SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp14082_c0_seq3
Scaffold_idBomo_Chr5
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_LOW_QUALITY_PROTEIN:_uncharacterized_protein_LOC101737452_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000122 P negative regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007165 P signal transduction
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0045892 P negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0071837 F HMG box domain binding
Transcript
Level		FPKM:4.31 TPM:4.34
ORF EntryO_BomoSK18134_complete:A_BomoSK_comp14082_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
CCGCGTTCGGCACGGTGTACTCGTGTCTGTGTTCAATATTGTTTTTAAAAACATTTATGG
GCAGATTTTTTGCTCGAAAGTCCACAAAAATCGCAAATGTAAAAAGTTGTAGAAGTGCTG
TGTGCTGTATAATCGTGCAAACAAACTATGAATTTGAGTTACGGAATGAGTACAGGTTTT
GCAAGATGTATGAGTAACCAATGACCGCAGGGCATCCCTGCGCGGTGGCGGGGCGGGGAG
AAGGGGGGTGATCGGATCGGTTCGCCGAATTCGCCGACAGCCGACAGCGTTGCACTGAGT
TTTTGCCTCATCTTGCACCGTAATAAAAATGACTAGTACAGACATCGCGGAGAAGATGCC
GCTCAATCAAGAAAAACGTTCGAACATAACTGTTTCTAATAACAATGACCACAACTACCT
TCACAAGAAATTTAAAAAAATGGCATCTACTATACCCGTTCTACCATCAAATCAGTCAAG
AGGTCAGGAAATTAGACAAAAAGAAATAAACGTGATACAGAATGCATCTAATGCTCCGAT
AACAAATGGAAGCATTTCTGCAGCACATCCTGAAATTGAAAAAATTAAAGAAAAACAACA
CAGGCAGCACGTAGATGCGGGTGAAAATAATGTACAAATTAATTATAATGATGAAAATAG
TAAGTTAGATAATGTAAATACTGTTCAACTATCTGGTCAAACCAGTTTGACAGATGAATT
TTTAAACAAGACTGAGAACCTTGAAAATGATTTTATCAGGGATGCCTATAATGGCACAGT
AGGCGGGCGATATATATGCCCATATTGTAAATTATCTTGTGCCAAGCCTTCAGTTCTTCA
AAAACATATCAGAGCACATACTAACGAGAGACCCTATCCATGTATACCTTGTGGATTTGC
CTTTAAGACAAAATCAAATTTATACAAACATTGCCGATCACGTATGCATGCGTTAAGGTT
ACAAGGAACAGATATACCTATGACTCTAAATGACGACGAAATGTCAGGGGGGTCCGAGAG
TGACACTCCTACCTCTATCTCTGAAGCAGGGTCAGACGTTTCGAATTGTCGAATAGAAAC
GTTGGACTATAAGCCTGAACCCGAACGGCTTACGGATATAACACAACTCCGCTACACAAA
TACATCTCCAAGTGAGACCAGTAAATCGAAGACAATTTATAAACCTAAATTTAGAGCTGG
AGTTGCGTTTTACCGTGAAAGCGATGAGAAAGAAAAATTAAAGAAATCAATATCACCAAA
TGCAGATTTTCTCAACGAACATATCTCTAAAATTATATCAGACAACGAAGCTATAATTGA
TGTTATAGAAACACCATTACAAAAAAAATATGGTAAAATCAAACAAATAGCAGAAAGTAA
ACAACTTATGAATGACATTAACGAAATAAAGTCGGATTCGTCTCCCTTGAATCTGACAAA
AAACAATAATGAAACAGAAGTTTCGTTCAGGAAAAGATCCCATTCTGAAAGTTTTTCACA
