SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoSK_comp13731_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr9
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_myc_box-dependent-interacting_protein_1_isoform_X1_[Plutella_xylostella]
Ontology
GO:0005086 F guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005543 F phospholipid binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005802 C trans-Golgi network
GO:0005829 C cytosol
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0007612 P learning
GO:0008021 C synaptic vesicle
GO:0016020 C membrane
GO:0030054 C cell junction
GO:0030672 C synaptic vesicle membrane
GO:0031256 C leading edge membrane
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0043547 P positive regulation of GTPase activity
GO:0045202 C synapse
GO:0048488 P synaptic vesicle endocytosis
Transcript
Level
FPKM:9.85 TPM:9.90
ORF EntryO_BomoSK15733_complete:A_BomoSK_comp13731_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TGCCACTCACGAGTGCCGAAAACGGCGAAAGCACGCATTTGGAATTTGACGTGTGACAGC
AACCAGCTGTACTGTAACCAAATTCGGTTGCAGATTGATGGTGTATCGTGATTTAGACAT
TTGGTAATGAAAAAGTGATTGAAATGGCTGAAAGTAAAGGTGCGTTAATCGCGAAAACAG
TGCAAAAACATGCAGGACGAGCTAAGGAAAAGCTCCTGCAGAACCTGGGCAAGGTCGACC
GAACTCTCGATGATATATTCGAAGAGCACCTACAGAATTTCAACCGACAGCACCAGCAGT
CCACCAGGTTGCAGAAGGAGTTCAACAATTACATAAGATGTATACGAGCGGCGCAGACAG
CTTCGAAGTCGCTGATGGAAGCGATCACGGAGGTTTACGAGAGCGGCTGGTCAGGTCACG
ACCTGCTGTACGTCCAAGCTCAGAACATGGAGGTCCTTTGGCAGGACTTCTCGCACAAAC
TCGGCGACCAAGTACTCATACCGCTCAACACGTATACGAACCAATTCCCCGAAGTCAGGA
AAAAAATCGAGAAACGTGGTCGCAAACTCGTAGACTACGACAGTCAAAGGCACAGCTTCC
AGAACTTACAGGCGAATGCCGCTAAAAGAAGGGACGACGTAAAGGTGACGAAGGGACGCG
AACAACTCGAAGAGGCCAAACGCACCTACGAAATATTGAACTCTGAACTGCACGACGAGC
TGCCCGCGCTGTACGACTCCCGGGTATTGTTCTACGTCAACAACTTGCAAACACTCTTCT
CCGCCGAGCAGGTCTTCCATTTCGAAAGCTCCAAGGTGTTCGCCGAACTAGAAGCGGTAA
CGGACAAGCTAGCGAACGACTGTCAGCGCGGCTCGTACACGAAGAAGGCGAACAACGTGT
CCCCTCCCCCGCTGCCCGCGCTCCCCGCCGCCCCCGCGCACAACGGGAACGCCGCGCACA
CCAACACCGTGCAGACGCCCCCCTCCCCCGCGCTCAACGGCGACTCCCCCACGCTCTCCG
GGAACAAAGAGTCGGCTCCGGTCAAAGAGACCGCACCGGACCCCAAAGACCCCGGAACGC
CCGTCAAAGAGCCAGCTCCGGTTGCCAAAGAACCCGTATCGGTTGCCGAAGAACCGACGC
CGATCAACAGCGAAACCGTTAAACCCGAGACTCCGCCCCCCACAATCGAAACGACCAATA
GCAGCGAGCCCGCGACGGACAACAAAGTCGAACAGCTCTACGACATACCCGTCGGACCTA
CTACAGTCGTCGAGAAAATGAATAATAACGAAGAAACAAATAAACATACAAATGTCGAAC
AGAATTTAATCGAGAAGAACGAAAAGCGGAACAGTGAGAACGCCGAGGAGGTATACGACA
TACCAGTCGGAGCGACGCTAGCCGGCCTGCCGCCCGGCGTGCTGTACCGCGTGCGGGCCA
CATACCGGTACACGCGCGAGGATTCGGACGAGCTCTCGTTCGAAGTCGGCGACATCATAC
