SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_SariMG_comp15106_c0_seq2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_acyl-CoA_synthetase_family_member_2,_mitochondrial-like_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0006631 P fatty acid metabolic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016874 F ligase activity
Transcript
Level		FPKM:6.55 TPM:6.57
ORF EntryO_SariMG1057_5prime_partial:A_SariMG_comp15106_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTATAAATTTAACAAAAATACTTTATTCAGTTATAATAATAATTTATCAACGTCA
AAATACTATCAGAGAAGGTACCAAGACGTACCACACAACAATTAGAAACTATTAACTATA
ATTAGAATTAACGTTTGCCTAATGTTTAAAACATTAACCATTGCGGAAACCAAAAAAAAA
TTGGTTATGAAATTTAACCATATTTTAATTAAATGTTTAAAATTTGAAGGACAACACGAT
AAATACTATCGATGCACGTTAATATCTATTAAAATAGTGGAAATTATTATCAAAATAGCA
AAATTGACAATCGGCATTTCCCTGGATTTGCGGACATTTTTATATTTCATATAGACTTTT
AAAAATAGTGTGTGTCCATCAATGAATTATCTTATTAACAACTTAATTTTCATGACAATA
TTACAATAACAATCTATAATACTATGTCGTTATAAAAATTAACATTAAAGTAAAATGATT
TCAATTATTAAGATTGAATACGATTAAACAACTGTTTTGTGTTTGTCTATTTAGTATTAC
TATTTATTGAATCCGAGATTACGGTAGAAAGAACATTATAAACGGTGCTGTGTTTTTCAG
AATTAATGCTGGCAACGTTAACAGCTCTGCATTATTTATTCTTAAGGTAAAAAAGCCAAC
GTGTGCTACACAGCTGTCTTTAGGTAATAATCTGAACGATTAATTGATTTCATTTAGTCG
ATAATAATTATTTATTTATATAGCTTCCATAAATATATTCTATACAAAATATATGATAAT
TATTCAACTATAAATCTTCTTTAGATTTTAACCTAAACCTCAAAATCCTAGTTCATACTT
TTCCCGACTCAATGATCTCCTTTAATTTATACTTCTGTATTTTCCCAGATGCAGTCTTAG
GGAATTCGTCGACGATCTTTAGCAATCTAGGTATTTTAAATTTAGCTATTCTGCCGCTCA
AATGACGGGAGACATCGTCTAGGGTAAATTTAGCGCCTTCTCTAAGTCTCAGAGCAACGC
AAATTTCTTCACCGAGTCTCTCGTCCGATACTCCAACAACCTGACTCTCAATAACATCAA
GATGGGTGTTCAGCAAATCCTCTATCTCTTTAGGTGCAATATTCTCTCCGCCTCGTACGA
TAATGTCTTTTATTCTGCCTACAATGCGACCATACCCGTCTTCGCTTACAGTGAACTTGT
CGCCAGTCCGAAGCCAACCGTCTTTATCGATGGTCTGTTTAGTTTTCTCAGGTTCATTCC
AATAGCCGATCATGTTATTGTAACCTCGTACGAGGAGCTCACCAGGATTTCCAAATGGTA
CTATTTCGTCTTCATTGTTCACCACCTTAACTTCGACGTGGTCTTGTATGTAGCCGACAG
TCTCAGCTACCACATCGATACTGTCGCTTGAAAGAGATTGAAAAACACACGCAGTTGTTT
CTGTCAATCCATAAAGTCCCTTCACTGAATCCGCTTTTAGATACTTCTTTATGTCACGTA
TAAGCTGCGGACTGCAAGGTGCACCGGCAGCCAATGCTAGTCGCAGATGAGAAGGTATAT
CTTTACCCAGTCTCCTTATTTCAGACAGGATGTCTACGTACATTGTTGGAGTTCCAGTCA
AAATTGAACACTTTTCTTCAAACAGAGTTTTTATGTTGGCGGATACGCTGTAAGCAGGAG
CGGCCAAAACAAGCGAGGAACCATGTCGCAGACCAGCAAGAACGGTGATGATTGATCCCA
AAGCATGAAATAATGGCACCTGCACGCATATATTTTGGTGTCCCTCATGGAATTCATTTC
TTTTGCCGGTGAAGTAAGTGTTATTGACCACTCCGTAGTGTGAATCTAAAGCTGCTTTTG
GTTCACCTGTAGTCCCGGATGTGAAGTGAATAAGGCAGCCATCTTCTGGAATCACTTCTT
TCCCATATATTGATATCTCATTCCTATTTCTATATTCTCTTACTAATGAACCAAGCGAGA
ATGTACCTGCAAGTTTCTCTTTACTATCAACGATAATAGAAGTCAAATTAGGAAAGCTCT
TCGAGTTTAATGACCCCGGTTTCCCGTTATGTAATTCCGGTATCATTTGTTCTAAAGTGT
TGTAATAGTCTCTCTTCGGCAGTCTATCGCCTATGAGAAGAGACTTCATTTCAGTTTTTC
TTATGCAGAAACTTAGTTCGTTTTTTTCGTACGCTGGATTTATTAATACCGATATAAGTC
CAGCCCTCGCAGCAGCAATCACAGCTACGATCCACGATACGGAATTGTGTGACCATATAC
CGACTCTGTCGCCTTTCTGAAGACCCTGGTCTCGTAAAGCGCATGCTAGGGCATCTGCCT
GTGTTATTAAATCATCGTATGTCAGTGTCAGGCTTTCGTGCATCGACTTCACAGCGATAC
GCCCCGGGTATTTATCTATAGTTTCTTTCAGGACATCGCCGAGGGTGGCATACGTCAACG
GCTCCGAACCAGGATTGTGTAAATAACTTCCACCGGATTGAATTTGACGAACCCATCTGT
AATTCAAGTTCAAATTGATGGGTTTTATGATACTTCTCACAAATAAATAACTTTTATACG
ACATAATACTACACGGGACCGTAGTCTGCGA
(2611 bp)

- SilkBase 1999-2023 -