SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp28999_c0_seq2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_T-complex_protein_1_subunit_epsilon_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0002199 C zona pellucida receptor complex
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005730 C nucleolus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005813 C centrosome
GO:0005815 C microtubule organizing center
GO:0005832 C chaperonin-containing T-complex
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0005874 C microtubule
GO:0006457 P protein folding
GO:0007339 P binding of sperm to zona pellucida
GO:0009615 P response to virus
GO:0031681 F G-protein beta-subunit binding
GO:0043209 C myelin sheath
GO:0044297 C cell body
GO:0048487 F beta-tubulin binding
GO:0051082 F unfolded protein binding
GO:0070062 C extracellular exosome
GO:1901998 P toxin transport
Transcript
Level		FPKM:9.80 TPM:9.83
ORF EntryO_SariMG10449_complete:A_SariMG_comp28999_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
GTTTGTTTTCTGTTTTCAAGATAGAATTTGGATAGCAAAGTTCTCGAATTTTAAATCTAT
TTTCATCTAGTGTTTTCTAAGTGATTATATTTTGAAAATGGCCATGTTCCCTGGAGCGGT
GGCCTTTGACGAGTATGGACGTCCATTTATAATTATAAAAGACCAAGAGAAGCAGAATAG
ACTTACCGGTATTGATGCCCTAAAGTCACATATCCAAGCCGCGCGACAAATCGCCGGTAT
CCTCCGCACGTCCCTTGGTCCGAGGGGTCTCGATAAGCTCATGGTGAGTTCTGATGGCGA
GGTGACTGTGACAAATGACGGAGCGACAATTCTCAAGATGATGGACGTCGAGCATCAGAT
TGGAAAGCTTCTGGTACAGCTTGCGCAGAGTCAGGATGATGAGATCGGTGATGGGACCAC
TGGAGTTGTTGTTCTTGCAGGTGCTCTCCTAGAGCAAGCGTCAAATCTCCTCGACAAAGG
CATCCATCCAATACGGATAGCGGACGGATTCGAAATGGCCGCCGCTACGGCTTTGGCACA
TTTGGACAGTATCAGTGAAGCGTTCCCAGTCAACAGGAACACCAGAGAGAACCTGATCAA
AGTGGCCATGACGACGCTCGGTAGCAAAGTCGTTGTGAAGTGTCACAGGCTGATGGCGGA
GATTGCTGTTGATGCTATTCTGGCTGTCGCTGATCTGGAGAAACGCGATGTGAACTTTGA
GCTGATAAAGGTTGAGGGCAAAGTGGGGGGGAGAATGGAGGATTCCATGCTGGTTCACGG
AGTCGTTATTGACAAGACAATGAGCCACCCACAGATGCCTAAAGTGTTAAAGGATGTGAA
GCTCGCTATCCTGACGTGTCCGTTCGAACCACCGAAGCCGAAGACCAAGAACAAGCTCAT
GGTCGGTTCAGCGGACGAATACAGGGAGCTGAGACAATACGAGCACGACAAGTTCATTGA
GATCGTCCGTCGAGTTAAGGATGCCGGGGCGACTTTAGCGATATGCCAATGGGGGTTCGA
TGACGAGGCGAACCACCTGCTGCTGTCCGAGGGTCTGCCGGCTGTGCGCTGGGTCGGGGG
GCCCGAGATGGAGCTGATAGCCATAGCGACGGGCGGCAGGATAGTGCCTCGCTTCGAGGA
ACTGACCCCGGCGAAGCTCGGCTCCTGCGGCCTCGTCCGGGAACTCACGTTCGGTACGTC
GAAGGAGGAGATGCTCGTCATAGAGCAGTGCTCGAACTCGCGCGCGGTCACACTCTTGAT
