SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoSK_comp14142_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Chr23
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_syntaxin-binding_protein_5_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005096 F GTPase activator activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005892 C acetylcholine-gated channel complex
GO:0006810 P transport
GO:0006887 P exocytosis
GO:0008021 C synaptic vesicle
GO:0010468 P regulation of gene expression
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016192 P vesicle-mediated transport
GO:0017075 F syntaxin-1 binding
GO:0017137 F small GTPase binding
GO:0017157 P regulation of exocytosis
GO:0019905 F syntaxin binding
GO:0030054 C cell junction
GO:0030141 C secretory granule
GO:0030193 P regulation of blood coagulation
GO:0030659 C cytoplasmic vesicle membrane
GO:0031201 C SNARE complex
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0043547 P positive regulation of GTPase activity
GO:0045202 C synapse
GO:0045921 P positive regulation of exocytosis
GO:0050708 P regulation of protein secretion
Transcript
Level
FPKM:1.12 TPM:1.12
ORF EntryO_BomoSK18556_complete:A_BomoSK_comp14142_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
CCCGAGGCGCCTGCGGAGGCCGCACTGCCCCCGTTGCCGCTCGAGGAGAAACCTAAGCTC
GATCCGCGCCGGAAGTCCACCTCCTGGAAGAACTTCAACCTCAAGCGACAGCTCTCTAAG
GTCGACCTCAAGTTCAAGGCCGCCTTTGCAGTTCCCACCGAGAACAACTTGGAAGAGACG
GTCGCAGAAAAGAGCACTTCTCAATTTTATTGCGAAGCGACCGATAAAACCGACGCCGCG
GTCGAACCTAACGCGGAGTCACCTGAACTCGACGATAACAAGACTGTAGTGAACGAAGAG
GACAAGAGTCAACTATCTTCACCGCTGCGGGTGTGCTCCGACGTGTTCGAAAGAATGCAT
AAGGAACTACAGGAAAAGAGGTCCTCTGATGTTTATGATAGGATGCACAAAGAGCTACAA
GAACGGTGGAAGGACAAGGAAGCCAACGAACCTGCTGTCTCCCCCGACGTCTCTCCCGTT
GTCGAAGAAGAGAAGGCAACGCGACCCGACAACCTACCTTTATTCGAAGAAGACGGAAGG
CCGACCAGACCGCCTCGCCAAAAGGGAAAGATCAAAAAAGAGGATGTCGAAAAGAAGGAT
CAGCGAGACCAAAGGCTGCTGTCGGTGCCAAATATTAAGTACAGTAAGCAGGAGGGTGCG
AAGGAGACGCGACGCAAGCAGCCCTCCAGCCAGCAGGCGTCGTTCGCCGGCAACCTGATG
CGGCGCTTTAACAAACTGGATAGTTCGTTCTCCCGGTCTCGTTCGAGCAGCATGTCAAGT
CTGGAGAACATATCGCAGGAAGGCATACAGTGCCTCGCCTTTGCCGACAGCTACACGAAG
AAGTCTGATCCGACTACGTTACTGCCAACATTATGGATCGGCACAACATTAGGGTCCGTG
CTCACCATGATGATCAGCCTGCCGGAGGCCGACCTGAGGCACACGCAGCCGGTAGTCGTC
TCCACAAGTGGAGGTCCCATATTTAGATTAAGAGGTTCCATACTGACGATGTCATTCCTC
GACTGCAATGGTGCTTTAATTCCTTATTCATATGAAAGTTGGAAAGACGACAGTAAAGAT
