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Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoSK_comp13727_c0_seq13
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_RNA-binding_protein_39_[Papilio_polytes]
Ontology
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GO:0003723 F RNA binding
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GO:0016607 C nuclear speck
Transcript
Level
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Sequence
(Nucleotide)
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(2876 bp)

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