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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_ErmoMG_comp37204_c6_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_transmembrane_protein_189_isoform_X1_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0031625 F ubiquitin protein ligase binding
GO:0061630 F ubiquitin protein ligase activity
Transcript
Level		FPKM:11.06 TPM:8.14
ORF EntryO_ErmoMG16149_complete:A_ErmoMG_comp37204_c6_seq1
Sequence
(Nucleotide)
ATTCAAGACAAGTGATATTTGAAGATAAATTATTTTATTGATAATGTGATAAATAATTAT
CTTATTAACTTGTTATTAGTCATATTAAAGTGTAAAAAATAAAGTAAGTTCACTTAAAGT
GCCTTTGTGTAAACTATATTAGTTCTTCGTTGATTATATTGGTTAAAACGAAGTATCAGT
CCTTTGTTGTACTATTTGTTCCTTAAATTATATAAGGTAAATGATGGCTTTACCCTTACC
CATTCCGCCTTGCGCTAAAAGGGGAGACGGACTTGCTGCTTTGGGTTGTGAGCGTTTCGA
ATATGCGAGCACCATGGCTACAACCCTGTTAGCACCGGTTAAAACCGAACGAGAAATCCT
AGAGCACTCGATGTCTGAAGATGATCCTAATGCTAATACACAAATAGCAAGTCAGGTAGG
AACCCAACCACGTTGGGGTCCACGACATAGAGGTGCTCAAGAACTAGCTGAATTGTATAG
CCCAGGCAAACGATTGCAAGAATGGGTATGTGTGGTATTATGTTGCACCCTCTGTATCTG
TACCGGCATATTAATGGCCGGATACGTTCGGGCAGATGCTTCACTGGTACTGGCAGCTGT
TGCGGGTGTCTTAACAGCAGACTTTGCTTCAGGAGTAGTGCACTGGGCAGCTGACACTTG
GGGAGCAGTTGATCTACCTCTAATAGGCAAAAATTTTCTCCGTCCATTTCGAGAGCACCA
CATCGATCCTACATCAATCACCCGTCATGATTTTATTGAAACAAATGGTGACAATTTCGC
TATTACGATACCGGTACTTGCACGAATAGTATGGCAGCTACTTACATACGATGAAGAAAA
AATACATGATCAGTTTCATTGGATTTCATACTGGTATTTATGCTGCATATTTGTGGCAAT
GACAAATCAGATTCATAAATGGTCGCACACATACTTTGGTCTGCCAGTATGGGTGGTTTG
GTTACAAGAATGGCACATTGTTTTGCCTCGACGCCACCATCGTATACATCATGTCGCACC
GCACGAGACTTACTTCTGTATAACAACAGGCTGGCTAAACTGGCCTTTGGAAAAACTCCA
TTTTTGGTCTATTTTAGAGACTATAATTGAAGCTGTGACTGGATGTAAACCACGAGCAGA
TGACATGAAATGGGCACAAAAACGTTCCTAGAACATTAGTTTATTATGCAATACTTGCAT
TTTTTATGATTTACACTCGTCCACATCTACAAAAGCAATTAATAGTATAAGTTAAAGTAT
ATTTTGCTACGCTTGAGTCACATAAGCACGTTATAATTATTATGTGTTATGTTATGTATC
AATTATAATTAATATTCTTGTCAATTGGCTGTGTGACAAACGAGTAGTTTTAAATTATCT
AGGCTATGGTATAAAAGAATCACGAGAGTCTAATATAAATTTGGTGGTCATGAAACTCTA
TTAATTACAAAATGTGACATGACGTATTTATTTTAAATATGACAGAACCCATTTTCTACA
GATGAACTGAGCACATGAGTGGATTTAGGAATTCATTTAAATTAGTTTCAAAAACGTAAT
ATGGTTTAATGAGCTATGGTCAAGTCGTACTAGACACATCGCTAGTTGGCCATGAGCAGA
CACATGAATTCAATGTAGGTATCTATCGCGTC
(1652 bp)

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