SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoSK_comp13532_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Scaf082
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_ubiquitin-conjugating_enzyme_E2_H_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0016740 F transferase activity
GO:0031625 F ubiquitin protein ligase binding
GO:0043161 P proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0061630 F ubiquitin protein ligase activity
GO:0061631 F ubiquitin conjugating enzyme activity
GO:0070936 P protein K48-linked ubiquitination
GO:0070979 P protein K11-linked ubiquitination
Transcript
Level
FPKM:15.54 TPM:15.63
ORF EntryO_BomoSK14468_complete:A_BomoSK_comp13532_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAATAACGTAAGTTTTATTATATTATGTAAAGAAATAAAATGGTTATTAATATAATTTTG
TAACATGCATAACCGTTGTTGGAACTCATACAGTACATTTATCGAGCGACATCGGAACAC
CATATTGTCAAATATTAAAAATACATAATTTGCTTTCAAAATGTACTATTTACGGCCAAC
AGTTCACTGTCAAAATATTAAAATATCATCAAAATAATAAAGCAGGGGTGGACATGACGG
AATCTTATCAAAATCAACCATCGACAAAAAATTACGTTATTCTTTTCTTATACCAAAATA
TATTATTATGGCTTTTAGTTTTTTTTTTATTATTTCGAAGATAATATATGTCTATAATAT
TAATATATTTTTTTCGTTTTCTTTTTTTAATTTAAAATCTATGTTTAACCCTATTCACTT
AAATATACAAATTGCAACACTTTTAGTTCGCAACATGTCATAGACTGAGAGATCTATTAT
GTGTCCAAACGTTTTTTTTTTTTAATTGAAGCTTTTTGTAAATGAAAAGAAAAATTGATA
TGTTGAAAAATATTTGAAGAATAAATTTAAAATCCATTATTTTGTTTTCATTTAAAGCTT
TTTAAAGTGATGGGCGATTTTTTTTTTGTAATCAATTAAATTTGTGGCATTATGTTCTTC
AAACAAAAAGTACATTGTGTTAAAAGTATTTATGCCAAGCAAACCCAGGAAACGACAGAA
TCAGCGCTCTTCATGCTAGTATTATTTGGTGTACAGCGAATTTTTCTCTATTGCTTGCAA
CACCGCCGACATTCATACAAGCGTTACAAACTTACTCATAAATTATTTTGGTTGCTTAAT
TGAATAACAAAATATTAGGAATTAACGCAATTATTACCCGACGACGTCGAAATTATGAGA
CTAGTACCTATAATTTTAATCAACAATATTATTGGTGTTCCAGTTTTTTATTTGCAAGAT
TTTTAATACAGATTTCTTAAGATTATAGATGTTTATTTTAAAAAGATTTTGCATCTATCT
TTTAGAATATTGGGACAAATTTTTAAAGGTAAAATGCGTTAATTCCCGTTACTATGTTAC
AAATGTACAGTAGATTATATTCACATCATGGTTTATGTTCTAGATGTAAAAAAAGGCGGT
GTCCAAAGCCCAAACAAGCTAAAAACAACTAAATTATTAATCTTTTAATTATGAATTATA
CTAAGTACGATGTTTTACAATTATAAAAAAAAAAACACTATTGACAAATGAACATACAAC
TGGAAATAAGGAAGAAAAAAACAATCACAGATCGTGTATTTCGCGACTATAGACAAACTA
AAATTTTCTGTTGCCATAACGAAAATCTTCATTAAATTTCCTGTATGGTTCGCTCACTGA
