SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp14021_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC101744110_isoform_X10_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000977 F RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:0.00 TPM:0.00
ORF EntryO_BomoSK17422_complete:A_BomoSK_comp14021_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
AGCAATACATATGAAAATTACTCTTGAATTAATAGTAAACAAAGATGTCGTCTTATATGA
ATCGTAAATATGCTCGGAATTATAGAAAACGCAAGTCAGAGGAAAGCTCGCGTCGAAAAG
AATGTAAGAAGCCTAAGTCCAGTACAGAACGAATGCGAGAGCTACGGCAGCGTCGAAAAG
AAAGCGAATCACCCAGATTATGTCATGAAAAATCAACGGTGCGAACTCGAAATACGATGC
TGTTGAATGTGAAAGAAAATGCAGAATCTTTGGATAATTCGTGTGGCAAATTGGAATGTC
GTGCGTGCCTTGAAAATGTTGAGAAAGCAAATTTAATAGACATTTTCCAATCATGGTCAA
CAGAACAGTTTAGTATGGGAGTCACTCTTGCTGATGATCTGTGTAAATTAACTCAAGTAC
AGATATCCATCACAGATCCACATTCCAACTTTATATGTATGCCATGTCATCAAAAATTAT
TAGATTCATGTATATTTATTGCAAAAGTTCAAAAGAGTCAACAAATCTTAAATGATAGGT
ACAATGCAATGTCTAACAAAAACAACTGGCCTAAACCTATAGAAGTACAAAAGAACATCG
ACAGTACTGTCTTGGGAGAGAGTACAACAGTGGAAATCAAACAAGAAGTTATTTCCGAAG
ATGAGGCTACAGACTTTGTTTTGAATTGTGATAATGCTGATCAATTGATGGAAATTAAAA
TTGAGCCTGAAGAGTTTGAGGAACCTGAAATTGAATCTGATGTTGAAAATAAAACAAAAA
AGCCAAAAAAATGAGGAACAAGCTTTAAAGAATGAATTCAAGCATAATAGTATAGAATTT
ACAAATCCAGTATTGCCAATGCCTCAGAATTCATTGCCTGACAGAATATCTGACTTGATG
GAAATTAAAGTAGAGCCTGAGGAGTCAGTGGAGCCTTTAGAATCTGAAATTGATTGTGAG
ACTGCAGAGACTCAAAAAAATCAATTGAATGTTGGAGAAGATTCGAAAAATGAATTTAAT
TTTGATAATACAGATTCGTTGAACCACAGCCCAGTAATGAAGGTCTCTCGGGATTTATTG
CCTATCAAAATAACTGTGAACGGTTCAATACCTGCAGATCAATTTGAGAAAATCCCTGAT
ATGAGCATAGACAGACATGTACTAAATGGTGACGAAGTTAGTCCCGAAGTGTGTGTTAAA
CATGAACCAGATAGTGACAATGACGACACTGAATTCATGAATGAGATGCCTTTGGAATGC
ATGCTCTGTATGAAATTATTTAGCAGTGTTTCTGAGCTCAAGGGACACGTCGTTGCTCAG
CATTCCTACGTCTCGGTCAAGAGGAGATCTGACTGTACAACTAGAATTGCTCGCAACAAT
TCAAAATATGTCTGTACATTATGTAAACGGAGTTTCGTAACGTCAACGGATCTTATGGTG
CATGAAACATGTCACGACAAGTATGCTTGTTACGGATGTCGGAACAAATATGATACATTC
GAACAGCTATCAAACCACACCAAGACATGTACAGCCGTCCAATCCAAAAAACAGCAACAG
CCGAAGACTTTGGAGGATGTTAAGAGGAAATATTGTGAATCTCCATTCAAAAAAAGAAAC
AACAGAAATAAAGTTAATAAAAGAGTTAATTCGAATCGAAACAGTCACAGTGAAGTGGAA
