SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp15268_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein_2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase_isoform_X3_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000139 C Golgi membrane
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005795 C Golgi stack
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0006487 P protein N-linked glycosylation
GO:0008455 F alpha-1,6-mannosylglycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase activity
GO:0009312 P oligosaccharide biosynthetic process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016757 F glycosyltransferase activity
GO:0018279 P protein N-linked glycosylation via asparagine
GO:0030246 F carbohydrate binding
Transcript
Level		FPKM:14.43 TPM:14.47
ORF EntryO_SariMG1161_complete:A_SariMG_comp15268_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GTCGTACTGTAATACAACTGCGCCCCTGAGTATTTATTGAGAAAAAAATGCACCTACATA
AATTTATAGTCTAATACTTGTATGCCCTAATAAGACTTTTATCCCCCAAAAAGTTTGATA
ACATTTCTTAAACACCCCCTACTTTGCCGTCTCTGATGTTACACCAATTCATATCGTCTC
TCGACGTGTAGTGTACAAAAAGAAATGTAATGAATCTCAAATTGATAGAGTAATTTTTAA
TAATACCGTGAGTGACAGCTCATTGGGTGGTCGCGTTCAGGGCTGTATTTAGGGGAATTT
GGGGCTCAAATCACCTTGGGAATATCGCTCTAGAGTAGTTTCTCAACCTTTGTTTTGTTC
ACCGCACACATTGATAATATGTTTTTTTTTCTAGCGACGTATCCTCAATTGACCCTAATT
TTTTCTAGGTCTTCTAGTGTCCCCCGAAAGTCTCAATGAGCCACAAGTAGGCATTATCGC
CCACGTTGAGAACCTAGGGTCTACGGTCTCCAAACTGTATAACTTAAGTGCTAGACTGAT
CCAGGGGCTTAGAAAAATTGAAGTAAATATATTAAGAATATTATCTTTTTTTGACTAGCT
CTAAGTCTGGACTCTTGTTTTAACGAAAAATTATTCGCCCGAATATAGAATAGATGGGGT
TTCAAAATTTAAACTAAAATAATCTTGTAGTAAAATATTTCGTGGATTATGAGAAACGTT
AAAATTGTACCAAACAGTTATTAGGACCCCCTCATTTATATCCTGATTACGGCCCTGGTC
AAATATCTTTCTATAATGTAAAAGTTACGTATGACGTATTCGTGTAATGTTTGTGCTTTA
TACAATTGCCGAGTGATTATTTATAGCGAAAAGTGAGAGTTTAATTATTTCTATATATAT
TTGAATAGGAATAAAATACCACGTTGATTTAAAAAAAAAGGTGAATAACACATACACGTA
AAATATTTCAAAATATTATAATCTCTTATTATTCAGGAATGTATATCAAAATATATTATT
CACGGTGTCCTGGAGTATTCATTACGTGAGTGATTTAAACTACGGCGCTTTACAGTTTTG
GCGGGATTTTAATTTATTACGTGGTGGTATTTATTTTTCAAAACATTAATTTGAGATATT
TAAATTTATATTATGTTATATTAGAGGCATTTAACGTGATATAATTCCGTTTAGGTACTG
TGGACAAATAAAATGTATTGGAAATATCACAAAAGTTTTAACAAATAGCCACCATTTGTT
CGAACATTGTCCGTAGTCTAAAGAACTTGTATTCAATGACTGTAATATAGAATCTGTATG
ATATAAATATTTACCAACAGATGTCGCCTTTTAAATGTTTTTTAATTAACTTACTTGAAC
GATAGATGGAGCTATGTCAACATACGAAAATACTGAATCACGATAGAAATTTATCTCATC
AAGTCAAATAAAATCTCAATGAGTTTTTATACAATATTTTAATTGTTTTTGATATTTATT
TTAATAAAAACTGTGTTTTATAACGCGGTATTGGTCAGTCTATAAGATTAAACTTTTTTA