GCGTTGTCGAATACGACGATCCAGATGAACAGGAAGAGGGCTGGCTGATGGGCATCAAAG
AAACGACCAATGAAAAAGGAATGTTCCCGGCGAACTTCACGCGGCCGATCTGAAGCTAAC
ACGAGCGAACGCGCTTCGCTTCGTCGAGCCAGTGGACGGTAAGCTTTATCGATCGAACCG
TAGTTGTATGAAAATTTTGTAAATTTGAAATACCAATTCCTTGGTCCCAATCGTAAAGGT
GACTGAAGACCTCCACATTAACAATGCACAATGAGATTTAATTGACTAATGATTGATAAA
GCTTTATTGTCCTTTCAAAGTTCGGTACGTCATTTTTGTATGTATGTATGTATGTATGAT
TAACTCGGTCTGTTGTTTGCAATGAAAGTATGAATGTCTCCACTGAAATTATTTAGTAAA
TTGAAACGCATTCAAGGCGACGCGTTTAGTCTTAATTCAATTTGATAATTAATTAACCAA
CAGCAAAGATGATGTGTTTTTTGATAAATTAAAAAGCAAAGAAACGTTTTTTTTTTTTCA
TTTATTAACATTTCACATGTGTCGTATGAATAGTTATGATTTTGATTTTATTGTCTATTT
ATATTATCAATCAATCATAATGTGTTTATTTATATATTACATCTATTAAATTAATTCGAA
TAAAAATCGTGTTAACCTAGTTTAGTTTGTTGAATGTTTATGAACAACATGTATATTTAA
TTATGAATAATATGATTATTTTGTTTGAGATCATAAAGAAACATTAAAGCATTTTATTTA
AAAAAAAAAAACTTAAATCGAATAGCGCTTTTGACTAAGATTTCCTAAACGGTCAGCCAT
TATTGTGAATAAAGATTGTTCGCCAGGTTATACTAAATGTGTAATATAGTTATTTTTTAA
ATCATGTTACTTAGATTTCACAATAACGAAGGACTATCTTCGTATAGAAAACATTTTTGA
TTAATAAATTGTCATTAATGACAGGTGTCAAAGGTGTTACTGTAAAAATATTCTAAATAA
TATAATATTATAATATAATAATTTGCTCATTAGAAAGTGACCTTATAATTAATGTTTAAA
TTGGAGTAATCAAAATAATAGAAAGAATAGCGTTGAGATTTATAAAAATCGAAAGTTTTA
ATATTTATTTATTTCAGTATTAATAAAAAAATTATACTTTAAAGATGTCATGGTTTCTAA
CGAATTTTTGTTATTAATATAATTTCACTTCGATTGAATTTATTTCACAATTTTATGTAA
TGGTAATAAATATTAAAACTGAAAAGAAACAGTTCTCTGTGCTGGGATTGAAAACAAAAC
ACTTCTATATTTCCATCACGTCCGTGCATTTCGTTTTGTATGCATTTCGAAAAAAAAAAA
CATTTTTCTATATTCCCTATTCGCGAGTCTATACAGTCTTTAACGAATACAGATGATCTA
AATCAATATACTAAAAGATAGATATTGTAAAATTTAACTATCAAACAAAACTTGCTACGG
GATATTGTGAACGGAACCCGTATTAATTAGTCTGATAGAAAATTTCAATTAATGTCAAGG
TTTTGACTGAATCTTCAAAATTTATATTTTGTACCGTAGTTTAGACGCAAGCTAAAAAAA
TCAATAATTTCTTGTAAACGTTTTTATCCATTGACTTTTTTCATAATTTATCGCTAATAA
AAAGAATTCACATGATTTATGGTAGGTACTCGTAGGAGCATACTTTGTTTTCACTAGATT
TACCGCATTCTCTGTTATAACTGTTTAGTGAATTGAATACTAACCATTGTTATTTTAATG
TTATTATGCTTTTAATTGATAATCATATATTTATGGGTGGTTTGGAACTCAAACGTGCAT
AAGTTTCAATAATGAAATGTTGAGTTCCACAGCACCTATCACGTATGATTGGTTGTTTGT
ACCCAGAACAAAAACTGATATTAGAACGCCAGTGTAAAACGAGGTGCTTTAAAAATGTAC
ATATAATATACTCCCCTGTGTATGTACATTAATAGAATAAGGATTGATTGATTTGTAATG
TGTTCCAATTTTAATTATTTTTTACATTAAAATGTTGATGTTTTTTTCCTGGTAACATTT
TTCGTAATCTTTCTTAATTCAAAAATTTTATTAGTAATTATTTAATATAACGAACGTATA
TCTTCCTCCATGTATACATAATATGTTAATGCCAAAACTGTATTGTATAGATGTGGCCTT
ATTTATGGCGATTGTCAATGTTGTTGTAAATGACTGAGGAATTTTTGAAATTTGGAATTT
TTACGTATAGATACATTTATATTGTTGTGGCGAGATTGTCAGCAGTGCCATGCGAGGTCC
ATAATTTTTAATATAACTTATAGTTTTGTTAGGACTTGTACAGTTTTACAACTGCAAATA
AAATATTTCTCACAAAAAAA
(3920 bp)

- SilkBase 1999-2023 -