GACCATCAACATACTGCCGTGAACATTCCAGGAATATAACGCGCTGATCTAACTCAATAA
TACGGATTCAAAAGAAAAAAAAAATTATAATTTAGAGAATTTGCACGAACCTTCGTGTGC
AATGTCACGGGTCATGAAACATTGCGAAATGCGTCACAATTGATTTTTATTCATCTTTGT
TTACACGTACGGGTAATTACTATTGAATTGCAAATCAACGATATGCTAATTATATTTATT
TTTTCGTCCGCCGACAGATAAGCGCTCACGCCGCTCACGCGAGGCACGAAACGTTATTGC
TCGACATTAAGGTATAAAGTCGAATGTACAAGATTTATACTTTTCAAATCATAATCGGTT
CTAGTGTAATGCGATTGATATCTAAACGACTATTTGCAGATTAAGATTCATTTAAGTAGT
TAATCTACAAATTTAATTTTAATACATCAAAAAAAAAAACCCCACAGTCAAAGTTATAAG
TGCAGTTTTTGTACAACGTAAATTCGACTTTATGCGCTACCTAATTTAAGCAATATTCGT
ACGAAGCTAACTGCGAACAGCGACGCTCGGTGCGGACGCACTAACAGAGCTGCGTTACAC
CGCGAGACGGGCTCATCGTCACGTAACGAAGCGCGATTACCAAACAACATTCTTTCAAAC
GAAATTAAGACTAAAATTAATTATTAATAATAATAAAAAATACATTAATACCTATGAGAT
AGTGCTGACTGTTCCTTTACACTGTTTAGTAAATTTAAGTTCGATAAACTCTATTGTCGG
ACATATTTAAGTTATGTACAAGTAACTAGATCGATCGCGCCCGTAGCTACTAGCTCTGTG
AACGGTACTGAGACAGTTTTCAAATGTATCTATAAGCGCGCTAATCCTTCTCCTTCAAAG
AGATAACAAAACGGAAGAAGTACTTTAAAAACTCGTGATCCCGGCCATTTTGATCAGCCC
ACAGACTCGTGGTCGCAAGTTGCGTACGTCACGTTAACGGGGGGCGGCTGCGGCGCCGGG
GTTGTGGGGGAGGTGTTGCAGATACGCCATGCTTCATCAGTCTACGATCATAGACGAGTT
ACCACTACAAGATTTCAATATGAAGTAAAGACGTTCAGATTCTTTCAAAGCAAAGCAGAA
TCAACGAGATGCAAAATGCGAGGTCATTACAGTGTGTGCAATTTTCGTGAGGTCAAGTGT
AAACAAGCTCCCCATTCCGTCATGCGGAACCGTGGAAGAAAAAAGAAAGATAAGGTAATT
AAGGCTTATTCAAAAGCGTTGACCGACAATGCACTCCTCGTAAACATTGCCTTACAGATA
AGGCTGAAGCGGTTTGAGCTCAGGGGCCAGAAATCGACCGCAGCCTCTCTCAAATAATTT
TTACGTCTACATTTTAAAACCTTTAAAATCCTAAATATCTAATATTACAATTTCTCCATT
TTACAATAAGATTCTCTGATTTAACGTGAACACTTCGACTGTCGTATTGCTTCTAACCTT
AAAGCGTATTCTACTCGCTCGTAACGAAACACGGTACAGACTCGCACCTTCCCAAAGTGC
TAACCGACACTTAACATGTCCATAAATTCGAAAAAAAAGAGGCGTTCTAAATTGATTACT
CTTATTTTATTTTTTTTAGTCGAAATATCGAATTATATCGAAGCTCTATCGACTAATAAC
CCCAAGCGTTCAGAGACCTATGACCGGATCGCAGATGAGACAGGGCTAGTGGCCTAATGA
AAAAGACAGCCGGTGCTCTGGTCCAGTGACACGATTATGGCAGACCTGCAGGCAGGTACC
TATTTATTTAATGATATGGTAAAGTATAAAAATACAACAAAAAAACAACGATAATCGGGA
TGGAAATAGTTTGAATATTGGGCGTTAACACAAGTCACTTTTTACCCAGTGCTGGAGCCA
CTTAAAGTACAGTGTATTCCATGCGGGTAAAGTATAAATGTACAACAAAAAAGACAGTAA
AGACACTACCATGAATGACGGGGAAGATGTATCTGGAGAAGAGCCACCCTTTTCTGGTCG
