SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_SariMG_comp29676_c0_seq2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_hnRNPA/B-like_28_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003697 F single-stranded DNA binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0003729 F mRNA binding
GO:0003730 F mRNA 3'-UTR binding
GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005730 C nucleolus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0007298 P border follicle cell migration
GO:0007317 P regulation of pole plasm oskar mRNA localization
GO:0007319 P negative regulation of oskar mRNA translation
GO:0007411 P axon guidance
GO:0030529 C ribonucleoprotein complex
GO:0043186 C P granule
GO:0043234 C protein-containing complex
GO:0045451 P pole plasm oskar mRNA localization
GO:0045727 P positive regulation of translation
GO:0046331 P lateral inhibition
GO:0048024 P regulation of mRNA splicing, via spliceosome
GO:0048027 F mRNA 5'-UTR binding
Transcript
Level
FPKM:5.67 TPM:5.69
ORF EntryO_SariMG12449_complete:A_SariMG_comp29676_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
GTATTTTTTAATTTCTTCTATGTTTTTATTTCTCATAATAGGTACTTTATGATTTTAAAA
AAATGTAACTGACAACTTCCTGTTTCTATTACTTTTTTAACATAGCGGAAGTGGTTGGTC
CGCCATAATCATTCGTGTGGGTCTGTGCTTGTGCGGTTTGGGTGTCTTTACCGGTGCCAA
CCATTATTTTTAATTAGTAGTAAGTTATGCGTATGAATCCAGACATGGACGATGATGAGA
AGGGAAAACTGTTCGTCGGAGGACTGTCATGGGAGACATCCCAGGAGAACTTGCAGCGTT
ATTTCTCACGGTACGGTGACGTCATCGACTGCGTGGTCATGAAAAATAGCGAGTCGGGAC
GTTCGAGAGGCTTCGGCTTCGTCACGTTCGCTGAACCATCACTAGTAAACGTGGTGCTGC
AGAATGGACCTCATCAACTTGACGGCAGAACAATCGACCCGAAGCCGTGCAACCCACGCA
CGCTGCAGAAGCCAAAGCGCGGCGGTGGATACCCTAAGGTGTTCCTCGGAGGACTTCCCT
CCAACGTCACCGAAACTGACCTGAGAGTCTTCTTCGGACGCTACGGCAAGGTCATGGAAG
TTGTCATCATGTACGATCAGGAGAAGAAGAAGTCTAGAGGCTTTGGATTCTTGTCGTTCG
AAGACGAGATTTCCGTTGAAAGAGTGACCCAAGAGCACTTTATAAATCTCAACGGTAAAC
AGGTGGAGATAAAACGTGCGGAGCCGCGTGATGGTTCCGGGAAAATGGGCTCTGGGGGCG
GTATGGGGGGTATGGGCGGGGGCGCTATCTCCGCGCCAGGGGACACGCCGCAGGCGGGCC
AGTGGGGCCCACCAGCCGCCGCGCCTATCAACATGATCCAGGGCCACAACGGTCAGATGG
GAGGCCCACCGATCAACATGCCGATGGCCGGCCCTAACATCATGCAAGGGTATCAAGGTT
