SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp13798_c0_seq3
Scaffold_idBomo_Chr27
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_IQ_motif_and_SEC7_domain-containing_protein_1_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005085 F guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005086 F guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0008289 F lipid binding
GO:0016020 C membrane
GO:0030036 P actin cytoskeleton organization
GO:0032012 P regulation of ARF protein signal transduction
GO:0043547 P positive regulation of GTPase activity
Transcript
Level		FPKM:0.93 TPM:0.93
ORF EntryO_BomoSK16016_complete:A_BomoSK_comp13798_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
CGGCCTTTCGGGCGGGCCGCACGTAATTTGAACGTCAAATCCGGATTTGACATAAACAGT
TGATAGTTCAGTGTGTTTACGTCATTGATTGTGTGCTGGAGTGTCCACAGTGCAAAAACA
AATATTGTGTTAAACGCTTGGGATTTACCAAGTTCATGGTGCAATCAACAAGTGTCAGTG
GTTCAGTGTTAATTTGGAGACAATTATTTTAATAAACCAGTTCAGGAAATTTATCGAATA
TATTAAACGTAATGGAATGAACAAGAAGAGAAGTAGAACTTCTGATATTCTTTGGTGAAA
GGCCCATTTTCCAAAGTGGCGAAGTCCGAGTCTCGTGTACAGTTAGTGGCCGAAGGGGAA
GGTGATGGGTGCTGTTCCTGCGCTGGTATGAGGATCGGTGACCTCGGAGGTGTGCTGCTC
GAAGCCGCCAAGCTAACCAGATCTTGGTTTTGCCAAAAACCTGGCTACGGCTTTTCGCAG
AAGGTAGACGAAGAGGAGCCAGGCGGCGGGGTTCCGCTGCATCCACCGGACGGCTTCTAC
ACTCATCAGCACTCGATCCACGCGCATCATGCCCACACTGAGCCCGACCGAGGGTACATG
GATGGCAACAGATACGTCACCGATGTCCATCGACCGTTACCAGCTCTAAATCATTCGAAC
TCGTCATGTTCGTCGGCGTCGAACGCGTCGACGGGCGCGGGTCTTTGCACGGCACAGGAG
CCGGCGTCGCAGCTTTACATTGCCGCGCCGCCGGAGGGCTTCGGCCTCGCCGTTCATACC
AACAGCCGCTATGAGATGTCGCAGGACCTGCTCGATAAGCAAGTGGAAATCTTAGAGAGA
CGATACGGAGGTCTCCGCGCCCGCAGGGCTGCCGTCACCATCCAGCGCGCGTTCCGAAGG
CGGCAACTGCTCAAGAAGTTCAGCGCGATCACGGCTATGGCCAAAGCTGCCGACTCGAAT
GCGAGACGGCTACAAGACGGTCCCGATCACGGTCAATTAGTCAATGGTACTGATATCTAC
GCGACTACGTTGCTACAAAAAAGTCCCAGCGGCACAGAAAAGATGTTAGCTTTGACGAGA
CCCATGAGGTCGATGTCCTTGCGGGAGCGACACGAACCACCCGACATGGGCAACCACTTG
CAATGCGACACGCACGACGTAGAAGCCATGGTTGCTAGAGTTCAGCAGTCGGCTCACCAG
ATCCACATGATCGCCACCGATCTACCGCCCGGGGTGCTTCATCCGGCTGACGCAGACAGC
GGGGTTTGCAGTTGTTCAGTTAGCGGCTCCGTGACCAATATATCGACTTCATCATCGCAC
AATGAATCTCTACACAATCACCAGATGATGAATACTGGTCCGATCTATGGAAATCTACTC
TCGTCGGGTGGCAAACCCCTGTCGTCTCCCACCCCCCGACAGCAGCAGCAACTGGCTGCG
