SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp13952_c0_seq4
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_katanin_p80_WD40_repeat-containing_subunit_B1_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0000922 C spindle pole
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005813 C centrosome
GO:0005815 C microtubule organizing center
GO:0005819 C spindle
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0005874 C microtubule
GO:0007049 P cell cycle
GO:0007067 P mitotic cell cycle
GO:0008017 F microtubule binding
GO:0008352 C katanin complex
GO:0051013 P microtubule severing
GO:0051301 P cell division
Transcript
Level		FPKM:6.75 TPM:6.79
ORF EntryO_BomoSK16960_complete:A_BomoSK_comp13952_c0_seq4
Sequence
(Nucleotide)
ATTTATGTCATAAAATGAAATGAATTGTCAAATCTAAAAAATCAAAATGCGTCAGATTTA
GTCAAAATTCAATATTAAAATCTAGGTTACAGTGGATTTAATGTATAGTACACGCCATTC
GAATGAATAAATTTCATAAAAGCGACAAAATACTCTAAGTGACAGTAAAGTGTTTTTAAT
TACATATTGCTAGAAATATTTTTTCAGCACAATACTCTCAAATTTTATTTATAAATATTG
TAACCCAAACATTAATTGTCTTGAAGCTTGAAATTCTTTTCATGGAGTTCTCGTAATAAT
TTATTAATTACAATGGAAGCTACCCGAAGATCATGGAAACTACAAGAATTTGTTGCACAC
AAAGCAAATGTCAATTGCCTAGCAATGGGACATAAGTCCAATCAGGTTTTAGCAACTGGA
GGAGATGACAAAAAAGTAAATTTATGGGCAATTGGAAGACAAAGTTGTTTAATGAGTCTT
AGTGGACATACAACCCCTGTAGAATGTGTGTGTTTTGGTCATTCAGAAGACTTAGTATGT
GCTGGTTCACAAACTGGTGCCTTAAAAATTTGGGATTTGGAAGCTGCTAAACTGTTAAGA
ACATTCACAGGGCACAAAGGAGCCATTAAGTGTATGGATTTTCACCCATATGGTGATTAT
CTAACTACAGGTTCTTGTGACAGTAATGTTAAACTATGGGACACTAGAAAGAGAGGATGT
ATTGTAACTTATTCTAGTCATAGACTTGCTGTCAATAGCCTGCAGTTTAGTCCCGATGGA
CAGTGGATTGCATCTGCATGTGAAGATGGTATTGTGAAAGTGTGGGATGTCCGCATAGGT
AAAGTACTACAAGAGTTCACTGAACACACTTCAGCTGTGACTTCAGTCAAATTTCATCCA
CATGAATTCCTGCTTGCAAGTTGCAGCACGGACAGGACAGTAAATTTTTGGGATATGGAA
AAATTTCAACTGGTCTCCAAGTTTCAAAAGGATAACACATCTATCAGGCACATGGTATTC
AGTGAAGATGGTGGAACTTTGCTTGGGTGTGCTAATGACGGCCTGCATGTGATCGGTTGG
GAACCTGCTCGAGTAATGGACACTGTAACTGGACATTGGGGTCAGATTCATGATTTAACA
GTGGCTCATACACAATTGATTGCTGCATCATTTCATTCAACATATGTTGTGTTAACAGTT
GTGGACTTGAGCAAAGTTCATCCATTTGGTGGACCTCCGCCGGTTTCTCCTCCGATCATT
AGAGATCTATCGCCATTTCAAAAAGGACACTCTGTTCGTAAAAGTTTCTCAAAAGAAAAA
CCACAAAAAGAAGTTTTACATAGACCAACACTTTTAGACGAGAAAACTGCCGAAGAATCA
ACATCAGGTACAGAAGCTGATGAGGATTCAGGCGCAGTCATATCAAATTTTAATGACTAC
