SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp13687_c0_seq5
Scaffold_idBomo_Chr17
NCBI non-redundant
(nr)		Ef1alpha-like_factor_isoform_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0000184 P nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0002184 P cytoplasmic translational termination
GO:0003747 F translation release factor activity
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0005525 F GTP binding
GO:0005829 C cytosol
GO:0006412 P translation
GO:0006479 P protein methylation
GO:0018444 C translation release factor complex
GO:0044822 F RNA binding
Transcript
Level		FPKM:0.00 TPM:0.00
ORF EntryO_BomoSK15362_complete:A_BomoSK_comp13687_c0_seq5
Sequence
(Nucleotide)
TTCCGGTTCAAGATAAAGACACACGCGGATCTAGTGGGAACAGAATCTAAATAATTTTAA
TTAACCGGGAAAGAAGACCAAATTATTTATTTTACGCTCTGCAACTATAATGTCCAATAA
CGGTGCTCCGGATTCATGGGAAAATGAAGCGGAAATAATAGGTGAAAAAGGATGTGGCGA
TGGAGGCGGAGAAAGCAGTGATGGTGGTGCAGCATCTGCTTCTCCACGTGTTGAAGAACC
ACCACCTACTACTGCATCTGTCCCGCCCGATGTCTCGCCCACTGCAGACAGCTGGGAAGT
TGAGGCTGATGATGCACTACTCACACCTGAAGAAAACAATGAACCGGAAGAAGAAGAATT
GGATACACAAGTAGGAAACACAAATCCTAACGTATGCATGAATGCTTTCTTCTTTTTCAT
AAATTACAAATCCCAAGAGAATTAAAAATAAGTAATGGAAGAACTTAAGCAGAATGCTCA
GAAAGTCTATGTTATCTATTTCTGTCATAAAGCAGTAATGCATTTTGGTTCAAAACAGCC
TTTGAAGTCATTTGTCAAGGTTAGTGGTGGCATTGACGTTGATGCGGTGACCACTTAACA
CCAGACGGGCCATAAGATTGTCCACTCATCATAACAATAAAAAAAGAGAATGTTTATTTT
TATATGTAGTTGATGAAGTTTTTTTTAAATTGTATTATTTTTAGTTAATTCCTCTAACCA
CACGTCATTTATCTTTGCTTTGTTTATTTTCAACATGTTTAGCTAAGATAATGCTTAAGT
TGTGTGGTAGTCTTTTTTAGTATTATTTAGTGTTTGCCATAAATAGATTTCGTTAGCATT
GTTGTTCAAATTTAGCTAAATATTTTGAACGATTACACAGACTTAAAACAGATTGTCTCA
TAAGAGTACTAAAAATTAGATCAACAAATTCCATAATTGCTAGTTGTTAAAAACATTTAC
AATATTTTAGGCAAATAATGTATCAGAATTTTCTAGCAATACTTAAAACTTTTTTGAAAA
TTTACCCTTAATACCATTTTGGTTCATTTGTACGCATTTGTATATGTTTTTGTCCAGGAG
GATGGTGAATTAACAAAAAAGATTCCAAAGAAAAAACCACCACGAGTAGAAGATACACGA
AGCAAAAAAGAACATGTAAATGTAGTATTTATAGGACATGTAGATGCAGGAAAGTCGACT
ATTGGTGGTCAAATAATGTCACTCACTGGAATGGTCGACAAAAGAACATTAGAAAAATAT
GAAAGAGAAGCGAGAGAGAAATCAAGAGAATCATGGTACTTATCATGGGCACTGGACACA
AATCAAGAAGAACGAGACAAAGGCAAAACAGTAGAAGTTGGAAGAGCTTATTTTGAGACT
GAAAAGAAGCATTTTACAATTCTTGATGCCCCTGGACACAAAAGTTTTGTTCCAAACATG
ATTGGTGGGGCTGCTCAAGCTGACCTCGCTGTATTGGTCATTTCTGCACGTAAAGGCGAA
TTCGAAACGGGTTTCGACAGAGGAGGACAAACTCGTGAACATGCGATGTTAGCTAAAACA
GCTGGAGTGAAACATTTGGTAGCACTTGTAAACAAGATGGATGATCCAACAGTTAACTGG
GATGAGAAAAGATATAATGAATGTCGAGACAAAATTTTGCCTTATCTTAAGAAATTGGGT
TTCAATACAGCGAAAGACCTATCCTTCCTTCCTGTTTCCGGCCAAACTGGACAAGGTTTA
TTAGAACGACTAACTGAAGATGTATGCCCATGGTACCGTGGACCATCTTTTATCCAACTC