ATACAAGCTGCGAACGCCAGGAGGATGCCTCCGGAAGTGCCCAAAAGAACGAGCAGCATA
ACTCTAAACGCCGAGAGTCCGGTGTCGCTTAGACGTGCGGAATGCGGAGCGGTCGTCAGG
GGAGGATCGATGTCTTCCGTGCAGTCCTCGTCCTCATCATCATCGCAGGAGCATCGCCAT
CACTACCACCAGCCCTACCAGCCCAGGCAGCCGGAGACGCACGTGCACGTCCCAGAGTAC
CTCAACGCGCGTCCCGGCGTCGTGCTGGAAGGAGATCGGTACTCCGTCTGGAAGAGACAG
GAGGCCGCTCCTTACTACGAAGCCCCCCCGCCCCCGATGGCAGCGCCCTGCTGTAGGCCA
CAGCATGAGCACCATCAGCATCAGCAACCGTTAAAGGTGTCAGAAACTGTCCGGAAACGC
CAGTACCGCGTCGGCCTTAACTTGTTCAACAAGAAACCAGAGCGCGGCATCGCTTACCTG
ATCTCCCGCGGCTTCCTCGAGAACTCGCCGCGGGGCGTGGCAAGGTTCCTCATCACCAGA
AAGGGCCTGAGCAAACAGATGATCGGAGAATACCTTGGAAACCTGCAGAATCCATTCAAT
ATGGCAGTTCTGGAATGCTTCGTAAACGAGCTAGACTTGTCGGGTATGGCGGTAGACGTG
GCTCTGCGCCGGTACCAGGCTCACTTCCGGTTGCCGGGCGAGGCGCAGAAGATCGAGCGT
CTGGTCGAAGCGTTCGCCAGAAGATACTGCATCTGCAACACAGATTTCGTTCAAAGGTTG
CGGACTCAGGACACGATATTCGTGTTGGCCTTCGCCATAATAATGCTGAACACGGATTTG
CACACTCCGAACCTGAAGCCGGAAGCTCGCATGTCCTTGGAAGACTTCGTGAAGAACCTT
CGCGGCATCGACGACTGCGGCGACATCGACAGGGACATGCTCGCTGGGATCTACGACAGA
GTCAAGGCGAACGAGTTTAGACCCGGCAGCGACCACGTCACGCAGGTGATGAAAGTGCAA
GCGACGATAGTCGGGAAGAAGCCCCACCTCGCTCTGCCGCACCGTCGCCTCGTCTGCTAC
TGCAGGTTGTACGAGATACCTGACATACACAAGAAGGAGCGACCCGGAGTCCATCAGAGA
GAAGTATTCCTTTTCAACGATCTACTCGTGATCACGAAAATCTTCAGCAAGAAGAAATCG
TCGGTGACGTACACCTTCCGACAGTCGTTTCCGCTGTGCGGCATGGTGGTCAGCCTGTTC
TCCGTGCCTCATTACCCGTTCGGCATACGTTTGTCTCGTCGAGTCGACAACCGTCGCTTG
TCTACGTTTAACGCTCGCAACGAGCACGACCGCTGCAAGTTCGCGGAGGACCTTCGCGAG
AGTATCGCCGAGATGGACGAGATGGAGGCCATGAGGATCGAGGGCGAACTCAACAGGGGG
AAGGGAAGGAACACCGGGAACAACGCCAGGAACGTGATGGAAAACCGAGACAGCGGCGTG
GCTGATGTTGAAATCGATCACCAGCAGTGCGTCGACCACGTCCACATGCACGGCGTGGTG
GTTCCTCCTCCGCCCTCGTGTCCAGCACCAGCAGCCCCCTCCAGGCTCTCCTCGAACCCA
CCGCCCACCAGCATCATCAAACGGAACGTGCTCAGCAACTCTCTAGTCGATATCAATGAC
CCGGCGGAGCGACTCCAGCGGCGCGGGTCGGTGGGGTCCCTGGACAGCGGCATGTCCGTC
TCCTTCCAGCAGGGAAGCAGGAACGCATTACACGCCACTTCACCGAGACATCCCACGGAA
CAACGGTCGCCGGGTCGTTTGTTCGGCGGCATATTCCCGGGACGTATTCGTAAGCTCAGC
GCCTCCGGGATCCCGGACGCGAAGCACGGGCAGGTCGGGAAGAGCACCGAAGTTTGAAGT
GCAACGAAAACATAATAATTACAGTAACGAACGAATCCATTCGATTCGGAGCAATCTTCT
GCGAATTTCCTCTCGTAATAATTTGGAAATATTGCATTTTTTTAGGTTTACAGTTCAGAG
ACAGATTTTATTATGAATTTTTCATGATTATGCATGTTTAATAGCACGCGCTCGATAATA
