SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoSK_comp13714_c2_seq1
Scaffold_idBomo_Chr12
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_gamma-secretase_subunit_Aph-1-like_[Plutella_xylostella]
Ontology
GO:0004175 F endopeptidase activity
GO:0005770 C late endosome
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0007219 P Notch signaling pathway
GO:0008593 P regulation of Notch signaling pathway
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016485 P protein processing
GO:0043085 P positive regulation of catalytic activity
GO:0055037 C recycling endosome
GO:0070765 C gamma-secretase complex
Transcript
Level
FPKM:10.64 TPM:10.71
ORF EntryO_BomoSK15567_complete:A_BomoSK_comp13714_c2_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TGAATCTGTATTGAGTCCAATGATTAATAAAATGGTTCAATTTACACTTTTAAACGAAAA
CATCATAAAATAGTGATAAATGTTCCGTATTTCACTTTACTGTATTAAAACTAAGAATAG
CTGCAAGACAGCGATTATATTATAGTGTAAATAATTACGATTTCTAAGATTTAGAAAGTT
AAAATGACACTCGCGGAGTTCTTTAGTTGTTCCCTGCTGGCGTTTGGGGCTCCGATCGTG
ATGTTCGCGATGACTGTGGCCACGGATCCAGTGCGCATCATCATTATGATAGCAGCGGCG
TTTGGGTGGTTACTGTCTTTTTTGTTATCCTCGTTAGTATGGTACGCTGTGGTTCCTCTT
AGATCATACTTGGTTTTTGGAATGATCTTCGCTATAATATTTCAGGAATTATTCCGGTAT
GGAATGTATCTCTTACTCAGAAAAACTGAGGCTGGCCTCAAAGAGATATCAGAGAACCAT
GAGATTGGTAGTAATAAGCTAGAGATGGCTTATGTGTCTGGCCTAGGATTTGGAACAATG
AGTGGAGCATTTGCACTAGTTAATGTATTAGCTGACTCGATTGGCCCTGGCACATTAGGC
CTGAGTGGTGGGACAGAATACTTTTTTGTGACAAGTTCTGCAATGACTCTTTGTATGATA
CTACTCAACACATTCTGGAGTATCATATTCTTTAGTGGTTTTGATGAAAAGAACTATCTA
AAAATTCTCTGGGTTATCATATCACATTTCTTTGTATCATTTCTAAGTTTATTGAACAGC
AGGGAGCTCTATGCAGCTTCAATCTTGCCTTCGTACATTGTTCTTATGATAACTTCATAT
ATTGCGTTTCGCTGTGCCGGAGGATCTAGTAAAACTTTTATACAAAGTTTCTCTGCACGG
TCATAGGTTATTGTTGAATTTGACCCAGTAAGTGGTGTTGAGACATCTCTAGGAGCGCCA
TAAGACGGAATCTGTGCTAGTATTGTGTTGTGGTGTGCCTTACGTTAATTGATAGTGTGT
TAAATAAAATACAGTTTTGTAATCTGAATAGTCTAATAAATGGAAGTTGAAAAACTATTT
GAATGCACAATTGACAATGCCAATTAATTATATAGGGAAAATCAACATAAATGGCAAATT
TCAGTAAATAAAACTTGTGAATATATAGCTTGGCTGATTAATTAACAGTATTTTGTTTAG
TTTTCTAATTATTTTAAAAATGATTCTACACAAGATTGCCCACAATGCTATAATACCACA
TTTTCCTTCATAATTTCTTAACTAACTAAAAACATAATAACTTGATTTTGAAACACACAA
ACACAAATATGCCACATTTGCAAATGTGGCTTGTGTCTTTCAAAGGCAACTCAGGGCACA
GTTTTTATTTTACAGTATAGTACATTAATACATATTCATATAGTTATGTTTAAAGACCTC
ATCAGCTAAATAGGAAATTTAATCAGAAATAAAGTCCTATGGAATTTATGTATTATGATT
TCAAATATTCACTACAGCTTGTGATGCAAAATCCACTTCATGCTAGGGTGAAGTCTCATT
CCTCTAGTGCAGAAATTCACTTATGAACATTTGACACCAAAGAGACTAGCTATATTGGGC
TCGAGCTACATTTGGGCTGATCATCGCTCAGCATCACTATCTGAATGTAAAACAAAACTT
GCCCCGTAGTTAATATGTTAACAGAATTATATTACTTATTTTTGCTTTTATTAAAAAATT
CAGTTAAAATGACTATGAATAGTTTAAACACTAAAAAGCATGCCTAAATAGAAAGCCAAA
CAAAAATTAATTTGATCCTGGTAATCTTAGAATGGTTAGATCAATAAATTAATTGCATTG
TCAGCAGTTCTCAATGTGCAAAATTTTTAAGTTACATATTAAAATTGGTAAAAGTTTCAT
TGATTCCAGTAAATAGATAGACAGGTCAAGCTAACAAAAAACGTATTAAAAAGGCTGATA
AATTAATATGTTTTGTAGTATTTTGATTTAATGTTGCCTACATAATAGACTGAAGTATAT
TTTAAATTATAAATAGTGAATGAGTCAGGTGTGATTAGGACATTTAATTTAACTAAGCCT
TTTTTCCATAAATAGAAAAGAAATGCGATGAAAAGTTTTCATCTTCTATGACTAACAGGA
AGAAAATGTAATCTACAGGATGCAAGAGATTCCCCACTAATGACATTCCATAAAAAAATC
ATACACGTTTTAATGTTCTTTTAATTTTAAGAATAATTTTATTTGAGCTGAGGATTCCTT
TAATTGAATTTAATATGTTTAATGTAATATTCTAACAAAAAATATGATTTCAAAATAAAG
TTCACTGCTCTAACATTGCAACATAATAAATAATGATTTTTATACAAAAATAAAATGTTT
TAATAATACATCAAATGCATTTTTTTTATTGTCTTTGTAGGCAGACGAGTTTACGGCCCA
CCTGATGGTGAGTG
(2474 bp)

- SilkBase 1999-2023 -