GCGCGGGGGTAACCGCATGATAGTCGAGGAGGCGAAGAGGTCCGTCCACGATGCGCTCTG
TATCGTCCGGAGTCTTGTACAGGACAGTCGCGTTGTATATGGGGGAGGTGCTGCAGAGAT
CTCGTGTTCCCTGGCGGTGGCGAGGGCTGCCGAGAAGATCTCCTCCCTGGACCAGTATTC
CTATAGAGCGTTCGCTGATGCGCTCGAGGCTACGCCGATGGCATTAGCTGAAAACAGCGG
TTTATCGCCGATCGACGCGCTGTCCGAGGTGAAGGCCCGACAGGTGACCGAGAACAATCC
AAATCTTGGCATCGATTGTATGGGCAATGATTCAAACGACATGAAAGCCTTGAATGTAAT
CGAATCCCTTCATTCGAAGAAGCAACAGATTGCGCTCGCGACGCAACTCGTCAAGATGAT
ACTCAAGATAGACGATGTTCGTTCGCCGGCCGATTCCTTTGAATAAACTATGTACTAATT
CTACTGTTATGTAATAAATATATTTATCTATTGTCTTTTCGTTAATGTCCCTCTTGTGCT
TAGATCAGTTACTTTCGAGTGTATTTTCAGCGTCGGGGATTGTGAAAGTTTTGATATCAA
CACAGGCTGAAATTAAAGGCGATAATTGAATGGGGGGAGCTTATAATTATATTCAGAAAT
ATATTTTAAAATATGTTTATTAGAAAAAAAAGAATTAAAATCTATAAAACATTCAAAACA
GATTCATTTAAAGTGTCGAAATCGCGTAGCCGTTTTTGCAGCGGTCAATGACCCGGCAGC
CATGTTTGTAAAATTATCAGCTGATGAACGCGAGTGGAGTCCTCGTTCGTCGAATACACA
TCGCATACTTGATACTTCAATTATATATTTTTAATTTAATTAATATTCTTTACTGTATTA
TTTTTTGCTTATACAGAAGCATAATTATAAGCGCCCGTTTAATTATTGCCATTGATTTCA
AAGTCATCTGCATACTACACAATTCTGCCGCCAATAACTATGTGCGGTTAACTTCAGTAC
ACACTTTACGATAAGGATCCTTTGACATTTGCATGACATTGACAGGAAGGCGCTGTTGCT
GCAAAAGATTCGAAAAAGGTACAAAGCTACGTACAAAAAAAAAATGATAATTTTTAAGAT
GACGTTTTTAGTTCCGATTTTGGCCACGTGCCGAAAGATCCTTGTCGTACTATAAACTTT
AAGGTTATGGACGTCAGAGGTAAGGAGAACTATATCTTTACTGTTATTATATATGTTACT
GTTAGCGGCAAGAGGATAAATTTGAAAGAAAAGACTATACGTTATTACATTAGGATAGAG
ACAAGTAAATACGCTTACCGAAACACAATTTTCATTGTTTTCAAATGTGAAATTCATGTC
ATTGCATTCATCCTTACGCTAAGTCAAAACAGTGGAGTTTTGTAACTGTTATTTGACGCC
TACAAACGGACACTTTTAAATAATACCCCATATAAGATCATTCTCCTTACACTTACCCTT
CACTACTCTAGTGAGATATGACAGATTATATTCATGTTACGGATTACGGAGAGTAATATT
ATAGAGTACCAGTAAATAGGGTTTTCTCAGCAGAAATTAATTTCAACTAAAATGATAACA
ATTTTAAAGTTCCGAAAACGACTAAAACCTTGCCAATGTATTAAAAAAGTACACATGTCT
GAATCCTAAACTTTACACTCCGTAATACGTACATAATCTGACATATAAATTTCAAGTGTT
GCCATATAAAATAAAAACTCGCAACATTGAATAATTTTAACTAAACAGTTAAATATTACG
AACACTATAATATGATTAGCATACTGTATATAGTTTTAACAAAAAAAAAAAATACAATTT
AAGTACATAAAATTATAATCCTGAAAATAATCACAAACACACACTTTCCCAATTTATAAC
ATTTACGAGGTAAATGCATTGAAATGCCGAAATCAGTTTTCGTTTTTTTTTTTTTATAAT
AATTACTATTTACTGAAAGAACCACAACGAAATCTTTCTTATTAACACATAAAGACACCT
TAATTAAATCACAAGATGTAAAAACGATAGAGCATATTGTTAATTATATTATTATTATTT
TTCGTTAGCAAAATATATTTGCGAAGACATCGAGTTCCTTGCCCTTATAGAAAAGTATAC
AAAAATTATTATCTAGACCTTAAACATACGTTTAATTTCTAAGTGCATTAGTAAAAATCA
TAAACCAACTGGCTATAATCTGCCTTGTTCTAATACCACACCCACATTCTGTCTCGGCTT
