SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_SariASG_c38816_g1_i3
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
MATH_and_LRR_domain-containing_protein_PFE0570w_isoform_X1_[Helicoverpa_armigera]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005768 C endosome
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005802 C trans-Golgi network
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005923 C bicellular tight junction
GO:0007030 P Golgi organization
GO:0030054 C cell junction
Transcript
Level
FPKM:3.91 TPM:3.78
ORF EntryO_SariASG16353_3prime_partial:A_SariASG_c38816_g1_i3
Sequence
(Nucleotide)
GTTAAATGAAACCCTGTTCTTACATAGTGTCAGTAATTAATATCACAATAATATGCACAA
AGCTTTTCTTAATTGTTTTGCAGTTTTATTTTTGTTATCTTCAATAAAATAATTTTTTGG
AAGTTAGATAATTTTTTAATCACCTTAGTTTAAAATTTAATCGATAATGCGCATTGAATG
TAAGGAGTGCAATGAGGGTGCAGATGGGCTACAACTGCATGCAGAATTGGACCATCTACG
GCAACATCTTTCTGAGAGGGATTCTCACATTATAGTAATAGAAGGAGAGTATCTTAAGTG
TACTGCAAGGGCTAATGATTTAGAGGAGCAACTAAATACTTGGAGAGAAAAATATGAAAG
ATTATATGACTCACATAAAAGAGTTCAGAAATTAAACCAAGTGCTAGAGGACAAATTATT
ACAAATGGTTGATAAAATGAAGAGTGAAAAAAGTCAACTAACCAAAGACATCGCTACATT
ATCAGTTAGGCTAGCAGAGTCAAAACATAATTACAGTATGCTACAGAAAGAAAATGAGAG
ATATAAAAATGACATGAACTTAGCAATTCAGTTGTTACAATGTAAGCCTGACAATTTTGT
ATCACAAAAGTTGGACAATTTGTCGGTGGATACACAAGCAAGAGTTTCACAGTATGTTAT
GTCGAAAACTTCAAAACCATCAAGTGCTACGCATTCTAAAAATGGTAACGACATTGATCC
CTTTGACGCCAGTGAGTATGAGTTCAACATTTCCGCTTCCCTCATGACTAAAATTCTTGA
AGATAGTATTCAAGATACCGTGACGAAACATTGCGATACATGTTCATGTAATAAAACGCA
CAACAAGCCGTTTTGCTACAATGAAAGTTATTATTCTGTATCTACACAGACGGTACTTAG
TGGTGATCAAAAAAATTCATTATGTCTTAACTGTAATGCGGAAATAAAATCTGCACACTC
AAATTTGAGTGTTAGAAGTAACTCACCTCATGTTATTAAGCTTATTAATGACACAACCTC
TACACGTAGCTTAATATCTCCAATGTACATAATTCCCCAGAAAATTTACAATGACAAAGA
AGTTCATGCGCCCATAACTGAGAATATCAAAAACATTTCCATTTCTGCTGATAACATGAA
ATATGAGGATGATAATAATATCTTAGAGACTAATGTAATTAAAGATGCTTTGTCTAAAGT
TGAAATTACAAATTCTCATAGACATAATAATGACATGGACATGGAGCCGGCCGTTCATCA
TAAACTATGTGATCGCACTAAAACATCAATTTCTAGTAATAAAAGTAGTATCAATGGTGC
AGGGCTTGATGATTTGCTTATGAATCAAAACAAAATCAAAATTAAAGAAACAAAATCAAT
AACTGACAAGAAATTAGCGGATAATACAAGTTTAAGAAAAAATTCACATAGCTCCATGGA
TGCAATGAGTAGAACTTCATCTATTGCTAAGTCTACAGTCAGTACGCATAAATCTAACGC
TCAAGTTGGACCTGGACCTAGATTCTGTCATTTGCGTATGCAAGCTGGCTCTAAGAATAT
CTTACTTGATAATGCTGAGCCAGATGTTCCACCAGTATTATATACGCGTCAAAGCAAGTG
TAATGAACATTCTTTATTCAAAGATCTCACTGATGATCTTGATAATTTTATTAACTTGGA
AAAAAGAGAGGTCAATGTGAAAGAGGAACTTAAAAATGATAATGTTGTTGTGGAAAGTAC
TCTTATTGATGTTCATATTGATAACAACAATAAAGACTCAAACACAGTGGATGAAGGTTC
TGCAATCAATCCTATTTTACTAAATGTTTCTTCTTCTCCGCTACAACCACTAAAAACGCA
TAACTATTCAAATAGTTCCGAACATAATAACAACAATAAATCTCAAAGTAGCCAACAAAA
TATCTCGGATATTGATAATTTGCTCAATGATTTTAATGCTAATCTTAATCGAAATAATAA
TAGCAATATTGATGATGTGTCTAAGAAGCAAAATGTTTTGCCTCCTACTGATAATCACGA
CGTTAAAATATTTAATTTTGACCGTTATGAACAAAGTAGATTTTCTTCTGGTCAATATAA
TAAACCTATGGAGAAAATCGATATGTCCCAATTACACTCTATAGAAAAAACTAAAATATC
AAAAGATTTACCACCACTGGGCGAGGCATCGAAGTTGGAAAACAAAACGGATGGTGCGAA
AGCAACGATGATGCCTCCAGTAGTTAACGTTTATCCGAATCTAACACAAACTCATTTGAA
AGTAAATGAACATAACAAAGTATTTACAAATGATCACAGTGTTAGTTCATTGTCAAGTGA
TGATAGTGCTGCTCTGTTACAAAAGCAACAATTACTTAGAGTTGCTGAGTGGGTGGAGAA
GAATTTAGAGCAGCAAAACAATTTTAACGAACCACTAGACGATGACGGTAATTTTAACAA
TAGAGCTAATAAACGAGACAGTAAACTTAGCAGACTTACTGAAACACTGAACGAACTTGC
TCTCAATATGCCGCATCCTGTAAGCAAATACTCGAAATCATATAACAAAGAACGCCACAG
CACGTGGCTACTAAACAATAATATTCCTACACATGAGAAAATTTTAAAACATAATAATTC
CAAGGCTAATAAAATATCCTGTAATGTCGTCAAGGAGACGATATTTCCAGTTGAATCGGG
TGGAGCTACGACAGAAATACGTAAAGAGAATACAATGAATAAGGGAAATGCCAGAGATTA
CGATGTAAATAAAGAGCTTTTGTCTACGTTGAAAATAAAAAGTGAGAAGGAATTGACTCG
CGAAGATTTAGCAAGAATGGAATACAATGTCAAGAAATTTTTGTTGAGCGGACCCCACTG
GGTGAACCCTGCGCCTGTTGGCAGAAGTCGACGC
(2914 bp)

- SilkBase 1999-2023 -