SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoSK_comp14269_c2_seq14
Scaffold_idBomo_Chr18
NCBI non-redundant
(nr)
Ontology
GO:0000323 C lytic vacuole
GO:0005537 F mannose binding
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005768 C endosome
GO:0005770 C late endosome
GO:0005802 C trans-Golgi network
GO:0006810 P transport
GO:0006886 P intracellular protein transport
GO:0015578 F mannose transmembrane transporter activity
GO:0015761 P mannose transmembrane transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0033299 P secretion of lysosomal enzymes
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
Transcript
Level
FPKM:13.99 TPM:14.07
ORF EntryO_BomoSK19742_5prime_partial:A_BomoSK_comp14269_c2_seq14
Sequence
(Nucleotide)
GACATTTTCTGTCGACTGTCGAATCTACCTATCCATTATTTTGATTGTGCGAATTACGTA
TAAGTTTTTCAACGATAAAATCTATAAAATGGATTTCAGGATTAAAATATATCTATTTAT
GTCTTGTTTGTATTGTTCAATATTTCCAATTTACGGTGAAGATGTGTGCCTGAAAAAAAG
TGCGTGCGTTTGTGAGTTTTCCAACGGCACCGGAATAGATTTGTCTTCGGCCAGTAAATC
GACATTTTTTTCTGCTCAAACTTTTGAAGTAGCTCCAGCAACAAATGCGATTGAACTTAG
TACTTATTACTATCATCCTTGCTATGACATACTTCTAAAACCGAATTCTACAACTGTTAA
CAATACTTGTACAGTACCGACAGCCATTTGCAGACACAGAGAAGTGCTTCATGCTGTTGA
TGGTACACCAGACACATATAAAAAGGATCTAAATGTGTATGATTTAATTGGCAATACTGA
TAAATCGGTATTTAGTGCTAAAGGAGATGCAATAGTTTACACTCATGGTCCATCAAATAC
AACAGTTCTCCTCATTTGCTCTCTGTCTGATGGTGAATTGCAAATTTTCTCTTTAGCAGA
GCCAAATAACCTTGTTCTAGCTTTCTACTCGCAAAGTGCTTGTTTAAAGCAAATTGATTC
CGGAAGATCTGTTGGCTCGACTTTGTTAATAATATTCTTTTCGTTTGTCATATTTTACTT
GGTCCTCGGAGTTTGCACCAAGAAATTCCTGATGGGTGCAACTGGTGTGGAAGTTATACC
CAATCTAGGATTTTGGACAGATCTGCCCAATCTTGTTAAGGATGGATGGGCATTTATGTT
AAGCGGCTTCAAACTGCCAGCTCGTAGCGCTGGGCCTACACTGTCGCCTGACCCCAACAG
CTATGACAGCATATAACATCAGACCGACGAGCCTCTATCCGAGGGGCACCTCGTGCTCAT
CGAGTGAATCTTTGATGAGCTACATATTAAAGGACATTAGTGTTGATGTGCTAACATATA
TACATTGTAAACATTATACACAAGTACAGTTATTTCGAATATGATCTGCTATTTCAAGAT
GTTTTATCCTTTAGATTTTACGTACAATGAAAAAATATTGAAATGTATTGGTAAGTAATC
AAAATAACACGTTTTTATTAATACAAAACAAATAGAACTATGCTATATTTCCTTTGCTTT
TTAAAACGATCAAATCAAAATAGTCATACAATGCATCAACATTTCTTGTCTTTGTGTGTA
GGCGTATGCTGTTTTTAGCGCCATTAAAAAACTAGACTTTTCAGATATAAGAATTTTAGA
CACGTTTTATTGTTTTAATTGGAGCCGGCTTATTACGGCAAGGGACCGGTTTATACATTT
TCAATTCCCACCATGTACTATGCCTAAAGCGCCCGACGTCTAAAGAGCAAAAGACTGGTT
TCACGATCAACGTATAATAATTAGTATTGTGGCATAGAAAGCGGATCTAGAGTTTTATGA
