SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_ErmoMG_comp37529_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		putative_vacuolar_protein_sorting_26,_vps26_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005768 C endosome
GO:0005829 C cytosol
GO:0006810 P transport
GO:0006886 P intracellular protein transport
GO:0007224 P smoothened signaling pathway
GO:0008565 F obsolete protein transporter activity
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016055 P Wnt signaling pathway
GO:0019233 P sensory perception of pain
GO:0030111 P regulation of Wnt signaling pathway
GO:0030510 P regulation of BMP signaling pathway
GO:0030904 C retromer complex
GO:0030906 C retromer, cargo-selective complex
GO:0042147 P retrograde transport, endosome to Golgi
Transcript
Level		FPKM:5.89 TPM:4.34
ORF EntryO_ErmoMG17837_complete:A_ErmoMG_comp37529_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TAAAAATCCCTCCAGTTATGATAAGATAATAGTATTGCACAAAATGTACATTATAAATAT
ATGAGATGTTAAAAATCACAATAACACTTAAAATGTCATTTAAAAGCAATTAGATACAAA
AAGTATTATTATCAATTTGAAAATACGTATTTCAATCGGTTGTCTGTGAATAAAGTTCTT
TCTTTCTTCAATTATGTTTCAAGATACTTGGATTACTGTTGATGGCAACAAAATCAATCT
TACCTCTCTCTTTCCAGACTAATCTAGACAATGGAAAATGTACGATTTCACAACTATCAT
TAAATTTATTTTTTAGTATATTTCTTTAACTGTAGTTTATTTGTGGGACATTTTTATATG
TGAAAATCAAGAAATATTCATATTATCACTGCACCATTCCTAAAAGCAGCAGCTACCTTA
GCAGTAATTTTGGACTGCTAAAATTAAGTTTAATTCAGAAAAAGTAATGTTCACGAAAAT
TAAGGTATAAAACTAATAATATAAATTGTAAAAGCTTATCCACATCCAGTAAAATATTTG
TAAATAAATACAGGCGTTTTAGTACACTTTATAAATACAATAGTTTTACGATTCAGGATT
TATTCAAAGAAAAAAACATCTTGTCTATACAAATTATTATTCAACAATTAATGTTAGCTC
TATCAGCAGCATCGATCAATGCTATTCAATTGAAACAAATTGATGTCGTCTTAAATCAGT
CGTTACATGCGCAGAAAGGATTCAAACTTAAACAGAAATATTGGAAACACTAACATATTA
CCACTGAAATAATTTTTTTTGTTGAAAATTTCAGCGATGTTTCGATTACCATTGTACACA
ACAGATGCTGTTCTTTGGACCAAGATCAAGAACTTGGAACTTAATAGAAAAAATACTGAC
ATCATATTGACTACTAAAGGACCATTCAGTTGAAAAAAAGATTCCTGTACATATACATTA
ACTATAAACAAAGAGACAGTGATAGATTAAGAATGAGTCATTCTACATATCACTGGATAA
AGTCCAAGAAGATTTAATATAGAATTAGTCAAAGTAATTTAACGGAACATTTATATGAAC
ATCCTAAATAATCAGAAAAATTAATTTTTAATGATTTTGTGAGAATATGAATTGTAGTTC
GAATCATTACTGCACAACATACGATTAATATTTTTAAAACCAGTAATTATTATATCTCTC
TCTTCACAGAACTATACAATCAGTTTCATTTATAGCTCATAATATCTTTGTTATCAACAA
AACGAATAAATGGCACAAACAGCTCGCTAAATGATTCGTTCTATAACACATTGCTATGAT
ATAAATACAATTGTAGATAATATTGGCTAATTACTTTTGAATTTTAGTTATTATATTTTA
AAAAACGTGAAGCAGAATGTTGTGTTTTCATGTGATTAACATGGACTGTAACCTTTTGAG
TTTGGTTGTAATTATTTTATTAACTACACATTTCGTTATTTCCAGTACTCATTTTGTTTG
AGACACACTCATACTCTGTAGTTCAAATAGATTTACAACCATAAAAAAATTATTCTATAT
GCAACTAATCATTTAGTAAGCTCCAATGCATTTTATTATTTAATGGAAAATTCTGTTCTT
TTATTCCTAAGTCCTTAAGGATGATTTTAATGTCAATAGTATACAGTTTTTTTCCATTAA