CAACGGATTGGAAGTGATACATTTGAAAGTGATTAAGTGTCAATTTGGTTTGTTACAAGG
TGGCATACTATATGCACAACGAAATTGGGTGAAATGTGAACGGCTGCGTTAGTGTAACAA
CGTTTTTACTACATAGTTAATAATAAATCGGTTTAGCTATAAGAGTTTACTAAATAGAAC
TAATCTTAGGCCAACCAGACGAGATAATAAACGTAAACAAGCGGACCGTTACTGAGTTAC
ATTGCGATAGCGAGGGATTATTATCTCTGTCCTTATCACTCGTACGCGCAGTTATGGCGT
CAGTTGGTCGACAACAGCTGTCGTTGTGTTTCGTGGTACAGGAAAGCACTGAGTACCGCA
GTTGTCAACATTTGGTCCGCCATTTTGTGAACAAGTTGGAATCAACATTTTGGGATCCAA
CGTGTATCTGCTGATAAATGGCGAAATTGTGTGGATCATGTTATAAAAGTCGAGGACAAT
TTTTATAGCAATATTGACAACATGATTGATAATACAATAGATAGTTTTATCATAAACACA
GCTGACTCGGACTCTTCCGACGAATCATCTTTGTCTAGTACAGATGACAGCGATTAAAAT
TCGAACTTTGTAATCATTTATTTAAATAAAAATGTTTTTTACTCCTGAAACTTTGTTTAC
ATTTTTATCTCGTCTGGTTGGCCTTACTTTAGAAAGAAATTAAATTGTGTCTTAAACGTC
AGAAGGAAATTTTCCCCATACGTAAATGTGTAGTAAAAGGATTTTTCCTAAACGTGTGCT
TTGAAAATTAAAAAGGTATCATGAAAAAATTATACAACAATAAAATAATAAAAATTAGCG
TTTAAAATTATTTAAACACAAATCTGCTAAATAGTTCATAGCGCCATCGTAAAAATCCTC
ATATGGAATGCGATTAACAAAAAAAAGGACGAAGGGAAACCTTTCTTCAAAATGGACAAT
TAAAAAAAACATACGAAAAATTTTCATTCGTTCATTTTGAACATTTATAAACTGTACATA
ATACATAATATATAACATTTATTATTAGTAATAATTTTACCATAAACTTCTAAATGAGAA
GTGGAAATTAAGGAGTTATTTTCAATTAACAATTGTGTTTTAATGCACTTTTCATTCGTT
ACAAACGAACGGAAAATTCTGAAAGACGTTTGACTCTCGCCGTGTTGCAAACAAAAAAGA
AAAAAATTAAAACCATAGTTACGAGCTACGCGCAAAGATAATCTAAAGACCTAAAACAAA
GTGTTCCTTTTATCTAGTTGGTCCAAACAAAAAGTGATTTACAAATAGATTGCGAACAAG
CAAAGGCTTATAAACAATGATTATTAAAATTTAGTTAAAGTGAAAGATTACAAGGACCAA
ACTTTGAAATTATGAAATTATTTTTAATTTACTGTAATATTAATGACATAACGATTTAAA
GATAAATGCACCTTCACCACGATTTTCATGTATATGATCTTATAATTTGATTCTCTATGG
TCGGGGGTCAGGACCATAGACAAATAAACTAATGATTAAAAAACTATGGTATGATTATAT
AATAATATATTATGTATGCATTCCATAGAATTTACTGCACTACTTCCGGCTTATTCCGAA
CATATATACTTATCATATTATTATATATTATGCTCTTAATTGGGAAAAATATTGACTTTT
TTTTTAAAGGCGACAACTTCACCTTTCAGTTCATATTTAAAATGTATAATTAAAAGAGAA
GATTTCTCACTCAGCACATCTCAATGTGAGGGAAAGCGATACGATCATATAATATATTCG
TGCTTTACAAGAAACAAATTTTTGTATATTTTTCCCAACTAAGGCCTATAAAACAGTTAA
TTGTAGTTTATACAACAAACAAACAAAAAAAAACATTATCGATTACTACTACGCGTAATA
GATGCTAGAAAAACACTATTTACTTGACTGATTCAGTAGCGACACAAGACAAATAGAGCA
GTGGACAAGCATAAGATTCGATGCAGGAATACTTCGAACACACATTGACCTACACAGAGT