GGGTCATTTTCAAAAACACCCTTTGAATCCTGAGGGATCTATAATAAAAGATCTCCTCTT
AAAAACGAAAATGGACGGAATGGTGCCAATTACTGGAGAACTGCTCGAAGGTCCCCTATT
TCTTTGCCCTGTTTGTCAAATAATGTACAGAAGTGCAGATAATTTAGAAATTCATAGGCT
GTATTATTGTAAAGGTAACGTTAACAGTAATGTAGTCAGTGACAGTAAAGATCTAAAAGT
TATAAGAACTGACAATATTTTTGTAAGAAGTAATTCTGTTAATGTGCGATTACCTGAAAG
TAGTTCAAGTGCTATTCAAAAATCAGGCATAAATTCAAAATCAGCACCAGCTCGATTAAA
ACCAGAGAACCTCGTTATCACGAAGGCAGAATGCAATGATGTGGTAGCTCCTTTGCCATC
ACCAGGTCCTTTACTCGGCAACACCCGACTTGTGGACTCAAGAATACCATCTGAATTTGC
TAGAAAAAACGACGTTATAAAATCAAAACCTATAGCAAGTCCAAAAAGGAAAATTGATAG
TCATTCTGATGCATACAGTCCAAGATTAGTAGAAAACGTATCACCAAGATCTACTGACTT
GTATTCTCACCCAAAATTGAGATGCGTAGAAACAAATTCGAATAATTTACGTTCGATCGA
AGAAATTTCACCTAATTTAAGAATTAATTCAACATCCCTTCAAATGTTTGGTGGTGAAGT
GAAGATAGTAGACCATTCTGGGAGCACTACAACATTGCGTATTGAACCAAATAAAAACCA
ATTGTCACCTATAATGATTCAGACAAACTTGTCGCCATCGAAGCTTATTAGTGACATTGA
AGCAAGTAGTGTTGTAGTTAGATCTGGTTTGCATTCAGGCGGGACAATCGTTCATAATCC
TCCAACACCGAAGGAAAACTTGAGTACTCCACAGCCACAGACGCCTAGAATGACAATATC
AACGACTGGTGTTCCAAATTCAAACTTGCCGAATATTCATGATATAACTCATTTTCAATT
TCCGCCACTCAGTGCAATTACGGCTTTTAATCCGTTAACACTGCCTCCATTGAGTCCTTC
AGCATCTGTATCACCCAACGGAGCTACGAAAATTATGCATGGAGGGAAATTGATCCCACA
CGTTCCAGGTATACCAGGACCAAATACTCCAAGTAGGTTTATAGGAAATACAAATACAGT
TCCAAAAAATCTAGGGAATAACGATAAAACAATTTCTATACATGATGATAAACACTCAAA
CTTAGGAGCCATACACCCTATAAAAAGTCCTCACGTAATGGCGAAGTATGATACTCAGCA
ATTGCGCAATACACGAAGTCCTAATTTGAGGATACCTCACATGGAAACCGAAAAACATGT
TCAGACACATGAACATAGTGAAGTACATTATATTTCTTCCATTCCTATTATCAATGTAAA
TAATGCTGAAGACACAAAAATATACTCCTCCAACACCATAAAACAACTCCATAGACAAGA
TGTCGGGCTGAAAAGAAACGCTGAGGGAGTTTTAAGGACACCTGTCTTGAAAGAAAACGT
TAACTTCCCAAACAATAAAAATAAAAATAAAGCACCTGGATTGTTGATCAAAACATTAGA
TATTAAAAATGAAAAAGAAATACGTAATTTTAATTTTGAGAATTTGATAACGAAAACTGA
AATTTTCAATAACCAAGTTCCAACTTCATGCGATATTCAGAAGAATAACACACAAGTTAC
AACATCGTGTGCAACTCCGCAAAATGAAAGGTCGGAGCCTTTATATTTTCAAAAGAACAT
AATGGTAAAGTCTGCTAACGGTGAAAGAAAACCAAAATTTTTGAGGCCGTCTACGTTGCC
TTTAAAGCCTGGGACGTTTACACCAAAAAGACATCACGGTATTACACCAAATGCAAATAC
TATGCCCTTGGTATCACCCGAAACTCCCAGACCAGCCAAGGCCTATGGGCAGTTGTACCT
TAACGGAAATGCGTATACGTACTTGGGCCTGAAATGTTCAACTAAGGTTTTTTATTGCAC
CATCAACAGACCTCAACCAACTTACGTTCCAAATCAACATTTTCTTTCCATGTACAGTAA
TTGGCAGTTATTATCAGAATTGACACCAGATCCATTAGGGTTGTCGGCGTCTTCAGCTAT