TTATATACCTAACCTTGCAAGTTCACAAGGTTTTTCCCGCTAATTGCAAAATTGAAAGTT
TCTATCGCATACATCTAATTTTGAAGATTTTTTTAAATATTTTTTCTCATTTAGGTAAGG
TGAAATAAATAAATCCTTCGTTTATACTTGCAAAATGTTTTTATTTTAAATGTGTATTGA
AGGTTTTTTAAATTACCTCTTTACGGCTCTATGACCAGATCATTTAATAATACACCACCA
TAATATGTCAGGTGTATTTCAAAAGTCTTTATTATTTGTCTAAAAAGAATTCCTTCGCGT
TTACTTTAATATGAATGTATAAAACATTTACTTAAACCAATTAAGATCTCTCCTAATTCT
TCATATTAACCTCTTTAAAGTTTCCTAATAAACGTACTAAGTATGTTAAATTAAGACTAA
ATTTAAAAGGTATACATTTTTTAAAATATATTTTAAGTTTTTAGTATCTAAGTCCATTTC
AGATTATTTCTACAAATGTTGTCCGTTTACAACTTCACTGGCGACATATTTATGAGCGAA
TTATCACAAAAAATTTGATCTAATTCGCGCCATTGGCCGATTTTTTCGCGGCCGCGTCTG
TCCGCCATTTTGTCTAGTTTTTTACGTCAATGTAAGTAAAACATAACTAGGAAAGCATAT
CAAACAATTTACTACCAAATTGCATTTGTAAATAGAGTTCATATTAGTTGTTTATTTTAC
GGATAGTGTCGAATATCAATGGAGCGTTTTATTGGAAAACAACAGGATATCTATCGATGT
GGTTGTCAAAATATCTAAAGCACAAAAATTAAATCAGCAGTGAAATAAACTGTAAATCAA
AGTGCTAATCGTAATTTTACATCTTATTGTAAATTATTCTAAGAAATTCTATTTCTTAAT
AATATCGATCGACATTTCTCGAACGAATATAACCTTAAAACGTTAGCTGGTTAATTGTAT
CTATCTGAATTACATTAGATAATGACCGTACACAAATAACACATATTTGTTATATAATAT
AATATATTGCAGCGCTATCGACTATGTTTCCCTCCATAGAAGTGTAGTCATGAATTCGGA
TCCCTTATCGTTGACATATCGATATAAATTCCAACTCTATAACAATAGCTTTTTGGAAAA
TTATTTCAAATCTGACATACAAAACTTATCGATAATTCACGAGACACGTATACATCCCTA
GCGTGTAATTTGAAGTTCACATTATAACTCAAATATGTAATTGAAATATGACATATTTTT
CAAAATCGAGTTATAATTTTATTGATGAGAAAGATAATAAAAAATTACACAAATAACAGG
AGGGACAAATCTTTTATATATTTGTTTCTTAACGACAGAGTAACAACTTTGAAGATGAGA
CAATGTAATGTAAAAAAAAAACCAGATATATTGAATATTGACAAGCCTAGACGCACAAAG
TTTCCTTTTTATCGATATATATATATAATGTTCTCTCAACAGACACCCCTTATAAGTAAT
AACCCATTGAGTGCGCTCTGGCGTTTTTGTAATAGTCGAAGTATTCTTGTGGCGATGTCG
CATACTTTTTAACAACATCGTCTAGCTGCATCTGATCACCCCAGTCCGCGAAATTGGGAA
AGTAGGATCTTTTCTCATCGAATTTCCTCTCATTGACCGACCTGAGGAGGTACAGCCTCT
CGACCCACGGCCAGATCATATAGTCGAGCATACCGGGTCGATTCCCACCGAAAAAATATG
TACCTCTACTCGCCAATTCCTTTTCGAAGATATCTAATGTTTGTATGATTTGTTCGCTGC
CGAATGCGAAATTAGTATCGAAGCATTCGAGACTGCCTTTGATTAGCTCATTGAATCTCT
CTATAAGCAGCCTATCTTGTGCTTTCACATAAGGGTCTTTCGAATGCAAAGGATTCCTTG
GGTATTTCTCGTCCAGGTAATCGCATATAACAACGCTTTCGAACAAATATTTATCACCGT
TCTCTGTCGGTATTTCTAATACCGGGATTTTCAGCCGTGGGTTCTTCGCGCGAAACCATT
CGGGCAACCTCAACGGGTCCAGTTTGTACACCTCGTACTTGGCCTTCTTCGCTTCGAGGA
TCAGCAGGACCCTGTGCCCGTACGGGTTCATATCGACGTGGTAAAGCCGCAGCTTGTCAT
TCAGCTCCGGCGGTGGGACGGCGCCGGCTGTCCTTTCTTGATAGTATGACATTTTAATCA
CAATATAATGGAATTTAGGTTTTCTTTTTAATTAATTCACTTTATTTTCACGTAACCGTC
TAGTGTTCA
(5829 bp)

- SilkBase 1999-2023 -