GGGGCACGTCCCCCGGTCAGACTTCGTACGGCGGGTACGGAGCGGGCGGTGCGGGAGCCG
GCCCCGGCAATTATCAAGGCTGGGGTGCTCCGCCCGCACCGCAGGCGCCTCCGCACGCGC
CCGCCTGGCCCGCGACTAACAACTACACGCAGCACACTCAGCCACCGGCACAGGGTTACG
GTAGCTACGCGAACTACAGCTCTGGTCCGGCGGGCGCGTCCGCCGGCGGCAGCTGGACTA
ACTGGAACATGCCGCAGAATTCCAACTCAACTGGCTCTGGTTCGTACGTGCCGCTGTCCG
AAGGCGGCGAGATGTATGGTCGCGGCGCCGGCGGTGGCACGGCTGCGGCGCCGCTGACGA
CGGCGCTCTCCTCTGCAGCGCTCTCCAAGTCTTCATCGGCTGACTACTCCGCCTACCAGC
AGTACCCGCCCGCCTATCAGCAGGATCAGGGTTCCTCGTACGGCGGCGGCGCGTCGCGGT
ACGGCGCCGGCGGCGAGTACCACGGGTCGCAGCCCCCCACCCAGCCACCAGGTGTGCACG
CGCATCCGCATCACGCGCCAAAACACTTCAACGCCAACGAGTTTAATAAGGAGTGGCCCG
CCGCCTAGGCCCGCGCCGACCTGCCGTGCCCGCCACGACACCCCGCGCCACCTCGACACC
CCCCGCCACCACACCAACACCGACACCACCACCACACGCAATTCATTCACGCGACACGGC
TCGGATACTACCGACACGGGCAACGGACGGCACATTACACGGTAATGCGCCGCGACATGC
TCGTTCTCTCTTGACATAACGACGGTCGATTAGTGGCGAGCGCTCGGGGAATCGCGATTA
TCCCGTTTGACGAGCATCTCACGCCCTTACCCATTTAGAAGCAAACCACCGCTTCCCTTT
CCGCTGACATCATTTTATCCGGACAAAAATTCGCAAGTCTAGTGCGATTTTGCTTATTCC
GAGTGCCCTGTCAAACGGTTTCAATGACCCAACATATAATCGGTTGCAAACTATATCGTC
CCGTCATCGCGAATACTTTTTAGTCTATACACAAAACACACTGTCGCGCGACAAAACTGA
TAAGGGATAATTAGTTTTCAATTTGTCATCATATTGTTTGTATTACGCCCAATTTTAGCA
AAAATCGTTGGTCTGTTACAAGTAATAAAATTCAATTAACATAAGTGTTGACAAAAAACT
TCGTTTTTATACAAAATTAGGAAGAGAATTAACGATAATCATAATAATCTATAGATATAA
ATAAACAAACGTTTCATATGTGGTAATGTTAAGATTTTGATATTTTGTATGACTATTGAG
CAAAGGAAAAATACTATAAAGTCATGTCTACTCCATTTTGCTATAAAAAATATATATATA
TGACACGTTTTTGACAGTCTTGAGTGTGTATTTAATGACTACACTAACACAAACCTACGC
GTAAATAAAGTTAAGCGTTAATTTTTAATAAATGTAATATGGAAAACTAGAGTTAATACA
CGTATTCGGGTTATTTAGATGTTTACAAAAAAATATATCTATAGTAAATTAAATAGGTGG
TGATCAAATATTTTATTCCTTAGTCTCTGAACGCTAATAAAGATGAATGATATTATATCG
TTCGATTAGGAAAGCTCTTTGATATTACTAACTTCCCCCATATTTCCCTTGCCGAGTTTT
TGTGACTTTCACATAAGCTGATGGAGGACGCTGTGTGTAATCTACGTGTTCGCTACACGT
ACATAACGCGATTTTTTTCCCTTTTTGTGACGACTAAACCTTTCCCCATCCTTCCCTTCT
GAAGTTTTCGCAACTTTCACTTGATAAGCTAAGGACGCTGTAATTTGTGAGTACGTCATT
CGTGCACACAATTGTCATAATATTTTCTTTTTTTTTTAATTATCAGCCAATCTTTCACCC
CATTCGCCCCTCCCCTAATTTTCGCACCCCCCTGACTTCACAAGCTGAAGGAGGGACAAG
