SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp13660_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Chr1
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_WD_repeat-containing_protein_47_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0005874 C microtubule
GO:0007275 P multicellular organism development
Transcript
Level		FPKM:2.18 TPM:2.19
ORF EntryO_BomoSK15215_complete:A_BomoSK_comp13660_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
GTACATAACATCATTATTCAAAGCAGACAAAGCACAAAACGAACAATAAATACAACATCA
TTTTTTTCTTAACAGGACACTATTAAGTATAATTTAAATAATAAAGAAGCACAAAAAAAA
ACATATTTTATATATATATATAGACAATGCGTATTTATCGTAAACATTTGCGCAGTGTCT
CGCGTGGCCTAATTAAATTTTAATTATAATTAAGTAACGTTATATTCACTAAGATTTACA
TTAATTACATTCACCAGTGGAGTTCTTAAAAACTACGAGGGTACGTCAAGTCAACATCGG
TGTTTTGTTCATGAAAATAATTAATTACGTATCGATTAATTTACTTTTCACCTTAATCGA
AAATTAAGTGGAGAAGAAAGGTCACACAAATCATTATAATTATTTTTTTTTTAAATCTAA
GGGACAGTAACATATTACACCCGAACTGAAAACCGAGTGTCGAATACTAATCACATTCTC
TTTTGATCGATACAATTAGAATTAAAAAGTCACATTAAATAACGTTATTTTAAAATTTAA
AAAAAAATGTCATGGCTAAATCAATACAGAATTAAAAATCTCTTTGTTGTAAACAACAAA
AGTCTTCGGATCGAAAACAAAGTCATTCGATAATATATTATGATAAATGTAAATAATTAT
TAATCGATTAAGGTCAGTGTTTGTGAAAATAATATTTTAAATCTTTCAGATAAAACTATC
ATATCATCGAATGATACGATTTTTATACTCGGAAAAAGAAACAACACTACAGATAAAATG
GTGTCAACTATTTCTATTGTCTCATGTCTCCTTCGAGATACCTTCGATTAATTCAGGTAA
AAACTATATTTGTGAATTTTTTTAAAATCTTAATGTACACTATTCATCAATTACTTAATG
TTAAAAATAATTAGTACACTAAATAAATAATTATAATAATTAAATCATAAAAGAAATAAA
ATTAATCTATTTTTTTTTTGTGACACGAACGTCAGAAGTTGTACTTCTTTGATGTTACCG
CACGTGCATCATGAAAAAACATTATGTGTATTGAAAACACACATAATATCTTCTGTGGGA
TAACATACTGCTAAATTTCGTTTACAATGCGCGCTCAAACAAGTACAACTATGAAATTGA
AAAAGAAAAAAAAATGTTGTTTAGATACAGATATATAATAACACGCATACAATTATTTAC
GTATAATTAAGTTTTGTGACAATCATCACTTGTATTATTTAACAGTCCACATATGTAAAT
AGACGAGATAGAAAAGATTTAAAGCTTTTTTTTAAGTTTTGCCCCTCAAAGTGAATACAG
CTTAGCCCTCCGAGAATCTTCTTTCATCTGCAGACGAGTAGTTAATGAACTCGCATTAGT
CTTGAAAGTAGATTTTACAAACTGGAATATTACGGCTCCTTATGAAACAAATTGAATTGC
AAAGTGCAATTTTCTTTATGAAAAAACTTTAATCGTGGTTCGTTCGTTTAAAAACTTTTA
