SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_SariMG_comp28870_c0_seq4
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
putative_tick_transposon_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0015074 P DNA integration
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level
FPKM:16.04 TPM:16.09
ORF EntryO_SariMG10023_complete:A_SariMG_comp28870_c0_seq4
Sequence
(Nucleotide)
TTAAATACCCTACACCTCCTTACATAATTACATTAATTATAATTGCCTATGTGGAAGAGG
ACGTAACCTATTTTTATAACTAACAGGAGAGTGCTTATGACTATCAGCCGCCTTAGGAGA
CTGGTCTGCAATACTACCATCAATATCGTTTCTTTCTGCTATATTATTCGCATTATCTTC
TGTTAGATTATCTTGAATAGAGGTACGGGTTAGAGAAAACCTATTTTTATTTGCCTGCTT
GGGTTCTAAAATTTGGTCGATATGTCTTTTTACCGTATTATTTTGTAGTTTCACGGAATA
AGAAGACGGCCCTTCTTGGCTACTAACCTGCCCCTCTATCCATTTATCTTTACTCTTTGT
ATAATCTCTAACATACACTCTATCTCCTACATTAACTAAGCGCTCTGTACCGCCCGCACG
CTCTATTTGTTTATATTGTTTATTTTGCACGCGCCCTTCAATATCTGGCCGTAAAGCATC
TAGACGACTCCGTAGTCGCCGTCCTAACATGGCCTCAGCCGGTGCAACTCCTGTGGTAGC
TTGTTCACAATTTCTATAATGAAATAGCATTTTGTTTAATGCTTCATCCACATCAACCCC
TTCATAACAAGCCTTTTTAATACAATTTTTTACTGTTTTGACAGCATCTTCTGCAGCTCC
GTTTCTTTTAGGCCTATACGGACTAGTTAATGTGTGTATTATACCGTTTTTATCGAAATA
ATTTTTTAATTCATATGATGTAAATGGAGGGCCATTATCAGTCACTATTTGTCGTGGTAA
ACCAAAACGAGCAAAAATTTCTCTGACTTTATTTATGACAATTTTCGCAGTGGTACTATA
TAAATAAATGACTTCTATCCATTTACTATATGCATCTACTATAACAAGATAATGTTTACC
CTGATATTCTGCAAAATCAGCATGCAAGCGTTGTCAGGGGCGCGAAGGAAACTCCCAGGG
AGTGAGGGGTGCGTGCGGGGGCGCATCACGCTGTTGCCGACATGTCATACATTCTTTACA
TAATTTTTCAATATCACTGTCTAACCCTAGCCAATAAACATAATTCCGAGCAGTATTTTT
CATCTTGAGAATCATAGTCATCATCAAAATTTTTTTAATGTAAATGTTTTTAAATCCCAA
ACGGCGTAACCACGCTCGACCGAGGAGCGGCGGCCCGCCTGCCGGTATTATGTACAAGCG
CAGCCCGGTCGCTTCGCGTCTCTCTGCCGACCCCAAACCATCATCATAAAGCGCGGTCAC
GGTTAAAAACCCGATAGGACAAATTTTCTCGCCCGTGTATGAGTTTAATTTCAATTGAGA
TTGTGACAATAAATACTTTTTAAAATATTTGTTATAACATTGTTCACTGATAACAGATAT
TTTGCTACCAGTATCTACTTCAAATTTTAACGGAATATTATTAATAAACATTTTAACTAC
ATACGGTTCGTCTGTTCTAGCGTCGACTCGCATATTGTAAAACTCACAGTTGCTCTCATC
AGTGTCAGACTGTATGTAGAATTGGTTCCTAGTAGGAACCTGCCTCACTGCCGTTCGATC
CTTCACAGTTTTATCACGACACATCACTTTCAGGTGACCTTTCACACCGCACTCGTCACA
ATTATAACGCCTAAAACGACACTTATCTGAGGTATGTTCCCGGCCGCACCGCCAGCAATG
CTGCGATCGCGTATCCCTCGTTCGATAACTGCTCGTCTCGTTCGCGCCGATCCTATGTAG
TGCCGGTGGTGGTCCGGCGCCGTCCGCCGCAACTGCCACTGCGTCCGGTGCCGTGCCACC
CGAGCGACTCGCCTCTGCGTGCCGCTCCGCAGCCTCCAGCGCCAGCGCCAGCTCAACCGC
CCGCTTGTAGTCCACATCTTTCTCCGCGAATAAACGGCTACGCATTTTGTCACTCGCAAG
GCCCGATACGAACTGATCCCTCAAGTTTTCCTCTAATTTATCACCGAAATTACAAGTACT
AGCGAGATGCTTCAAATGTTGTAGATAAGTGCTCAGATCTTCATTCGGCATCTGACGGCG
CAATCGAAAAATGTGTCTTTCAGCGATGTCGGATCGTCTGGGCTCTAAATGTTCTTGTAT
AATATTAGTCAATTCACTAAATGTTTTCTGTTCTGGACTAATCGGTGCACATAGATCGCA
CATAAGATCATAGGTTTGTTCGCCGACCAAGGTAATTAACGTTGCCGTGTGTAACGATTC
TTTTATTTCGTTTAATGCGATAAATTGTTTGACACGACTCACATAAGTTGACCATTTTCG
CGTAGACAAGTCAAAACACTCTATTTTACCAAAAGGCATGTCAGAACACTGTTAAACACT
GGTAAAAACAATTTAATTTTAATAATCCTCGTCGCCAGTTGCGTATTACGTGTAGTGAAA
CACAAGCGGTAGTTGCAAAACTATTTATTATAAATA
(2436 bp)

- SilkBase 1999-2023 -