GTAGGATAAAGACCGTGCCAAAGTTTTGTTTGAACAAAATCGTTATTTACAATAACACAA
AACTGCGACCGCGACACCCCTTGGAAAAATCAACGCTAACTCCACGCGCGATAACCATTT
ACAATTCCCCACTGTTGTGTGCAACCTCAATACCTTTTTAATGATTACGTAACAAATTTG
TAAAATTGTTCCAAACAAATTCTATTAATGACATAAAAAAATACGATCAGAGGTATAATT
CACTTTTACTAAAAGGTCTTCTTGTATCACCCTTTTATAATGTGTTAAATGAAGAGTGAA
TGACATAGGCGGTAATAGCGAATAACGCGAATTGGTTTAGCTTTTAGATTAAAAGTAAAA
GGTAAACCTTTAGGGCTGTCGCAGAAAGGAAATAAAATACTTTAGAGTCGGGCACAAACC
CAGTGTACCATTCTCCGTAGGGTATTAACGTAGTTTTTATAGAAATTCAGCTACATCAAA
GCAGTATATAAAACTGGGCAAGATTTAAAAGAAGCGTGTAGTACAGATATCACGAGAGCG
TAGAGATAGTAATCAGTTTATTGTAAAGTTAAAAACGAAAGAAAAACCACTACATAACGC
ATGTAGTTCTAATCTTATATCGCCAAGTGGCTAATGTTTCCTCGTACAGAAATTAGCAAG
TTCTTATGATTATAGCAGGGCTGCCCACCACGATACAGCAGTTCCGATTGTGATCAATAG
ATGTCGCTAGTGTCTCTACATGTTCGATTTAATAAGTCATGTTTCTTCTATCATTTAAAA
CATAGCATTGTGTGATACTTATATTCATACAACTAAATGCCGGTCGCTTATATCTCTTAA
TTAAAGACCAAGCAGAGACCGATCGGTTTAAAAGCGGTAATGCACACATACATACATACC
GTGTATGCGTTTGCCAGAAATAAAAATTAGATATACGTTTTTTTTTTTACATTTTATTAT
TATATATTTTTTAATAATAAAATTAATATTCTATTACACCTCGTTAATAATTACAAATAA
GTTTCCATTAAAATCTAGTATCATTGAATGTTTCACTTTTTTTTATATATAATAATAATA
TATCTTTATATTATTTTTTTACGCCAACGCGTCCGTACCCAACTATGATTCATTAATGAT
GATCACATTAATATACTTTTAACGTAAAAACAATTATGTAAAAAAAAAAACTCAAAAACA
TAAATGCTAAAGCCAAATTTACTCAGTAGACGCAATACTCTGGACTGTAATCAATAGTAA
TACAAGAATGTACACAAGTGATATTATTAGTGCGCGCACATATTGAGTCCTTATAACCAG
CGCCTTAAAGTACATAATACGTTGTTTGGTTTTCATTCAATATAATAATTATACTGTTAA
CTTTTAATTACCAAAAATAAATTAATAGGCGATAGGTCGCAAATGTTAATACAGAATTTA
TATATCTAGAACAGACAACCGATTTAAGTCATTTATCAGAAATCCGAAATAAAGATAAAT
TACAGACTCTGAAAAATGTATCAATGTCCTAATGTTAACCACTTATTGGATGTTCAGACA
TCGACTTTTCGGTCGGTAATTATATTTATATTTTTGGTAATTAAAAAAAATAATATTTAT
ATATATTTTATATTAGAAATTGAAAACCACGATTGTCCGCTGTAAACTGAACCTTGTGCC
ACTATTGAATTAAATCGCTAGTATTTTTTTATTAAATTTTTTTAATTATCTTAATTTATT
TATCCTAGATAATTTTATGGTACTATTATAATAATATATTTTATTGCTGTTAGTAAATAA
AATATATAAATAAATTTAACGCGTATATGTTATATATTTATACATGTGTGTGTGTGTTGT
GTATCATAGCGCGTACGCCGCGGCCGCCGCCCCCGCACCCAGACGTGTCCCCCCGCGTAT
CACTTGCAGCACTGCGAGGGTCGCGGCTGCTCGCCGTCCGCCAGGCGCCGCCCTCGAAGT
GCTGCAAGTGATACGGGGGGGGACACGTCTGGG
(5733 bp)

- SilkBase 1999-2023 -