SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_ErmoMG_comp37542_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_protein_ultraspiracle_homolog_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0003707 F steroid hormone receptor activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0043401 P steroid hormone mediated signaling pathway
GO:0043565 F sequence-specific DNA binding
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:2.98 TPM:2.19
ORF EntryO_ErmoMG17893_complete:A_ErmoMG_comp37542_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTAATTGCGATAGTAATTTTATTTTAATCACCATATCTTAAAGCTATGTATTTCTA
TACAAAAAATATAACTTAAATATAATCAGATAATTAGTGAACATTATTATAAATCATCTC
ACAACCGCTGCAACTTCCCCCATTGTATCCCATACATAATATGTCAATATTTACTTGCGT
TTAACGGCAATACGTTCCTACAACACAAGAATGTAGTGAAAACACTGAAAATTTAATTAT
TTATATACATTTCGTACATAAAAAATAACGAATCCCCATTAAATTGAGCTTTCCACTACA
TTCTACAACTACAATAACCTCAAAAAATGTACCTTCTCATTTTCAATATATTTGGTATTA
GTTTTAAAACAATTTAGAATACTGAACGAGCTTTCTTTTCATGTTGACAGTAAAATAATA
GTTTGTAAATGTTTTTTTGGTTAAAATAATGTCCACACTAAGAATGAAGAGCTTTTCAAA
CATACAGTATTGAGCCACGTCATAGCATATAGCTGAAATAAAAATCATTGTCCATTTAGT
TTATCGCGTAGGCCATTCAGTCATACCTCACCATTTAAATGAGAAGTAACATCGCAAACT
AGTTTAATAAAATCGAATATAAATTATTCACCTAATAAAACATTACATTGTACTTGACAA
AGAAATATTTACAGATAACTATAATAATATGTTTAATATGAAAATAGAGAAAAATATGCT
TTTTCTTGAATAAAATTTACTTTGCATTTGCATATTTTATATGCAACTCTACAATGGACA
GTAAAGCACCAAAATCTATATACTCTTCGAAGAGTAGAAATAATTTTGAAAAATGTAACG
ATTTTTATTTTACTTGCAAAATACAATTTGTGTACTATTTTTGATGATGTAATAAAATTT
AAATATTACAAGTGCTTTTTAAAGATTTGGTAATTAATATTAACATTCTTTGATTATTCT
ACATTTATACTATTCATCTACAGAAAAACTACATAATAATATTTCTAATAATAAATTGTT
AAAATGATGTATTAATATAACGTTTACCTATAACATTAATAATAAAAGAGGCGGCCCCAT
TTACATTACTTAATGTTAATGTCTCAGCAGTACACGTTACTAGCGAGAGATATTTTCATT
AACATTAATATTTTCATAAATTACGATCCTTTCGTCGACGTGAGATGAAAATCTTTAATT
CACACTTATTTCGTTCAGCACGAACGGGGCATTATCACAAAAAGTAGATTATTAACACTA
TAGTATAATATTTAATCGCAAATCAAAGCGATAAATACGCACATACGAACAATTACCGCG
TTCAGATATAACCATTTGAATGCTACGTCGGTCATTGAATGCTCATAAACGTCAGCTAAC
AATACTAATACTGGAAATTGTTTTAAACATACTCTAAGACTACTCTTTAGAAAAGTGCTT
GCAGATTTTGTTATAAAACTCTTCAGTACTCTTCTTAACCAAGTAAACCTTGGTAAGGTT
TACCTTAAGGCCGGTAGATGTCGTTACCAGGCGTGTATTTTTCCAAACGAAGTCGTCAAA
TTATTACGTATCCCGATTTCTATTATACTATTGCAATGTTAAGGGATAAGTTGTCCACAT
TAATGGAGTAACTATAACTTCGTACAAAATTCGAACATTTTTGGTTAAACTTTGTAGTAG
TAGTAAGTACGCGAGTATAACCTTTTATATGGTCATTAATTTAGGATGAGATTTAAGCCA