CGTCTCGTCAAATATAACAGATTACAAAAAAAAAAAAACGCGACAAATAAAGTGTAGCGA
GTATGCGTACCGTAATAAGAATAACTCGGACTGGGTTACGGACCCTGTGATACAGTAATT
AGAGTCGTTAATTGCTTGGCCTTCGTGGCGAAAGAGTAATCTCTGTGTTGATCTCAACAA
TGCGATGGACTCTGCGTTCGGTACGAGCTTTTGTAATATCCATCTCATTTCATCTTTTTT
TTTTTGTAATACAGTAAAAGAAACTAGTCAATAAAATTTCGGGATGGCATTTAGCCGCAA
CACTAAAAAAAAAAGATTTTTTTGAAAATGGAAAGGCAATATTGTACATGCATAATTTCA
CAGCTCGTCAACGGGGCGGATAGCATTGCTCGTTAGATCGAATTTCCAAATGTCATTGTT
CGGTAATTAATTCTCCAATAAAATTATTTCTAGCACAGTTCAGACTGGAATTCTTCATTA
GGTGACAAATACACGTTTATATAAATAAAAAATAGCCGAACAACAAAATAATCTAACAAA
AAATGCTTGCGTTTTGCTAATGTACTAGTAATTAAGATCAAGGTCGTTGTTTCGTCTCCA
TCCAGCCTATTTCTATGGCAGCCGTGCAATCCGGTTTCAAATGGTAGATCGGTAATTAGA
ATAAAATTGAGAAGTTTATTTCTCAAAGTTTGCAATGTGAAAACATTCAGCCGGCGTGCT
TCAAACTTCTAGTTTAAATGTAGTGAGAAATTATTTTCCTTCGGGAAAACTCGGATCTTT
ATCGGGATACGATGACACCCGAACTGTCAATGAATGATCGTAATAAATAAGTGACATTTT
CATATCTATTTTAAGGACCTTTATTTTTTAGTATCAAATGTCAAAATGGATAATGTCATT
GTATAATATAGAGATGCTACAAAAAACGGTATATTTACCAGTGTATTATACGAAATGAGT
TCCCGAGATTTTTATGTAATTATTGCTACGTTCGGGATGTGTGAATATAAGTTTCGTCAG
AATACGCAATATCTCTGCCTTCAGATCTGTGCTTCCTTATTAAGTCTAGGTACTTTACTA
TTTTAAGTCTAACGTCATCTTTTTCCATCAGCATTTTCGTATTATTAGTAATTTTCTTGA
ATAAAAAAACCATTTGGTGAAGTATTCTTCTTAGTGAAAAATCACATCCTTTAAAATTGC
TTTTATTGTAGGGACCTGTTTATAAATGAGATGAAAGTTATTAACCATTCGTCGTATCAC
TGCATAATTAAAATCATCAAGATCTAGATAGAATTTCTTGCGTGGTCTACCCAGCTTAAT
TTTGTTTGTGTTAGTATTGTTTTTATTTCTTTGTTCTACCTGGTTCAAAATTTTTCTTAT
TGTTGGTCTAGATGTGCCCGTTGCGTTCGAAATTCTCTGTTGAACTTTGCCAACATACTC
AGAGTTGTTGCTATTTTTGAACTTGCTCTTTTCCAATATGAAGTACAGGTAAATATTAAA
TATAATTCCTGGGATGGGATTTTTTTACCGTTTTCGAGGTTTCGGTGTGGCTATACAACC
TTTTTATAAGTAATCTGAAAATATGATTAAAACTATAGCGAATATTTGAATTGCGTATTA
TGTACTCTTTATATATATATTGGTCTGATGGTTTGCCTTACGCCTAGGGCTCTAAGATGG
GTAGGTACTGAAGCTATTTGAGAGAGCACGTTAAATACGAATTTTTCCGAAAAAATACGA
AGAAAAATCTTTTCTCACGATATCTATAAGCTGTTAAAATGATTCATCGACTTTATTTTT
TTACTTTTTTTAGGCTGAATCTTAGCAACACCTTCTATTGATCATAATCGTGAAATATTT
TCGCAGTAGCACCTATATTTGTTAAAATTATGTTATGATTAATTATTTACAATTAATAAA
TCTTGAAATCTCTTCCTACATTGTGAGGGTGACGATATAATTTTAAATCGCACCACGCAT
AAGGTGTTTCACGGTCGCGGATAAAATAATTTTTCGACTTAGTACTTCAGCTACAATATT
ATTATAGTTATTTCGCATTTCATTATTTTATGGAATTTTCAGACACGAATATGTGTCGAC
AAGTTCAATGTGACTTATCTCTAGGTCTATGTTACCAAATATTGCTCTCCCGTATCATTT
