SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_ErmoMG_comp37571_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_serine/threonine-protein_phosphatase_2A_catalytic_subunit_beta_isoform_isoform_X1_[Papilio_polytes]
Ontology
GO:0000775 C chromosome, centromeric region
GO:0000922 C spindle pole
GO:0004721 F phosphoprotein phosphatase activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005694 C chromosome
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0006470 P protein dephosphorylation
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0046982 F protein heterodimerization activity
GO:0051321 P meiotic cell cycle
Transcript
Level		FPKM:24.08 TPM:17.72
ORF EntryO_ErmoMG18076_complete:A_ErmoMG_comp37571_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GCAAACGCCATTTTGTAAAGTGTCCGCTCTATTCAATTTTCTGAAAAAGTGTAAAATAGT
TATTTCGCATGATTTTGTGTACAATAATAACATAATAACAACCAAAGTTCGAATTAACGT
CTCGCACGTTAATTACACTCACACAAATAATGGAGGACAAGGCGTCGCTTAAAGAACTGG
ATCAATGGATACAACAGCTAAATGAATGCAAGCAATTGACAGAAAATCAAGTTAAAACGT
TATGTGACAAGGCAAAGGAGATCCTCACGAAGGAATCGAACGTGCAAGAAGTAAAATGTC
CCGTGACCGTGTGCGGCGATGTCCACGGTCAATTTCACGACCTGATGGAGTTGTTCCGTA
TTGGGGGACGCTCGCCCGATACTAATTACCTTTTCATGGGTGACTACGTGGATCGTGGCT
ACTACAGTGTTGAGACAGTCACATTGCTGGTTGCTCTTAAGGTGCGTTACCGTGAGAGAA
TAACCATCCTTCGAGGCAACCACGAATCGCGTCAAATTACTCAAGTATACGGATTCTACG
ACGAATGCCTCCGGAAATACGGCAACGCGTCCGTTTGGAAGCACTTCACCGATCTATTCG
ATTTCCTGCCACTGACTGCCCTCGTCGACGGACAGATATTCTGCCTTCACGGCGGTCTCA
GCCCGTCCATTGACACATTGGACCACATCAGAGCCCTGGATCGTCTCCAGGAGGTGCCCC
ATGAAGGTCCCATGTGCGATCTTCTCTGGAGTGACCCTGATGATAGAGGCGGATGGGGTA
TATCTCCCCGTGGTGCTGGCTACACGTTCGGCCAGGACATCTCGGAGACGTTCAATCACA
GCAACGGACTGACGCTCGTGTCGCGCGCCCACCAGCTCGTCATGGAGGGGTACAACTGGT
GCCACGATAGAAATGTCGTCACTATATTCTCAGCACCCAACTACTGCTATAGATGTGGTA
ATCAAGCCGCCATAATGGAATTGGATGATGCACTTAAGTATTCATTCCTGCAGTTTGATC
CGGCACCGCGTCGCGGCGAACCTCACGTGACGCGGCGGACGCCCGATTACTTCATGTAGG
CTACCGCCACGGCGCATATCATGCAGGATCCGTGCGAGAGAACGACTACATCCCTCCTCG
GCACGTCCCGCCGCGCCACGTCTCGCCGCGCCTCGCCCCGCCGCGTCTCCCGCAGTGCGT
CCCGCACCAACCGCAACGCGTCCCACTCCGACCGCAACGCGTCCCGCACCAACCACAGCG
CGTCCCGATACACCGCACCTCAACACAACGCGTCCCGATACATCGCGCCCCAACACGACG
CGTCCTACTTCGCCGCGTCCGAATACGACGCGTCCCGATACACCGCGCCCCAACACGAAG
CGTCCTACTTCGCTGCGTCCGAACAAACCGCACCCCGTCTCACGTTGCGTTTGCATCCGT
ACGACGCGGTCCCGGAAATCACGTTACGCATACGGTTCTCTTTTACGACGCACTCCTCGA
TTGAAGACATCGTTAATATGTATTACGGTTCTCTTAATTAACGTTTACATATATTCCAAT
AAACAATAGCACAAATGAACAATGTCACATTTAAAAGGTATAAAAGCAAAAGAGCCAAGT
CCTAAATTATGACATTTTGAACTGGTGATGTCATATTGTAATTCACGAAACTGCATTTTT
AATACATGTCATCTATCCCAGTTAAACTTTTTCACTGTTTAATAATCTATTCCATTAATG
GAAAAAAAAAACGGTAATATAATTGCGTAGTGTCAATAATAATGTGACGAATTTAAACGT
TTTGTGACTGAAGCGCCATTGCTTTTATACTTCTGGCTTTTTCAATATAGAACTATTCAT
AAATTCACATTTAATTAAGCATTTATCAAGTGCGTTTAAAGCAATTCATCTTGACTTATG
TTTGATATTTGTAGTAAATTGTGACATTGCTTCTATCCTTGGTCTATTCTATTGCGTAAG