AACCGCAATGACGATATTGATAAACATTGGAATCTTTCCATTTTTATACCGCCATTTTTA
TGAGAATTATGATGTTTTTTTTTTAAAGTAAATCTTGAAGAAATTCTAAATCTATTGAAG
AAATCGGCTTACAGTTATATGTAAGGTAATACGTATTTGTATATTGATGTTTGTTTTCTC
GTCAACATAGGGTTGAAAACCCCACGGTAAAATCCTAACCAGGGTGCTCGGTTGCCAATT
TTAATCTCGATTCACGGTTTTTTTAGTAGAGTCAGCTCAGTAATTTATTATTATTTGATA
TCATAATGTTTAATTTTTTTGTGTTGTTTCGTAACCGATCATTTCGAAAATTTTTCTTCA
TGGATAATAGATGTACTTCCTGATCTGTCTCCCAACTTTTGTCATATTTGCACAGAGCTC
TTGATCCCGTAAATCGCCCCAGCCGCCGTTGCCTTTGGTGAGTTTCTTGTTATGTTTAGC
GCCACCCGAGGTGACTGTCGCCGTCACCTTCGCCGGAAATAGGTAAGGTTTGGCGGTCTG
CAGTAACTTCTGGACTTTACTAATCACAGCCGATGCGTTACAGTTCGATTTTTTATGGTG
GAAACCGCATTCCCCTATATGAAAAATTCTAGGACCTTTCGACATGATAACTTTGAACTT
CTCCCTCCCAGGTCTGTTCTGAGAGAGATGCAGAAGAGAATAGTCCCAATTATAATCATC
GTAAGCGCAGAACTGATCCTGCAGTTCCATTATATTATCCCATACGGTTCTGTTGAAAGC
GAAACCCATGTTGTGCATGCTCGAATGCCATGGTGTTATTTCCACCTTATCACTTGTAGA
ATGATACTGGTATGTCTTTAAATATGTCCCTAGGGATATGATTTCGCATTGCGGACATGT
TTTATCCGCTGTCGTGCGGAGTAAATTAAGTATGTAGATGAAATCTTCGGCGACGTAATG
ATCTTCCTCCAAGAAGACCACCATTCCTGTATGGTTGGACGTGCATTGGAGTTGGTTAAA
GATCCTGTTCGCTTTCCACCACCAATGGTTCTTCGTCTGAGCGTATTTCGCTTCTCTGTA
ATGCCCGTGAAGGTCTGGATGTAGGGCGTTGTTACATTTCAGTTTGACTGCCTGTTCTAT
TTTCGCATCCCGCGGACAGTCGTTCGGATCCATACCGGGAAACTCATTAGGGTGGGTTTG
TATTGAATAAGGGTAGAATATTTGTATTACCTTCGTGAAGTCGATACTTCTGACCAAATT
GTTAATCTCCTCATCGTAGTAATCGTGAGAGAAGACCAACAGCGTTCGGTCTATGTCTTT
CGCTTGGGCCAAAGACACTATTAGATGCCTTAGGTAAGTCAGCCTTGTATGGACCTGTAT
TGCTATTATAATTGTATCCTCTTGCACCGGGCCGAATATATCTTCATTAATTATGTATTG
GGCTTCGTTGTATTTCTGGATGGCCTTACGTATTTGTGTAATATTTTTTGTGTTGACGCG
AGCAGTTGAATTAGCGGTGACATTTTTAGGATGTACAGTTAGATATCTGTGCAACTCCGG
CGGTACAAGAGCCAGCACCTGTTCAGAAGTTTCGTTGCTGTTCATAAGTTCCTCTTCTAT
ATAATTTTCTTTGGGTAACAGCATTCCTTTTAAATTAATCACATCGTTTGCAACATTATC
GTAATCACCGTCCCTATACATGCCTCCGCTCGAGGCGGCGAGCATTATCTGCAGCCATAT
ACAGAACAAGCCCAGTATAACGAGCACTCTGACCAAGGAGCCATATTTCAGACGTGGCAT
TTCGTTTCAATTGGAACGGGCCGACGGGACCATCTTCAAAACGCTTCCCGTTTAGGCGGT
TTAGGACTTCGACTCATGGGAACGGATGTCAGGTCATTGTATACTGGTCGTGTCTGTTCA
TAAACATATATCGAAATCAACTTTTAACATCACCTTCGTTTTCCAGAGTAACTAAATAAT
TCACTTCAAAAAAGTAAAATTTTTACCGAAATACAAAAACTTAAATTTAAAATCATCCAC
TATTTAAAAATAAACTTTGAAATAGGTAATTAAAACACAAATGTCCGCGATAATACACTA
TAAAAATGAATATATTTTTATAAATAAATTTGGCACGATTTATTGTCTGCAGAAAATTAA
TCCGCAATTTTTATAAAATAAATTTTGCGCGAACTTCGCAAATGAACTGTAATTTTGAAT
GGCAAAATAAACGTTTCAGAGCTTGCAGTTGGTCACATGACGCTAATTAAGCGTATAAAC
AATTTAAATTGACTAAAAGACGATGATGACACCCGCAAAGTGCTAAACAGGTAAAAAAAA
TTCAACCTACTTGTGATGGTAATATTTG
(3928 bp)

- SilkBase 1999-2023 -