SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp29003_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_protein_pygopus_isoform_X3_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0001105 F transcription coactivator activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0007223 P Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0007367 P segment polarity determination
GO:0007472 P wing disc morphogenesis
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0009880 P embryonic pattern specification
GO:0016055 P Wnt signaling pathway
GO:0022008 P neurogenesis
GO:0030177 P positive regulation of Wnt signaling pathway
GO:0035214 P eye-antennal disc development
GO:0045944 P positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0048526 P imaginal disc-derived wing expansion
GO:0048813 P dendrite morphogenesis
GO:0060232 P delamination
Transcript
Level		FPKM:0.89 TPM:0.90
ORF EntryO_SariMG10456_complete:A_SariMG_comp29003_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TTTACGAATCGTAAATAAAATTGGTTTCAATAATTTACTAAACCCTGTTATAACTGAATT
TCAAATGTGTTAAACGAATAAACCTTCTTGAAGCTTCATATAAACGATAATAACTGTATC
GTAAATGTAATTTGCTTGTGGTATTTTGTCATATGTTGCACGCCTGCCTTGGGTTCACGA
AGGAGACAAAAAAAATAATCAGTTTACCAGTGTAAAATTGAGAATGTAATACATACTCAG
TCTTCCGGAAGGAGATACATCTTTATCGTGACAATGAGGTGCCTTATTATTCAATACATT
TATTTCAATTATGTCATTCTTTCGTCATAATGGTATTGAGAGCTTCAAGTCAATAGTGCC
AAGATGAGTCATAATCTGGCAGGCATGCCGTCTTATAGGCTCCCAGGGCCAGGTCTGGGG
CCTCCAGACTTTAAACCTCCTATGGATACTCCAACTCCCCCAGCACCAGCACCTAGTAAC
CCAAAAAAGAGAAGAAAAACTTCAAATGCCAATAATGCCTTAACACCACAGCCACCTCCA
ACGGCACAGGATCTTTTACCACCACCACTTACTGGATATGGAGACACAATTGTTGCATCA
AATCCTTTTGATGATTCTCCTTCAACAGTCTCACACAATGGTCCAATGATGAGCCAAAAT
GGGCCAATGATGAGTCAAAATAGCTCTATGGGAATGATGGGTCCAATGCATGGAATGGGT
GGTCCTCCAATGAGGCATATGAGCCCTTTACCACATAGTATGAGTCCTATGAGTCAACAA
ATGCCACCTAGAGGAGGAATAAGTCCAATGGGCAACATGAGTCCTATGGGTCATATGGGA
GGCATGTCGCCAATGGGAGGTCCAAGTATGGGAATGAGTAATCACAGTATGGGTCCAGGC
ATGGGACCTACATCAAGATCAATGGGAAGCCCAATGAGTCCAATGAATTCTATGCCCATG
GGTTCACCTATGTCATCTGGGCCTATGGGTAGTCCTATGAATATGGGTTCTATGGCAGGA
AGTCATATGAGTAACAGTCCAATGGGTCCACCAATGCATAGTCCACTTGGAGCGGGTTCA
ATGAATGGACCCATGAATGGTCCAATGGGAGGAGGAGGCCCCGGAATGAATGTACCTCGA
ATGAATGGCCCTATGGGACCCAGTTGCTCAAATGGTTCAATGGGACCAAATAGTTCTATA
ATGTCTTCAAATGCGATGCAAAGTGGTGGTATGGGTCCAGGACATTGTGGCCCAATGAGA
CATGGTAGTCCTATGGGTTCAGGAATGGGGAGTGGACCACTCGGAGGCAATGGTTCAATG
ACATCCATGGGCCCAGGTCCTCCATACAGTGGGAGTCACATGGGACATGGAGGACCCATG
GGGATGGCGGGCAATGGATCCATGGGAATGGGGCCAGGTAATATGGGAAATTGTGGACCT
CTTGCTGGTATGAGTGGAATGGCAATGGGAGGACCTGGTGGACAGGGTGTGGGGCCAATG
GATCCATGGGAATGGGGCCAGGTAATATGGGAAATTGTGGACCTCTTGCTGGTATGAGTG
GAATGGCAATGGGAGGACCTGGTGGACAGGGTGTGGGGCCTATGGGTCAGGGAATGAGTA
TGTTTGGACCTAAACCAATGCCAGTGAGTGCTGGTAAGGTATATCCACCAGATCAACCTA
TGGTATTTAATCCTCAAAACCCTAATGCTCCACCAATCTACCCCTGCGGAGTGTGCCACA
AAGAAGTGCATGACAATGATCAAGCTATATTATGTGAATCTGGTTGCAACTTTTGGTTTC
ACAGAGGATGTACGGGCCTAACCGAACCGGCTTTTCAATTGCTAACCGCTGAAGTGTATG
CGGAATGGGTTTGTGACAAGTGCCTGCACTCGAAGAACATACCGTTGGTCAAGTTTAAGC
CATAGCGTTGCACCGCACCTTCTTCACCCTTGCTCTTGATCACACCAATTTGAATGAGCC
CTTCAATATAATGGAATATATTCATTTTCCTTCTTGCATAGGACCTGTAAAGGTTAGTAT
ATTTCAGAAACGAATGCATTAATGATACTTAAGTGACTCAAGTCATTATTGCCTTCAACA
TGACTCGTAAAACTGAAATAAATAATTTCAATACTGTTTGGTTGTAATAAATTGGTCATT
AGTCTCGCTAAGAAAGATCTCATGTCGCATAGTTAGTTGAAAGTATTGTCTATTGAAAAT
TTAAAATCATTTACACTATTAAATGATTTACTTACTACTCAGTTATTTGAACTGTGGTTT
ATGGAATGTTAACTATGAGATTGCAG
(2306 bp)

- SilkBase 1999-2023 -