SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp14041_c0_seq6
Scaffold_idBomo_Chr27
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_protein_pygopus-like_isoform_X3_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0001105 F transcription coactivator activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0007367 P segment polarity determination
GO:0008587 P imaginal disc-derived wing margin morphogenesis
GO:0016055 P Wnt signaling pathway
GO:0030177 P positive regulation of Wnt signaling pathway
GO:0045944 P positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Transcript
Level		FPKM:3.13 TPM:3.15
ORF EntryO_BomoSK17633_complete:A_BomoSK_comp14041_c0_seq6
Sequence
(Nucleotide)
GGTGCCCGCCTCAAGGACGAGGGTGTTGTGTGTGCGTGGTGATTTGTGTTAATGCTGATA
GAAAGAATTTTATTAAAATCTGGTTTTTATAATACGATGAGACTTACATAAATGTGATAA
AACACAGTGTTTTGTGTCATCAAGTGCAAGTGAATCCGTCGTGAGGCGGTAATCGTTCAA
GTTGGCGAAGGCACGCAGAGGTATGATTAAGGAGAAGGAGAAGGGTGGAGGTGCCCGCCT
CAAGGACGAGCCCAGTGACCCTGCTGAGCCTGGCCACGGTTCCCGTCCGCCCTCGGCGTC
GCTGCCCACTCCGGCGGCGCTGAAGAAAGAACCAGAAGACACGCATCGTGTGAAGATAGA
ACCCCATAGTCAGCCCTCTGGCGAAGATTCTGCGTCAGACCTTGGAGTTGACGGCATTAA
AACAGAGATCGACGGCCTCATGGACAGCGACGGTGACCCAACAAAATCACCTTCCTGCGA
ACTGGGTGGACCTGGCTCGTTAAAATCAGAAAGGCTATCTTCAGACTCGAACGACATTTT
GGATCCACAGACAGGCCTCAGAAGCTCGACAAATAATCTTCAGGATGGAAACCCAAACTG
TCGTAATCCAAATGGCCCAGATAACATGGGTTCGTGTAGAATGGCGGGAGGTGGAGGGCC
TATGGGTCCTGGGGTTTCTATGGGGCCTATGTCTGCTAGTGAAGCACAAACACTTCCGTC
GAATGTAATGAGCAAGCAGTCTGGCAGCATGGAGCAAAGTCAAATCTTCGTATTCTCTAC
AATGATGGCAAATAAAGGAGCAGAAGCAGTGCTTTCCGGTCAGCACCACTCCATTATTGC
ATACCATTGTGCTCAACCTGCAACTAAGAAATACTTAGAGAAACACCCATTAAAAATTGG
TCAGTTCAATAAACAAAGTCCTGCTCAGTGGTTGAACAATTTAGCTATGGCAAAAACACG
GGGTGGAATGCGAGGTGGGCCTAACATGATTGGAGGACCCAATCAAATGGGTCATATGAT
GGGTGGACCTATGGGCCCCAACATGGGGCCGATGGGTCACAGTGGAATGGGTCATATGGG
TCCTAGTATGATGGGGCCAAACAGAATGAGTGGACCAGGTAATCAAATGATGATGATGAA
AGGTGGACCTGGACAGATGGGTCAAATGGGTCCTGGTATGGGTCCCATGGATGGGTTTCC
AGGAAGCACCCCGTCCTGCGGTGTCATGGACGGCCTCGGTGCTGATGGTGAAATGCCCTG
GGACACCAAAAACCCCTCTGTAATGTCTAATGGCATGTCAAATGGTCCGGGACAATTACC
TGCATGCTCGGAAGCATCGGGCCAACCGCCCGATTCAGGCTCTGCAGATGGTGGAGATTG
TCAAACTGGACCTAAAGGCGTAAAAATACCAGATGAGAACCTGACGCCACAGCAGCGTGC
GCATCGCGAAGAGCAGCTTGCAACGATACGAAAAATGCAACAAATGTTATTCCCTGAGAG
TGGAGGAAACAATGTCAACCAAGGTTCAGGAGACAACTCGCAAGCGCCTAACGATATTAA
CCCTCCAAATTCTACGGCAAATATGAATATGCCCTTTCCACCAATGTCTGGAATGGGCCC
TAATGGCCCTATGGGACCTGGGCCTAATGGACCCATGGTATCGATGTCAAATAATATGAA
CTCTGGACCAAGTTGTACAATGGCTGGCCCAATGGGTCCAAATGGACCTATGGGTGGTCC
AATGGGCCCAAATGGCCCTATGGGAGGTCACATGGGCCCTGGCGGGCCGATGGGTGGCAT
GGGTGGACCGGGCGGTATGGGAATGGGTCACGGTTCTATGGGTCCCAATGGAATGATGGG
GCCTAATGGACCCATGATGGGTGGTATGGGTCCTAATGGTCCCATGGGACCTCTGGGGCC
ATGTGGAATGAAAGGAATTCGTGGACCATGTGGAGGACCTGACATGAAATCGGGAATGTG
CACAGACATGCATATGGGTAGAGGTTGTGGGGGACCTATGGGGCGTATGCCGAACCCAAT
GGGAGGTATGGGAGGTCCTAAGCCCTGTATGATGGGCGGACCACATATGGGACCCAGAAT
GATACCTGGGCCCAATCTGAACGCGATGAACGGCGGTATAATGATGGATGGGAGTATGAT
GGGAGGCATGATGCCGCATGGCGACTGCGGTCCCGACCACCACGGAGTGCCCGTCAACGG
ACCTATGTGCGATGAGTACGGACGCGGAAGAAATATGGGTCCAGGAGACCCCGGCGGGCT
GGGTCCAGGGTTGGTTCCGGGACTGGGCCACAAGCCCGGTCTGCGCAGCCCCAAGAGTCC
CGGCGGTCCGGATATCGACTGGCAAAAATTACAACATCAGTTCTTTGACGATCCTAAATC
TATG
(2404 bp)

- SilkBase 1999-2023 -