SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_ErmoMG_comp36092_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_LOW_QUALITY_PROTEIN:_rho_GDP-dissociation_inhibitor_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005094 F Rho GDP-dissociation inhibitor activity
GO:0005096 F GTPase activator activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0043547 P positive regulation of GTPase activity
GO:0050790 P regulation of catalytic activity
GO:0071526 P semaphorin-plexin signaling pathway
Transcript
Level		FPKM:60.79 TPM:44.73
ORF EntryO_ErmoMG12001_complete:A_ErmoMG_comp36092_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TATTTTTAAAAGTTCGATGACCGCCCGGAAGCATTGTGGTCCGTCATTTTTTGATCGGTA
GAATTTAGAAATCGCTAAATCTTCGCAAGTTTTACATTTATTTGGTGTTATTTAGTGTTT
TTTAGTTCCCCTATTACTTTTGTGTAAAAACTTATTAATTTTAACGCTAATTTATCTTAA
ACAAACATGTCTGGAGAACCTGAAGTAGTCCACACACCCGAGGAGGATACTGAGGAAGAA
GAAATCAAATCTTCATACAAACCTCCACCAGAGAAGACCATTGAGGAGATCCTAGCTGCG
GATCAGGAAGACGAATCACTCCGGAAATATAAGGAAGCACTTCTTGGGCAGGCTCAGGCG
GGTGCTGTTATTGTTGAGCCGGAAGATCCTCGTAAAGTGATTGTGAAGCAGCTCGCGTTA
TGCGTGGTCGGCAGGGAAGATGTCAAGTTGGATCTCACTGGGGACTTGACAGATCTCAAA
AAGCAGGTGTTCGTGATAAAGGAAGGCGTGCAATACAGAATAAGGATTGATTTTATCGTC
CAACGTGAAATTGTGCATGGTTTGAAGTACGTTCAGAAGACTTATCGGCTTGGCGTGCCA
GTTGACAAGATGACCCACATGGTAGGATCTTACCCCCCTAAAACTGAGATTCAGTCATAC
ACGACACCCCCCGAAGACGCACCCTCGGGGCTGATGGCAAGGGGCTCTTACACCGTCAAC
AGCCTTTTCACCGACGACGACAAAAACATCCATCTCCAATGGGAATGGAGCTTCGAAATC
AAGAAAGATTGGAAAGACTAAGCTTGGCTTTACATTGAAAGACCGACTGGGTTGGACTTG
GCTGCACGAATTCAATATCGGTGCCCGTGTCAGCTGTCACGCGTATGTCAAAATTATTAA
ATCCATTTCCATCGCACTAGTTTATCGATAATTTTGGAATTTTAATTATTATATGAATTT
AATAGACTGTATATTATTAGATTACATCAAAATTTTTTTCCTAAAATTTAAGCCCGTAGT
ATTTTATTGTAGTTTTTATTTAGTTACGTCCAATCCAGTTTGTATGGTCGCGTTATAATG
GCTAACTGCGTGGAATTAAAAAATATATAAATATTGACAAATTAGTTTATATAGGTTCTG
CCAAATTGGAATTTACTTGGTTCGAAATTAGAATTAAATTAGAATACTTATGAGTGATTG
AGCGGACAGTATTTTTACAGTATTAAAATGTTGGGAAGTTCGAAAACGATCGTGAAAAAC
ATTCTATTTGGCGGAACCAGTCATTAGTAGTAGTAGTATTTTGATTTCACAAAGATCTTA
GGAGACAAGCATTTAGGTCACGGACACATTGGTGTAATTACTACCTATTTTACTACCCTA
GTTTTATACCGTGATGAATTTTAGTAGGAATTTTAAATAAAAGGTCGGTTATTGAAATTA
ATGAAATGTTAAGAAATATGAAAAGCATAAAAATGGAGTTTTTAGGCACAAGACTATCGG
CCATTCCAAAAAGCATTTTGAGACAAGCTAGCAATAGGTTTTTTGTAATTTTTATACCTT
TATACCTTCTCAATCAATGCTATATTAATTCTGATAACTTTGATTATAATAATTAATATT
TGGAAACTAAAATTTCCGTCTTCCTACAAGAGTGAAATAGATATATCGATATGTCACAAC
ACTAGTACCAAAACTATAACAAAATGAGGGTAATGGTGCATCAATAATAATTATATATTT
TTAATATTTCTCATATTTGCTTCCGTGCATTAAGTGCCAGTGGGGGGAAGAAATTATCGG
TAAAAATAATTATCGATATTTATGATCGTGTAGGTCGCATCGCTAGTCGAGATAAAGCAA
TAATTAAGCCGTTAAGTCTGCTCACTAAATGCCTTGGTACATAATTTTGTACATTATATT
AACAGTACAAAATACTATTTAAGCTAATACTAAATTTTAAGTATTTTTTCAAAGTATATT
TCTATTGTCAACGGTTTTAATGGCGCAGCCTATTCAGAGCTGTTCGTGGACTTTTTGGCG
GGAATTTGAACAAAATGGACGCCTTTGTCCTATTTTACTAAAATGCGTTCTTAGAGACTT
TAAGCGATATAAATCGTTTATTGTAGGTATGTGTCATCTACAAAGCGATTTTTAATAGTT
TGCAGTTCAAATTTACTTAACTTCACTCCCATAAATACCGTGGTTACATGATAACAATTA
AAAACAAAAATTGTCTGTCTGTGGACAAATTTTTGTTCGCGCATCCCGCCAAAACTACTG
CATCAATTTGGATATAATTTCCACAGACGGATTGCTTACTGTCTAACTTAAAACTTATGC
TATGTTATAGCCTACAAAAAATGTTTTGATGCCCAGCGAAGTGATCACAGGTCGACTAGT
AAGAAATACACAAAAGTCCACGAGAGTTCTCAGTAAAATTTACGGAAACTGGATATCTAT
GGAACTCTGATTTGGCTTGTCGCCTAGACGCCGAAAGTTAATAAAAAAAACTGTTTCGTG
TTAGTATAAAAGTTAGTGTTAAGAAATAATACACTTATTGAGAGACGCATTAAGGCTATT
TTCGCTTGAGCGGTTGAAAGGTGCTTCAGTGTTGCCACTGGTGCTCTGTAAAAATAAGCT
TCCCTTTAAAAAAATATTATAACATACTATTTACCTCATCCTCGAGACCGTATTTTCGTA
TATTTTTATGATAAATACTATTTCAATATTCTTAAATAATCTTCCACGTAATGTTAAGGT
TTTAAGAATAAATTTGCAATAATTAAATTTTTGTCGTTTTTTTCCTGGCAACCCTGGTTT
TATTGTACTGTGTATTCTCTTGTACAACGGTATTTCGTTTTTAATCATAGATTTGTGATG
CAATGTAATAGTTTGGCCAAAAATAAAGCTTATTTATTCGAGTAAAAAA
(2929 bp)

- SilkBase 1999-2023 -