AGGGCGCTTTATTAACTGTTAAGCTAAAATGCGTTTTCTTATGTAGTGGAATGAATATGA
ATAGATTTTTTTTTTTTTGTTTTAAAAGTCTGGATCCGTTTATTCGAAATAATATTATTA
GTTGCTCTGAAGAATTTAAATATCTTAATTCATGCGAAAATAGTGTAAGACGGTGATAAG
TGCAGTTGTGTTTGGTGCGAGCTAACGTTACAAGACTATGATGGTTATTGGTGGAATTTT
TTTTTTATTTGCCGGATAATAATTGGGCTTTTAAGTAAGCAAACAAAACTCTGTGAGCGC
CGGGCTCTAGTCAATATTTCCCGTTGAATAGAATATTCTTTGATCAACGACTTTAGCAAC
GTAATCGTATGCAATTCGATGCAGCCCTAAAGCATCGAACTATTCGTAAACAAAGATTCG
TGACCGCATCATTCGAGGCACGACACAAATTAAATCGACAAGCAAACTGCACACGATAAT
TTAATGTACCTACACTCATCGTCATTTTTCGAAAATTCACCTCATATTATTACGATACAT
CACCAATTTTCCAATCAGATAATCTAGAAACCTTTATTTAGTGTAATGGAAAAAACGTCG
ATTTGGAAGGAAGTATAAATGAAAATACATACGACTACTAAAGGGTGATGAAAAAAAAAG
AAGAAAGTAAGATTTTAAAGCGTTTTCGTAAACATCGATAAACTTTATACCAATCAAATT
TAACACGAAATAGAAATTTTTTTAAAGCCACTTTTTTTTGTAATGATTGCTTATATCAAA
TTATCAACCAACGGCACCTTTGCTTTCGAGATTAACTAATTTTCATTGTTTTACAAGCAA
CTTCTTTATTATTCTTTATAAGATCCTAAAAGGGCTGTTTTACACAAGCCGAGTTTCACG
AATGTTTACATACGAGAATATCGGATCGACGTCATGTTTATCGTCTATCGTAATATGAGT
GGGCGATCGTACGATACGTTTTCCGGAAAATGAACGCACACGATACTCTCGCTACGATTC
GAGAAACCCGTAGTGTCAGCTCCGATGTTAATAATCGTATCGTTATTAGACCGGCGGTAT
GGTCCACAGCACGGCCGTCTTGTCGGCCGAGGTCGATAGAAACGAGAAGTCGTCGGGATG
CCATCGGGCCGAGATCACTTTGTCCGGATGTCGAGCGACGGGCACGCTTGGCAACGGACA
AGTCAAATCGCCTTGCAAATCGGCAAGCACGACCCTGCCGTCGTAGCCGGCAGTCAGCAG
ATAGTACGCGCCGGGAGAGAAACGAACGCTACGGACGTCGCTCGAGTGCGGCGTGAAACG
CTGCAGGGCCCTCGAACCCCGTACGTCGTGTAGCGCGCAAGTTCCGTCATCGTGTCCGCA
CACCAGCAGCCGCCCGCTCGGGTCGACCGCGAGTGACGCGACCGCTGAACCCTTACTAGG
CTGACCCGCTGGTGGGGATATTATGTTGACACAACCCCCGGTGCGGAGATCCCAGAAACG
CACTGTCTTATCCTGACTGCCAGACACGAACATAGCACCACCCCAGTTATACAGCGATAA
AACGTGTCCAGAATGGCCGCTTAGAGCCTGGAAGGTCTTCCCTATGATGCAATCGGTGAC
GTATATCTTGCAGTCGCCGGCTCCGCCGCTCACCAGCAGACTGGTCTTGTTTGTCGTGTC
CTCGATGAAACACACGTCGCGGACAGTACCGTCGTGTACCGTCAATTCCACCTCTTGTCC
TTCCAAATTGCAAGCGTGCGTGTTGAACGCCATTAATTTTACGGTTTTATCATTAGAGCC
TGTGGCTAGTAGATCACCAGCGGGACTCCATGCGAGGCAGTAAATACTCCCCTTGTGGTG
TTTGGTTCTTTTGAGAAGCACCGTCGGCGCTGTGGGAGCGCTGTTGTCCTTGACATCCTC
GATCTTCGGATACGAACATATCCTTAACGTTTTGGTGTTCGACCCAACAGCGTACAGCTT
