SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_ErmoMG_comp37579_c1_seq4
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_CUGBP_Elav-like_family_member_1_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0008380 P RNA splicing
Transcript
Level
FPKM:1.49 TPM:1.09
ORF EntryO_ErmoMG18141_complete:A_ErmoMG_comp37579_c1_seq4
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTCTTTTTAAACTTGACATTTATTTACATTTACATGAACAAAAACGGGTGTCTGT
ATAAAACAGTATTTGAATTTTGCATATACTTTTCTTTATTCGCTAAAGTGCCTCGAGATT
TGTAAAAATAGTTTTTCTTAGATATGCAGATTATTGTACCGTGACTCTAATCAATAAAGC
CGTTTCTCGCCCAAGCAAGATATTTTGTAAAATAAATGGAAATTAAATATTCAATTGATA
ACGAAGTTACTAAAGAAAAATTGTTTTTGGATTTATATAAATCGGTAAACTTAAATAACA
GGAGAAGTAGAATTTTTATATAAACAGTTAAAATTTCTTTACTTTTGGGTTTGAACATTT
TTTTTTGGTTATCTAGGGAGCCTTCTTACAGTTAACAGGCAACACTGACGAATATGTCAA
ATGTATGAAAAGTTTCGTAAAAAATTAAATTTCCATTTATAGACAAACTGTACAATGCAT
TTTTATGCAACAACATTATTCAGGTTTAATAAAGTACCTAGAAAAATTTAGGTAAAAAAT
TTATTTAGTCTAGGGCACACCCGAAGCTGGGTATCCATTCTTTGTATTTAACCAATTTAT
TAAGTGCACAGATGATATCTCAGGATGTCTCTTTCCATTTAAAGACGATGGAAAGAGACA
ACGTTATATGGCAGTACACATGGCTATCAAGTCATGGATAGCCAACCTCAAAATTACATT
TTAAATGTTCGTGTCTAGGATTCGCATTTTAATAACCTAAAAATAATCAGAATACAATAT
AATCTTCAGTTTCATCTCTTTAAATATACTCTCATGACTTTTATAATAATTTATAATCTT
AAATAACAAAAAACTAAATCGAAAGACAAAAAGAAAAGAAAATTTACTTAATAATAAAAG
AAACGACAAAATTTTACTACTTACACTTTACTAAAGGAATCACAAGAGACAATTTTATAT
TTGTATCGTCTAAAAGGAAACTTATTCAGTCTAAATATTGTCTTTCAATAGACATTTGAA
ATAAAATCTGACCGGAATAAAGTGCAAATAATACAAAAAAAGTAACCAAAGAATTCAATT
AAATTGGGTATTTCCACTGATCACACAATAAACGGACAATCAGAAATTAATCACAAAAAA
ATGTATTTAATCTGCAACTAAAATAGTTAATTTTTAATGACCTATGTTCTTTTTAATTTC
CATTAGTTGTCATATTAAAAACGTTAATCAATATGTAGGTCACACACACTTAATTATTGG
TCATAGTGATTCAGATCACAGCAATAATTTAACATTTAATTAAACGGTAATAAACTCATT
TCTATTTTAATTGGGACAGAACAAAGCTTTGGCGTAAACTTTAATGCTCAATTTGAATAT
TCGACGTTTAAAATTATTTTAAAAAACGAATTGTAACCAAAATCGTAGACTAAATATCGA
CATCAACTATAGCATAGACAATGCAAATAATTTTAATGATTTTTTTAAAAAGTTTCGGGA
CTCAATAGTATAAAGAAAGAGAAATGAGTTAATTTCCGTCGATCGTTAGGTAGGTACATC
AAAGTCTTAACGAAGACAACATAAGTTAACATGTTACAAACAAGAATACTGCACACTTTG
AACGAATACTAATTAATGACAAAACAAATTAGTTTAGACACGACTTTACACGTATATTAT
TGATTCCCTTATAAGTTTCCTTAATCCTTTTCATTGAGCGAAGTCCTTACATACGAGCGA
AATACAATGAAAATAAAATATTAATAATTAACACTTAATCGTACAACTAAGTAGAAGTTA
GAACGTTGTGTGAAAAATGTTTGCTGTTAGGAAACCGTAAGTACGCTCATTTTATTGTTT
TTTTTTTTTAATAAAATCAAAGGCCGCGAATATTGTCTCAAAATATCCAAATAAATTGTA
TTGAACACGATTAAGTAACAAGGAACGTGTTTGATTTGTAAAACCATAGGCTGTTGTTTA
TTTACATTTTAAATTTTATAGTAAATCTTTTTCGAGCAAACTTTTTTCACAACGTATCAT
AAGACCTTAATAAAATATAATAACGCAACGTGCCAGTGACAATTACGAAAACGAGTAGAG
AAAAATACAATAAATTTGTTTAATTTAAATAGAAGAAAAAAATATAAGAAACACCAAACT
TACATGCGAAAAATATTCTAATATTAAATTACTTAATACTAAAGAAAAAACCTTTTTGAC
TAAAGGGCCAGTGTTCGATGTGTATATAAAATAATTTTAGTTAAGCATCGTAATATATTT
TACTTTCGTACTAATGTACGTTTTGTGTAAAAACTACATTAAAGAGCGAAAACAGTACCA
TTAAAATACTAGGTAGCTCACAGTTACAATAATTCGATTGAAAAAAATGTTTAGTGTTAC
