACTAAACTTATGTAGAATATTTCTGAA
TATAATTACAAGCTCCCATTTAATTATTGTCATTAATTTCAATTTCATCCGTACAATAGA
ATACTGCTATAAGGATACTAATAAAACAACACAGTGTCAAACCTAAAAAAAATGGTCTCA
AACGCAAGATTACATAATAATGTACATTTTACTATTAGTGTTGTTTGACGTAATGTGTCT
ATTTAAAATAAAGAAAAAAACATTTCGTACTTGCATGTTACATACATTTACATTATTGTT
TCATTCTATATAGACAATCAATATTTAAAAAAAAAT
(6816 bp)

- SilkBase 1999-2023 -