GTCTTTATACGATTCTCGACATCGACCACAAAATATGTCAGTAGCAGTAATTAAGCACGA
TCTTATTTTAACACACTCATCACAATGGAATACATTTATAAAAGAAAAGAAACAGGTGCT
CCAGTCACTAGATGTAAAAAAGATAGAGGAAAATAAGTCTCAAATTATGTCAGAGTCTGA
AAACTTGATGACTCCCAAAAAAGAGTTGACTGGTGGCTTTGAAAGTAATGAAGAGTACAC
ATATGTTCGGGGGCGTGGGAGAGGACGTTACGTCTGCTCCGAATGCGGTATTAGATGCAA
GAAACCATCCATGTTAAAGAAGCATATTCGCACTCACACCGACGTGAGGCCTTACACATG
CGTGCATTGCGCTTTCAGCTTTAAAACTAAGGGTAATTTAACTAAACATATGAAAAGCAA
AGCTCATTACAAAAAGTGTTGTGAGTTGGGTATAAATCCAAATGAAGGTGATTGTGACAC
TAATGAAATGGCCCAATGCTCTGGTGAAACAGATGACGACACTGATTCAGATGGAGATGA
AGGAAATGAGGGTGAAACTGAATCCAGTGATACGGAAGCATATAAATCTCGTTTACCGGA
ACATGAAGCTGCACATTGCTTGTTGTCTTTAGGTGGTAACAGACCTTCTACGTCAGCTAC
TCCAGGTTTATTAACAAGTGCTAGACCAACAACGTATCCTTACGCACCCGTGGGATTGGA
ATGTATCGAAATATACACAGAACAGGTTAGGGATTCATCTGTTGATGTGAGAGTTGATGC
AGAAAATGAACCTATTGATCTCAGTAAAAATGATGTGAAAACACCTAACATTCCTGAAAT
TCCAACTGCAAGAGAATCAAGTGTTTTAGCTTCTTTGGCTTCAAATACCGCTAAGCTCCC
TCAAGCTCCGAATCAATGGACAAATGGGGAACCTTTGCTACACACATATTTGACCGAAAG
AGCTTTATTAGATACAAAAATAAAGCAAAGTCAAGTTACGAGTTGCCTAAGCAAACATAA
AAATATCGATTTAGAAAAATCTGCGTTCACGGATGATGCAGTAGAAAATCAAAATAACAC
AGAAAAAGTAAAATCTTTACATTATATTAAAAATGATGATAGAGTAAGAAATACAAATGA
ATGTGACGAAATTGAAAATAACATATCCTCCGTGGCACTTAACGATATGGTAATTGATAC
AAAAGATTCTACCATAATGAACAGCAATGTACCAATTGATATGAAAAAGTCGTTTGTGCA
GAATAGTACAAATTCTAACGCAGAAAATGCAAAACACGTAGTGTCCGAATATTTAAAACA
AGCAAAGATTAATCTCATCAAAGCGCAAGAGGATATGTCAATTAATCAATCAGAAAACTT
CGGTGAAGAAAAAAATGGCGATGATATCTTAAAATCTGATGAATTTTCAGATTCAGAAAC
CATGAAGTCATCATCGATATTGGAACATGATTCTGTTGCGACAAAAGTCGTAATTGGTGT
GGGTGGCGTGGCTTTTAAGGTTACTAAAGGCAAAGAACTTGAAAGTTCTTCATATCCCCC
TGGCAGAATCATGGAAGACGGATGCAGAGATTGCAATTTTTGTAATAAGACATTTACGAA
ACCTTCACAGCTACGGTTGCATCTAAATATTCATTACATGGAAAGGCCCTTTAGATGTAG
TATATGTGCCGTGAGCTTTCGCACACGGGGTCATTTACAAAAACACGAACGGTCTGCTTC
ACATCACAACAAAATATCAATGACTTCAACATTCGGGGCAGCAACGTCGTTTAATCCCAG
ACCGTTTAGATGCTCCGACTGTAATATAGCGTTCCGAATTCATGGACATCTTGCTAAACA
CTTAAGAAGTAAAATGCATGTTATGCGTTTAGAGTGTTTGTTTAAATTACCTTTTGGTAC
ATTCACCGAGATTGAACGCGCCGGTGTTAGTTTGACAGATATAGACACAACAGATTGTGA
TAGTTCGCTGGCTAGCTTGCAATTGCTCGCAAGGAAGCTTCACGAAAAAGATCCAACAAA
ATTGGAATATCGAGATCCTAACGGTCTAACAATAGTAGAACTACCTGCAGGCAGGGAACT