GAAGTTTTGGTTTTCCTCAAAAATGTAAGAAAAGTATTATGTAAACGCAAAACAAATTCA
TTTGTATTACTTCTGAATAAATTACCAAAAACTTTTCACAGGAAATTAAACGATATTTTT
AGACATAAATTGGTGTAATAACTACACTTGTCCTCATACTGGTGTGTACATAATGGAATC
ATTTAAAAAGAATTTTGTTCTGTCGAAACTATTTTAGGTAGTTATATTCTACACGAGCCC
TTACGATGTTAAGTACTTTTAAAATCTTACAGCATGGTTTGATAGGTTATGAACGTAACG
CAAATGTCACAAAAATCAGGTCAACAACCTTTTGTAGATATCTGAGTCTATAGCAAAGTA
ACGTTGTTAGAATAAAAAACGATAATTTAAGAGATTGTCATTTATTTTCGATTTTGATGT
CGAATCTAAACGACAATCATACAATGGTTACTGTCTACTATTCTATAATATTGACGTAGA
AGCCACTTTGTTGTAGGCCCAGCTGTAAGACCTTCCAGCTGAGATTGTCGAAAACCAAAA
TTAAAAAAATGTGCTAACAACAAATACACTGATCACTTTGAGATCATTATCTTTATTCTA
AATCTTAATGTTTTCAACAAAAAAGACTGAATTGCAACTGATAATGGCCACGAATACATT
CCCTACGAGTGGTAACATAAAATTAAACGAACGATATAACAATGAAAAATTATAACTAAA
TTGTTCGAAACGAACGCAACCTTTAAATAAAACCTACAAGCAATACTTATTTGGTATTCA
TAATCTGAAAAACAACTTTGGGTGACGAAATAACTTTTTCATTCTGTAAAAGTACCAGTT
CTTTGGCGCTTACCGTAGTTGGATCCCGAACGAATTCAATTTAAAAAAAATTTAAAAACG
TCTGACTAAATGATACCAACTTTAAAAATTATAATAATAAAACAAATTTGGGGAATACTT
TGGAAACGATAAATCCTTTGACACAAACCTTATTAAATACACATACTTATTAGTTAACAA
CTGTGCACTCGGATTCGCGTTTTCATAACCTCCTTCAACTTCCGTAAACATCGTGTGCAC
CGATACATCACAACAAACGTTCAGAAACTTACAACCTCTTTTCGATAAAGTTTTTTTTTT
AAATTTTGCACTAGGAACGTATTTGGAATATTCTAGTACGGTCTCGATAGTTCCCTGGAT
CGTTTCAATTGAACTTTGAGTCTCTTTGTACCTATTTGAAAGCCGTTCATGGCTTGTATG
GCCGCCTGGGCAGATGGCGCATTATCGTACGAGACGAAACCGAAACACTTTGACAGGTTC
GTCTGCTTGTCTATGAACACTTTGGCCGATATCACGTGACCGAACGGTAGGAAGGTAGAC
GCCAGATCCGTGTCCGTGAACTCCTGGGGGAGGTGGTAGATAAATAGGTTGCCGCCCTCC
GGACCTTCAACTTGTTTCCCTGCGGCCGCTGCGGCTGCCGATCCCAGGACTGACCCGAGC
GGCGCTGCTGCAAACGCAGTGCTGCCGAACTGCGCGGCGTACGCTGAACTCAGCGGCTCA
GCTGTTGACCATAGTTGCGGTGCGGCGGATTGCGGCGCGCTTGTCGGAGCGATTGGCGCT
ACCGCCTGCGACTGGGATACGACGGGGGGTTGCGCAATCGCCGCCAACGCCGCCAGGTTC
TGTACCGACACCGGCGCCAGGAGACCCCCAAGTTGTTCCGCCCCCACGCTCCCCACTCCA
CCCCCGCTCAATCCTGCACCATTGAAACCGATATCCTGATAGTTAACACCTTGCAATAAC
GTCGATCCCTGCCCCTGAAGCAATTGCTGCTGTAACCCGACCGCCTGCAATTGCTGCAAT
AGTTGCAGCTGCGTTGCCGGCGAGAGAGCAGCTTCAGACGCTAGGTAAGCCGTCGGTGCG
ACCGGCGTCGTGATGCCCCACAGACTCGCCTGCATCGCTTGCATCTTCTTCTGTTCCTTC
TCTTTTTGCGTGTCCGCAAACTTAACGACTAGGGGAGCTGAGCAACCTTCCATCGTCTGA
CTGTGATGTAGAGTTTTAATGGCGGCTATAGCGGCCTGTTTCGACACGAAAGTGACAAAA
GCGCATCCTTTACTCTGACCCTGCGCGTCCCTCAACACGGTACACTCTTCAATGGCTCCG
TGACCCGAGAATAGTGCTCGCACGTCGTTCTCAGCCAGTTTCTTGTTCAGCATACCCACG
AATAGTTTTCGTTCGTTTCTGTTTTCACTGTCAGCCGGCTTCATTTGAATGGGATGGTGC
ATCTTTACTGACTCCGGTGATCTTGTCCCGTAGCACGTTGATCTGATGTACTCTCCCGAA
CTCCTCAAACATAATCCTGAGGTCGTTCTCGTCCATATGCCTTGGCACCTGACCGACGAA
CATCTTAATGTAGTCAGGATCTGGCACTTCAGGTTTCTCATCGTTGTTATTGTTGTTAAT
GCTCGTCGTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTTATGTTCATATTCAGCCCATTCGGCTTGGT
GTAGGGGGAGCCCGGCGAGGTCACCTTGTGGTTCTTGTTAGGGTGCGTGTGTCTGTTCGC
GTTGGTATCGAGGCCGCCGCCCGGCGATATCTTGCCAGCGAGTGCGTTCAATGAGTGTAA
CATAACGGGCGGCGGCCGCCTTTTTCCAAGCAGCCTGGTCACGCTGGTGTA
(5091 bp)

- SilkBase 1999-2023 -