GTTCGTGAGCGTCGGGAACGAACACCCACTAAGCAGAGTTCTTCAAGTAGTGGCAGTAGA
ATGAGCCCGACTCCCGGCCCCACGGAGTGCTCCTCCACAGTGGGCGACAGGCAGTTCGTA
GTGATCGCCTCCGAGAAGCAGGCCAGGGTGGTGGCCTTGCCCAGTCAAAACTGTGTTTAT
AGACAACAAATTGTTGAAACTGATTTTATCGTTAAAGCTGAAATCGTTAGCTTGAAAGAT
AGTGTTTGCTTGGTCAATTACTTGTCAACCGGGCACCTGGCGGCGTACAGTCTGCCCTCA
CTGCGGCCTCTCATCGACGTCGACTTCCTCCCTCTCACCGAACTCAGCTTCCAGACACAG
TCCAAACAGAGGGGTATCGTAGACCCAATGCTGAGTATTTGGGGCCAACAGCTCATTGTA
AACGAGGACACCGATCAGTAAGTCTGCGAGGCGGATGCCCACGCTAGGTGCTGCCATGCT
CTGTGGAGTCGCTCGCTCCTCTGTTGCATACGTTTATAGACCATATTTATTCGTTGTCCG
ATTTATTGAATGCTTTGGTTAGACCCCCATAATATCTGTTCTGTTCCGAGTGATGAAACG
GACGTGGGCAAATCGAAGAATCCTATTCTAAACTCAATATTGTACAAATAAATTAGGAAT
GAAAAATAATACCGACGGTACATACCCATTGTTGTTAAAAAAAAATTATAAAAATTTTGT
TAAACTATTGTATAAATTCAATGCAAAAATACTAACCTCAAAATTTTAAACCTAAAAAGG
AAACTCGACTAAAACGAATACAAATTGTTAAGATAAATATTGAGTGCATTCGTGATTTGC
CCCGGCCTCTCCCCCGCTTGCAACCCCGCTTCTATAGTCCACTGTCTACACCCGACTGTT
GTATCCACACGAACACACACGTCCACCACACCCGACACCTCGTCACATACTACAACTACT
GTATCTTTTAAACTCTTGCTGTTCTGCTGTTATCCGCGATACTTTCTACGCTCAAGCATG
GCCGCTTTGGAATTTTGAACTGAATTTCTCTTTCGTTTCACATTTTGCAGCTCATAATAA
TAATAAATGTTAGTCATGCTTTTTGTTAGACGATTTACCTTTTAGACATCAAATGAGGAT
GCCGGATCTTTGAGGTGAGATATTTGCCAGTATTAATCTCTGTACTTGCCTTCACTTCTG
TCACTTCTGAAGACTTCCGAATTTTCGTTCTTCGATGAAAATTTCCGTTCTATTCTTCTA
TCTGAAACAGGTCAAAATAAAGAGTAATCTATTCTTTTCATAATTCTAAATTGATATGTA
CTGGCGTTAATGAGTGATCTGGTGGAATTTCAGGATAGCGAAGACGTTCTGCTTCAGTAA
CCGCGGGCACGGCCTGTACCTCGCTTCGCCTTCCGAAATACAGAAGTTCACGATCGACGC
TGAGTTCTGCCAACAATTGAACGAAATGTTGGGAGAAGTATTCTTGGCGCGCGACATGCC
GGAGCCGCCGAAGGAGAGCTTCTTCAGGGGACTTTTCGGTGGAGGAGCGAGACCTCTTGA
TCGAGAGGAGCTTTTCGGGGAAAGCAGTGGAAAGGCCAGTCGCACCGTCGCCAAGCACAT
CCCGGGGCCAGCCTCAGGCTTGGACCAGCTCGGAGTCCGGGCCTCCACCGCTGCCAGCGA
GGTCTCGCGCGCTCACCAGATGGTCGTGGAGCGCGGAGACAAGTTGTCGCAGCTCGAGGA
CCGCACCGAGCGGATGCACTCGCAGGCCGCCGAGTTCTCCTCCTCCGCGCACCAGCTCAT
GCTCAAGTACAAGGACAAGAAATGGTACCAGCTGTGAAGCGTCCCACGGACCCCCGTCGC
GGTTTTGTACATGTCTGTATGTATAGTATAGATAAAGTAGTAAAACGAGTAGCAGTTTAG
TGACGTAACTTTTCTATCGATGCTGCACTGTCGGCTCTAGGTGCTGACCTCATGAATTTC
CTCGGAGGCCGATATCCGGTCGCGTCCTTTAGAGCTTAGCTGTCGAAGTAGTCGTCGTAT
GGAGTGTTCGTGTAGACGCGACGAACGAACGCACAAATTGGTATCAGCAGCGAGCGTAGT
GACCCGCTTCTCCGCGATCAGTCCTTCAATTATTTCTGTGCCTAGGCAAGTCTAGATTTC
TTCATCAAACACGATTCCTTTGTTGTTTCGACAGCTTTACCGTCGCAGTGGACACAGTTA
CCATTTTTATATAAAAATATCGATAGTTGTATCTGTACTTTCGACGATGTTTTCAAAAGT
TTTATTTAACTTTGATTACATTGGGAAAAATTAAAAATTTCTTAAATTTATTATTCGTTT