TTTCGCGATTCTCGTGGTCGGCTACAAACGTCGAATACCTCGATACGTTTAGTGCCATCT
TGTGTTTTTATTTTTTTATTTTCGGAACTACATTGCTGGTTTTGTTTTGAAAAATAGGCA
ATGTATCGTTAAATGCTGTAGACGGTTCTTAATGGCAACCTTTAATTAAAAAAGAATTGC
TTACGTTATTAAAATTCGATAAAATATAATCGTTGTCGATAAAGTCAAGAAACATTTGTC
GATTAAGTCGATGCTAATTCGATTTTCTATGTCGAAAATCGATTGGTAAGTATTTCTAAA
ATTCATTAAGTTACTTTAAAAGCAATCGGTTTTAAGGCAAGATTAATACAGAACAGAATT
TGATGAAGGATTATTTCATGCGATAAGGTGCCAACATCTTTTTCTGTAGAAATTAAAAAT
ATATAACCGTCGTTGTAGCGAGGTAAAATTTTTGAAGCTTTCGATTATCGCAATCCAAAA
TCGATACTATATCGATTTGAGATGTTCTCATTAGTGTTGACTATGATCTAGATATCGATA
AAAAAAGTCGATACAAGAGTGTACGAATTCGGAATTTGAGGCTCGAAGCGTTTACGTCGA
GTCGTAAATAAATCGAAATATGGGTCCACGTTTACTGATGATAGTGTTTTGACACGTGTC
AGTTAGAAATAAATTGTCAATAATTCGAAAGTGAAGCTTACTGACACCGCGCACTGCGAG
CCTCCACAATACAATAGAGACATCTACCTCATTTGTGATCTTAGCTATTTGCATTGACAT
GTCAACAGCCTTGACAATCCATTACAACAAAAATATACCTAACATGAATCATTATTAATG
AACACTTTCTTCGTTTTGGAAGCTGGTAATACTTACTAATTACTTGACTTGAAGAATTAT
TGATAATTTATATTATTAACTAGCTAGACGTAATAGTGCCGTCGTTGTGTATTTAAATAA
TACCAAGCAGAGTCGAAGTAAAGAAATAGCTGAAACGTACGTTACCACAAACTAATTTAA
TATTTTGGTGAGCTTTCGTGAGTCTTGCTCATGATTTAGTACACTTTTAAGGTTTAATCT
GTTCGGTTTCTTATTTATTCAGATTTATAATTATAATGTTTAGTAGAGTCGATTCATTTC
TTTAGAATAATTGTACATACGTTTGGATTAGAAAAAAATAATAATAATGCAATAGTAACT
CGAGCACAGGATACATCTAAAGCAATACATAGATTACACTTGTTAAATTATAAATTTATA
TCGATATAAAAACTTGAAAAAAAAAACGAATTTATTCATAATTGTTGAAGATTTTTAATA
GATTTAGATTTTGATGAAAAATTGAATAACTTAGAGGAGTTCTTAAAAAATTGTACTTAA
TATGTTTCTCGAGTTGTCTCGATAATTTTCATCGATAATCGATTGATCTTTAAAACGGAA
TCACTGAAGTTATCGATTAAGATTATCTCGATAACTGAATTCTATCTAATCTCCCATCCC
TGTTTGTTGTAAACGAATTCTTCCAAAATTATGTACGATTTTCTTCACACGACTGTACAA
AAAGGCTGCTTTTGACTTTTCGACTTCCAACTTACGTTTTATTTTCTTTTGAAGTGTACC
CGGTAGCGATATGTACTTATAAGAATATGATCGATCTTGTGAAACAGTCTTATATTAGTA
CTTACAACGCCACTATCGAGATAAATTATTATTATCAAAAAAAAATCGGGATTTTTTGCT
TCATGAACATTTACACTCAATGTAGGATTTTTATACTTTCATTCGCCGAACATCACTATC
TTTTGACGTCATAAGATCGGTTTGCCTACATTCGTACCGAAGTGAATTTTAAGTTAAAAT
GGCTCGTCATAGTCGTCGCGTGCTTCGAAAAAAGCTTTAGTGAAAGCGAAATATTAAACC
AAAAGTAAGCAACTGTCTACTATGATCCATTAATTCCTTAAGGCTTACCAACAGAAGTTA
CAGTAGAACATAAATAAAAATTATTCAATATTAGAACACATGTTTAATGTAACTCTAATA
ATACACAGCCTTAGCTTACATTAAATAATGCGAACTAATAAAAGAAAAAGAAAACAATAA