TCTTCGAGTGAATGTTTATGTGTGTGTCAATGAGTATTTAGTGTTGTCTTGTTCTTATTC
GTTTGCTGAATTCGTATAAATTGCGAGTGTCGAAACGGTTCATGATAAGGCACTTTGTTT
TCCCATTTGTAACTGCGAGATTGCTAGTCAACGTGTGAATGGAACTTGTTATTGTTACAC
ATTAGAGTGGTGGTGAACGTTTTGTATCTAAATGTATGCTTAAATTTTAATATTTCATCT
GTAATTTCTCTTAGTAAGTTGTAATACGTTTTGTACTTCGATGAAGGAGTTTCGGGGCAT
TTGGTCACAATAATTTCGATGTGGCACACTTTATGTGCGTTGTGAATGATTTCATGTTAT
TATCTATTTATCATTAACAACATACATGGAGTAATCGTTGAATGCTTATTTGTATTGAAA
ACTAACAGTACGATAATATTAAGTTGTTACTCATTTTGTAAAATGTACTAAGAAACTTAA
CAATTTGAAACTACACAAAATTATTTCGTGTGAAGTTTCTTCGTAACATTTTGGAGTGTT
TTTTTTATTTCGAGTGACTAAAATGCATGTTTTCGCGGAAGGTATAGGCGGGGTGGGGAC
GATAAGATTTTTGCGATTTTTCGTGACCATATTCGACGAAAAAACAGTTGGCGTTATCTG
ACTGGCTTCAAGGTTTAACGCTACTCTTTAATACACTATTATTGTTAAGACGTGTTCACA
CATGCGCAGTGTACTAAAGCTTATTCCGCATTTTATTTTGCATGCTTATTTCTGAACGCG
TCTTAACATAATAGATATATTTGCTCGTTGAGGATTATTGTCTCGTGAAATGTTCAACGT
GCGGACGCGCGCGTTATGCTGGTATGTTCATTAGCAGCCGAAAAAAAAACTTGTATTTAC
AACATATGTATCAAAGACAATTAGACCTCATTAAACGGCGTTCATTTGCTATAAACGTAG
TTTTATTTCGCATCCATAAGTCACCAACGAATGAACAATGGACATACCATCATAATTCAT
CATTGGTGACTCTCATAAAATCATTTTTCACTTGGGCCTGACTAGATTAAGAGCTTGAAT
TTGATTTGCTTTAAGTAAATGTGGTCGATATTGTAAACTTAAATTTAAGCTTTTTTCTGT
TTAGGTCCGTATCTATAAGGTGTGGTGTCCACGATAGTTTGAGGTTTAAAGCGAACAACT
GACAATACGTATGTAATGTAAAATTTATATTTGAATTGAACCTACTATCGACGGCGCTGT
TGTTTTGTGTAAAACCAAAATAAAATTGACGCACCTCTTACGTTAACACGAACGATTCTT
AACCACTTTCTTTACTAGAACAGATTGTGAAATCTCCAAAAATGCACTAGAATAAGAAGA
TTATTTCTAATTTCATCACAGTCATTTTGAGTTTAAAGTTTGGGTTTCATAGGAAATCAT
TGAATGCAGTCATTGTAGTGTCATTGAACTGTCCAATTGCGTACTGAGAGCGCCATTTTT
CCTAAGAAATTCAAACTTTAGCGTATGTTTCACATTACACAATTACAAGCGACTACATTA
ATTTTACACACTTTTTTACATCTACTATTTACACTTTGGTTCAATGAGCATTTATTTTTA
TGGCAGAATGGTATTTTTTTTAATATTTAGTATAATTATATTTTATCGCCCGACTGTAAG
TCTCGTATTAGTTTTAGCGTATTCCCAGTGCAATCGTTCTGTCATAAAATGTCGAAAAGT
GCATTATATTATATTTGTTTTTAAAAATTCCATTTTTCTAATATTCGAGCGACCAGTACC
TGTAAGATGGAATAGTGTTTCACAATAGTGGAGCTTTAAGTTGATATAATTTAATTATTT
TAGGTAATTGTGTAAATACCTAAAGATCAAGGCATTAAAATAGATTTTTAATTGTTAAGT
GTAAGTTTCGGATGTTTCATTTGATTAAACACTTGACACGATACTGGAGTGAGGTAAGTA
AAGAAATTATAATTACATTACTTTTTCTATCGAACTCACATTTTTAGTTTTGACACAGAG
ATGAATTTATTTATAAATAAAATGAGTGTGGAGGTTGTTTGAACAAAATTATCTATTTTA
TATTCCATCCTCATTAACAAAAACATTCTTATAATTTGTAGTGTTTCTAAACTAACAAAA
GTAACGCGAGTTAATCTCGTCAGTGGAAATAGAAAATACTTTTGTTGGTGCCATCGAATT
TATCGTAAAAAAATAAATTCACGAATTTTATTTCCAACTATTGTTATGGAAACGCGTGTG
TCGTAAATTATACAAAGACTATGCCCACCAACGACACCTGAAGCCACACGTTTCATTGAT
CTTAAGTATTAAGTATGTAAGTTTTAGGTAAAATAAATAAAAAAAGTCGGAAAAAATACA
AAAAAATATATGTAATGATTCTGAGCGTCTCTAGCGTGGAATAAAAGTATAGTACAATGT
TCACTTGTTCGGTTCTAATTATTTCACACCACAGACGCTTGTATAAATAATTAAGGCTTT
TCTGGTAATGCATAGAAATTAAATTTGAACACTTGAAAAATTATCTTTTTTGTACGGACG
TCGCGTTATATTTACGATGTGCCGAATGGTATGTTCACGTCTAGTTTGTCCTTATCATTG
ATCAATGTGTAATAGATCCGTTAAAATAAATTATTATTTAACTATGTACTACATATGCCC
GTTGATAGGAAAATAGATAATAAATAAAATTAATTGTAAAAAAAAA
(4726 bp)

- SilkBase 1999-2023 -