CCCGTTGGGATGGAATTCGGCACACCGGACCGCCTGCAAATCCTCAAGCACTGTCACGGG
CTTGAAAGTCGGTCTTGAATCACTGGATTCAATCCCTACAGCTGTCGGACCTGGGACAGG
AGTAGATGATTGTGGGCCGCCATTTCTTGTCTGCATCGTAGAGGGTTCTCCCACGTCTGA
CGATTCACTGATTTCACTTCGCTGATTCCTGCCGTAAAGCATTTGTTCCCTGGGCTTTTC
CTCAATTGGCGGTCTGTTGGCGAATTGTTGTTGACTCTTGGCAGCTGTCGAAAATCCGGC
TGGGGCATCGGTTACTTGCTCCATTGATTTCGGTTGCCTCGATTCAGACGAACAGAGATT
TCTGATGTAGTCGTCACACTCGCGTTGCTTTTGTATTTGATATTCTTTAAGCAAGTCGCG
TCTGAAATCACCATCCGTAGCGTGTACGACCGCATGCTCGACTCTCGGCGGCGCACGCTC
CGCGAGCGATGAGCGTTCAGTCGAAGCCGCAGTGTTCGAAACTGACGTTGACGCAGAGTA
ATCTTGGGCTCTGTGTTCAGGTGTCGTGGCGTTAGACGCACCGATGCTACTACCTTCATT
TAGTTTCGCGGGCGGACTATCTTCGGACAATTTCACTTGCTCAGCGATAGGCTTCAGAGT
ATCATTGAGGTCTTCAAATATGCCGTCCCCAGTTGGACTGTCGAATAGCCTATCCACAGA
CGTATTCATCAGCTTACTGCCTTTTATTCCGGTTAAATGAAATCCGGCAAAACATGATGA
CGAAGGACCATAATCTATGGCCGAAAGTGCCATGAGAGCGGGATGTCTCGGTGCACCGTC
AGGAAGTGGACGTAATGACCTAGTCATAGCGTCCGCTGCTGAGCGTGGCCGTCTGAACGG
CATAGCCAAATGTGGGAATGTCCGCGGCTTAATAGGCGTGACGAGCATGTGTTCAGTCCA
TGACGTGTGCAATGAAGGCCGTTCTAGTTTTTCTACATCAACATTTAACATTCTTTGTTC
GAACGGTACACTGAACGTTTCTGCTGGAATCGACTGTAGCCATGACAGTAAGCTCAAATC
GGATTCATCAAATCCTGAGCCGTCAAGGAGCCTTGAAAACGTAACGTCGTTCGACTGTGC
TTCCTTTGATCCAGTTGCTTTAGCTTGGCAATAGTTCACGCAAGATTCATACAATATTCC
CTTGATTAACAATTGCATTAGCCGATCATTCTTGGCGCACTTTGATATGGTGCCGCTCGA
TGATTTTTTATCGCAAGGCAAAAACTGCTCGACCAGCGGATATACTTCTCTGAAACATTG
AACACGCGCATTGCTTGGATTCCATTTTTTAAACTGAGCATGATCGGTTATACTCGGCAA
TGTCAATAACAAACATAAATTGGAATATTCTTCTTTCGATGGGGCTATTTTTTCTAATTC
ACTCAATACCTTAACAACTTCTTCAACAATGTTCTCGACGTTGTTATAGGCTTTAATTTC
AGACCTTATGCATAATAATTCTATGTATTTGTGTCTCAATATAGCATAATTAAACTTGTT
TGCTTCGAACGTTTTAAGTGCACTAAGCGGTTGAATAAATTCCAACACATCATCCCATTG
TCCATCAAGGATTAGCTGTCTCAAAAACAAAACGTCATCTGCGTAGTTGCCGTTTATTAC
GCCGGTTTCTCTTTCTAAGGAAAGCTGTGTGATGTGAAGGTCTCTGTTATGGAGGAACTC
GAGTGACAAACGGACAACGTCATCTTCTCGGAGATTTAGGTGGGTTGACGGCATCTTATC
TCTCTATACCTTCGATATAAAAACGCCTATGTATTAACTTTGTGACTCGACAACTTAATA
ATTTATAGTTCGACATTCAAAACAATAACAATTAACGGCACATCTTGGAGAAATTTATTG
AATTTATTCCACATTTT
(5417 bp)

- SilkBase 1999-2023 -