TTAGCACCCGGGACCATACCTCGTGACCGGTCTCTTGGCCGTGCTTCATCACGAGCCTCG
TTTATTAAGGACGAATCACCAACAATCCTAGGGTCCGTTTACCGTTTTTACAATTCCATA
AAAATACAAGAACATCGCTACACACCGACCGCGTTATGCCGAAAAGAACCAACCAAAAAA
TATATATTTATATATTTCTGATGATCTGGCAAAAGTTTACGTACCTTTTAGGATTAAAAG
GCCGTAGTGGTTTTGTGTTGACTTCATGTTGACAGCTGTCCGCGGCAGACGTACTTCAGT
ATTAAGTTCGTATTTGCCTATCAAGATTCATTGTGTGACCAAACTCACCTGCGAACGCGT
TTCGGTCGGTATTAATTTTACCAGGATATTTACAGCCCTTCATTTATAAAGCAACAAGTT
TATGGTTCAACGCGGAACTGTGCGAGTACGTTTTCCTGATGGGAGCCCTGACGCTTGTTA
TGGGTACCTATACTACAGAGCAGCACTAAACTCAGCCGCCAACTGCTAATTGTGAGCACT
TGTGAACACGGTAGGCGTTTTCATTTTAGAAAACAATGTACGTTCAATTTCATTACAATT
ACGTTTCCGAATTAACGCTATGAATATAAATTTTTCTTTAGTCGTAGAAGAGAGTGACTT
TGAACTTTTCTACATAAAACGATCGAATCCTTAATTATTTTTTACAATATATATATTTTT
TGAAGCTGTCTCTCTGCGTGTGGAAAAATATTTTTATTGGCAACCCCATTATCTTAATAT
TATCTGTAGCAGCGATTTTTATTATTCAAATACAGATACAACATTAATCTCACTATAGTG
CTTTAGTGTTTTGTTTGGTGTCATGTAGTATTATTATTTTAAATTGTAATTGGATTAATA
CATTGAGTAAGTACATTAGAGTGAAACAAAACGAATTTTGATACGAAAAAAATTAATAGA
CCACTGAAAATTGAATACACCAATTATATATAGTTTTAATATCTCAATAGTTTAAGAAAC
AATTATATTCAATCTCTTGTCGTTCGAATACAAAACGAAACAAGCCAAAACGGATACGGT
TGTTCAACGATACTTTCAAAAAGTGCGACTTCCGGGTTCGAAATTCGAAAACTAAAACCG
TTACAATTCGAATTCGAATCAACGAACGTTTTTATTGTTCTCGTACGCGTTCACAGAGCG
GTGGCGGTGAGCGGCCTCGCGCGGGCTGCGGTCCGGGCCAGTCTGTGTTATAACTCCATG
TCGTGCGCCTCGTCTTCGCTGAAGTCGCTCATCGAGGACTCCGAGTCCGAGTCGTTGCCG
TTGCTCGCCTTGTTGGCGCTGGCCCCGACCCCTGTTATCGCGTCTTTCTCTAGCAACGCT
TCTTCTGTGGCGAACTTACGAACGTAGTCACAGACTTTTTTCTTGTACTCCTCGGGCTTG
TGCAGGTACATGGCGGCCGCGTCACCGTTCAGCGGGTCGATCGGGTTCGGGTAGGTGAGC
AGTTGCGGCAGAAACGATTCAAATATATTCGATAAGTCATAAAGGGCAGTCCACGCCTGG
TTGATGACGTCAAGACACACGGTCCCCGACACCTCATCTATGTTGGGGTGGTAGACCTTA
TTCATGAAACCGATGGACGGAGACTTGAAGGGGTAATGATCGGGAAGGTGCACGCGTACT
CTCCACACACCACCTTCGTATGGCGTTCCTGGAGGTCCGAAGAATTTCACGCAGAACTCG
TTAAGGCCGCTCAGGATTGTCACTTCGTGCTTGCTTTCGATAAGTTTGATGACATCGGTG
TCCATGCGTCGTTTCCCAGCGCTCGGTGACGACATCTTCGTGATCTATTCTTAATAAATC
ACAGTATCGAACACGAACACTAGAAACACTAACGCGAAACTCACTCGAAACTAATTTCTC
GTCCACCACCAGCAGTCAGAAAAATAACATTGTAGAAAAACAATGGACACAAACCATAGA
AACACTAACGCGAAACTCACTCGAAACTAATTTCTCGTCCACCACCAGCAGTCAGAAAAA
TAACATTGTAGAAAAACAATGGACACAAACCA
(5492 bp)

- SilkBase 1999-2023 -