ACTGAAATATTTCGTCCCTCCCGAGCATTGAATAGAACGCCGCCTCCAGCAACAAGTTTA
TCTTCCGATGATTATTCATTATCAGGACACGAGTCGGTGGAGAAGGATACCGTAGTAAGT
GACACGCTTCGTGAGCTGGTACTGAGTGAACCATCACGACCGCTGCCTATACCCTCGCCG
CCGCAACGACATCGTACTGAGCATTATTCACGGATACCCACTTCCACTAAAGAACACTAT
ACAGTGATTGAAAAGAAAACTGAGAGCTTTACTAGGGTGATGGACAACACTAAAGAAGAG
AAAATGTTTGCTACATCTCCAACATCAACCTTGAGAGATTACACTGCCAATAGTATAACG
TCAAGTTCACTCAATAGACATAATTCATACAAAGAAACTAAATCATCTACAGACTTGACC
ACAAGTAACCTTAGACCCAGTAATAGTGACATGTCGTTGGGCCCGCCATCATTAGGTCCC
AGATCGTTATCTTTCACACGAACTTCGAGTGAAACGTCGAGACGCCGGGTTGACAGCGTT
CATGATAATGTGACAGTAAACCGAAGTGTAGACGCTGCGGACCGTGAGTCTGAGCCAGAA
TTTATTCCGTACAACACAGACAGGCCGGTTGGGCTCGACTTAGATGAGTTTTTACCCCGA
GGAGTGCGCGAGGGTGGGACCAGACGCGGGCCACGCGGAGTAGTCGTGGAGCCTAGCGAG
CAGGAAGTCCTCGGCGTCATGATGCGGGGACACGACTCTATGATGGCCGTGCTCACTGCG
AGGCAGAGAGCTTTACAGATATTTCATTCAGTGAGAGTAAATAAGAGTTTAAAAACAGCT
TTAGAATCTGTCATTGCTCTGGAAGACACTTCAGTGATCCTGGATATCTTGAATGTCATG
GCACATAAACCGTCTCTGTGGAATTTGGATATATGTTTATTAATGTTGCCCAAAATATTT
GAACTCCTACAAAGCAAATATGAATCATACATGCAATGTGGTTGTAATGCATTAAGACTC
ATAGTGCGCAACTTCTCCTCGGTGGTTCGAGCGAATGTGAGTGCTCCTGTGAGAACTCTT
GGGGTAGACATACCTCGTGAAGAACGATATTCAAAGTGTATGCAAATACATCGACTCTTG
CTTGATGTCCGAGCCTTCTTACTTAAGCGCCAGACACTTCAAGGTAGACTTGGCGCTGCC
TTCAGAGACCTTCACACCTTGATGCAACAGGGTTTAGATTGATTCAACTGCTTTCGTCAT
CATATATAAGTATCAATCAGTACTCTGAATAAATAAGGCGAAAGACTAAAGTATGATGAT
ACAAAGACATATTTTTATAATGAATTTTTGAACAGTAATAAATTTTGACAAATCATAAAT
ATATACAATAGGACAAATACAAGATGTTAAATTTTTGACCTAATTCAGTTTGATTGAAGA
AAATTAATTTTGATTAATGAGAACATTGTCAGTTTGTGAGGAAACAAGAATAAATTTTTA
TTATAACCACACACTGTATTTGGCCATTTCTCTTCAAGCAATTGATGAACAAAATAAATC
TTTAAAAATATCTAAATATAATATATACAGATATAAAATTTTAATTAAAACATTAAATTG
ACTATTATGAAATATTCAAAGTGATATAATTATTATGAAATAATATGTATAATGAAAATT
TTAACTTCATATAAATAAAAAATGCTCACACTTTTAAAAGCAGCTATTTGTATTTACACA
ATATAAACTATTAACTAATAAGGAAAGCTTAACACAATAAAAAATGGGATAATCTTATTT
TTTTATTGTCACCTTAACTTTACAAACAAAATCCATAATATATAAGGCCACTTTTTTTTC
AACAAATACACTAAGTTAGACTGGTGAATGACCCTGCTTGCAGTTAAGTGGTTATCTGAG
CCCATAAACATTGCAATGTGAATGCTACCTTGTCTAAGATATGTCTCAGTTTTAATTGTA
TAGAATAACATATCCCTTCAAACTGGAACACAGGAATTCTTTAGGCTTACAATGCATAAT
ACTGCCAGTACATTCCCGATCCTGCAGAAAGAATGGAAAGCAGTCGACGT
(3530 bp)

- SilkBase 1999-2023 -