SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_SariMG_comp29508_c0_seq5
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_caskin-2_isoform_X5_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0007165 P signal transduction
GO:0019904 F protein domain specific binding
Transcript
Level
FPKM:3.88 TPM:3.89
ORF EntryO_SariMG11811_complete:A_SariMG_comp29508_c0_seq5
Sequence
(Nucleotide)
CTCAAGTTCATCTTGTACATCATTAAATTAAAAATAAGTATAATATAGTTACATTTCATT
AGTAAGTATATAAAATGTCTACAATATTACGAGTAGTTATCAAAGAAAACACAGCATAGA
AACAGTGATCACTATCAAATATTTACACGATCAAGCTAATGGGCTACGTTATTATCATGT
TGTTTAATTTTACACATTGGCCTTGGTAGCGTTGGTTGTAACTAAAATCGTTTTTGTAAA
TTCATTGATATGTAAAAGTAATAAACATCCCATTAAACATAACTAATAACGTAACATCTT
TGAATCAGAACCAGATATATAATAAATAATCTTAGCGCATATAACATCAACATATCATAG
TTGTTCATGTTAAATATAAAATGTTTTAGTTTATGGCCGCTAAATATCACTTTATTCACA
TTGACATTATTATTTAAAAAGTTAATAATTAAATTCGTATTTTAACCTTTGTAAGTGATT
GCGAGAACTTGGTCTTTTATCCAAGATGTTTCAAATTATATTGAAATGTAAAGTGAGTTT
TATTATGGAAAATGTTTGTTTATATCGGACTAATTTGATGTGTTTGAACTTTACCTGCGT
ATAAATGCTACTCTTTCACTATCCTTCGTTTAGTTCGGAATTGTTCATACTACTCTTTTA
TGTTATTAGTATTGACAATAATGATAAAATAGGAAATAACTCATACAAATCATACAATGA
ACCAAAACAGTTACTTATTTGTAACGCCTACAATACACTGTTCGTGAATTGGATCACAGT
TAACCGAAAACGATAGTGTAAAAGGGCATGTCACTTAACTTCGTGTTCGTGGAAGCTCAC
CGTTATAGGTTTTTGCGGTCGAGACAAAGCTTGCAGTTACTGGAAGTTCATCATGAAGAG
TCACACTACGCTACTCGTTTCACTTTATTTCGCGTCAACAAGTACGAAAACAATGAATTG
ATTAACCTTGAAAAGTACTTTATCAAGCAACTTCGCGAGAAGTGTAGTGGGCGTGTTAAA
GTTGGCCAAAAGTGAACTAATAAAACGCAATAAAAAAACTAATAGTATTAAATTTTTTAT
TTAATCTTTTTAGGTATTAAATTATAAAATATGTTATGGTTAACTACGTACACTAGAAGA
TTTGGTAAAATTTAGTGTAGGATATCTTTTCAATGTAAACCAATCTTTTTTGATTATAAT
AATCTTTTAGTGCTTGAATTTATGCATTTCGTTGGCGTTATCAAAGAAAGTGATTTTTTG
TTTGAAAATGTAAATGCGATGTTCCTCTATGCTGTAAAATATATTGCCATAATATTATGA
GGCCTATAACTAATTCCATAAGTCTATTATTATACATTAAGTTCTAAAATTTTCACACTA
GTACCCTAATCCTAAAACTGTTTGTTGTCTTGTAGAAATTCTACGTAAAGTTTATTTCTA
CTTCATAAACGAGTAATCTACAATTTTATTGTACATGAAAAACTAACTACTGGATTATAT
TACTTAACTATGACAAAATTTAAGTAAACAAGTATTTACAAAAATAGCCACTTTCACATT
TCTTTTGGATTCAATTCAACTTACATTATATTATTATACCCAACAGAAATAAAACGAAAC
GGAAGGAACTCATTTGTATTAAATCCAAAATCACACAACTCACTAAAGTTTTCATATTAT
TAAAGTTTTTTTTATCCATATTATTATCGTATAAAAGTGTACTACATCGGTACAAAACGC
TACAAAATGTTACACAATAACAACAATTAGTAATTTGTAGTATATTTATATTATGTGCCA
ATAATGGAAGTCCATATTGAGTGTGCTGCAAATAAAAAATCATTTAAACATTTTTAAATT
ATTTATATCCGATAGGATATTGATTTGAACTTTGCAGAAGAGAACGTTTAAACTCTTGTT
AGTTGGTACTCATTGTTAATTTTTTTTGTTTCACTCTCTCTTATGGTCCTATCACACACG
GCATATCATACACAAATTAGAACATGAATGAATCGATGGTGGATGGCTGGATTTCATAAT
TTCCATTAGCCAAATTATGGCTAAAATGAGAATATTATTCCACCCAAAAATCCACCAGTC
ATTTCTCTTATAAAATAACCTCTTAATAAGATGTTAATTTATTATTCAATAATATACAAT
TGTCCTCAACGTGAAAAACACACTGCCGATAAAACCAGTACGCGTCGATCGATTCTTTGG
