SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp14128_c1_seq11
Scaffold_idBomo_Chr23
NCBI non-redundant
(nr)		Retrovirus-related_Pol_polyprotein_from_transposon_TNT_1-94_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0004190 F aspartic-type endopeptidase activity
GO:0004518 F nuclease activity
GO:0004519 F endonuclease activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0006508 P proteolysis
GO:0008233 F peptidase activity
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0015074 P DNA integration
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0090305 P nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis
Transcript
Level		FPKM:5.12 TPM:5.15
ORF EntryO_BomoSK18509_complete:A_BomoSK_comp14128_c1_seq11
Sequence
(Nucleotide)
AGGTGGGCTGTGAGGTCGTCCACCGATCTAAGTAAAAAAAAACATCCACACGTGTTTAAT
GATACTTCTAATGGTAGGAAACACATTCTCCTAGTATGAACCAACTAAAACGTACAACAC
AAATCTTCGTATTTAATTTGTAATTTCTTTAAAATTAGAGATGAAAGCTATTTTTTGAAG
AACAGTATTTAAATAAAGATTGTCCGAATGATATTATTAACTAAGCTAAACGAATATAAC
TAAAATAATTGAAGCAATACGATTGAAAATCTGCAGTATAATCAATGAATGTATTTTGGC
ATAGATTCATATTTGCTAAAGTGTATTTTAATTATTTCCAGATAAAGCCCGGATCGAAGT
AGATATAAAAATTGTTCGATTATATAAATAACACTAAGTTATACACAGTTATACTTTGTA
TTTATTTAATATTTAAATGTAGATGAAAATACAATGCGGTGGATGTCACGGAGTAGAGAA
AAAAAAGTAGTGCCATAGATTATATTATATCATCTCATATTCACATTGAGTGTCAAGGCG
CCAAATTTAAAATTATTTCAACACTTCTCCTCAATTTAAGCCTTAACAATAAAAGTAAAT
ACTATTGTTTTATATTAAGACAATTATTAAACCAATGAATTATATGAACACATTCCCAGT
TTAGATCTTAAGAAAGCAAATTTATCTCTACATAATGCTTTGGTAAATATATCTGCATAC
TGATTGTCTGTACCTACAAACTCTAATGCAATTATCTTTTGATGATACTTTTCTTTAATA
AAATGATATCTAACTTCAATGTGTTTACATCGTTTGTGAAAGTTTATATTTTTAATGACA
CTTATAGCACTTTGATTGTCCAAATGAAGAGTCATTGAATTTTGTTTATATTCACTGATG
TCACTTAAAAACTGTTTAATCCACATTGTCTCTTTAGTAGCAGCACAAGCAGCAATGAAC
TCTGCTTCAGTAGTAGACAGGGCTACTGTCTGTTGTCTTTGACTAGACCAAGTTATAGCT
GCTCCATTCTTGATAAAAACATAGCCAGTAACTGATCTACGGTTATCCAGATCATTTGCA
TAGTCTGCATCGCTGTAGCCTGTAGTTTCTGACGGTTCTGTGGTTTTAACATAACACAGG
CCATGGTCTATTGTATCTTTCAAATATTTGAAAATCCTCTTCACTGCGTTCCAGTGACTT
TGGTTATAACAATTTAGATAACGACTCACCAGACTGACAGCAAACATGACATCGGGACGA
CTCACTATAGCCACATGCATCAGGGAGCCGACCGCTTGTCTGTATGGTATACTTTTATTA
GGTTCTTCATTACCCTTTTGCAACTTTACATGAGGGTCAACTGGAATACTGTTTGGGTTA
GAGTTATCCATATAAAAATTTAATAGCATTTGTTTAATATATTTAGTCTGATGTATGAAT
ATACAGTTACTAAATTGCTCTATTTGCATACCCACAAAATTACTAGGCTTATTTAATACT
TTTATTTCAAAAATTATGCTCAATTCTTTAGTGAGCTCAAGCAATGCAGATTCATCTGTT
GAGAATAACAATCCATCATCAACATATAGGCAAAAATAACATTTCTTATTATTAACTAGA
CCAACATACACACATTGATCTGCCTTAGTGTTGACAAAGCCATACTTCTTCAGAACAGTA
TCAAATTTGCTGTTCCAGCACCTCGGAGCCTGTTTCAAACCATAGAGGGATTTATTAAGT
TTACATACCATGTTTTCTTCACAAGGTAGGCCTTCTGGTGGTGACATGAATATGACCTCC
TCCAGCTCTCCATACAGGAATGCTGTCTTCACATCAAGTTGAATAACTTTAAGATTATTC
TGAGCAGCTACAGATAATAATATACGTATAGAATCGTACCTCACAGTTGGTGCAAATGTT
