SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_SariMG_comp29827_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_nuclear_pore_complex_protein_Nup50_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005634 C nucleus
GO:0005643 C nuclear pore
GO:0006606 P protein import into nucleus
GO:0006810 P transport
GO:0008536 F small GTPase binding
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0031965 C nuclear membrane
GO:0046907 P intracellular transport
GO:0051028 P mRNA transport
Transcript
Level
FPKM:5.50 TPM:5.52
ORF EntryO_SariMG12966_complete:A_SariMG_comp29827_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAAATACATCTTACCTACATGACAAAATCTTTTGGATCTAAAATATATGACCGACCATGT
TTCTATAATTTTGAAAATTCTGTCTGCACACATTACTCAATCACTACTGGATGGGTTTCG
ATGAAATTCGGTATAAAGTGTACTCCTTATTCTGAAGTAGAATTTATATATATTTAAAAA
CTCACCCCAAAATAAGTGAAAAGAACTGATGTCAATTTTATATGAATTAAGTTAGTTTTA
GAATCATGAGACATTACATTTAAGTTGTAATTTATGTAAGAAGTTGCCTTGGAGGGCTTT
AGAATCAGTAATGGAAAAAAATTCCATGATTTTCAAAATTAAGTAAACATAGGAATGCAC
ATTTATATAAAGTGTATATAGTATGTTTAGTATAACATAGTAGCTGTCGTTTTACAAATA
CGGAATTCCACATAGGGAGATTCTTGTGCACAGCTACTCAATAAGATTGATGTCAAAAGT
AATAGTAACGTGATTTATATTTATAAATCAGCTGTTTTGCTTCCATATAACATGATTATT
TACTGAAACGGTTTTCTTTAACATTATATGGTTTAGGTAATGTAGTATTGCAAAACGCAA
GTTATATTTTTTGTCATCACAGATATCTTCATAACTCATTCCATACATTTAATAAACAAA
AATATGCTAAAACCTTTCAGAGTAGATTTTATGGTGAAAAAAATGTATTATAGTTTAATG
TTTCTTCAAACTATATGCTAGCTAACATACATAGTAATGTTGCCTTATTATATTATAATA
TGTATGGATACATTGCCATCATAGTGTTATAAAAAACTATATAATAAGTACTATGCTTCG
ACATGCATATTAAACTAATGAGTTTAATTATAATTAGGAATGCCTAGTTATGTTTTAAAA
ATTTTTCCATACATAGTTAAATCAATGTTATATTTTTTACCCACTGAATATATCTGTCAC
CTAAAATTGATTTTAATATTATAATAATACAATGTCAATCTTACGCTTAATTACATACTT
CTAACTTGTAAACACTAAAAACAAAATTACAATATTTATAATGTACAAATAATTTCCCAT
GACTTAAACTCATCACATCAAATCCAGGATGTATTTTTTTTTGTAATATCTATTCTATAG
ATGTACTTTATTACAGAAGCAACACAATAAAAAAACGTGACAGATAAGAAGTGTAATAAG
ATTATAAAATATTTAAAAAAAAGTGTAATGGATAAAAAGTTTAAAAGTTATGCCTTATGT
TTATTCAATACTTCTAATAATTCATCTGCTTCTTCAGATGTCTTTACTCTGATCAGAACA
GATGTTGGTGGTGGTTTAGAGTCTGGAGTAGGAATGCAAACAATCATCACATTATTTTTA
CCCATCTTTTGAGTTGGTATTGCGGTTGAAAGTCGTAAATTAAGCAAAACATTACCCAAA
CTTGTATTCGCACGAACCAATAATTGATGTTTGTCACTACCTTCAATCTTCTTGATATAA
AGTGTACCTACTCCTTTGTCTGCAAAATTGGCATCTTTTTTCACAAATATTTTGCATCGT
TTATCAAAAACACTATTCTCTTCTACAATGGGAGTATGTTCCACTTTTGGAGGATTGTCT
TCACTTTCTTGACCATGATTATCTTCCTTTTTATTTTCAGTGTTATTTACTTGTGCAGTG
GTATTACTGCCAAAACTAAATGGCTTGTTAATACCAAAGGAAAAGGGTGTCGTACCATTA
ACAGATGTACTAGTATTAGTGGTGATCGAAGTAGGAGCTGATGTTGTGGCATTTGATGGT
ACAGTAGTTGTAGGAGCGGTTGATTGGACTGATGGTTTTACACCAAAAGAGAAACCAGGA
GTAGTTGTCACAGCTACAGGTAGAGATTTTATAGACGAGTTATTAATACCAAAAGTAAAT
CCTGTTGGTTTTTGTCCTGATGAATCATCTACACTAGCAGCAAACAATGACGGTTTTGTA
GTATCTGTTTTAAATGGAGAACTTTTAGTAGTTAATAAATTGTTAGCAGTTGCAAACACA
GATGTAGTTTTAGCTGATGTTATGGTTTCCTTAGGTGATTTAGGGTTAGTTTTATCTTCA
GTTTTATCATTTTTATTTTCTACATCAATACTTTCATATTCACCTTGTATTTCTTTTAAA
TATTTTTCATAGTCTTTGAATATGGGTGTCAAAATACACAATGGTGTTTCATCAACATGT
TTTTTTATCCACTCTGATACTGCTTCATTTAATCCTTTTAGTTTTGCATAATATTGTATT
TTTTTGTCTTCAATTTTTTCACCATTATTTTTTTTGTCAGCATCAGTAACTGATGATGAT
GCCGGTATGCTCTCATGGGTCGAACCGTTTGAGATAGGCTGTGTCTTGAAAGGTGAAGAA
TTTGTGGTGGATGATACTATTTTATTTGGTGTAAAAACATTGGGTGCACCAAAAATAGAA
TGAGTCACTTGAGGTGTCGTGATAATTTTACTTATGTTAGTGACCTTGGTAATCTCCACA
TTAGTGGTATCTCCTGAGCTGGATAAGGATTGTGTTTTAAATGGTGAATCATTAACAGTT
GAATCTGGTTTTGAAGAAAACACTGATGAAGCAGCATTGGACTTTCCAAATAAACTTGAT
GTTTGAGATGAAGTAATTCCAAAACCTTTTTTAATAGGTGTGGAAGAGGTTCCGAATATA
CCTTCTGAACCGCTCGATTGTGGCTTACTGGTAAATAAACTAGATGTCACAGATGACTCA
GTCTTAGTTGAAATAATATTACCATTTTTATTGCCATTGGTTAAATTAGCCAAGAAATCA
AATGATTTATTTTGCATTTTCCCAATACCACCAAAACCACTGAATACATTGTTCTTTGTC
TCATCACCAGATATCTTTGTACGCCTCTTGGCAGTTCGTATTTCGCGTTGTTCAAGAACT
TCTTTAGAGGCTGTTTTGAATGAACCCATTTCCTCGTGTTCTTTCGGATCTTCAGAGTCC
CAGTTATCATGGTTCAATTCAGTAGATGCTTGACGCTTCTTAGACATTTTGGAACTTGTA
TGAGCCGTGTGTGACTTTTTAATTATGTATTCATTAACTCTTGCTACTTTACGAGTCGCT
GATTACTGCATTTTATGTATTATTTCAGAATAGGAATATGTTTTATCATTATCTGACAAT
CTATCTTCATATAATGTAAATTAACAAATTTAAAATGTTTAAGCAATAATTTTTCCGCGA
AAATTTTAGAAACACTTATTCTTACAGATCGGACTTTCAAA
(3281 bp)

- SilkBase 1999-2023 -