CGGCATTTAAAATACTTTGAAAACGAATGCATTGAACATTATCTATCTTGAAAAATCTTG
GATACTTTTCGGGACTAAGCATACGCGAAACTAATGCCTAAAATAAAATTTTCATAAGCC
CAATTTCTAAATAACAGTTTCATAGCAAATGAAGTAGTATTCATCTTGTCATTGTATTTA
TACTTAATACTTGGGTCTTGTGTTAGTTCATTAAAGCTTTAAAGATCTTACTGGTTTTGA
ATGTTCTTAGTAAAGCGTGCCTTGCGTGATGTGTTTGTGTAAGGTTGTGGTAGGTGTTGA
ACCAACAAACTTTTAACGACGGTTGCTTTGCTTGTGATTACAGTCATATTGTCGTTGATC
AACGAACACTAAAACATCACACTAAACTCGTCACGTAGTCTAAACTAGTCGAAAATTAGA
CTGGTTTATAAACAAGTTTAACGTTAACAATTCGTTGTTGTGTTAACTGTAAAACTATCA
ACGCTCACCCATCGAGATGAAGGTCTGGATAGTAGGGTCTCGTAAATCCTCATCGTATAC
GTTAACAGTAGCATTCAAAAGGTTTAATTAGAGCAGTGACCGGTAGTACTGGTGTGTGAG
CGGTTCCTACATGAGGCTGGTGTCGATGGGCGGGGCGTGGTTGCAGAGCGCCTCGCGTAT
GAAGGCGGCGATGCTTCCCTCGGCCACGAGATGGAAGAAGCTGAGGTGCTCGAAGCTCTT
GAGTGAGATGGAGCGCAGCGCCGGCAGCCGCAGCAGCAGCGCCGCGAACCGACCCTCCTC
CCCGCCGCGGCAGCGCCGGCAGTACTCGTCCAGGCACGAGAACATCTTTTCTCGCAAAAC
CTCAACTTCTTGTTTGTTCTTCAGTCCTTTTACATCAGGATTTAGTAGTATGACGGCCTT
GAGTGCGACGTACTCAGACATGTCCATGCGGAGGGAGCGCATCTTGAGTGAGAGCTCCGA
GAGCACGCGGTCGAAGATCTGTCCCAGACCGGCCTGCAGTGCAGAGTTACGGTGCAACGT
CATACCTGGCATTAGACAAATAAGCTGAGGCGGCGCTGTATTCCTTGAGTCTACGTTTTC
TCTCTCATCGTTTAGAAATTCCATGGATCGCCATGCGATGGCAAACAGCAGTAGTTCGTT
CCACGACCTCTTGATCAGAAGTATCTGATCCTCGAGTTCTAGCTGCCCGAAGTGTGGAAT
GTCACGCGCCCAAACGATGAGAGCCGCTATCTGTTTATTGCCTATTTGACAAAGGCTAGA
TACTGGTCCTCTGTATTTAGCAGGCACGTTGCTCTCTGGCCCGACGCGAAGTATGTGGAA
CTCCTTGGCCGAATCAGCAACTAACGCTTCTATTTCCATCAGCCGCTCAATTGAAAGCTC
CTGTACTGAACTGCTGGGATGTGCATCTTCTATTCCTCTCGCCGCCCGTTGTCTCTCTTC
TTGAACAGCTTCCCTCTTCATACCACAAGCAAGACATTTCTGATATCTACAGTATTGACA
GCGATTCCTCTGGCGTTTATCTATTATACAGTTCTTATCTTCTCTGCATGCGTATGTGAG
ATCCTTTCTGACTGTCCTTTTAAAGAAGCCTTTGCAACCTTCACAACTGTAGACACCGTA
ATGCTTGCCCGATGCTCTGTCACCGCATATAGAGCATAGATGTTTGGAGCCGCTCAAAGG
ATGGTTAGGGGGGTAACTCTTGAAAGGAGGGGGTGGCGTCGAATCGTCTCGGAAACCGTC
AAGCATCGCCGTATCTGGCTTCATCTCGGGCGGTGACATCGGCGACATAAAGCCAGGCTC
TATGTTCAGCCATTGTATATCGAGTTCAACGTTGGGTGGGCCTGAAGGAGTAGCCATTGG
CTGCAGGAAATTCGAATGTTGTGAAGATGGCATCATCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGGGCT
GGGCGTCATTGGCCACGCCCTGTTGATCAACGCCGTTACCGACATCGTCGGTTTATCTTT
CTTCGCCACACTCGACATGGCCACGTCAAACATCCTCACATCACTATAATCTCACTGCAC
TTCAATATCCACCTTCGTCAATTGTAACAATTTCAACAATTAGATTAAGAATCAAATAAC
ACGACGGTCACAATCAATTTGCGCGTTAGATCCTTAGTGTAACACTAATGGTGATGAATG
CCAGTTGCGAATCGTGCATCGATTTTCGAGTTAGTCGCGAGCGGCGCCAGACTCACGGCC
GATACGAGTGGCGTCGCTACTCTGACTGCCGCACCGCCTCCCCGCTCGTACCCCTCGAC
(4019 bp)

- SilkBase 1999-2023 -