TCATTGTAGTCTATGCCTTTGGTTTGTGCATATCCTTTGGCACACAGCCTTGATTTATAC
CTTGGTCCGGTTGGTTCATCCTTTATACGGAATACCCATTTACAATTTATAACTTTGGTA
TTAGCAGGTCTCTGAACCAATGTCCATGTATTATTTTTCTGATGAGCATGTAATTCCTCG
TCTATAGATCTCATCCATTTCTCTTTATGGATTGAGTTCACAGCTTCTTTATATGTTTCA
GGAACGTCCAAAAGCATAACTTCATCCTGACACAAGTATGTATTCTCTTCTGGATCATCA
GAAGACTGTTGCACCTTCTTCTTTCGGCGTAGAGTTATGTTAGAGATAGGGAGACTATCA
TAACTCCTATCAGGTAGGTAGTCGCTGTCTGATGATTTAGTGTCACATACAGTATCATAT
GAACCTGTTGAAGTAGAATCATCTGTCATTTCAGATGTTTCACTTTCTTTGCTGTCATCA
ATATTCATTGATGGTTTCTTTTGAGATAGTTCTATGGGAACATAGTCCCTTTTGACAGTT
GATTCAAGGAATGTAGCGTCTCTGCTTTTTATCACTTTTCTGGAATTTGGTATTATGAAT
CGATAGCCTTTGGTGTGATCACAATATCCAATAAAGATCATCTTCTGTGCTTTTGGGTCC
CACTTTCTGCGTTTCTCCTGTGGTAAGTGTACCATAGCTTCACAGCCAAATATACGCATA
TGTTTCACATATGGCTTCTGTCCAGACCATAACTCTTCTGGTGTTTTAAATGACAAAGAC
TTTGTTGGTGAACGGTTTATGATATAAGCAGCAGTGTGCACTGCATCAGCCCAATATAGT
TTAGGTAAATTGGCATTCAGGAGCATACACTTTGCTCTTTCTATAAGACTTCTGTTCATT
CGTTCCGCAGTCCCATTTTGCTCTGGAGTGTATGGTGTGGTTGTTTGATGTATAATTCCA
CAACTCTTCAAGTAATCAGAAAAATTGTTATTGACATATTCCAATCCATTGTCTGTCCGG
AGAACTTTTATACGAGCTTCAAGTTGATTTTCGACTTCATTTCTGAATTCTTTAAACTTT
TCTAGAGCATCTGACTTATTCCGGAGAAAATATACATAGATCTTCTTTGAATAATCATCC
AGGAATGTTATGAAGTATTTAGATCCACCGAGTGTTTGTGTTTCCATAGGACCACATATG
TCTGAGTGAACCAATTGAAGAGGGGTTTGTGCTCTCTTGCATTCACTTTTAAAAGGCAGC
CTCGTTTGCTTACCTTCTTTGCAGGTGATACATGACAGATTTTCTGATTTTTCAGAGAAA
ATTACATGATCTACATTGTCAGACATCTTTTTCAGACTATTAAAATTCAGGTGTCCCATT
CTTTGGTGCCATAGGTAAATATCCTCTGCGTCAACATCAGACATGCATGCATAGCCTCTT
CCAGGCATATTTAGCCGGTACATGTTGTTGATGATACTGGCCGTTGCTACTATCTGACCT
CTGTTTATAATAGCACAGCCATTTTGATTAAACCTTACTTGGCCACCGCTTCTGACAATC
TGGCTAACTGATATCAAATTAGTTGCTAGTTCGGGAACACATAACACATTTCTGAATAAT
AATTTATTTTCTTGACCCTTCTTATTACATACATTTAAGCTCACTTGCCCTGAGCATTGC
ACATTTAAAATTTTGTTATCTGCAGTTCTAATTGTCTTTACAGAAGGCGTGTCATTCTCA
TTTGACAGCAAACCTCTATGTTTGGTCATGTGTGAGGATGCACCTGAGTCCACGTACCAG
GCATCATCTTGAGTCGTAGATGCTACAAAAACAGCAGCATATGAGTTACTTGCTTTTTGT
GTATCTTTAGTCTTGTTTTTACATTCTGGACTTTTATGTCCATATTTATTACAAGTGTAG
CACCTTGGTCCTTTTGATTGCTTTTTGGAATTCTTATGAAATTTCTTGGTAACTGCAAAT
GCTTTTGAGTCATTTTCAGGTGGTCTTACATCTTGTAGTAGTTTTGCCTTTACTGAGTCT
GAACTGATTTTCATGCCGGAACTCTCAATAGCTATTATCATAGGTTGGTAAGATTCGGGT
AGACCGGAGAGCAGCAGTGTACCTAGCCACTCGTCATCTACTTTAAAGCCTATGTTTCTT
AGCTTGTAGGCAGTGTTAATAATTTTGCTTACGTATTCCTCTACATTTTGGCATCCAGCA
AGTGATGTATTACAAAGGTCACGCAGTAGACCAACTCGGCGTGTTAGCCCGGAGTCATCG
AATGCTGATGTTAATTTGTGCCAAACTTCCTTCGCAGTCTTCGCCTCTTGTATGTGAACA
TAGTTTATCGGATCCACTGAGAGAATAATCTTTGTTTTTGCTTTAATATCTCGTTTTGTA
TCTTTTACCTCATCTTCTATACAATCCCACAGCTCCTCGTGTTGCAAGTATGTTTGCATT
GCAAATCGCCAAGTTGCAAAGTTATCACGGCCTGATAGCTTTTCAATTAATGCCATTTGA
TTATTCATTGTGATTGATAATGATATTCGGTGGATTTTAGTTAAAAAAAAAACAATATGC
CGGCTTCTTATTGAGAGGTTATGTTCACTGCAAAACTGTCTATCACTGATTTTAAAGTTT
ATTTAGCACTTTTATTATTTATAGGCTTTACTGGGCCCATAACC
(4604 bp)

- SilkBase 1999-2023 -