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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp13350_c2_seq1
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_transmembrane_protein_189_isoform_X2_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0031625 F ubiquitin protein ligase binding
GO:0061630 F ubiquitin protein ligase activity
Transcript
Level		FPKM:9.09 TPM:9.14
ORF EntryO_BomoSK13750_complete:A_BomoSK_comp13350_c2_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GTGAAATGAAAAAAGTGATAAAAATTATCAAATTATCAAATAAACCCAAAATGAGCCTGG
AGTGAGTCATATGTTGTGAATCAAAAGAATAGTTACAGTGCCTTTCTTATTGTTATGATT
TCATTGTTTTTTAATATTTAAATGGATTAATAACATCCGAAAGAAAAGTACATCGTCGCA
TAAATTGCATAAATAAAAAACAAATAATGGCTTTGCCGTTACCCATATCGCCTTGTGCTA
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TCAGATATGTTCGGGCTGATGCTTCACTGGTACTGGCAGCTCTTGCAGGGGTCTTAACAG
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TCACCCGTCATGACTTTATTGAGACCAATGGTGATAATTTTGCTATAACGATACCTGTAC
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AATGGTCGCACACATATTTTGGGTTGCCATCATGGGTGGTGTGGTTACAAGAGTGGCACA
TTGTGCTGCCTCGTCGCCATCATCGTATACATCACGTCGCACCGCACGAGACTTACTTTT
GTATAACCACTGGCTGGCTTAACTGGCCATTAGAAAAACTTCACTTTTGGTCGACTTTAG
AGACAATAATAGAAGCTGTAACTGGATGTAGACCACGAGCAGACGACCTTAAATGGGCAC
AAAAACGTTCCTAGAACATTGAAATTTATTATGCGAAATTATTATTTTATACGACTTACA
CTTGTCCACATCTACCAAATCAATTAATAGTATAAGTTAAAAGTATATTTTGCTACGCTT
GAATCACTTAAGCACGTTACTTTATGCATCAACTTTTGTCAATTGGCTGTGTGACAAATA
CTTAGATTAAAATTGAAATTGTGTAGGCTTAGTGAGAAATCACATAAATATTGAAAGTTA
TTATGAGACGCGTCCGCATCAGCGATAGGTCTGTTGAAGATTAAGGGGTGTAACCTCTAG
TGGAGTGCATAAAGTTAGTTACTATACTTTATGTATAGAGGCCTATGATTTTAAAATAGT
TGTCAATTATGGAATATATTTATGGCTAATTAGGATCGAGTAAAATTGTCATCGAATTAT
ACATCGTCAAAATGTTCCTTTTTCAAATTTTAATTTAAAAAAGTTATAATTGGTTATATG
AACTACTTCCGATATGTTGAAATTGAATTGTTTCAATCTAGTGATGCTTGTAACTATTCG
ATGTGATGGTGTCCGTAAATGAAATACGAGCTATTGTGTTATGTGGATGTACGATGTTTA
CTACTATTGGTTCGATTATTGATCATTATACATATCTTCATCTTTTATCAGTATAAAAAT
TACATTGATGATAACGTTATTTCATACGTTATCAATGATAATAATCTTATAATTCGAATA
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ATGGCAACGAATGCGTAACACCTTAGTCGTCTGTGACCACGAAAACTGTAAAGTATTTGA
AATTTCTGAAAATAAAATCAAAATAATAAAAGTGACATTGAACCCCATAGGTACATTTAG
GTTACCTATGTCTACAACTCGCAAATAATGTTTCATGTTTTTAATCTTAAGATTGTTATT
ATGAATTAATTTTAGCAACAGTCTAATGTTGTCAACGCGTACTCTGAGCCAGCCTGAGCT
TGCTTAGATAGGACACTGGTGGTAGGACCTCTTGT
(2255 bp)

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