AACTATTATTCTATGATATTCTATGATAATCGGGAATTGTTTTTACAACATCTCCCCTGT
ATACTTTCAATATACACAAAACATTTCCAGTCTAACTAAATCTGCGACAACTAGGAAATG
TCGACAATGTTTTTGACATCGGGTCGTTCACTGCAAATGTCAATGTCACAATGACAGCTA
CATTCGTTCCGTCGATGACTTGATACTAATGTACTTGTTGATGTAGTGAAAATTCGTTCG
CTAATTTTCTTACTACCTTAATTAAAACTACTTTGATGGTGTAGACTTAAGATTATAACA
AGGTCATTTTCATTTTATATTATCCAACGTTTGAAATCGGATGACCAAGATCTTATTTGT
CCATAATATATAATGTTTATTGACAAGTTTGGTAGATTGTTCAACTTGGTCGTTCATGTA
CACGATATAGAAACCCAGGCGTTTGAGAAGCGCCAACTATGATCTTAATCAAAATTAGGG
TCTTACGTGTCAACGACCTACGTGGATTTGATTTAATTTTGTTTTGCAAGTATTTGCATT
TTGGTAAATTTTATAAAATGGTTGACTCCACTGTCGAGATCTTGTAGACAAACTGCAGGT
TTGTGTACTCGATTCTTCTTGACATAAACTATTCTAAACCGCTCCTTTTCTTTAACTGAA
ATTGTAAGCCGTAAAAGTACTTTTGATTATGTCCACGATCAAAAAATAAAAGAATTCCTA
ATGCCTTAATATTCCTTCACGTTACTTACTAATATGTGATACGTGCATCGTTAAAATAAC
TGAATACCTCTAGAAACTCTCTCGCATTCCGTCGTGTTTGAAGTCTGAACATGAATTTTA
AAAAATGTTTTGAGGTTTCATTGATTCATAATTTTTAATTTTTTCTTTTTAAATAGATAT
TGTGACCATACCAGTATAAAAAAGGAGTCGATCACAAATAAATAGTAATGAGCACCCAAA
GTCACTCTCTACTCTCTGCCCGTCCGCGTTGCACCCGCGCGTCACGAATCTCAGTTCCCG
TCCCACTCCCAGCCGCGGCTGACCCACTGGGAATTGAAAACTGTCTAAACAATAAATAAA
TAAAAATTTGGGTTTACCAACATCACCATCAAACCAAAAAATTTACCAACATCAACAGCA
AACTAAATGACCACCTAAACAGTTGGAACATAATTTTTAAGCGTGCGGGATGCGGGGGAT
GTTCACGTATTCTGATTTAGAGATAGATGGAGGTATTTTGACATGTGGCTAGGCCAATAC
TAATTTTATTATCTTTATCCAACGTAGGCTGCATTTAATTTATATTCCAATAAATGAATA
ATGTGAATTTTAGTACCTTTTTGCGTAAAATTGAGATTATTTAAATGTTGCTACTTATTA
ATAATTTGTAGATTTAAATGAGATAGATGCAAAATACTAAACAATATTATATGAGTCAAC
TAGACATGCTATGGTGATCTGTATAAAGTATTAAATTAATATATAAAATAGATAAATGTA
ATATTATATTATATAGTTGAAATTTTAAGCATTGGATGACAATAATTTTGTTAAAGTTAT
TTCTCAGTTGTGTGTTAGTGTCGTGCCGTTTCGGTACATTTGATTTTCTTTTCGTGCGGA
AGTTTTATTTTTATTGCATTTTTATTATTATACTTATTTTATGTACGTAATTAAACTTTT
CATTCTTAATTAGAAATCATTTAATGTACTTATTCTCAATTTAAAAGCAACATTTTGAAT
CGCCTTATTATAAAAGCAATATTGAATTCGGGTTGCAAGCCTAAACAAGACCAATCGTTG
TTGTGTCGGTGTTGCTAGCGCTAAATGTATAAATGACGCGTTAAATATTGTAAACTACTA
AACGCTATTTGTATATCGCTGTGTATTTTAAGGTAATAGCAGAGATACTCGTTAAAATAT
TTTTATGACCTTTAGTCGGCTCAGTCTGAGCAACTTTATTATTTCAACAAATATTGGCAG
TTCGATTTATTTGCGAAGCCAATGGTTTCAGTGTTCCAAGGGATCCGCCTTTAGCTCGTA
GGCAGAGCTAATGAAGCTGTGACTTGGGAATTAAATATTTCTACTTTAGGCATATTTTCT
AATTTTGGTTAGTTTTTAGCTTCCATCATGACGAGCATGCGGCACGGTAATGAAGACTTT
TTTCAGAAGATTCGAGAACTATTTCAATGAATTTCATCTGCTCATAATAATGATATCCTG
TAGAGTACAGAGTGTGCCGGGCGATCTCTCTGCTTCTTTACAGCCAGTTCCTTACGTTAC
