SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_ErmoMG_comp36869_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_phosphofurin_acidic_cluster_sorting_protein_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000042 P protein localization to Golgi apparatus
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0030137 C COPI-coated vesicle
GO:0032092 P positive regulation of protein binding
GO:0034613 P cellular protein localization
GO:0044325 F transmembrane transporter binding
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
GO:0072661 P protein localization to plasma membrane
Transcript
Level		FPKM:4.39 TPM:3.23
ORF EntryO_ErmoMG14693_5prime_partial:A_ErmoMG_comp36869_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
CGCGCCGAGCCGCTCGACATACAGCTCGACTACTGGCTGGTGCCAGGTCGTCAGCAAGAA
GGAGCAGACAGCAAAGTGACTGTTAAAGCATCATTCCGAGCTCTTCACGTCACGCGTCAA
AACTCACATCTCTGCATCACATACCTTACTAAAGAGAAGAAACAAAAAATAATGCGGCTC
GGCAAGAAAAAGGAGAAAGGAGGCGAACAAGAAGTAGGACGCACCCAGACGGTGGACGGT
GTCGCCAGACTTATCTGTTCCGCTAAGAGCTCGCACAATCAGCCGCTTAAAGTGTTCATC
GATGGAACTGAATGGAACGGTGTCAAGTTTTTCCAACTGTCGACACAATGGCAGACCCAC
GTGAAGACGTTCCCCGTGGCGACGTGCGGCGCGCCGCTCGCTCCGCCCGAGACCTAAACG
CGTACTGATATATTGTTGGTATTACTCGCTTCAGCTTCAGAGGCCGAAGCCGGACGTCGC
CCGATCGTCTAACAGTAGTCGTCGCGCTTGTCGGTACGTAATCTCGCAACGGTCCGAAGG
CTCTAACTAAAGTCGATAAATCTTACAATTGTCGACTTTTATGCTATCGATAAATTATTT
AGCATTCATTATTTATTACGTTGTCGAGCTGCCATTGTTTTGTAGGGGCGTAGTGGTGTG
ACTTTTTTTGTGTAGCTTGAGTATCGTTTACTAATTCGGCCATAGAAACTTTCAAATTTA
ATTTGTATCGTTTTAGCACACGTAAATTGTAACAGTGAAATGAAGTTAGCGTGTAGTGTT
TATGAATTGTATACCAATGTTGTAATATTTAGTCATCTGCGTATGTACACACGCAGTTTA
ATTTTTTAATTCATGCTACATAATAAAAGCTCAATAACCACAATAACTATTTCATTGTAG
TCATTAAATGTTAGTTGTTAATGTAATATTTGTGTATCGATGATAAATGGTTCGTGACAT
TTCCAACATTAATGTTATGTGTGTAGTTTAGAATAGTAAAGTCGATGAGAGATGCCGATT
CGTTTTCGGTGCGTTTCGTCACATATCAAGTTTAGGTTTGTGTAAGAAGCGAAATAGAAG
GTATTTTTTTGTATTGTCTGTGATTCGTGAATGCGTTTTATTTCTTTTGTATCGGAATAG
AGATGTGCATTCATGTTTTAATTTTTATATAGCAGCTAAGGTAGGATGTTTTTAATTTTG
TACGTCAATTGTAGATTTTGCATCGTTGAGATTATATAATAACTTCCTTATTTGTTTCAA
TATTTTTAGGATACTACGTAAATTAAATTCCGAGCCACACCGTGAATTAAGATTCGTTCA
TTTAGGTGGTGCGTTAAAATTTGTAAAGTTCTTTATGAAAAAAAAAAAAACATAAATATT
TTGTAATGTTTCGTCTTTAACATGCGCGCAAGACAACGCCATTATTCGAAATGTATTTTC
TAAATAAGCGGTCGGTGAATTTAAGAACTATATTAAACATCAATGTTACCGCAATGTTAT
TCTCCGAATGTAATGCTACTGTTGTATAATGCTGGGGCCACACTATCGGGATTTCAGAAT
GTTCACAGTACGTGTCGTAGTCGAAATTTATTTGCACTAAATATACTAATATGAATGCCT
AAACCGTAAACTGGCGCGCATCTAAAGTTTTTGCCATAATATTCGCTTGCGTGGCTCGAT
TGGCTACTCCTGTTAAAATTAATTTCTATACCGCGATTGTGCGATAATGTAGCCCCAGCA
TAAGGATATAAAGCTAGTGATTAAAATAATTCACATTATCGTTAAAATATTAATCGAAAT
AACACCAATTTACTTATCGATACGGCTAACAATTGAAATTATACCAATATTTAAGAAAGC
TATGTAATCACATTGTTCTAAATGTTTCTAGTAACTTACGTGTTAGAATGTTGAAGTGAT
GATACGTAGACATATCGTATTAGTATCAAATTAGTGCTGTATAATCAGTATTATTTGTTC
TGAACTGTCTGATATAATTTAGGACCTCTTCTGATGATTTGCGTTTTTCGATCTCAAATA
AACCAAAATCTTTGTGTATTCCTTAATTGTCTTGGACAATGTTATGTAAATTAAAATTAC
ATATTACTGTTGAACTGAAATTGATTGAGATATATACTGTGTGGTATATGCCTTTCCGAA
ATTGTGTAAGAAATATTATAAAATTAAGTTCTTTTAAACCTTAAAACATCCAAAGTAACG
CTTAAACCTCTCAACTGATTTTTATGAAATTTGGTACAGACAATCT
(2266 bp)

- SilkBase 1999-2023 -