GATAGGTTTTATAATAATTATTTTGACGGAGTCATTTTAATGATTCATTGATTCTTGGCA
ATATATGAATTGACCAATAAGGTTTTATTCTGTTTAATACGATACCGTCATCCTCATCGC
GTAAATTGCCAATATCCGAAGCTTCTAGAATTTTTAAATACGTAAATACATAGCACATTG
CATTTTTTGTAAACCAAAGCAGAATCTTGCCCCTCTAGTGTCCCTATACATTCTACGTTA
ATTTAATACATTTACTTCTATTTAAAAATATTTTTACCGTTTAATCTCGCCTTCTTTATT
TTCACGAATCACGAGAATTGTAAAGTACTCCCATCATTTAAAATAATTAAATAGAAATAA
AAAAAGCGAGATTAAATGGCAAAAGTTGTTCTAAATATGTCTATGAAAACCGAAGAAAAT
GTTATGTTTAGTTTGTGTTATAATATGTATCGTAAACATATTGTAAAGAAAGATCGACAC
AGCTATTATTGCATTACGAAATAACGTAGTGGTACTAGTACTAAAGAAAATAATAAATAT
TTTCTGGACTCCTGATATATAGGGCGGCACTAGTTTAGGCCCATTGCACATTATTAAATA
TTTTACCTTGAATTGTAATTTCAGCGTCTATAATAAATGTCTTTAGAACCTTTATATTAT
TGTGAATTGTGAGACTATACGTATACAGTTGTAATCATGTTTTGGATTTTCTTTTTTAAA
TAAACCACTTTATTTTTATCAGTATTTATTTTTATCTGTATATTGAATCATGATTTGAAT
TAGTAGTCTATATTATCTGACAAGATCGAGTACCTAGTCTGTCATTCTGAATATGAAATG
AAATTGTCGTAGGGTATTTATATGCAATTGTCGCATTCAACCGATTCGCATTCATAACCA
ATAAGAACTGTCGACAAGCGAACGAAAATCGTGACATTACGAAATGAAAATCGTCTGGTT
CTCGAATGACGAATATATTTTGCAATATTTGCTGATACAAGACAAAAATGGTTTCGTGTT
ATTCTTACATAAACGATAGATAATTTCCATGTTGCATGCCGATTGAGAGTAATAATACAA
TACCTACAATAATACATAATAATACATAATGCATAACAATAATAATACATACAATAATAA
TAATATAATACAATACAATACCTTGTGATTGAATTAACGCTCTTTGTGCGTATAATTTTT
ATTGTCTCATTTAGTTTTAGACTGTATGGACAAAGAAGTATGAATATACAGACGTTTGGT
CTTATTGCTAGTACGTGCTCTTAAATGCAATAACAGCAATTTCGGATTTCTGTAAATCTG
AGCCGAATCAACGGGAATTCCGTCATAAATCAAGTATAGTATCGCACGTAAATATGTCTA
ATATATATTCAGTTCAACGTAATGTATTTTATGTAAACAAATGTATTTAACGTGCGATTA
AATAACTCAAGAGAATATGGTATGATTTTAAGTTGGATGACGGCATTCACATTGTGATGG
GCTCTGGTATTTAACCGCTTGAAAAAAAACAAAAACTTCCCTCTTTTGAGTGTTTGTATG
ATTTTCATTTCACGAATGTAACATGTTACAGTATATTTAAATAGAAATTTATAATTAAAA
AAGGATCAATATTTTTAGATTGAACATAAATGTTACGATTGTGGTGAAGACGTAGCAATT
TTAATCTTTTAGAGTGGATAATTTTAAGATAAAACATGTTTAGTGTTATTTGTAAATTAA
TTGGTAGATTCAGTTTCCTCTATATATCCTTTCCATCTTTCTTAATTTGTCATATTAATT
TACAAATATAAAAATCTAAATAGTTCTGTATTCGATAAAATAGTCGCACGCGTAAGTCTT
GTTAAAAGATTCATCATCTGTGAACAAAACAAAATCTAGTAAAAAACGGACAATTCGTGT
TAAGGATGAATTACAACCTTAAAAGTTTAATATGATTAGGGCATTGCGATTTAAAAAGAC
AAAATTTTCGTTTTTGGACAATATGAACTTTAAGTACTTTTCTATGTATTTTTATAAAAC
AAAGAACGTATCTCAATTTGTTTTTTTATTTATATATATTGCATATCATATAGGCCGTAA
CGAAATCTATCTTGAAGTCGTTTAACAAAAATTTTATACCATCGAGATATTATGTACTAC
GTACAATCTCGATGTAGGTAGGCCCTTTGCGGTAGGCAGCGGCTTGGCT
(5869 bp)

- SilkBase 1999-2023 -