GTTTATTGTTTACTCTATATTTACGTCCAATGTTAATTATTCGCTAAACCTAATAAGTCT
ATAAGTTTTTAGCTTGATTTACATACCGTAGACTGGCTAGTTCTGTAAATTCGCAAATAT
TTGAAACATTTTGAAAATAGCTTTTAACATATTTATTTTTGATAAATAATTCCAAAGGTT
AGTTCTAAAAGTTGATATGCAATAAAATGACTAATGGATCATAATGTATCCGTTCTTGTT
AGTCAATAAATGAGGGTCACTGAAGAACACTGGGTGGTGACGTTGAAATGTAAAGAGAAA
TAATTTACACAATCGCACCTCTAGAACTTATCTGACACAGTTGAAAATGTTGCTATTTGC
GAACGGATACTTCGAGAATGTGCGTTTACAATATAACACAACAGAAACATTACTAATTTA
GTGGTGGTGTTGGTACAGACATTCCAATTACTAGGCTACTCTGCCCAATCCTAGAACCAA
CCATGCGTACCGCATGAAAGGTACCGCACTGGCTCTCTCGATGCTAATAAAATATAATAT
GTATGAAAATTGAAAGATTACGAAATTATAATAGATAGCAGTTTTAAAATTTGTTGATGT
TATGTAAACTGTAGAATGTTAATGTGTCACTTCGATCCAAATATAGGTGTCGACGAATTG
TCTATACCTAAATGATTGCCAGCGAATAAATACCGCGGAATACTAAGTAACTGACATAAA
CAAGGCAGTCATTAACGGCACGTTTCAATTAATTGAGTTATCTATACAAATGCAATCCTT
AGATTCAAGAAAAAATGTGTTTCAATAAATGTTAAAATAATGTCTAAATACGTATATATA
TATTATTGTTACTGTTTTGTATGTAGGGGCGATAGATAGTTATGTTTAGGCAGACTTTTT
TATAAATTATCGGGAGTGACACAGAAATTTTGTTACGATGTCCACCTGTTGTTTTAATCG
ATGTTATATTTTCGTAGCTATTTACAATTTTAGCTGTTGAAAAACCTGTTTGAGGCATGT
CTCGGATTTTTATAGATTTTAAAAAGTATAAAATATTAAGTCTATTATGATAGAATACAG
TGCTAATTGTGTTTGTCGAACAAGAAGTCTCAAACACAGTACTTCAAAATAACATGTAAC
ATGAGTAGTAAAATGTTTAATTTATGAAATCACAAGATGCACCTACGTAACAAAACTAAA
ATTCGCCAATGTATTTTTACTTTCTCTAATTTATGTGTAATATATCTTAATGCGCTTTTA
TATGTAAAATCACACGAAACGTAAACAGAGAAACTGTAACTATCATAACAATAAAATTAT
TAACACTTTTTAATTCAATCCTCTTTTCCGAACTTGTCTCAAACTAGGAAGAATTTTAAC
AAAAAAATTTAAATATTTCTTTAAACATTTTGCTGTACATGATGGGGCCGTATCTCGGTG
GCATATCAATGGATATATCATAATGTTATCACGTACCAACTACACGAGGATAAATATATT
CGTATACTTTTGAAAAACGGCTTACCACGGTCTCTATGATCCCTTACGGAAAAATTAGTG
AATAAATAATGCATTTTCCATTTTCACATTGTCACTTCACTATTGACTCATTCTCTTTTC
TGTAAGGATTTAACATTAACCAAATGTCTGCCCCGTCTCCTTCTCTCGCAAGTTCATTCA
ATACTTCACTGTGGTGCATAGTTACGAATATATTTTATTATATATTTTATAAGCAGAGTT
CTACGATATCGTTAAAGTGCAATAAGCGTTGTTTATCAATCGTCTAGTCTGTCCTTCCAG
TCCCAACTCACCTCATAGTATACAAATATTATTACTATAATATTAAAAAGCATCAAGTTA
AGTTTTGTTTGATTCTATCGTTGTTATTGTTGAAGTCACGTTGCTATGTAAGTTATAAAC
ATTTACGTTTCCATAAATGCAATTAATAATAATAGATTAATGGGGATGTGCTAATAATTA
TAATCTTAATTACATCATTTCATTGACTGGCACGTTCCCGACGGAATCTAAAGCAAATGC
TAAATTAATTTTGAAATTATGGGACTAACGTAATAATAATAAGATATGTAAATAAAGTTA
TAAAGAGAAAAAAACTTGTGGCAAATTAATGATTGTTATCTAAAGTAGAATCATTTCAGC
GCCATTTTGTATCGACTTCAGAACGTTTCCTAGCGTCGCCACAGCGGCCACTATACAGAC
TGTACATAATATGGAAGCTGTTGGACTATATTATTTAGTTTGGTAGATGAATATTATAGT
CATTACAATATATAAATAAATTATAAAAATATTAAAA
(8017 bp)

- SilkBase 1999-2023 -