GTGTATAATTTAAGTGATGTACATTACAAATGTGTACACACACATTTATTATTATTATCA
AATTATTTTCTTTTTGATTGATTGATTTACCTTTGCTTTTTTTAAATATTTCTCTTTGGA
TGTGGGCTTTTTGATGAAGGTTTAATTTTATTAGGTATCGTTTTGATGTTTTTTTTAATA
TCCCTTACCCTTTTCGGATTTTTAAATTGATTTCTTTTAATGATACCATATTTGTTTGAT
GGGATCTCGCTATTTGGTATAGTGGTGATGTTTACATACGATTGTATCTTATTGCTTGTA
GATATATATATATGTGTGTATACATATACGTAGGAGCGCAGTAGGGACGCAGTATTACCG
GACCACAAGTGGGTATGTATTTACCCCCACTAAACGCACATTTGACAGACACTGTTGTTA
ATCAAGGCCCAATTTGGGAAATTTTGACCTAAATGAACTTAACTTAAGCTAAATAACTTG
TATAAAATATTTGGTATATTTCTATATATATATGTTTAACGGTATATGTATGTTTAATAT
TAGAGAATTTTGGTTATTTAACACCCATTTTTAGACTTAGGTGAGAAAACTATAGGGTTT
GTAGTAAAAATAATTATTATACGTTAATAATATTAACAAAACATAGTATGTTGTGACTGA
ACGTGATTTTGATATGTTTTTAATGTTTTCCCATTTTTATTTATTTGAAAAAAAAAATAT
AAACGGGAAAAAGTTCTGTATAAATAAATATATTCATAATTTTAATAATTATTTTTTTTT
TTAATTTTGTTTCGTATACGCATTTTACATTATCGCAATTTTTTTTTATAAGTTGTTAAA
ATACCGAATAGTAATATTTTAATTATTATCATTGCGAAATTATTTTAACGGAGCAAATCG
ACGATGGATCCGTCGTATTTGTTTATAAGTAATAAATCTCAAGAGTTTAGGATATAGTTA
GGTTCACTGACTGCGGCGTGGTGCGTCCACCACGCAACTACCACCATCAGCACCACGCCC
CCTAAAACCTCGCGCACCCCCCGCGCGGACTCACCATAAACCCTGTATATACTATAAAAA
TCGTGTGTAAAGCATAATTTTAATCGATTTTCTCTCGCCACGCATAGTTTTTAATTTGTT
TAATTTATGTGATTGCCAAATATAATTAATTAGAAGAAAAAAAAACATCTATATAGATAG
AGAGACGTTTCTCGAAAGGGTGTATGTTATTATAGAGTTCGTGCACATGTTAATTACTAC
TGAGCCGTTATGGTGTCGCGCGCGTGTCCCCCCGTTCGCCCCCCTCTCACAAAGTGAGTT
ATATAATATAATTTAACATTGTTAGATTAAATTTAATGTTAGTCCTTTACTAGTAACTAC
TATATATATTTATATACATATATCGCTCAATCGTTTGACCGATCGACTGATTAAAATTTT
AGTGGTTAAGCTTGATAAGTAAAAAAATCGTTTCGAGTTCGGGGGAATGGGGGGCGAGCG
CGCGCAGCGAGTCTATAGGGTTAATAAATGATTATATATTTAGAGTTTAAATGTGCCGCC
GAACTGTTGTTCCTTTAATTTAAATACGGCGCGCCTAATATTCGTTATAATAGACAAATT
ATTGTTGATGGTTATAAAAATGAGCATAAATAATTTGATCGTTTAGAATAGGGTTATTTA
AGATCGCTCCATAAGTAAAGTATAATTTTTATCTATTGAGGAATATTATAAGCAACTTTA
GTATGTGGCGCGGTCCGGGGCGAGGGGTGCAGGTTGTCCGAAATTATATTTAAAAAAAAA
ACACGTTTACAATTTTTGACAAGATTAAATATATTCGGTGGTACACCATTTTAATAGAAT
TCCTATTTAACAGAATATTCGACTGAGACTCGTAGAAGTTTGTAAGGGGAAATAAAATAA
TAATCTTAACTTAATAACAATGTTATCTTAAAAATAGTGTTAAATTAAGTGACGTCAGTG
AAACCAGAGTGCCCAATAATTTAGATTACTTGTATAGTGTGATGCCTATATCGTGCCGCT