TCATCTTCGGTTCGGTTTAAAAACAACATGTTTAGAGTGATCCATATATTATTTCCTAAG
AATCCTATCAACAAATCACACTTTGTATAATTATATATTTTAATGAATTTCCACTAAACT
AGATAATAATATACTTAATGCAATAAAGCTATACACACTTATTATTGCTTCTCTGTGTAC
TATGTGTTTTAATTTACATTAAATTTATAAAATCAAATATTATTTATATTTTACTAAAAA
ACCCACACTAATCTGCCTTAAAGGCATGATACTACGAACTGTATATGTTCCAAACATTTA
CAAATCAATGTTTCTACAATTTTTAGTTTTTATATTTTATTGATTTCATTTGTATGTAAT
TTTGATTTAAAAAAATGTCCATTATTTATTAAGGCTTGAAATTTGCGAATAAGTCAGAAA
ATAAAGGCGTTTTAAATAAATTTAAATGATACTCTTAAAACTAGTATTAATTTGATTATG
GAGTTTATGAGTAATGTTTGAGTGATCAAATTATGATTACAAAAGCTGCAAACTGAAGCT
CAGTGAACATCAGCTGGAAAAAATAATAATGTCATTCAAATTGTAAAATATTACTACTAC
ACTATGAACCAAATGCACCATTTAATTTAGCAGGATAAAAAGGTAGGTATAATTAAATTG
CTTCCATCCTCAAAGAGATAATACAGTTGACAAAAGATAACTAAAGTATAATACACCATA
TCATGCTTCTGTAAATTCATCTAAAATGAAAGAATAATTTTAGAATTTTGTGACAATGTT
TGTTGTAACATTATTCCTCAGAAATAACTAGCATTGTAATGTATCATATTTTTTAGAATT
TAAAAGCAAGATTTTTTTATGCAATATTTCCAATTGACAAAACTAATGTTTCCATTTTAA
AGAAACTTGCAAAGACACCCTGTTTTTGGATAAAATACAAAGAAGTCTACTTACTATTAT
ACTACTAACTCAAATGGTGTGTTCAGTTCATGATCTTAGCAACCTTTTAGAATTTGAATA
GCAGAATAAATATGACTATTGATCAATAGTCTTCAGATATGAAAACATATAATTCAAATG
ATCATTGCTCGTCGGAAGGACAGAGCAAGTACATTTTGGCTATTGGCTTGGACTGGCTTC
ACCATCAGGTTGTTTTAGGACCGGTTTCTCGGAAATCTGCGGTTTCTCTGCCACCTGAGG
TTTCACTGAAACAGGAGGTTTCTCAACCACTGGCGATTCTTCGGGTTCTGGTTCAGAAAT
TTCTTCACTAATGTTATGGCCATTGTTGGTGTTATTTTCATTTATATGAGTGCTTGCCAG
ACTGTCTATGATTGCTTCAGGTTTTTCTCTCTCCATTTGTAAAGGACCATTCTGTTTTTC
AGGCATAGAAGGTGATATTGATCTTTGCATGACATTTTCGGGGTGTGATGGTGTGGCTCG
GGCTGAATTGTCATCGCTAGATACACTCTGTTTCCTTATGGTTTGGTGACCTTGATATGA
CAAGGTCTGTGGTTGGTGAGGGTGTAATGGCAATCTGGACTTGTCACTCTTCCTCCATAG
TGTCACTTCCTGCTGTTTGAAATACCGTCGGTCCTCAGTGTCCATCAATACTAAGTTAAG
GTAATACCTTACTGAAAACTTGTTATTGATGTCTCTCATTGTGGGAGTGAGATCATAACC
TGCTAAGAACACCCTAATGGGAATACTCTCACCTCTAACTGGTGCACCATCCATGATTTC
ATATTTGGCTACAGTCTCATTCTCAGTAAATGTATTGGGACCTGAACCAGTTGTTTCTCG
CTTTATTATTGATATCTCCATGTGTTTGATCTTGATACGGACCAGCAAGAAATATATTTT
ACCAACTATGACATCTTTCAAGTGATATTTTGATTTGTTGTATTCAAACTCTATGTGCAA
GCAGTCCTCTATCCCAACCTCCATTTTAATGGAGTTGAGGACATCCGGATAACTACATAG
CGTATGGACGGCGATGTCCACCTCCTTGGTGATGTCAGTGAGGCGCCGGACGATCGTGGC
TCGCAGGAAATACCGCAATCTGACATTAGCACCCGTATACACTTCGTATGGCTTTTCTAC
ATTAGCAAACTCGAAGGGGTACGACGTGTGCTGAAGCAAATCGCCTGGGCGAGCCAATTC
TTTGACTAGGGATATAAACTCGTGATGATTACCTCTGTCGTAAAATAATTCGATCTGACC
TATAAGTTCGACCTTGATGCCTTGGTGTTCGAGTTTCGATCCCGGTTTCCGTAAAGTCAC
ATTCACTTTCCCAGAGACTGTTTCACCGTCGTAATACAACAACAACTTTTCTTTTTTACC
ATCGTCCGTTTTCACTTCAGCAACTTTCCGTTTGTCAGCATCATCAAATACTATTTCGAT
GTCCGCAGTTTGACCGAAACCGAAAAAGCTCATTTTCACAATATTGAATTACGCGAATTA
TATAAATATTTTTATGCGGCTCTGTTTTGAAATAGTAATGGTAAAATTGAGCAAAACATT
GAAAAACGGCGACGAAACGCCCGCGAATCGGTAGAGGCGATTGCAAGATTTGAAGCAAAG
(4260 bp)

- SilkBase 1999-2023 -