GTCGGAAGACGAAGATAACACACCCGCCGATAACGCATGTGTTAGTGAAAAAAACAGTAA
TGGAAAAACAAGTGAAGGTAATGAAGATCAAGAAATGGAAACACGTGTTAACTGTAGTGC
CACAGATATTTAGTGCCAAAATTATATTACGTACATAGTGTATTTTAATGTGCAGTTTTA
TTTTGTTTTTAATTTAAGTGTAATTATTAAAGCTGGGGTTACTCAGATTCGTGTGAAAAC
AATTGTACGCTTTAAGATTGTAACATACTCTAACATTAAAAATTCGAAAAATATTAATAT
GTATCTTGTAAATATCTCCACGTAATATTAAATTTGTTAAATTTGCTTTTAATGTAAGTC
TTATTATGTATTAATACTGTTATTTGTAATTTCTACAGAGATAATATTTGTTGAATTGTA
TTTGAAAACGAAGACCTAGATGGGATATATTATTGCGACAGAAAAAAAAGAGGTCCACAT
TTTTTAAACTACGCTTAAATATCAGTCAAACATATTACATTGTCATAGGAGTAGTCGGAT
GATATATAGAATAGAACAGCACTTTTGTATGAATTTTTGTATGACATATTTACCACTTCA
TATTTATACTATGTAACTACTACTTCCATAAATTTAAAACAATTGGCATATCAACTTCCA
TACACTAAACGTAGATATGAATAAAAAACAAAAATGTCTTCCATAAAAATGTACGGAAAT
AAATTGAATTTAGTTTCTTTAAAGTTATAATCAATTTGTATACATGTTTAAGCTGGGCTC
TCCGATTTAAAAAAATTATATTAATAGTAGTATAGTTTTGATTCCTACTATTATGCATTA
CTATTATTCATTTAATTTTTATAGTCCAATGTAAAAATAATTATTAGTGTGAATGATCAA
TGATCTGCATGTTTTGTCTTTTTTGTAAGGGATAGGTTACAGAGCCTAGTTTTTTATATA
TAATGTACTGTTATTTGAAAAGTATATATATATTCATTGTTAAACTATTTTTCTAGAAAT
TAAGCTTTATGGCGCTAATATGAAATTAAGCTTCATTGAAGCTGCAGACCACAAGCTGTT
CGAAAATATCACTATTAATAATACCAATCAAATCAAATTCAAATTTTTAAAATATATGAT
ATCATCATTATGTTTCTTTATTGTAGTATATATATGTCTTATATTGTTATATAATATATT
GTATAAACTATTTTAATAACGATGTAGATTTACAATAACATTTTTACAATATTTTCGAAC
TGGGTTGCTGCACTGCGCCTTATACTACTATTGTACTATACCATATTGGAATATCAATTT
TCAAAAACAAACTACTTAGTTATTTTTGTAAATATCTTGTGTCTGATCATATCACGGGAC
TGTCATAATTATTAAGGTACAAAATGTATTTAAGTACCACCATAATAAATAACTATCTAT
TAAAATATATATGTACATAATCGATAAAAACCTAAATCTACCATTATGATCAAGAAGCTT
ATAGCAACAGAAAGGCATCGACGCTAATCAATGATTTATAATTATAGGCTCCTAATTCTA
AAACTTATACAAAAAATCTGCTATACGTTTTAATTGAAAAAACTGTTGAAATAGACATTC
AAGCGGAAACGATAAATCGTATCAGTCTCGAGAGGCGACATAAAGTGCGGTAAATAAAAA
AATAAATATTTTAAACAAAATAACATGCATACTTAAATAATTCACATCTACAAATAATGT
TTCTAATATTAATCCAATTCCGGATTGGCATGAAAGAAAAATGATAATATTCAATATAAT
TTCAATTGAATGCCTATTTACTGGTATTGTCATTATTCACATTATTTTAAATCATACATG
ATCCATCCTTTCATCTCTCATTACAGACGGGACTCTATCAATTTTACTTGCCCTTGTTTA
CCATTACTTATAAGATCAAACCGTTTACAATTTAAATAACAAAATCAAAATTCGATATGT
TACTCAAAAATGTGATCCGACGTTATAATTCTCGCACTATCCAATAAAATTGTTTCCAAT
TCTTTGCTATTCCATTGTTGTGCGAGCGGCTCTTTTTCCATTTAAGCCAGTGTGCTTAGT
GCGAGTTTTT
(7870 bp)

- SilkBase 1999-2023 -