AATTTGAACTTTAATCTAGTTTATTCGAGTGTTTATAATAACATCGCTTATTTTAACTGT
GCCGGTCTGAAGTATGCTACAAATGGATACCCAACAATGAGCGAAACAGTATTACGCATG
CGCTTTTCTCTCTCTGTCACTCCTTTACGTTTGATGTATATTCACACCTCGTTTGCTCTA
CTTCTCACGTTATGCTAATGTTTTCGCAGTGCATGTATCTGCACCGCCGCCGTTCTGTTT
CCGTTTAGACCAGCACAATTAAATTGCGCTTTCTACATTATATAATGTAATGGAAAACAA
TTATTAAATTTTACGAATCTGTCAAACCTTGACGTTTTTCTTCTTCTAACATGGCATCCA
ATTCATCAGTTAGATTGGCGAGCATGTTGCCTATATCGTTCAGTACGTCGACTGGTTCTG
TGCTTTTCCCTTCATCTTTATGTTCGGGCAGTGAGTGCGGTGTTGTTGTTTTTATATCTG
TATTTCTGGGCGGTAGAGTCGCGAGCGTTATTCCGGTGCGACCGTAGTCCACTGTGTGCG
GACGGGACGCCATTTGACTTCGGTTCTGTTTAATAGTGCCCGCGTTTTCGTTCGCGAACG
GGATGCTATCCGATTCCGTACTGGAACTTGACTTAAAACTAGCATCCGAGCCGGTCCTCA
GCTTGTCTTCTTCATATCGACGAGGAGGTGAGGAGGGTGCGGGCGGCGGGGGCAGTAAAC
CCGTACTGTCTAGTGAGACGCTCAGCGAATCAGAACTGGGATACGCCGGCAAGCTCAAAG
GAAGACTTTTCTCCGGATGTATTTCCACCGTAGTCTGCCCGAAGCGAGAGAAGGGGGCGT
ATTGAGAGCTCTGTCTTTTAGGGGGGTCCGGTGGGGGCTTCCTAGCGACGTGCGGACTAG
CTCCATAAGCGACACGTTGAAGTCTAGCCGAGTACGCTATTTCATCGTACGTGTAATCGG
GTGATTTGTCCCTGTACGCAGGAGTCGCTTGTATTTTGGCTACGGGACGAGGTCGGACAA
GCCCTCTTGGGCGCGGCAGCGTTCCACCACCCTCGTATGAACTGTCGTTCGTCGGGGTTA
TGTCTCCGTCATCGTAGGAACGTCTCCATTGCCCTCCACCGTAATAAAATCCGGCGTCCG
GCGAGAATGTTATGTGTGAGGATCTTTCTGAAGGGTCTTCGAGGCTTTCTAGGGATTTAC
CGCGGGGGTGACGGATCTGAATTGGGACCAGATCTGTGGCACATAGGGGCGTCTGTAGGG
CGTCAAAGTTTAGGTCGGGGGGCTTATGGTAACTCCGCTCCCACTCGTAACGGTCCCTCG
GATATAAATCCTGTCCGGATTGTATTCTCGTGAAGTCCAGGGACCCCTGATTACTGATGC
TTCTTTTCCCCGCTCTGATATCTTTAACTCTTTTAATGGCAAGAAGTATTTTCTTTTGAT
GCCCCAAACGAACGATACCCATATCTTCCAAATCCTCCCATGCGAGTTGCGTGACGTCAT
GCACGGTGCGGTACCCCTGCGCTACGAGCGCTGGTCCGTACTCCTCCAGCCTCAACAGCC
GAAGCCATTCCTCTAATGAACCCGGTATGTAATCAGGCAAATTGTCCGGTACATTTAAGT
TGGCCAACTCTGCCTTTAAACGTTTGCGGTGATTCGGCTTCTTGATACCGACAGCTGTTA
AATCTTCAGGCGTCATTCGCGTAACCGTCGGCAAGTCGTAACCAGCTTCAATGAACAGCC
GAGCGTACTCCTCCATTTGAAGGTCAGCGAGGCACATGTGAATGATGTCTGTATCAGGTA
GTCCTTGAGCGATCATTGCACGGACTCTGTCAGCCAAATCACCGCAGTGGCACGCTGCGT
GATGATGATGCGGCATCCTGCCTGACGCTCTCCCGCTATCCAGTGATGCTGATGAGTGTC
TCGATCCGGACCCGGCCGATCCTGAAGACGACCCGGGACTGTCACGTCCGGGGCTTTGTG
TCATATCGATGCCCTGATCATCGCTGAGCGCCAATTGATGATGGTAGTACACTGCCGCTT
TGTGTGTGAGTGGCTGGGAGGGTGGTGGAAACGTGAAAGTGCCTCCACCTGCTGGACTCT
TTCCAAGGCTTCCACTGGCACCACTGACTCCGGACACACCGGAAACGGTACTGCCGTAAT
CGGAGTGGTCATCTCGTGTGTGTGAAGGTGTGTCAGGTGGTTGAGGATACGGTTGCTCTT
CACACGAAGCGTATCCTTGTGAACCGAAGCTTGAGCCCGAATGCCGATGCTGCGGTGTCC
CGAATGCATCGCCAGGTACCGCGGGGGGCGGCACGCGCTTCGCAGTCGCTGCCTTTCCGG
CCCCGCTGCCGCCGCGAGACATCCCGCCCACGTTTATTTTCCTCATACCGGTCCTAGACC
TTCACAGCGCCGCCAAAATCCTGTCGTCCGGATCAGCAACAACAAAACACACACTCAGAC
TCAGCATTTACAATTTATATCACAAAGCACTTGTTTACAAACATTTAGTTATCATTAACT
CATAGAAACAAACGGTAAACACTATTCCCGTTGGTTGATAAGAAAGAAAACATGAAATTG
TTTATATATCACAAAGCGATCTACACCCACGCAAA
(4835 bp)

- SilkBase 1999-2023 -