ATCGACGAGCTTCCGTCTCTAAACCGTAAGATCGATGGTCCATTTATTATGCCTGTTGTT
GATAAATATAAGGACATGGGAACGGTCCTCATGGGCAAGGTGGAAGCGGGAACTACACGT
AAATCCAGTACATTATTTCTGATGCCAAACAGGGTGCAAGTAACAGTTGATCAACTTTGG
TCCGATGACATTGAGGTAACCTCTATTGGGCCTGGTGAAAATGTCAAAGTAAAACTTAAA
GGAATTGAAGAAGAAGATGTATCTCCTGGTTTTGTTCTTTGCGACGTAACCGAACCGATT
ACGACAGGAAGAGTTTTCGATGCCCAAGTTGTGATTCTAGAACACAAATCCATCATTTGT
GCTGGTTACTCTGCTGTTATGCACATACACTGTGCTGCTGAAGAAATTACTGTTAAGGCT
TTGATTTGTTTGGTTGACAAAAAGACTGGAGAGAAGTCGAAAACGAGACCACGCTTTGTG
AAACAAGATCAGGTTGCTATTATGAGGATAGAATGTGCAGGAGTTATATGCTTAGAACCA
TTCAAAAAATTTGCTCAAATGGGCAGGTTCACATTAAGAGACGAAAATAAAACCATTGCG
ATCGGAAAAGTTTTGAAGGTGATTGAGTAAATCGGCACTACATTGTAATTTAGCTAGGTT
AGGCCTTTTGAGAACCTATTAATATTTGCAAAGTGCATGTAAAATGTATTCCAGGGTCTC
AAAATCCTGAAAAAGCTCGAGTACAGCTTGTTATATTATTTTTCATAGGAAACAATATAT
TTTCTGCATATTTAGTTGTCTATTATTATTATATTCAGTTAGATCGTTTCAAATATTTCT
TATTACATGTTGTTGATAGTAACTTGTAAAAGTTTCAATTAACAACATATGTAAAATTAC
AAACATTCTCAATAAACTTTACACAACTGTGAAATAAATGTTTTTTGTTTTTTGATAAAT
TTATACTCAAAAGTTAAAGGTTTATATAAAAAGGTACTAACTAACACTACAAAATAAAAC
AAAAAAAGCTAAATTATTGGAGTTGTAATGTCATTGTAGTTGTCGATGGTGAGACTCTCA
CTCTTCATGCTGGAGTGATCTCTAATAAGTAACAAATTGATGCCATCTAGAAATTGGTCA
CTCTAATCTTATTAGTCTAATTGATACTTATATAAGTATATGATTGATAGTAATTACGAT
ATATTTTTACATAATAATATCAGTTAATTATATAGTGCTGTTTATTTTTTAAATATTCTT
TATATTACATACTTTTATTCCCGCTTATTACTTTAATTTGCGTTCAATTTCACTTAAATA
CATATTGAAGTTGTAGTTTCTTTATATACACTGCAATGTGTACTTGTTATGTTGAATTAT
ATATTTTGCAATATTTTATTGTGGTAGATTTATAGTTTTTACATTTTAAGATTCTGATTG
AAACTAAAATTCAGTTAATCATCTTAATCACAAAAAGAAAAGGAATATAAGGTTTGTTTA
ATTAAATTCATTCTTATTTGGTCACTTGTATTTTAGAATTATAACTTGGTTGGAGTAGAA
TTTGGTAATTAAGTTGTGTAAAAATATTGAAATGCCTTGTTGATCGTAATTTACACATAG
TACTTATATCACTGAAAATAAACACGGCGGTGCGCATTAATATTAATTCCACCACAAGAT
ATTAACCATGTTTATTATGAATTTTATAAATTGTCAGCTTTTAACAATACAATAAAATTT
ATACATTATAAAGTTATTGTATATGATTTTATTTATTTATTTAAATGAGCGGAAGAGCAG
TGAGGTGTGCATATCTCGTTACAGTTTCCTTATGATTAAATTTATTTAAAATCCTTGTTA
ATGATTGGAAATTGGGCCCAGAGATCTGCACCTCTCCACGTCACGCATTATGGCGTCTGT
CAGAATGTCTTAATGTAGGTTGGAATTCGATTCGGCTTAAAATAATTTTTTGCACATTGT
TTGATTTTATCCTAGCGCTTCTCATTGCGATTTAGTATAAAATAAAATTGAAAATTACAC
CACAAATCCTAAAGATTAATTTTCGCGTATAAATCTGTATCACGAATTGTCATAGAACAA
CAAACTGGGGCTAGCAGTTTTTTTTGTACCTAAATATTCTCGCTAGATTCTAAGATTTAT
TCGACTGGAGATTGGTGTCGAAAAGTTTTTATATGGGGAAAACAAATAAAAATCGCGAAA
CAGTTAAATCACCTGAATATTGCAATCAAAATATTAAAAAAAAAAGTTCGCCTTAAATAC
TATTATTTATATTTTACAAGCTTATTGGCGCATATTTCGTCTATTGTCGTTCGTCGTTGT
TAATGGCCAAGGTTACAGACAGTGTTATCTGTAGGGAATAAATAAGATGCGTTAATATAT
TACTAGTAAAATTGAACGAAACAACAGCTTAAGCATACCTAGTTTTATGTAGATAAGTAA
TAAAATATTTTGATAAAAAAAAAAAA
(4286 bp)

- SilkBase 1999-2023 -