TCTTCACAACTGTTCCTACATTATTAGGTTTAATTTTGTCTCGATCATTCCTGTTTTTGT
TTTGTCGTCCTAATATAGTGAGGGTAGGTCTTGTTAGTCCGTTTCGTAAACGTTTTTTTT
AACTCTTAACGTTTGGGAATGAAACATATTTAACACTAGCGTGAAACTTCTCTTTTTCTC
GCTTGCCGGCACAAACTCGGTTATTTTGGTCGCATTTTTATTTATTCACAATAAATATAC
TCATTCAGTTCGCATACTGTTTTTAATCCTTTTTCACAGATCATTGAAATATATAATAAC
TGTAGATTTAATTAACCAACCACCGATGATGATGGATAAGAACGAAATTGTTCAAAACTG
TTTTAATATTAGGAATGGATGCCTTAAAAAAAGTTAAGTAAATATATAGATGATTTATAT
TATGTTATTTTATCAGTGATAACGATTAGCACTAAGGTGTTTATATAAGCGGTCCTCCGG
GAACCTCATAATTCACAAATCTACGGAACAATATATAAGAGAACTTAGTTTGTAATTAAC
CAACGTGGCAATTTTCTAATTAACATAAAATGAGCATAATTTATTTAAAGTAAAGGTATA
AAATAAAATATGTATTAGGAATTTTAGATTTACTGAACATTAATTAATTAAACTTAGTGC
AAATTATTGTGAGAATTGAGGGGGAAAAAATCAATTGAGACTATTTATATGGGTTTTTAA
TTATTATTACTATAATAGTAGGTGAAGAAACATTAAAAATATCGGATGAATTTATTAGTT
AAAAATAGTTAGCGAAATACAAATACGGTAAGATTCTCTCGCTAGAGGCTCGTCTGTCAA
ATGTGTTGTTACGTACTAAAGTGCGGTTTGTCTTATTGTGATACTCTACTGCGGCTCTGT
TTCAAAACTCATTTCCTTCCTCAGTAGTCCCTTTACCCCCAACTCCCTTCAATTTCCCAA
TAATTCCTTTACCTTTCTCCATAAATCCCTTTCCTTTACCCCATAATTACCTCCCCTCTC
CCCGTGATTCCCTTCCATTCACCCATTATCCTCTTACCCTGCACTTTACACTCACGGATA
TTCAATATCAAACCTTTGTTTCATCCATATTAAACACAAATATTTATTATATTATAACCA
TTATATTTTTTAAATTGCCTTTTAAATAATAATAACAACACGGCTTCCCTTCTCTAATTA
TATATACATTTTTTTTCCCTAATAAACATACAAATTCTGATAAGATTAAAAACCGTGAGT
GGTCGAAGTATAGAAAGTAGTAAGTAATGCATACCTTGCATTTTTTTTAATATTCTTATA
TTACACTGTAATTTCAACATGATATATATGCATATATATATATATATGTATATTATTAAT
ATATAATAATAATTATAAACTCGTATCTTAAAAAAATGTTTATATAATATTTTAATCATG
GCTTAAATGTAGTAGTACTGTTGTGTAGTTAACATTTCGACTATTGTTTGTATTACTTTA
TTATTAATAATAATAATAATAGCGTACGCGGTTTTTATATGTGTATGTTTATCCAGTAGT
ATATAAAGGTAACATGTTTGTGTAAAAGTGTATCTTGGTATAATTAATAATATGCCTTAA
TTAAGCACATACCGCATGGCCGTGACTCCAGTCCGCCATTGCACGCAATCTTTTCATTAA
TAATAATATATTTATAATCGTAATTGACTAATTATGCAATTTACAAAACCACGTCTAGAG
TTAGTTTAGGTAAGCAGTTCGAATCATTTTTAAGTTCAAATCTCTACTCGTTTGTAATAA
TTTATATACGTACATATTTATATATATATATATATTAAAAAATATTATCATACTAAAATT
AGATGAATTTGCATTTAAATGAATGATTGATTGTTTGACATTACGGCAGATTTAACGATT
ACCCCTAAGTAGTTTATTCGAAAGTTTTTTTTTTAATTATTATTAATAATATATATATAA
AAAAATTAAAATAAAATCAATGCAGGTATTATGAAATAAAAC
(7002 bp)

- SilkBase 1999-2023 -