SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp14189_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr15
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC105385776,_partial_[Plutella_xylostella]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003693 F P-element binding
GO:0004803 F transposase activity
GO:0006310 P DNA recombination
GO:0006313 P transposition, DNA-mediated
GO:0015074 P DNA integration
GO:0016740 F transferase activity
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:4.02 TPM:4.05
ORF EntryO_BomoSK18961_complete:A_BomoSK_comp14189_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TCTTCGTCGTCGGTTTGATTAGTAAGGTCTTCGGCATTGCTGTTGGTGTTTTCTGTATCT
CTGATATTGTTTGTTGTATCTCTTAAAAAAGTAATTTAATTGTTATGTAAACTTATGTAG
GTGCTGACTTGTCTGTTTGTAATTTATATTATTAGTATTACATATTTTTTAATGATTAGT
GCAGGTATTTGGTTTCAGGAAATAGCTACTTTTCGCTGTATTACGAATATCTTATTGGTA
TCTCTACTATTGGCGAAATTCTCAAACGGAACAGTTAATTTTTTTATTTTTTTGTGTCGA
TTTTTATTAAAATACTTTTGAGCTAAGACTTTCATCTCATCATCACCTTCATATGTCAGC
TTACCACTTAATATTCTATTAATTGACCTGCACCAGCTATAAATAATTACATTAATTACA
CTGTCTTCAAAATAGTGTGTCAATTTTTCTTTATGGTCTATACAATCGAAAGGGTATGTT
ACAAATATATCACAAAACATTTTTATTGTTTTACTTAAATTTTCTTTAGGCACATCTTTC
TTTAAATGTGATATAGTAATGTCTTGTACTTCCTGGAAACTTTTATCTAGTTGATAAGTG
GGATAACACAACCACTTTTTTGATTTTTCATATTCTTTTGCCCTTATGTATGTGTTTTGT
TGACTATCTTTATTTCCAATCAAGGCACTTCTACAAATTTTACAATTTTTTACGACATTT
TTCAAACATTTGGTAAGAACCCAGCCACACACGTATGTCCTTTGCCCAGCATCCTGACTT
TCATTAATATTTTGAGATAAATTTTCTCTTAAGTGTATTATCTCTGGCTCTTTGGATGCG
GGCAGATTATGTTTTTCTTTAACAAAAAAGTCTAAGGTTTGTAAGCAATCATTTTTATCT
GCTTCGCAATTGGCATAGATTGAGTGGGGAGAATTATAATTATTTAATAACAACGCCTTA
AAAGCACCTTCAAAAGCTACACAATTTGGTGCCACATTTCTTGCTCCGAAACTCCTAATA
TTACCAAAAAAGTTTTCGACTGGGTCCTGATTAAAGTGCCTTGTTAACATACAGTCAAAA
GAATATTTTTGGGATAAAATTTTCCAGAGAGCTTGCATACCCTCAATTGTTTTTACAAAA
TTTTTTACAGATGGTACAGTTTCAATTATAACATTTTTCTTAGTAACAAACTTGATAGAG
TTCAAGGCTTTTATGGCTTTTTGCCAAAGCTGATGATGGGGTGAAAACCTTTTAACAGGC
CCTTTATGTAGTTTTCCGTTGGGTACATGAAAAGTGTTACCATTTAAACTGTCAAATAAT
TTGTCAATTATTAATACAATTGGAATTATATCCCTGCACTCCTGTGGCAAATTCCCTCTG
GCTGTTAAATGCTCAGTGGCTACAGCCACACTGTGACTGAACAGTTGCGTTGCTGCCTTC
ACTCGCATCTTCTTAATTTTATCAGGATTAACATGCTCCTCTGTTAATTTCTGAAGGCAT
CTTAACTCTCCATATGATTTGTCAGCCTCATACAGCAATTGGAAATATTCCCACTTCACT
TTTTTGATTTTGCCTTTATCTTCATCGTCTTTATAATACATATCTTTGGTGAGGAGATTA
TTGCGTAATCCCTTGATGAGATGTGGAACATCATAAAGAGGTATAATTATTTTCTTATTA
ATTTCAAAGAAATCTTGTCTCCATTCTTTATTCTGTCTTAAATAGTCTGCCTTAGTATCT
CCAACTAAACTATTAACAGCACTCACATTCACTGTGCTTTGGTCACAGATGGTACAGAGT
ATCATGAGTCCAGTCTTGTGTACATTTTCAATAACTTCTGTAATAAATGTTTTTAACTCA
ACTGATTGGAGGCTGTTGGTAAAATAGTAGGTTGCTTGTAGTTTTTTTTTATGCCTTTCA
CCATAAAAACTAAGGCATGATCTGCTAATTTGTGTCCATGGCTTGTGAACCCTTTTAATT
GGTCTTTTGCTGCATCATAATGCAGCTGAGGGGTTATAGACATCTCATCAAAAATTAAAG
TGCACAAGCGGTCTTCCATGGTGAGCTCACTAACAGTTTTCTTTAATTTTTCCATAACAA
TCGTATTGATACCAGGGCCCAATTTAATTTCACTGAGAAGTCTTTTCAAAGTTTTAGGCG
CTGGTAAAGAAAAATACCTGGACAACATTGAATAACATTTGGGACTTCTTTTGTAGAGTG
TTAATGATAGCACTTTTTCTTCTAATAGAAATCTCCTGCCCGACGGTTTTTTTGACGTAG
TGCGAAACTGCATATTCGTAAAAATCTTTGCAGGCAGAGTCATATTTTTGGCAATCCTTT
TAAATGCAGATTCATCAGTAATCTTTTCAGCATTTGCTAATCTTGTCCTGAAGTTATCTT
CTCTTTTTTGAAAAGTGTTCACTCTTTTCCTTAATTGTTTGATTTGACTTTGGTACATAT
TATATTTTCGCAAGGATAAACTATTGTTCCGTGTCATCATATCTTCAACTAGGACATTGG
AAGTTGTAGGTTCAATAACATCCAAATTCAATGTCTCTTGTACTGAGGAGGCAAAGCTTT
CTCCTAAAGAATTTTTTTCTCTTTCTCCCAGATCAGTTTCGATTAAATGAAGCGATGGAA
CTCCCAAAGCGTCCACACGATTGTATCGGTTTTTATTTTCTTTTGCAAAATGCCGATCAC
ATATGCGTTGGTTTCTGTAGTATTCATAGTCCTCTGGGGTATCCAGTTTACCTCCAATTG
CTTGAACCCATGCCTTAAAACGTTCAGGTTTACTCTCTAGGCTGGGAAATACGTGAAACC
TTACACCAGGTTCTGGTGCACATTTTAATATACAGCGTCTCGGCATCGTGTCGAAGTAAT
ATCAAGAGCACAGAGAAAGTATACACTTGAGCGTCTATTCCGCAAAACCAACACAAATAG
CGATAGCGTCTTATCACGAACGTCTCCCGGTCAGTAGCCGGCAGGCCGGCACACAAAATC
TATGAATTTATGATATAAACTTCACAGAAGCGCGGAGGAACACGGAGCTCGACTACACAC
ACTATCTGGAGTATCACAAACACGAAGAAAACAGAATTTATCACAAAACGCAACGAAAAC
TACAAACACGCGCATACGCAAATTGCAGTCGCCATTTTGTG
(3161 bp)

- SilkBase 1999-2023 -