TAGAAATACCTAAGTAACCTATTCAACTAATTTTAAAGAGTATTTTAAAATTCATAAATG
ATTTTCTTAATACAATTAACAATAAATATCCTTTGTATTTAACAGACGAAGGACTTTAAA
AGCCTTAAGGAATACTTAATTTTAAGCTGCGGTTTCGAAAATTATCGTCCTTGGTTAGAT
TCAGTTTACCATTTTTCAAGACTTCAATATTTATAGGAGTTAATTCAGTACGATATTTTC
TGTTGCAAGATCGATCATAACATCATTTAAGTAACATTAACTAGGAAACTGTTGACTTTG
TACGCGTTACTTAGACTTGTTATATGTACTGTTCGATAACAGTTAGTTAATAGCCGCGTT
TGTTGAATAATATTAAAATACGTATAACATATATAGTGACGTCATAAATTTCTCTAATCT
AAAACTGTTTATTTTTTTAAATCTGAACTTATTTCTTTTTCGTGTCATTTTTACTATTAT
TATAAAATATATTGACGTATCCTTTATAACAGTTTTTGTTTGATTGGCGATAAAGCAAAA
GCTTAAGTTTATTATTACAGTATTTTATGACAGGTTTTGTCAAATTAATAAAATCATAGC
ACGTTTGTCATGTAAATAAATATTTACAGAAGAAGCGTGATTGTAAAGTTGGTTCTATTG
CCTCTGTGTTACGCATACATTGCCTAGTGAAAAGATGTGAACGAATAATGGAATAGATCA
CAGTTAATTTTAAAATTCAACCAACTCTCAACTCTAGAATTTTCTAGGGATATCTCTTCC
AATTTTAAATATAAGTCCTAAACTTTTTTCATTCGAGTATTTTTTCGCGCTGCCGTAATG
CGATTGATACTGCGGACTCCACAAACGTAATCTAATTGTGTACGCTTGAATAGGGATTAT
GCATGTATTTTTTGAAACCATTCTACTAGTTATTGCTTTACCAAAAACAAATATAACACA
TCCGTAATACAAACCATTCGGCAATTTTTTATTTATTAAAATCACTATAATTTTGGGGCT
ATTTAAAGGCGGCCATTTTGGCACGCTTTTTCTGTGACGTCAGATTACATTAAAACCGGT
TTCAGTCATTATGTTGAGTCTTTCTACACAAGAATGTAATAATTTAACACTGAGAACTTA
TTATTTATTAACTTAACATGAAACAAATGATACACATAATCACTAGAAGCCATACAAACA
ACTTGTTGACCCTGTTGACAGTGTAGTTTGACGTCACATTTTGTTCCACCAATAGCGTTG
CGTTTTAGAAATTTGCGAGGGAATTTGAAAAAAGCCAATTTTTTATGATTAAATTTCACT
ATTAAATCATGATAAATTTCAAAAATAATTGTATAGGTATGTGTTTTTAGCAATCAAATT
TACAAATAAAAATGTTTTTTCCATCTTGGAGTCACGTGCATATTCCCTATTATCGCGTCA
ATCGAGCCATCGACGAGCATCAATTAATTCAGTGACAAAGAGCCAATTCGCTTTTGCAGA
TTTAATGAGAATCTCCCCATCATAATGACGTAAAATTCATTGGGATTTTCAGGATTAAAT
GTGTGCGTGTGTGGGTTTTCCCATGAAGTGTTCTGATAAACGCGGTAGTTCAGAAAAACT
ATCGCCAAATTTGTCATGCGCGACGAAATTAATGGAATTGATAAATGTGTTTTTTGTTCG
TTCGAATTTGAACTTTATTGCTAAGTTTAGAGAAAAAAAAAAACTTTCTAATGCGGTTCT
TTGAGTCTTATAGCGAGACTTAAAATAATAGCTAGATATATTTAAATTGAAAATGAATCA
TTGTATTTGTATGGCTGAGGTATACAGCATCTGGAAACACGTCAGAATCTCTTTAAATGC
TTATTTCCATTATTAAAGTTTATTCCTGTATAGAATAGTGAAAGTATTTACTTTTTTAAA
TGATTTTTCGAATGTGTGGTTCATTGAAATTGAAATGAAAAGCTATTTGGCTTAAGCAAC
ATTTCCCTTAATAATCTACATTTATCTTTGTAATTACTTACTTACTTACTTAATAATTAG
GTTCGTTTTATTTATTAATTTATTTAATATATTTTGTACACA
(7722 bp)

- SilkBase 1999-2023 -